Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 170762389

Identifier: 170762389

GI number: 170762389

Start: 306489

End: 307856

Strand: Direct

Name: 170762389

Synonym: UPA3_0280

Alternate gene names: NA

Gene position: 306489-307856 (Clockwise)

Preceding gene: 170762406

Following gene: 170762377

Centisome position: 40.77

GC content: 18.42

Gene sequence:

>1368_bases
ATGTTTGATCAAATCTTTAAAAAAAGGAAACGTCATTTAAACTTTCAAATTTTTATTTTCTTTTTTGTTTTAATATTAAT
TACTTTTTTGATTTTATGAATTATTTCAGGTAATGTTCAAACAATTATTGATTTTATTAAAAAAAAGATTTATGATGCTA
GTCCACAATTAAAATATTTAACAAATATTCAGATCAAACCTTTTAAAAATTTAGAAGAAATTTTTGATTTTATTATTAAA
AATAAGAATTTGATTAAAGATTTACAAAACGAACCTGAAATTTTAGATGTTATTAAAAACAATCCACAGATCTTAAAAAC
ACTTAATGATAACCGCGAATTTTTAAAACAAATTGTTGAATATAAGCCATTTGCTGAAATTCTTAGCAAGCAACCTGAAA
TTTTAAAATTTGTTCAAAATAATAAAGAATTAATTAAACAGATACAAAATTTACCTGAATTATTAGATTTAATTAAAAAA
CACCAAAATTTAATTGATCACTTAAAAACTAACGAAAAATATATAGAAGTTATTAAAGCTAATCCTCAAATGTTAAAAGA
TCTCTATCATGTAGATGATAATTTATTTAATATTATAAAGACAAGCTTAGAAAATGATAAAGAAAATAATATTTTAATGT
TGGCTATTAAATATTCAGTATTAATTAATAATTTTACTAAGAATTTAACTTTACAAGAATGAAAGCAAATAATAGAATTT
TATAAAACAGTTGATTTAAATAAATTTATAGTTGATGATAATTTGTTTAATATTATTAAAAATAATAATCAATTATTTGA
AGTTTTTTTAAATAATTATGACTACATAAAAAATCTTGAGGACAATCAAAAAATTATTGATATTATTCAACAAAATCCTG
ATTTAATTGATGATTTTAAAAAGATTGATTTTGATCTTTTAACACAAAAAAGGAATTTTGTTCGTGCACTAATTAAAATA
ATTGATTATAAACAACCCAAAGAAATTCAATTCCTTAACAAAAAAGTTTTTTTAGATTTCTTTAAAAATAAATCTGAAAT
TACCAATGCTTTAAACATCACATCTTTAATTGGATTTGTATTGTTTATAGTAATTTATACAATTTTTATTTTTGCATCTT
TTATTTCTCATATTCTAATGTTAAAACAAATTAAAGATTTTAATAAAATTTTTAAAGAAGCTAAATTAAAAAAAATATAT
CTTATAAGCACTTTATTATTACAATTTTTATTTTTAATTTTATTCATTATTAATTTTATAGTATTAATTATTCTAGTTGT
AGATTATAATAAATTGAAAGCAATAGTTTTAAATAGTGGTATAAAAAGAAAAGTGGAGGATAGTGATGCAAGATTGCATT
TTTTGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCGCTATTGTTGCCTTAAAAAACAAATATTTATGTAAATTAGTTTAAAATTATAAAAATAATTTTTTACATTATTATTTA
TTTATAGACAGGAGATGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATTTTAAAAGGTGAAATTATTTCAAAAATAATAGATGAAAACGAATTTGCTATAGCAATTTTAGACATTCAACCTGCAA
GTGATGGTCATATGTTGATT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 455; Mature: 455

Protein sequence:

>455_residues
MFDQIFKKRKRHLNFQIFIFFFVLILITFLILWIISGNVQTIIDFIKKKIYDASPQLKYLTNIQIKPFKNLEEIFDFIIK
NKNLIKDLQNEPEILDVIKNNPQILKTLNDNREFLKQIVEYKPFAEILSKQPEILKFVQNNKELIKQIQNLPELLDLIKK
HQNLIDHLKTNEKYIEVIKANPQMLKDLYHVDDNLFNIIKTSLENDKENNILMLAIKYSVLINNFTKNLTLQEWKQIIEF
YKTVDLNKFIVDDNLFNIIKNNNQLFEVFLNNYDYIKNLEDNQKIIDIIQQNPDLIDDFKKIDFDLLTQKRNFVRALIKI
IDYKQPKEIQFLNKKVFLDFFKNKSEITNALNITSLIGFVLFIVIYTIFIFASFISHILMLKQIKDFNKIFKEAKLKKIY
LISTLLLQFLFLILFIINFIVLIILVVDYNKLKAIVLNSGIKRKVEDSDARLHFL

Sequences:

>Translated_455_residues
MFDQIFKKRKRHLNFQIFIFFFVLILITFLIL*IISGNVQTIIDFIKKKIYDASPQLKYLTNIQIKPFKNLEEIFDFIIK
NKNLIKDLQNEPEILDVIKNNPQILKTLNDNREFLKQIVEYKPFAEILSKQPEILKFVQNNKELIKQIQNLPELLDLIKK
HQNLIDHLKTNEKYIEVIKANPQMLKDLYHVDDNLFNIIKTSLENDKENNILMLAIKYSVLINNFTKNLTLQE*KQIIEF
YKTVDLNKFIVDDNLFNIIKNNNQLFEVFLNNYDYIKNLEDNQKIIDIIQQNPDLIDDFKKIDFDLLTQKRNFVRALIKI
IDYKQPKEIQFLNKKVFLDFFKNKSEITNALNITSLIGFVLFIVIYTIFIFASFISHILMLKQIKDFNKIFKEAKLKKIY
LISTLLLQFLFLILFIINFIVLIILVVDYNKLKAIVLNSGIKRKVEDSDARLHFL
>Mature_455_residues
MFDQIFKKRKRHLNFQIFIFFFVLILITFLIL*IISGNVQTIIDFIKKKIYDASPQLKYLTNIQIKPFKNLEEIFDFIIK
NKNLIKDLQNEPEILDVIKNNPQILKTLNDNREFLKQIVEYKPFAEILSKQPEILKFVQNNKELIKQIQNLPELLDLIKK
HQNLIDHLKTNEKYIEVIKANPQMLKDLYHVDDNLFNIIKTSLENDKENNILMLAIKYSVLINNFTKNLTLQE*KQIIEF
YKTVDLNKFIVDDNLFNIIKNNNQLFEVFLNNYDYIKNLEDNQKIIDIIQQNPDLIDDFKKIDFDLLTQKRNFVRALIKI
IDYKQPKEIQFLNKKVFLDFFKNKSEITNALNITSLIGFVLFIVIYTIFIFASFISHILMLKQIKDFNKIFKEAKLKKIY
LISTLLLQFLFLILFIINFIVLIILVVDYNKLKAIVLNSGIKRKVEDSDARLHFL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53976; Mature: 53976

Theoretical pI: Translated: 9.88; Mature: 9.88

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
0.9 %Met     (Translated Protein)
0.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
0.9 %Met     (Mature Protein)
0.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFDQIFKKRKRHLNFQIFIFFFVLILITFLILIISGNVQTIIDFIKKKIYDASPQLKYLT
CCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHH
NIQIKPFKNLEEIFDFIIKNKNLIKDLQNEPEILDVIKNNPQILKTLNDNREFLKQIVEY
CCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHCC
KPFAEILSKQPEILKFVQNNKELIKQIQNLPELLDLIKKHQNLIDHLKTNEKYIEVIKAN
CCHHHHHCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCC
PQMLKDLYHVDDNLFNIIKTSLENDKENNILMLAIKYSVLINNFTKNLTLQEKQIIEFYK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
TVDLNKFIVDDNLFNIIKNNNQLFEVFLNNYDYIKNLEDNQKIIDIIQQNPDLIDDFKKI
HCCCCCEEECCHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHC
DFDLLTQKRNFVRALIKIIDYKQPKEIQFLNKKVFLDFFKNKSEITNALNITSLIGFVLF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVIYTIFIFASFISHILMLKQIKDFNKIFKEAKLKKIYLISTLLLQFLFLILFIINFIVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IILVVDYNKLKAIVLNSGIKRKVEDSDARLHFL
HHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEECC
>Mature Secondary Structure
MFDQIFKKRKRHLNFQIFIFFFVLILITFLILIISGNVQTIIDFIKKKIYDASPQLKYLT
CCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHH
NIQIKPFKNLEEIFDFIIKNKNLIKDLQNEPEILDVIKNNPQILKTLNDNREFLKQIVEY
CCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHCC
KPFAEILSKQPEILKFVQNNKELIKQIQNLPELLDLIKKHQNLIDHLKTNEKYIEVIKAN
CCHHHHHCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCC
PQMLKDLYHVDDNLFNIIKTSLENDKENNILMLAIKYSVLINNFTKNLTLQEKQIIEFYK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
TVDLNKFIVDDNLFNIIKNNNQLFEVFLNNYDYIKNLEDNQKIIDIIQQNPDLIDDFKKI
HCCCCCEEECCHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHC
DFDLLTQKRNFVRALIKIIDYKQPKEIQFLNKKVFLDFFKNKSEITNALNITSLIGFVLF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVIYTIFIFASFISHILMLKQIKDFNKIFKEAKLKKIYLISTLLLQFLFLILFIINFIVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IILVVDYNKLKAIVLNSGIKRKVEDSDARLHFL
HHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA