Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 27815 chromosome, complete genome.
Accession NC_010503
Length 751,679

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The map label for this gene is 170761857

Identifier: 170761857

GI number: 170761857

Start: 670968

End: 677759

Strand: Direct

Name: 170761857

Synonym: UPA3_0580

Alternate gene names: NA

Gene position: 670968-677759 (Clockwise)

Preceding gene: 170762005

Following gene: 170761914

Centisome position: 89.26

GC content: 24.25

Gene sequence:

>6792_bases
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TTTAATGATTGTTTCAACAGTTGTTATTGTTGCAACAACGATTACAGTACAACGTTTGCAAAAATCACAAAGCGATATTA
AAAAAATTGGTTTACAAAGTGATTTTTTAATTGATACAAAAGAGCAAGATAATATTAATTTCAACGAAATTGACGTTAGC
AACAATCTTGTAAAACATAATGAAAAATTAATTCAATTAGCAACTTTTAATCAAAATATTTTAAAAAATTCAAATAATTA
TTTACAACTAGTTGATAATGCATTTCATAATCATAACCTTTTTTGGCCAACTAATGTAAACAATCAAAAAATAGATGTAC
TAAATCTTGAAGGAAATATCGATTGAAATAAAATTAATCAATTAAAATTACAAACTGTTTTTTGATTTGAAAACAATAAA
GAAAATAATCAAAATTTTGCTAACAATTATGATGATTTGGTTTATGAATATCATAATTCTAAAAATCAATTAGTAGGATT
TCAAAATTTAGATGGTGGGCATATTTTATTTAAAACACCGGCGTTAAAATCAGCAAACGGTAATTATGAAACAACATTTA
AAATTAATGCTGCAATTGTCCAAAAAAATAAACCATTTAAATCTTTTTTTAACTTTGATAAATATAAAGAATTAGGATTT
AAGAATAAATCTTATTTTACAAATCCTGTATTAATTAAAAATATAGATCTTTATTCAAAACAAGTTGTTCAAACACTAAA
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CGATAAATAAAGATTTTTATAGTGTGAATTTACATGTTGATTTTAACACACTATCAACAAAATACCTACTATTTGCTAAT
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TTTATTTCAAAACCAAGTTTTAATTCCAAAAGAATTAATTGACGATCCAAAAAAAATAGAAGAAGTGCAAAAAATTATTG
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GAAAATAAAAATAAGATTCGTGATTATGAGATGCAATTAAAACAAATAAATATTGCTCTACAAAATTCGAATTATTCTAA
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AACTTAAAACTATTTCAGCAAGCGTGCCAATTTTAGAGTATTACACACTAAAAGTTAATACTAATGATCTTAATTTATTA
CAAAAAAATAATGTTTATAATGAAATAAAATCAGAATTATTAGATTCTAAAAAAGGTAACATATATAAGAGAACTGATAA
GGATAACCCTTATCCAATTTATGTTAAACGAACCTTTTTTTTAACACAATTGAGGAATTTAATTATTGCAATTGCACTTA
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TAATTCCTATCCCAGACCAATTTGTTAGTGTTGGTTGAATTTTTGCTATTCCAATTGCTTTAACATTAATTTTAGGCTTT
ATTTGCTGGGTGTTAATTTATTATATTTTAAAACATTCAACCGCAGAGACAATGAAAGGCGATGCAGGTTTTAAAATCAA
TAAATTTATCATTAAAACAAAAGCAATCTTTTTAAAATTTGGTGCAATTCGAGTTTTAAAAGCTACTTATGTTGTTGCCA
ATTTAGCAAGAATGTTGATTTTATTAGTAATCGCTTCCTCTTTTTCTATTATTGCTTCTATTATTGCAACAACAAAAAAT
AATTTTAGTCAGTCAGCAAGTATTACTAATGCTAAACGTGAATATCAATATGCAGTTGATTTATATTCACCAACAGAACA
GGGAGGATTTTATTACATTTCAAAGTTTGATGAAATGGGTGTTTCTAATGAATATGCTCCTTTAAAACAAATTGTTAAAA
ATGTTAAGATTGTAATTAAAATTAAAAATTTAGTTAATAAAAAAGTCAATGTTGTATATATCAATAATCAAACAAAGCAA
AAAGTAATTATTGAAGCACTTATTAATGATAAGGGAATAATCACTTTTAAAACTAATCAGCTTGTTAAAGGTAGTTTTCA
ATTTGAAGGTATTTATGAACAAGAAACAAATAGAGTTTTAATTAATTCACAAAATTTAAATCCATCATTATTAAATATAG
ATAATCGAAAGATAGGCCATTTTATTTACTCTAATCAAAAACAATATATCTATTTACTAAAATCATACTTTAATGACAAT
GATGTAATTTTAGATTATGTTGATGCTAATAATCAACATACTTATTTAAAAGCAAAAACTCTAGGTCAATACTTGGTATT
TGATCCTTCACAATTAAAACAAAAACAAAAATATCAATTAGTTAATGTTATAAACCATAAAGGAAATACATGAGTTGATT
TAAATAATATAAGTAATGATTTAAAAAATTTGGATTATTCCAAAAATGGACGTTATTTATATGATTATTATGGAAGATTA
CCATATTTATACTTTAATCATTTACCACAAAATCTAATTAACCAAAAAGTTTATTTGACTTATACAATTAACCAAAATGA
TGAATTTCGAATTTATGGTATTGTTAATAAAGAAAAAGAAGTAGTTTTTGACTTAACAAAATTAAAAATTAATACCCAAC
AAAGTTATCAATTACGCGATATGCGAATCGCAAATAGTGATTTATTAATTTATGATAATAAACAACATGAATTTAATAAT
AATATTTTATATTTTGATAACAATTATTACGGTTTAAACAATAATAATCAAAAGCAAATTAATATTGATTACTTAACTCC
TAATCGTAATCTTTATTTAACTTTAAAAGCAATGGGTAATGAATTTGTTAATAAGAAAAAAATACCTTTTATAATGACAA
AAGCAATGGCTTCTTTAGTTGAACCTGATACTGCAATTTTAGATTATAATGAATTAGAAAAGGGTTATGTTTATCAAATT
AGTACAGCAACACTAGAGGGTAGTGATACAAACTTATACTTAGATAACGTTAATTCTATTGATAAAACAAAAGATAATGG
CTTACCTTATTCGTCTCTAAAATACAATAACGCAATGCGTGAAATTAAAAATTTAGGTACTGATCATCCAGTCTATGGCA
AAATGTTATCAAATGTTTATTATCCATCAATTAGTACCCAACCTGAAATCTTACAAAATATTCGTTTTTTTGATAGTAAA
GTAATTTCAAAAAGTTCTTTAGATGGAAATATTAGTGTTAAAGCAACGGATGTTAACATTGAATTTAACCCTTGAGTTTT
TGCAAAAACTTTCTTACCTATCACAGCAATAGCTCGATCAGAACTAAATGAAAAACACTTATTAGATGAAGCATTTAAAA
CTTTTGGTTATGAAATTATTAATGGTAAAAAAATCAATAAATTATATGATGTTCCTAACTTTGAAGATAATGGTATTATT
CATCAAATATCATTATGAACAAAAAATGGTTTACCACCTAAAAGTGAAAATGATGAAAATGCTTTCTTTATAAAACAAAA
TGGGCAATGGAAAATCAATGAAAAACCAGGCGTGTTAACAGAGCAGGGCGCCGCAGAATTCTTACCAGAATTTTTACGTT
TAATTACTCAAATGTACACCTTCAAAACAACTCGTTATTTACAATATAAAGCCGGTTTAAAATTTGTTAATATTGAAGAT
GAAAAAGTACAACAACCATATACATACTTATTAGGTAAAATGCAAACAAAAACAAAAAGATTTGCTAATGAAATTAAAAT
ATTGGGTATTAATTATGAAAAAAATAAATTTATTAATGGAAAACCAAGTCCTACTACTCAACTAAGTTTGATAAATGATC
AGGGTGTTAATTTAATTGATCTAATTAAAAATGATGATCCTAATAATGAGATTCACAACATTATTATTAATAAAGTTGTC
GCCCAAAAATATCATTTAAAGATTAATGATGTTTTTGAATATCAAATTAATAATCACATCAAACGTCTATCAAATAAATT
TAATAACACACCAGAGAATTATAAAACTAAGTTTAAAGTTGTTGGGATTAATGATAGTTTAATGGATGAGCAATTAATTA
TTAATCAAAAAGTTGCAAATAAACTAATTGGTTTTGATGATTATCGCCGTCGGATTCAAATCGAAAATGGTTATCCAATC
ATTGAAGAACGCGAGTTCAATGGATTCTTTACAAAAGAAAAAGAACCTATTTTCTTTAATAATATGGCTTCATTTTATTC
ACCTACTGGACTATCACCAGCAATTGATTCATGACCACAAAATTTATTAGAAAATATTGGTGGTAATGTTCAAAGCATTA
ATATTTACTGAATTTTTTATTACAGTTGAGATTTAGCTAATTCGATTTTAAATGCTAGTTTCGATAAAAATAAAATTACT
TGAGAACCTTTTTCAGAAATTAATTTAGATAAATTATTAAAGAAAATAGGAAAAATTTTTGGAAAAGAAGCTAATTTACC
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ATGATTATTAAATATTCTTATTGCTACACCGCTTTCTTTTGGAATTATTCATATTTATAAATTAGCAATCTTTGCTGCTT
TTAATATTGTTTTAGTAGCTTCTATCCCTTGATGAATCTTTGTAATTAGTTATGGTTTTGTCGGGATTGTATTATTATTT
GCTTGATTACAAATGTTATATAAAACAAAAAAACTAAATTTACCAAAAGCTTTAAACCAATTTAATAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATTAATACTTGGTTTTAATGGTGAAGGATGGTATAATAATAAAATTATACTGATTTAAATAAACACAAGTTGTACATTT
GTTTTTAGTTTGGAGTTAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAGACGGCCGTAAAGACCGTCTTTTTTTTAATGTTAATTGCTTGTTTTTATTTTTGTAAGATTTTTTTTAAAACATTAA
AAGAAATGGTTGGATTCGCT

Product: efflux ABC transporter, permease protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 2263; Mature: 2263

Protein sequence:

>2263_residues
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AWLQMLYKTKKLNLPKALNQFNN

Sequences:

>Translated_2263_residues
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>Mature_2263_residues
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RLIAIMKVLGMRDFRNVNNFMFIYPIV*LLNILIATPLSFGIIHIYKLAIFAAFNIVLVASIP**IFVISYGFVGIVLLF
A*LQMLYKTKKLNLPKALNQFNN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 259023; Mature: 259023

Theoretical pI: Translated: 9.69; Mature: 9.69

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
1.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
1.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKMFLLMKNMMRLFFKNKTLVTQLSILMIVSTVVIVATTITVQRLQKSQSDIKKIGLQS
CCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
DFLIDTKEQDNINFNEIDVSNNLVKHNEKLIQLATFNQNILKNSNNYLQLVDNAFHNHNL
CEEEECCCCCCCCCEEEECCCCHHHCCCCEEEEEECCHHHHHCCCCEEEEEHHHHCCCCE
FWPTNVNNQKIDVLNLEGNIDNKINQLKLQTVFFENNKENNQNFANNYDDLVYEYHNSKN
EECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHEECCCC
QLVGFQNLDGGHILFKTPALKSANGNYETTFKINAAIVQKNKPFKSFFNFDKYKELGFKN
CEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHCCHHHHHCCCCC
KSYFTNPVLIKNIDLYSKQVVQTLNDRSNQSIDFKDYQSTFQAIVDTLETNTINKDFYSV
CCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEE
NLHVDFNTLSTKYLLFANYLKNEGIDKNRYINELKIDNYKQKYLDLFQNQVLIPKELIDD
EEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCEECCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCC
PKKIEEVQKIIAKAKALLIAKIREETNIFYENSQKSALENKNKIRDYEMQLKQINIALQN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEC
SNYSNNELIQLKNEQKVLAANLDQAKFKHFLYNDLIKQDFRSILNNYNIYYRKHESAIYN
CCCCCCCEEEECCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHH
DVKSDSNFIVTNASNPTYTQNGLIAPRNQIDNMVQINEKNKNSQNPNKKFKRIFINDDNS
HHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCC
NKINNFYDLYSNYIKVIQILKNSYEKDPDTDKDLLVEERDYTPINTSLINIYQLPQFFNI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LFNQSELLSIQYLKEMSDYKKYLLQIFEPYQDKEWIFNLKHKDQDGEQVVAIYKNADSNS
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCC
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CCCEEEEEEEEECCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
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PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

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Metal ions: NA

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Specific activity: NA

Km value (mM): NA

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Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7569993 [H]