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The map label for this gene is 170757096

Identifier: 170757096

GI number: 170757096

Start: 3337195

End: 3338619

Strand: Reverse

Name: 170757096

Synonym: CLD_1446

Alternate gene names: NA

Gene position: 3338619-3337195 (Counterclockwise)

Preceding gene: 170756177

Following gene: 170757232

Centisome position: 84.35

GC content: 25.96

Gene sequence:

>1425_bases
ATGAGTGATAGTCCCAAGGAGTTTATAAAAAGATTTATTGGTTTTTCTATGGGGCCAATATTATCGGCTATTATTAGCTT
TTTTACTGTTCCTATAACTACATATTTTGTAGTTCCAACAGAATTTGGAAAAGCTTCTATGTACACAATGGCGTTAAGCA
TTAGTTCAATGTTTATATATTTAGGTATGGATCAATCTTTTACTAGAGAGTTTAATGCAGAGGAAGATAAAAAATCTTTA
TTTTGGAATTCCTTAATTGTACCTTTAATATTTTCACTAATACTAGGAGTTTTTTATATTATTTTGTATAAGCCATTATC
TATGTTAATGATTGATACTGTTGATAGATATATAGTAGTTATTTTGGCATTATCATTACCTTTTGCAGTTATAGATAGAT
TTAACTTATTATTGATAAGAATGGAAGAGAAAGCTAGATTGTATTCTCTTTTTAATGTAATAAGCAAAGTTATAAATGTA
GTAATTTTAGTACCTTATCTTTTATATATAGATAAAAGTTTTAAAGGGATAATAAATGCAGGTTTCGTGTCATTATTTTT
TATGTGTATAGTAGAATGCTTTTTCACAAGAGAATATTGGTTTACTAAATTTAAACTAAATAAAGCTTTAATAAATAAAA
TGTTTAAGTTTGGGTTACCTTTAATACCAGCATACGTAATTGTTTGGTTTTTAAATTCTATGGATAAACTAGCTATGAGA
CAATGGTCTACTTTTCAAGAGATAGGGTTATATTCTGCTGCATTTAAAATTGTTGCGGTAGTAGACATAGTTAAAAGTGC
ATTTTGTACTTTTTGGACTCCAACTGCTTTTAGATGGTATGAGGAAAAGGTAAAAGAGGAAAATTTTATGAAGGTAAGCA
ATATGTTAATGTGCTTTATGAACTTTATGTTTGTAGGTATAGTTTTATTTAAGGATTTAATAATAAAATTATTAGATGCA
AGTTATGCTAGTTCAGCCATTATAGTTCCATTTTTATTATTATTACCTATAATGTATACTGTATCGGAATCTACTTGTTT
AGGAATATCCTTTTCAAGAAAAACATCTTATAATATAATAGTATCATTAATAGCAGCAGTAGTTAATTATATTTTAAATT
ATTTATTAGTTCCAAAGTATGGAGCTTTAGGAGCTTCCATAGCTACAGGAATAGCCTATACAGTATTCTTTTGGGTAAGA
ACACTTATATCAAGAAAGCTATGGTTTAAATTTAAACTAGGATTTTATATATTAAATACAGCATCCATGTTATTGTTAGC
ATCGTTAGATGTGTTGTATAATAATCTTTATATAAATATCGCTATATCTTTATTTATTGTATATATAAATAGAAATGAAG
TTAAATCTATTATATCTTATATTAAGATGTTTTTAAAAGATAGAAAAAATAAAGCCGTTGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATGAGAAGTGTAAAATATCTGTATTTATCTAACTATAATTTAGATGAAATAAAAAATCAATGTAGATTAAGTTTTATTT
TATCTTAGGAGGAAACTAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATTATTTAGGAGGTTAAAAATGGAGTTTAAAATGCCAATTATAGATGTAGAAAAAGATATAAAAAGTAAAAAAGTACAA
TTTGTTATAAAGAGATTTTC

Product: putative polysaccharide transporter

Products: NA

Alternate protein names: Exopolysaccharide Biosynthesis Protein; Exopolysacharide Protein Wzx; Lipopolysaccharide Biosynthesis Protein; Polysaccharide Transporter; Flippase Wzx; Heteropolysaccharide Repeat-Containing Protein; Polysaccharide Biosynthesis Family Protein; Capsule Biosynthesis Repeating Unit Flippase Wzx; O-Antigen Translocase; O-Antigen And Teichoic Acid Export Protein; Multi Anti Extrusion Protein MatE; Polysaccharide Biosynthesis Protein CpsL; Polysaccharide Biosynthesis Related Protein; Capsular Polysaccharide Repeating Unit Transporter CpsL; Cytosol Aminopeptidase; Polysaccharide Biosynthesis Protein Wzx; Lipopolysaccharide Biosynthesis Translocase; Polysaccharide Biosynthesis Protein-Like Protein

Number of amino acids: Translated: 474; Mature: 473

Protein sequence:

>474_residues
MSDSPKEFIKRFIGFSMGPILSAIISFFTVPITTYFVVPTEFGKASMYTMALSISSMFIYLGMDQSFTREFNAEEDKKSL
FWNSLIVPLIFSLILGVFYIILYKPLSMLMIDTVDRYIVVILALSLPFAVIDRFNLLLIRMEEKARLYSLFNVISKVINV
VILVPYLLYIDKSFKGIINAGFVSLFFMCIVECFFTREYWFTKFKLNKALINKMFKFGLPLIPAYVIVWFLNSMDKLAMR
QWSTFQEIGLYSAAFKIVAVVDIVKSAFCTFWTPTAFRWYEEKVKEENFMKVSNMLMCFMNFMFVGIVLFKDLIIKLLDA
SYASSAIIVPFLLLLPIMYTVSESTCLGISFSRKTSYNIIVSLIAAVVNYILNYLLVPKYGALGASIATGIAYTVFFWVR
TLISRKLWFKFKLGFYILNTASMLLLASLDVLYNNLYINIAISLFIVYINRNEVKSIISYIKMFLKDRKNKAVA

Sequences:

>Translated_474_residues
MSDSPKEFIKRFIGFSMGPILSAIISFFTVPITTYFVVPTEFGKASMYTMALSISSMFIYLGMDQSFTREFNAEEDKKSL
FWNSLIVPLIFSLILGVFYIILYKPLSMLMIDTVDRYIVVILALSLPFAVIDRFNLLLIRMEEKARLYSLFNVISKVINV
VILVPYLLYIDKSFKGIINAGFVSLFFMCIVECFFTREYWFTKFKLNKALINKMFKFGLPLIPAYVIVWFLNSMDKLAMR
QWSTFQEIGLYSAAFKIVAVVDIVKSAFCTFWTPTAFRWYEEKVKEENFMKVSNMLMCFMNFMFVGIVLFKDLIIKLLDA
SYASSAIIVPFLLLLPIMYTVSESTCLGISFSRKTSYNIIVSLIAAVVNYILNYLLVPKYGALGASIATGIAYTVFFWVR
TLISRKLWFKFKLGFYILNTASMLLLASLDVLYNNLYINIAISLFIVYINRNEVKSIISYIKMFLKDRKNKAVA
>Mature_473_residues
SDSPKEFIKRFIGFSMGPILSAIISFFTVPITTYFVVPTEFGKASMYTMALSISSMFIYLGMDQSFTREFNAEEDKKSLF
WNSLIVPLIFSLILGVFYIILYKPLSMLMIDTVDRYIVVILALSLPFAVIDRFNLLLIRMEEKARLYSLFNVISKVINVV
ILVPYLLYIDKSFKGIINAGFVSLFFMCIVECFFTREYWFTKFKLNKALINKMFKFGLPLIPAYVIVWFLNSMDKLAMRQ
WSTFQEIGLYSAAFKIVAVVDIVKSAFCTFWTPTAFRWYEEKVKEENFMKVSNMLMCFMNFMFVGIVLFKDLIIKLLDAS
YASSAIIVPFLLLLPIMYTVSESTCLGISFSRKTSYNIIVSLIAAVVNYILNYLLVPKYGALGASIATGIAYTVFFWVRT
LISRKLWFKFKLGFYILNTASMLLLASLDVLYNNLYINIAISLFIVYINRNEVKSIISYIKMFLKDRKNKAVA

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 54682; Mature: 54551

Theoretical pI: Translated: 9.85; Mature: 9.85

Prosite motif: PS00165 DEHYDRATASE_SER_THR

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
4.4 %Met     (Translated Protein)
5.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
4.2 %Met     (Mature Protein)
5.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSDSPKEFIKRFIGFSMGPILSAIISFFTVPITTYFVVPTEFGKASMYTMALSISSMFIY
CCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHEE
LGMDQSFTREFNAEEDKKSLFWNSLIVPLIFSLILGVFYIILYKPLSMLMIDTVDRYIVV
ECCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILALSLPFAVIDRFNLLLIRMEEKARLYSLFNVISKVINVVILVPYLLYIDKSFKGIINA
HHHHHHHHHHHHCHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GFVSLFFMCIVECFFTREYWFTKFKLNKALINKMFKFGLPLIPAYVIVWFLNSMDKLAMR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QWSTFQEIGLYSAAFKIVAVVDIVKSAFCTFWTPTAFRWYEEKVKEENFMKVSNMLMCFM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NFMFVGIVLFKDLIIKLLDASYASSAIIVPFLLLLPIMYTVSESTCLGISFSRKTSYNII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHH
VSLIAAVVNYILNYLLVPKYGALGASIATGIAYTVFFWVRTLISRKLWFKFKLGFYILNT
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ASMLLLASLDVLYNNLYINIAISLFIVYINRNEVKSIISYIKMFLKDRKNKAVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SDSPKEFIKRFIGFSMGPILSAIISFFTVPITTYFVVPTEFGKASMYTMALSISSMFIY
CCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHEE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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA