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The map label for this gene is ypnP [H]

Identifier: 170756831

GI number: 170756831

Start: 2081583

End: 2082905

Strand: Reverse

Name: ypnP [H]

Synonym: CLD_2677

Alternate gene names: 170756831

Gene position: 2082905-2081583 (Counterclockwise)

Preceding gene: 170754455

Following gene: 170756118

Centisome position: 52.62

GC content: 29.1

Gene sequence:

>1323_bases
ATGAGTAGCACAACTAAAGATTTAACTAAGGGATCTCCTTTAAAAGTAATACTTAAGTTTTCATTACCTATGATAGTAGG
AAATATATTTCAGCAATTATATAATGTTGTAGATTCAATAATAGTAGGGAAATTTATAGGTACAAAGGCTTTAGCCGCTG
TAGGCTCTTCCTTTGCTATTATGGTTTTTATAACATCCATTTTACTGGGATTATGCATGGGTACTTCTATTGTGTTTTCA
CAATTTTTTGGGGGAAAAAAGATAAATAAGTTAAAGGCTAGTATATCTACATCCTTTATTTTTATAGGAATTACTTCAAT
TATAATAAGTGCATTATCCTTAATATTTGTAGATCAGATTATTTTATTTATGAAAATTCCTAAAGAGTTATTTGTAGATA
CTAGAAGTTATCTTAAGATAATATTTAGTGGTATATTTTTTACATTTTTATATAATTGGGCGGCAGGTCTTTTAAGGGCT
CTTGGAAATTCTAAAGTCCCATTATATTTTTTGATTTTAGCTGCTATTATAAACATAGTATTAGATCTTGTATTTGTAAT
TACTTTTAATATGGGGGTATCTGGGGCGGCTCTAGCTACAGTTATTGCCCAATTTGTTTCGGCTATTTTGTGTATTGTAT
ATTGTATAAAAAAGCTAGATTTCTTAGAGTTTAAACTAAGTGAAATTAAATTTGATAAAGAAATATTTAAGTTAACTGCC
AGTTATTCCATGCTTACATCAATACAACAATCTATTATGAATTTTGGAATATTAATGATACAGGGATTGGTAAATTCCTT
TGGTATAGCGCCTATGGCAGCCTTTGCGGCAGCAGTTAAGATTGATTCCTTTGCTTATATGCCTGTACAAGACTTTGGAA
ATGCTTTCTCTACTTATATTGCCCAAAACAAAGGAGCAGAGAAAGATGAAAGAATCAAAAGTGGTATCAAAGTATCTTTA
AAGATTATAACTATATTTTGTATTTTTATATCTTTAGTTGTATGGATTATGGCAGATAAATTTATGTTAATATTTATAAA
TCCTACAGAAACTCAGGTTATAAAAATAGGAATACAGTATTTACGAATTGTATGTACATTTTATTGTTTCATAGGTTACT
TATTTATGTTTTATGGTTTATATAGAGGTTTAGGTAAGGTTAAAATGTCCATAGTTTTGACAATAATATCCCTTGGTCTC
AGAGTGGCCCTTGCTTTTATTACAGCTCCTTATTTAGGATTAAAGGGAATTTGGTGGGCAATTCCTATAGGGTGGATTAT
AGCAGATATAGTAGGAATGATATATTATAGATCTATTAGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGTTATGAGATTTAATACACATTATTGTAAGGACAAGCTTCTTTTGCCAGATCTTACCCTAGGGAATTTTGATTTATAC
ATTAAATTTGGAGAAGAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTTAAATTTTTATAGGGCTTAAAAATAAAATGCTCCAAAATGGAACGAAAATTATAAATTTAATAGATTTATAAAAAAA
TTATATAAAAATGTGTTATA

Product: MATE efflux family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 440; Mature: 439

Protein sequence:

>440_residues
MSSTTKDLTKGSPLKVILKFSLPMIVGNIFQQLYNVVDSIIVGKFIGTKALAAVGSSFAIMVFITSILLGLCMGTSIVFS
QFFGGKKINKLKASISTSFIFIGITSIIISALSLIFVDQIILFMKIPKELFVDTRSYLKIIFSGIFFTFLYNWAAGLLRA
LGNSKVPLYFLILAAIINIVLDLVFVITFNMGVSGAALATVIAQFVSAILCIVYCIKKLDFLEFKLSEIKFDKEIFKLTA
SYSMLTSIQQSIMNFGILMIQGLVNSFGIAPMAAFAAAVKIDSFAYMPVQDFGNAFSTYIAQNKGAEKDERIKSGIKVSL
KIITIFCIFISLVVWIMADKFMLIFINPTETQVIKIGIQYLRIVCTFYCFIGYLFMFYGLYRGLGKVKMSIVLTIISLGL
RVALAFITAPYLGLKGIWWAIPIGWIIADIVGMIYYRSIS

Sequences:

>Translated_440_residues
MSSTTKDLTKGSPLKVILKFSLPMIVGNIFQQLYNVVDSIIVGKFIGTKALAAVGSSFAIMVFITSILLGLCMGTSIVFS
QFFGGKKINKLKASISTSFIFIGITSIIISALSLIFVDQIILFMKIPKELFVDTRSYLKIIFSGIFFTFLYNWAAGLLRA
LGNSKVPLYFLILAAIINIVLDLVFVITFNMGVSGAALATVIAQFVSAILCIVYCIKKLDFLEFKLSEIKFDKEIFKLTA
SYSMLTSIQQSIMNFGILMIQGLVNSFGIAPMAAFAAAVKIDSFAYMPVQDFGNAFSTYIAQNKGAEKDERIKSGIKVSL
KIITIFCIFISLVVWIMADKFMLIFINPTETQVIKIGIQYLRIVCTFYCFIGYLFMFYGLYRGLGKVKMSIVLTIISLGL
RVALAFITAPYLGLKGIWWAIPIGWIIADIVGMIYYRSIS
>Mature_439_residues
SSTTKDLTKGSPLKVILKFSLPMIVGNIFQQLYNVVDSIIVGKFIGTKALAAVGSSFAIMVFITSILLGLCMGTSIVFSQ
FFGGKKINKLKASISTSFIFIGITSIIISALSLIFVDQIILFMKIPKELFVDTRSYLKIIFSGIFFTFLYNWAAGLLRAL
GNSKVPLYFLILAAIINIVLDLVFVITFNMGVSGAALATVIAQFVSAILCIVYCIKKLDFLEFKLSEIKFDKEIFKLTAS
YSMLTSIQQSIMNFGILMIQGLVNSFGIAPMAAFAAAVKIDSFAYMPVQDFGNAFSTYIAQNKGAEKDERIKSGIKVSLK
IITIFCIFISLVVWIMADKFMLIFINPTETQVIKIGIQYLRIVCTFYCFIGYLFMFYGLYRGLGKVKMSIVLTIISLGLR
VALAFITAPYLGLKGIWWAIPIGWIIADIVGMIYYRSIS

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790477, Length=426, Percent_Identity=22.5352112676056, Blast_Score=70, Evalue=3e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48771; Mature: 48640

Theoretical pI: Translated: 10.05; Mature: 10.05

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
3.4 %Met     (Mature Protein)
4.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SSTTKDLTKGSPLKVILKFSLPMIVGNIFQQLYNVVDSIIVGKFIGTKALAAVGSSFAI
CCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
MVFITSILLGLCMGTSIVFSQFFGGKKINKLKASISTSFIFIGITSIIISALSLIFVDQI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILFMKIPKELFVDTRSYLKIIFSGIFFTFLYNWAAGLLRALGNSKVPLYFLILAAIINIV
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
LDLVFVITFNMGVSGAALATVIAQFVSAILCIVYCIKKLDFLEFKLSEIKFDKEIFKLTA
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SYSMLTSIQQSIMNFGILMIQGLVNSFGIAPMAAFAAAVKIDSFAYMPVQDFGNAFSTYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCEEECCHHHHHHHHHHHH
AQNKGAEKDERIKSGIKVSLKIITIFCIFISLVVWIMADKFMLIFINPTETQVIKIGIQY
HHCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHH
LRIVCTFYCFIGYLFMFYGLYRGLGKVKMSIVLTIISLGLRVALAFITAPYLGLKGIWWA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IPIGWIIADIVGMIYYRSIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]