| Definition | Clostridium botulinum B1 str. Okra, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010516 |
| Length | 3,958,233 |
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The map label for this gene is 170755363
Identifier: 170755363
GI number: 170755363
Start: 3343043
End: 3344275
Strand: Reverse
Name: 170755363
Synonym: CLD_1442
Alternate gene names: NA
Gene position: 3344275-3343043 (Counterclockwise)
Preceding gene: 170755005
Following gene: 170756673
Centisome position: 84.49
GC content: 24.9
Gene sequence:
>1233_bases ATGGAAAGTTTAAGTAATATTATTACATATTTAATTTGTTCTTATATATTTATTTTGCCTATTTTACCAAGTAAGTATAA ATATAAGAATATTCCTTTTAATGGGGATGTTGTGTTGCTATTAATCATAATTTCGTTTATTATATTTATATTTATAAATG GTGAATGGAGAAAAAATTTTTTTAATGGTATGAAAGATTTTTTTTGTAAAGCAAATACTATATTTATTTTTATGTGGGTA GGCATGATGGTTGTATCCATTTCTTATTCACCTGATAAGAAATTAGCTTTACAAGAAACCATAAGAACTAGTACGTATAT AGTATTATTTTTTATAATAAAATATGAAGTTTATAAAAAGAAATATTTAGATAAAATTATTTATTCATATATATTTACTT CAATTATTGTAGGATTTATAGGAATATACGAATATTTAAAAGGGATTGGATTGACTCATAAAGGTGAGTTTAGTACAGTA GTAAGATGCGTATCTACCTTAGAGAATTCTAATAATTTGGGAGGGTTTTTTATAATGATAGTATTTCCTATGATGGTACT ATCATTTAAAGAAAAACAAAAATGCAAAAGAAATGTATATATTCTATGCTCAATTATAGCTATTATAAATATAATAATAT CTTTTTCACGAAATGCTTGGTTAGCATTTGTAATAGGATACATGGTATTAATAATTGTATTTAATTTTAAGCTAATATAT GGAGCTATACTGGGAGCTGGAGTGTCCTTATTTATACCTAAAATATCTAATAGATTAAGAGAAATTGGAGATGTAAGTCA GAATTTATCTAGAATTAGTTTATGGAAAATAGCTTGGGAAATGGTAAAAGACAAGCCATTATTAGGTGTAGGAAATGGGA ATTATAGAACCTTATACCCGCAATACTATAAAAAAGTTAAATATTTAGGATATACAGCTCAAGCAAAATTTCATCCACAT AATGCTTATCTAAAAGCTCAATGTGAATTAGGGATAATGGGATTAATATCGTTGCTTGGTATTTTTGTAAGTTCCGTATG GAAGGTAAGTGAATTATCTAAGAAATCAAATAATACATTTTATAAATATTTTTACAAAGGTTTTATTGCTTCTTTAATAG CTTTTATGTTCATGAATTTTATAGATAATTTCTTTTCAGCACCTAAAGTTATAGCCTTTTTTTGGATAAGTTTAGCTGTA GCTGATTCTTTTGAGTATAATTGTAAAATTTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGTTAAAATTAAAGAATAGTTAATACCTCTATATAAATAGATTGAATATAATTGTTCACTGTTGTTATTTCTATAATCTT TAGTTTAAGGGGACATACTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TCTTTGTAAAAAGGAGTTATAAAAACTCCTTTTTTAATGTAATAGGTGAGTCGGTACAAGCAAAAGATTATTTCGTTATT AATTAAGATTTTATGGCTGA
Product: exopolysaccharide biosynthesis family protein
Products: NA
Alternate protein names: ExoQ Family Exopolysaccharide Biosynthesis Membrane Protein; Exopolysaccharide Biosynthesis Family Protein
Number of amino acids: Translated: 410; Mature: 410
Protein sequence:
>410_residues MESLSNIITYLICSYIFILPILPSKYKYKNIPFNGDVVLLLIIISFIIFIFINGEWRKNFFNGMKDFFCKANTIFIFMWV GMMVVSISYSPDKKLALQETIRTSTYIVLFFIIKYEVYKKKYLDKIIYSYIFTSIIVGFIGIYEYLKGIGLTHKGEFSTV VRCVSTLENSNNLGGFFIMIVFPMMVLSFKEKQKCKRNVYILCSIIAIINIIISFSRNAWLAFVIGYMVLIIVFNFKLIY GAILGAGVSLFIPKISNRLREIGDVSQNLSRISLWKIAWEMVKDKPLLGVGNGNYRTLYPQYYKKVKYLGYTAQAKFHPH NAYLKAQCELGIMGLISLLGIFVSSVWKVSELSKKSNNTFYKYFYKGFIASLIAFMFMNFIDNFFSAPKVIAFFWISLAV ADSFEYNCKI
Sequences:
>Translated_410_residues MESLSNIITYLICSYIFILPILPSKYKYKNIPFNGDVVLLLIIISFIIFIFINGEWRKNFFNGMKDFFCKANTIFIFMWV GMMVVSISYSPDKKLALQETIRTSTYIVLFFIIKYEVYKKKYLDKIIYSYIFTSIIVGFIGIYEYLKGIGLTHKGEFSTV VRCVSTLENSNNLGGFFIMIVFPMMVLSFKEKQKCKRNVYILCSIIAIINIIISFSRNAWLAFVIGYMVLIIVFNFKLIY GAILGAGVSLFIPKISNRLREIGDVSQNLSRISLWKIAWEMVKDKPLLGVGNGNYRTLYPQYYKKVKYLGYTAQAKFHPH NAYLKAQCELGIMGLISLLGIFVSSVWKVSELSKKSNNTFYKYFYKGFIASLIAFMFMNFIDNFFSAPKVIAFFWISLAV ADSFEYNCKI >Mature_410_residues MESLSNIITYLICSYIFILPILPSKYKYKNIPFNGDVVLLLIIISFIIFIFINGEWRKNFFNGMKDFFCKANTIFIFMWV GMMVVSISYSPDKKLALQETIRTSTYIVLFFIIKYEVYKKKYLDKIIYSYIFTSIIVGFIGIYEYLKGIGLTHKGEFSTV VRCVSTLENSNNLGGFFIMIVFPMMVLSFKEKQKCKRNVYILCSIIAIINIIISFSRNAWLAFVIGYMVLIIVFNFKLIY GAILGAGVSLFIPKISNRLREIGDVSQNLSRISLWKIAWEMVKDKPLLGVGNGNYRTLYPQYYKKVKYLGYTAQAKFHPH NAYLKAQCELGIMGLISLLGIFVSSVWKVSELSKKSNNTFYKYFYKGFIASLIAFMFMNFIDNFFSAPKVIAFFWISLAV ADSFEYNCKI
Specific function: Unknown
COG id: COG3307
COG function: function code M; Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 47419; Mature: 47419
Theoretical pI: Translated: 9.97; Mature: 9.97
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.7 %Cys (Translated Protein) 3.2 %Met (Translated Protein) 4.9 %Cys+Met (Translated Protein) 1.7 %Cys (Mature Protein) 3.2 %Met (Mature Protein) 4.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MESLSNIITYLICSYIFILPILPSKYKYKNIPFNGDVVLLLIIISFIIFIFINGEWRKNF CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH FNGMKDFFCKANTIFIFMWVGMMVVSISYSPDKKLALQETIRTSTYIVLFFIIKYEVYKK HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KYLDKIIYSYIFTSIIVGFIGIYEYLKGIGLTHKGEFSTVVRCVSTLENSNNLGGFFIMI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH VFPMMVLSFKEKQKCKRNVYILCSIIAIINIIISFSRNAWLAFVIGYMVLIIVFNFKLIY HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GAILGAGVSLFIPKISNRLREIGDVSQNLSRISLWKIAWEMVKDKPLLGVGNGNYRTLYP HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCEEECH QYYKKVKYLGYTAQAKFHPHNAYLKAQCELGIMGLISLLGIFVSSVWKVSELSKKSNNTF HHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH YKYFYKGFIASLIAFMFMNFIDNFFSAPKVIAFFWISLAVADSFEYNCKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MESLSNIITYLICSYIFILPILPSKYKYKNIPFNGDVVLLLIIISFIIFIFINGEWRKNF CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH FNGMKDFFCKANTIFIFMWVGMMVVSISYSPDKKLALQETIRTSTYIVLFFIIKYEVYKK HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KYLDKIIYSYIFTSIIVGFIGIYEYLKGIGLTHKGEFSTVVRCVSTLENSNNLGGFFIMI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH VFPMMVLSFKEKQKCKRNVYILCSIIAIINIIISFSRNAWLAFVIGYMVLIIVFNFKLIY HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GAILGAGVSLFIPKISNRLREIGDVSQNLSRISLWKIAWEMVKDKPLLGVGNGNYRTLYP HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCEEECH QYYKKVKYLGYTAQAKFHPHNAYLKAQCELGIMGLISLLGIFVSSVWKVSELSKKSNNTF HHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH YKYFYKGFIASLIAFMFMNFIDNFFSAPKVIAFFWISLAVADSFEYNCKI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA