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The map label for this gene is 167622658

Identifier: 167622658

GI number: 167622658

Start: 887471

End: 889999

Strand: Reverse

Name: 167622658

Synonym: Shal_0718

Alternate gene names: NA

Gene position: 889999-887471 (Counterclockwise)

Preceding gene: 167622659

Following gene: 167622657

Centisome position: 17.03

GC content: 49.94

Gene sequence:

>2529_bases
ATGAGTAGCCTAGCGGGACAGGAGCTGTGGCTTACGATGCGTTTAACTCTGAGCGTATTTATGCGCCACTATCTAAAATC
CCCACTGCAAGCTGGAGCTATTTTACTCGGCATCATTTTGGCGGTCACTCTACTTATTGGGGTCAGAGCCACCAATGAAA
ATGCGGTGCGCAGTTACTCCGAGGCGACCGAGCTCCTAAGCCAAAGAGCGCAACTGCTACTCACGCCTCTGAGCGGTAAC
AAATCAATTGAGGAATCGGTTTATTTCACCCTGAAACAAGCCGGTATAGCCCAAACGTTAGCCGTTTTAACTGGCACTGT
CACCGACGATAGAGGTCAGCGCTGGGATATCCAAGCGAGCGATCTTGTTGCCGCCTTATCGATACAAACTAAGGGCTCAT
CTACAGGTAGCGAACAGCAGAAAGCCGCGTTATTTTCAGAAAAACTCCCCCTCGCCAAACTGTTATCGGGCGAACCTATC
ATCCTAATGAGTCAAAGCCTTGCGGCGAAGGTCGCCCCTCAAGCAAAAATGCGGCTATATGGCATCTCCCTTAAGGTGAT
TTCATTAGACGATGATCTTGGACTCGGCAATGCTATTCTAATGGATATCTCACTCGGGCAAAGACTGCTAAATCAAACAG
GAGAGCTCAGTTATATCGCCCTGTTTGGCGATCCAGATAACTTAACGGAGCAGATCTACCGAGCCTTTAATCAGCAAACG
AGTAAGCACTTTGAATTGACCCCTCAAGATGGCGGCGAAAGCCTGACGAGTCTCACTCGCAGCTTTCACCTAAATTTGAG
CGCAATGAGCCTACTGGCATTTATTGTCGGGTTATTTATTGCTTATAACGGCGTGCGCTACAGCCTATTGAAACGCCAGA
AACTATTGGTACAACTGCAACAGCAAGGCATACCACAACGAGCCTTGTTGCTGGCACTGTTACTTGAGCTACTCGCCTTG
GTGCTAGTGGGGTCTATGGCCGGGTTTATTCTTGGCTTGCAGTTAAGTCACTGGCTACAGCCGATGATTGCACTGACACT
CGAGCAGCTTTACGGTGCAAGGCTGATGCCTGGAGTCTGGCAGTGGAGCTGGCTATATCAGGCGATTGGACTCACTTTTG
TTGCGGCTCTACTTGCCTGTTATCCACTGTTTAACAGCTTAGCTAAACAGCCGCTGGCTCGAAGTGCCAGCCGATTCGAA
CTACAGAGTCATGCAAGAAGACAACACCTAAGACTCTTTATCATTGCGATAATACTGCTCGTTATTGCCGCGGGACTATT
TCCACTGACACTGGAATACCAACAAAGCCTCGTCCTGCTAGGCGTGGTTACCATCGCAATTCCACTACTACTGCCACAGG
TGTTGCATGTGGGATTATCCCTTGTCGAGCGAATCACTCCTGCAGGACTGTGGCAATACGGCGTGGCAGAAAGCAAAGAG
ATTATCGGCCCGCTTTCTCTCGCCATGATGGCAATGCTATTGGCGCTGACCGCCAACATCTCCATGAACACCTTAGTTGG
CAGTTTCGAAATCACCTTAAAACATTGGCTCGATGACAGGCTCTATGCCGACCTGTATATCCGCCCTCCAAGCGACAAAG
TGGTCGAAACTAAAGCCTTACTGGCAAGTTTACCCGATGTCAGTGCTATCTATGGTCAGTGGCTACACACGAGCCATTAT
CAAAACGATCCTGTGAGCTTAATGACCCGCGATACGCACTCGCTGCGAAACAGTAATCAGATAAAGGCTCAATCGAGCGA
TCATTGGCAAGAATTCTTTAATGGTAAGACACTGATGATCAGTGAACCGATGGCGATTAAGTACCGCCTCAATATTGGCG
ATAAGATCTCACTGACAGAGTTTGAAAGAGCCTCGCTACCTCCTCTGCCTATTGGGGCCATTTTTTATGACTACGGCAAT
CCCACAGGCCAAGTGATTGTCAGCCAAACCACTTGGCAACAGCTGGGCTTGCCAGCCGCTCCTAGCAGCATTGCCGCCGA
TTACGATAAGCAGATCGGTGAACTTGAATCGATACTGCAAACTCAGCTGTCGCTGTCTGCCGCGCAGATGTATAGCCAAA
CTAAAATCAAGCTTCGTGCACTGCAGATCTTTAAGCGCACCTTTTCCATTACCTTAGTACTCAATAGCCTCACCTTACTG
GTTGCCGCCATCGGTCTATTTAGCGCCTGCTTGATGTTGACCCAAGCTAGGCAAGCCCCCCTAGCAAGGCTCTATGCTCT
GGGAGTGAGTCGAATCCAGCTGCGCACTATGGTTTCAGGGCAGATGTTACTGATCGTGCTATTCACCTGCTTGCTTGCCC
TGCCAACGGGAGCCTTACTCGGTTACCTGCTGATTAATAAAGTCACCCTACAGGCCTTTGGCTGGAGTATCGCAATGGTG
TGGGACTGGTACGCCTATTTCCGAATGTTAGTCATCGCCATGATCGTCAGCGCCGTCGCGGTGATCTTGCCGCTGCTGTG
GCAGACCCGGCGTCCATTGAACAGTCGCTTGCAACAGGAGGCGCTATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTCGCTAGAGAATCTAATACCGCAATCTTAATGGTCACCCACAGCAGTGAGTGCGCCGCCTTTATGAAAAGGCGCTGGCA
CCTCGAAAAGGGTAAGATCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAACGTTTTACCGTTTAGCTCTACTATTTCTGCTTAGCGGCTGCGACTCTGAACCAAACTCGTTATCTACTGGTATGGGA
CAACTGCTCGATGGCAATAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 842; Mature: 841

Protein sequence:

>842_residues
MSSLAGQELWLTMRLTLSVFMRHYLKSPLQAGAILLGIILAVTLLIGVRATNENAVRSYSEATELLSQRAQLLLTPLSGN
KSIEESVYFTLKQAGIAQTLAVLTGTVTDDRGQRWDIQASDLVAALSIQTKGSSTGSEQQKAALFSEKLPLAKLLSGEPI
ILMSQSLAAKVAPQAKMRLYGISLKVISLDDDLGLGNAILMDISLGQRLLNQTGELSYIALFGDPDNLTEQIYRAFNQQT
SKHFELTPQDGGESLTSLTRSFHLNLSAMSLLAFIVGLFIAYNGVRYSLLKRQKLLVQLQQQGIPQRALLLALLLELLAL
VLVGSMAGFILGLQLSHWLQPMIALTLEQLYGARLMPGVWQWSWLYQAIGLTFVAALLACYPLFNSLAKQPLARSASRFE
LQSHARRQHLRLFIIAIILLVIAAGLFPLTLEYQQSLVLLGVVTIAIPLLLPQVLHVGLSLVERITPAGLWQYGVAESKE
IIGPLSLAMMAMLLALTANISMNTLVGSFEITLKHWLDDRLYADLYIRPPSDKVVETKALLASLPDVSAIYGQWLHTSHY
QNDPVSLMTRDTHSLRNSNQIKAQSSDHWQEFFNGKTLMISEPMAIKYRLNIGDKISLTEFERASLPPLPIGAIFYDYGN
PTGQVIVSQTTWQQLGLPAAPSSIAADYDKQIGELESILQTQLSLSAAQMYSQTKIKLRALQIFKRTFSITLVLNSLTLL
VAAIGLFSACLMLTQARQAPLARLYALGVSRIQLRTMVSGQMLLIVLFTCLLALPTGALLGYLLINKVTLQAFGWSIAMV
WDWYAYFRMLVIAMIVSAVAVILPLLWQTRRPLNSRLQQEAL

Sequences:

>Translated_842_residues
MSSLAGQELWLTMRLTLSVFMRHYLKSPLQAGAILLGIILAVTLLIGVRATNENAVRSYSEATELLSQRAQLLLTPLSGN
KSIEESVYFTLKQAGIAQTLAVLTGTVTDDRGQRWDIQASDLVAALSIQTKGSSTGSEQQKAALFSEKLPLAKLLSGEPI
ILMSQSLAAKVAPQAKMRLYGISLKVISLDDDLGLGNAILMDISLGQRLLNQTGELSYIALFGDPDNLTEQIYRAFNQQT
SKHFELTPQDGGESLTSLTRSFHLNLSAMSLLAFIVGLFIAYNGVRYSLLKRQKLLVQLQQQGIPQRALLLALLLELLAL
VLVGSMAGFILGLQLSHWLQPMIALTLEQLYGARLMPGVWQWSWLYQAIGLTFVAALLACYPLFNSLAKQPLARSASRFE
LQSHARRQHLRLFIIAIILLVIAAGLFPLTLEYQQSLVLLGVVTIAIPLLLPQVLHVGLSLVERITPAGLWQYGVAESKE
IIGPLSLAMMAMLLALTANISMNTLVGSFEITLKHWLDDRLYADLYIRPPSDKVVETKALLASLPDVSAIYGQWLHTSHY
QNDPVSLMTRDTHSLRNSNQIKAQSSDHWQEFFNGKTLMISEPMAIKYRLNIGDKISLTEFERASLPPLPIGAIFYDYGN
PTGQVIVSQTTWQQLGLPAAPSSIAADYDKQIGELESILQTQLSLSAAQMYSQTKIKLRALQIFKRTFSITLVLNSLTLL
VAAIGLFSACLMLTQARQAPLARLYALGVSRIQLRTMVSGQMLLIVLFTCLLALPTGALLGYLLINKVTLQAFGWSIAMV
WDWYAYFRMLVIAMIVSAVAVILPLLWQTRRPLNSRLQQEAL
>Mature_841_residues
SSLAGQELWLTMRLTLSVFMRHYLKSPLQAGAILLGIILAVTLLIGVRATNENAVRSYSEATELLSQRAQLLLTPLSGNK
SIEESVYFTLKQAGIAQTLAVLTGTVTDDRGQRWDIQASDLVAALSIQTKGSSTGSEQQKAALFSEKLPLAKLLSGEPII
LMSQSLAAKVAPQAKMRLYGISLKVISLDDDLGLGNAILMDISLGQRLLNQTGELSYIALFGDPDNLTEQIYRAFNQQTS
KHFELTPQDGGESLTSLTRSFHLNLSAMSLLAFIVGLFIAYNGVRYSLLKRQKLLVQLQQQGIPQRALLLALLLELLALV
LVGSMAGFILGLQLSHWLQPMIALTLEQLYGARLMPGVWQWSWLYQAIGLTFVAALLACYPLFNSLAKQPLARSASRFEL
QSHARRQHLRLFIIAIILLVIAAGLFPLTLEYQQSLVLLGVVTIAIPLLLPQVLHVGLSLVERITPAGLWQYGVAESKEI
IGPLSLAMMAMLLALTANISMNTLVGSFEITLKHWLDDRLYADLYIRPPSDKVVETKALLASLPDVSAIYGQWLHTSHYQ
NDPVSLMTRDTHSLRNSNQIKAQSSDHWQEFFNGKTLMISEPMAIKYRLNIGDKISLTEFERASLPPLPIGAIFYDYGNP
TGQVIVSQTTWQQLGLPAAPSSIAADYDKQIGELESILQTQLSLSAAQMYSQTKIKLRALQIFKRTFSITLVLNSLTLLV
AAIGLFSACLMLTQARQAPLARLYALGVSRIQLRTMVSGQMLLIVLFTCLLALPTGALLGYLLINKVTLQAFGWSIAMVW
DWYAYFRMLVIAMIVSAVAVILPLLWQTRRPLNSRLQQEAL

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 92987; Mature: 92856

Theoretical pI: Translated: 9.56; Mature: 9.56

Prosite motif: PS00213 LIPOCALIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSSLAGQELWLTMRLTLSVFMRHYLKSPLQAGAILLGIILAVTLLIGVRATNENAVRSYS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
EATELLSQRAQLLLTPLSGNKSIEESVYFTLKQAGIAQTLAVLTGTVTDDRGQRWDIQAS
HHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCCHH
DLVAALSIQTKGSSTGSEQQKAALFSEKLPLAKLLSGEPIILMSQSLAAKVAPQAKMRLY
HHHEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCEEEECCHHHHHCCCCHHEEEE
GISLKVISLDDDLGLGNAILMDISLGQRLLNQTGELSYIALFGDPDNLTEQIYRAFNQQT
EEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCC
SKHFELTPQDGGESLTSLTRSFHLNLSAMSLLAFIVGLFIAYNGVRYSLLKRQKLLVQLQ
CCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
QQGIPQRALLLALLLELLALVLVGSMAGFILGLQLSHWLQPMIALTLEQLYGARLMPGVW
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH
QWSWLYQAIGLTFVAALLACYPLFNSLAKQPLARSASRFELQSHARRQHLRLFIIAIILL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIAAGLFPLTLEYQQSLVLLGVVTIAIPLLLPQVLHVGLSLVERITPAGLWQYGVAESKE
HHHHCHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCHH
IIGPLSLAMMAMLLALTANISMNTLVGSFEITLKHWLDDRLYADLYIRPPSDKVVETKAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHH
LASLPDVSAIYGQWLHTSHYQNDPVSLMTRDTHSLRNSNQIKAQSSDHWQEFFNGKTLMI
HHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCEEEE
SEPMAIKYRLNIGDKISLTEFERASLPPLPIGAIFYDYGNPTGQVIVSQTTWQQLGLPAA
ECCEEEEEEECCCCEEECCCHHHCCCCCCCCHHEEEECCCCCCCEEEEECCHHHCCCCCC
PSSIAADYDKQIGELESILQTQLSLSAAQMYSQTKIKLRALQIFKRTFSITLVLNSLTLL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VAAIGLFSACLMLTQARQAPLARLYALGVSRIQLRTMVSGQMLLIVLFTCLLALPTGALL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHH
GYLLINKVTLQAFGWSIAMVWDWYAYFRMLVIAMIVSAVAVILPLLWQTRRPLNSRLQQE
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
AL
CC
>Mature Secondary Structure 
SSLAGQELWLTMRLTLSVFMRHYLKSPLQAGAILLGIILAVTLLIGVRATNENAVRSYS
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
EATELLSQRAQLLLTPLSGNKSIEESVYFTLKQAGIAQTLAVLTGTVTDDRGQRWDIQAS
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DLVAALSIQTKGSSTGSEQQKAALFSEKLPLAKLLSGEPIILMSQSLAAKVAPQAKMRLY
HHHEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCEEEECCHHHHHCCCCHHEEEE
GISLKVISLDDDLGLGNAILMDISLGQRLLNQTGELSYIALFGDPDNLTEQIYRAFNQQT
EEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCC
SKHFELTPQDGGESLTSLTRSFHLNLSAMSLLAFIVGLFIAYNGVRYSLLKRQKLLVQLQ
CCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
QQGIPQRALLLALLLELLALVLVGSMAGFILGLQLSHWLQPMIALTLEQLYGARLMPGVW
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH
QWSWLYQAIGLTFVAALLACYPLFNSLAKQPLARSASRFELQSHARRQHLRLFIIAIILL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIAAGLFPLTLEYQQSLVLLGVVTIAIPLLLPQVLHVGLSLVERITPAGLWQYGVAESKE
HHHHCHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCHH
IIGPLSLAMMAMLLALTANISMNTLVGSFEITLKHWLDDRLYADLYIRPPSDKVVETKAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHH
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HHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCEEEE
SEPMAIKYRLNIGDKISLTEFERASLPPLPIGAIFYDYGNPTGQVIVSQTTWQQLGLPAA
ECCEEEEEEECCCCEEECCCHHHCCCCCCCCHHEEEECCCCCCCEEEEECCHHHCCCCCC
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CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHH
GYLLINKVTLQAFGWSIAMVWDWYAYFRMLVIAMIVSAVAVILPLLWQTRRPLNSRLQQE
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
AL
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA