| Definition | Chlamydophila pneumoniae AR39, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002179 |
| Length | 1,229,853 |
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Identifier: 16752314
GI number: 16752314
Start: 28270
End: 30708
Strand: Direct
Name: Not Available
Synonym: CP0020
Alternate gene names: NA
Gene position: 28270-30708 (Clockwise)
Preceding gene: 16752312
Following gene: 16752315
Centisome position: 2.3
GC content: 41.37
Gene sequence:
>2439_bases ATGCATTCTTTTGCACAAAGACACAGGGAATCTTTAGAACATATCGCTAATTATGAGAAGACTACAGCGGAACGTGACAT ACTAAAACGGTTGATCGAAGTTTTGGATCAGAGGGCGAGCGAGCGCTACCGCTCTGCCGTCGAGAAGCTACACAAATATG AAGTGGAGCGTGCGACAGTAGCGAAGTCTATTCCTGTGGCAGCCATTCATGAGAAACCTCTTTCCTCTACACATGCATCT GTTCAGGTTACAGCAAGTACGCCAGCAGCTACAGGATCTGGAGTCGGGGCCTATTATAACGCAGTAAAACAGAAGTGGGC GCAAGATCTTATCGTTGAGCTTAATACGGTTATGACCACTATCATGGCCTCAGTTAATAGTAAGAATCCTGCAAATAAAG ATGTCTTTGATAAATTAAATACTGAACTTCAGGCTTTAGTCGCTGCGGGGAATAATTTAACAGAAGAGAATTTTCAGACT CTCTACAATTTCCCAGAGGAGATCTTCACTGCAATCCAACGAGCAGATACGTTTACTGGGGGAATGAAAACAGACTTTAC GAACCAGTTGGCAGGCAAATATGGAAATCAAGCTACTTTAACTCAAACGTTTGCAGACGGTAGAGTCGAAGGGTTCAAAG ACATCCTTACAGCGGTACAAGGAGTCCTTACACCAGAGCAGTTTACTATCTTTGCTGAGATTGCGACAGAGCTGCAGGCT TTAGCAGATCATGTAGGTAATTTTGATGAAGCAGGATTACAACGGATTGAGGATGCTGGAGAAAAACTCGCCGCAGTCAT TAATTCTTCTGACCTGACTAGAAATGATAAAATTATGTTCTGTCAACATATAACAGACTTATACTCAGATCAAGTTGCGG CTTTAGGATCCTTTGATACGGTACTTGATGCAAGTATCTATGTTAACCAGCATCAAGGAACGATGTTTTCCAATTTGTCT AGCTTTGTTGGCTCTTTAATTGGAACTTTTGCTCCAATTGATCTGAGTTCCTCTCAAGGTGATATTAGTAGTGCGGCTTT AGCTGGAGCTCTACAAACAGCCCGAGGGTTAAATTCTCGTTTCAATGAGTTAACTGCTGAGCAACAGAAACTGATTAATG AGTGTATAAAATCTTTGGTTACCTTTAAGTGTGGTGAGCACCTTGGTGCTATCTGGGCTTATTTTACAGCATCTACTGTA GTTGCTTTAAACCCTACTGCAACCATGGACCACGTTAAAGCTGCTATCCTTGAAGAAGCTAAAGAATTAGATAACTCTAG TTTTCAGTTAGCATCATCTATAAAATCCGCGATGACTTCAATTGTAAATTCAAGCGGTTCCTTTTCCGTAACGGTGAACT CAAGTACCTTACAATATACTATATATTCTGAGAAAAACGGCAAAGTTGAGATTAATCAAATCCTGTTAAATTATGGATCT ACAGGATTTTTGCCAGAAATTACGAAACTAGCAAAAACAAACGCCGAATCTACGGCACGAAGTTATTTTCGGTTTAAGGC TCTTGCTGCTGTAGAATCAGAAAATGTACAGAACAAAATCGAAGATCTTCAGAGTCAATTGCAACAATTCACCAATATGA AAACAGAACTGTTTGATGGGCAATTGTTATCACAGGCTAGTGAATTACGGGCTCTCCCCCTACCTTCGGCAGTCGCCTCT GTGTTGATCGATCGTTATATGCCTAAAGAGGTCGATTATCTAAATGAAATCTATAAGAAGCTATATTATAGCAACTTAGG ATCTTCTGTCGGAAATTCCATTATTGATGCGATTTCTCAATATGTCAATGGAGCTACGTATTTCAATTTTGCTAGTTATG TGGGACAACAGCCGGCAGTAGGTGCTGGGGGAGCGAATGCCTTCCCAGGATCTCAAGAAAGCGCTCAGGCAAAGTTGGAT CAGGAGCGAAAGCAAGCTGCTTTGTATCTCCAAGAAACACGGGGAGCTCTTACAGTTATTGAAGAACAAAGAGCTAGAGT GCTTAAAGATGATAAAATCACGAATGAGCAGCGCTCCACGATTTTAGATTCCTTAAGGAACTACGAGGACAACATCAATT CTATCTCAGGTTCTTTAGTGTTATTGCAAAATTACTTACAGCCTTTGTCTATAGCTGGAGGTTCTGTAGCAGGAACTTTT GAAGTTAAAGAGGGGCAAGAGCAATGGCAAGCGCGATTGCAGATTCTTGAAGAAGCTTTAGTGTCCGGGTTAGTAGGAAA TATGATTAATGGGGGTATGTTCCCACTGCAATCTACAATACAGTCAGACCAGCAATCTTTTGCGGATATGGGACAGAACT TCCAGTTAGATTTGCAGATGCACCTGACTTCTATGCAGCAGGAGTGGACTGTAGTCGCGACTTCTCTACAGCTTTTAAAT CAAATGTACTTAAGTTTAGCACGAAGCCTGACAGGATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases GTTAATTAAAAATAACACTGTTCTTATCTAAGCAGACATTGATATGATTTATAGCACTTCTATTTCAACATTTTATAAAA AACTCTCTCTAGTGTCTTCA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTCTTCAATTTCTAAACTTGGATTTCTAAATCTTAAAAAAATTTTAATCTTGCGGAGATGTTGGCATGTTTTTCGCTCCT CTTCTTTATGAATCGTTACG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 812; Mature: 812
Protein sequence:
>812_residues MHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASERYRSAVEKLHKYEVERATVAKSIPVAAIHEKPLSSTHAS VQVTASTPAATGSGVGAYYNAVKQKWAQDLIVELNTVMTTIMASVNSKNPANKDVFDKLNTELQALVAAGNNLTEENFQT LYNFPEEIFTAIQRADTFTGGMKTDFTNQLAGKYGNQATLTQTFADGRVEGFKDILTAVQGVLTPEQFTIFAEIATELQA LADHVGNFDEAGLQRIEDAGEKLAAVINSSDLTRNDKIMFCQHITDLYSDQVAALGSFDTVLDASIYVNQHQGTMFSNLS SFVGSLIGTFAPIDLSSSQGDISSAALAGALQTARGLNSRFNELTAEQQKLINECIKSLVTFKCGEHLGAIWAYFTASTV VALNPTATMDHVKAAILEEAKELDNSSFQLASSIKSAMTSIVNSSGSFSVTVNSSTLQYTIYSEKNGKVEINQILLNYGS TGFLPEITKLAKTNAESTARSYFRFKALAAVESENVQNKIEDLQSQLQQFTNMKTELFDGQLLSQASELRALPLPSAVAS VLIDRYMPKEVDYLNEIYKKLYYSNLGSSVGNSIIDAISQYVNGATYFNFASYVGQQPAVGAGGANAFPGSQESAQAKLD QERKQAALYLQETRGALTVIEEQRARVLKDDKITNEQRSTILDSLRNYEDNINSISGSLVLLQNYLQPLSIAGGSVAGTF EVKEGQEQWQARLQILEEALVSGLVGNMINGGMFPLQSTIQSDQQSFADMGQNFQLDLQMHLTSMQQEWTVVATSLQLLN QMYLSLARSLTG
Sequences:
>Translated_812_residues MHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASERYRSAVEKLHKYEVERATVAKSIPVAAIHEKPLSSTHAS VQVTASTPAATGSGVGAYYNAVKQKWAQDLIVELNTVMTTIMASVNSKNPANKDVFDKLNTELQALVAAGNNLTEENFQT LYNFPEEIFTAIQRADTFTGGMKTDFTNQLAGKYGNQATLTQTFADGRVEGFKDILTAVQGVLTPEQFTIFAEIATELQA LADHVGNFDEAGLQRIEDAGEKLAAVINSSDLTRNDKIMFCQHITDLYSDQVAALGSFDTVLDASIYVNQHQGTMFSNLS SFVGSLIGTFAPIDLSSSQGDISSAALAGALQTARGLNSRFNELTAEQQKLINECIKSLVTFKCGEHLGAIWAYFTASTV VALNPTATMDHVKAAILEEAKELDNSSFQLASSIKSAMTSIVNSSGSFSVTVNSSTLQYTIYSEKNGKVEINQILLNYGS TGFLPEITKLAKTNAESTARSYFRFKALAAVESENVQNKIEDLQSQLQQFTNMKTELFDGQLLSQASELRALPLPSAVAS VLIDRYMPKEVDYLNEIYKKLYYSNLGSSVGNSIIDAISQYVNGATYFNFASYVGQQPAVGAGGANAFPGSQESAQAKLD QERKQAALYLQETRGALTVIEEQRARVLKDDKITNEQRSTILDSLRNYEDNINSISGSLVLLQNYLQPLSIAGGSVAGTF EVKEGQEQWQARLQILEEALVSGLVGNMINGGMFPLQSTIQSDQQSFADMGQNFQLDLQMHLTSMQQEWTVVATSLQLLN QMYLSLARSLTG >Mature_812_residues MHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASERYRSAVEKLHKYEVERATVAKSIPVAAIHEKPLSSTHAS VQVTASTPAATGSGVGAYYNAVKQKWAQDLIVELNTVMTTIMASVNSKNPANKDVFDKLNTELQALVAAGNNLTEENFQT LYNFPEEIFTAIQRADTFTGGMKTDFTNQLAGKYGNQATLTQTFADGRVEGFKDILTAVQGVLTPEQFTIFAEIATELQA LADHVGNFDEAGLQRIEDAGEKLAAVINSSDLTRNDKIMFCQHITDLYSDQVAALGSFDTVLDASIYVNQHQGTMFSNLS SFVGSLIGTFAPIDLSSSQGDISSAALAGALQTARGLNSRFNELTAEQQKLINECIKSLVTFKCGEHLGAIWAYFTASTV VALNPTATMDHVKAAILEEAKELDNSSFQLASSIKSAMTSIVNSSGSFSVTVNSSTLQYTIYSEKNGKVEINQILLNYGS TGFLPEITKLAKTNAESTARSYFRFKALAAVESENVQNKIEDLQSQLQQFTNMKTELFDGQLLSQASELRALPLPSAVAS VLIDRYMPKEVDYLNEIYKKLYYSNLGSSVGNSIIDAISQYVNGATYFNFASYVGQQPAVGAGGANAFPGSQESAQAKLD QERKQAALYLQETRGALTVIEEQRARVLKDDKITNEQRSTILDSLRNYEDNINSISGSLVLLQNYLQPLSIAGGSVAGTF EVKEGQEQWQARLQILEEALVSGLVGNMINGGMFPLQSTIQSDQQSFADMGQNFQLDLQMHLTSMQQEWTVVATSLQLLN QMYLSLARSLTG
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 88903; Mature: 88903
Theoretical pI: Translated: 4.75; Mature: 4.75
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASERYRSAVEKLHKYEVERATV CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AKSIPVAAIHEKPLSSTHASVQVTASTPAATGSGVGAYYNAVKQKWAQDLIVELNTVMTT HHCCCHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IMASVNSKNPANKDVFDKLNTELQALVAAGNNLTEENFQTLYNFPEEIFTAIQRADTFTG HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCC GMKTDFTNQLAGKYGNQATLTQTFADGRVEGFKDILTAVQGVLTPEQFTIFAEIATELQA CCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH LADHVGNFDEAGLQRIEDAGEKLAAVINSSDLTRNDKIMFCQHITDLYSDQVAALGSFDT HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH VLDASIYVNQHQGTMFSNLSSFVGSLIGTFAPIDLSSSQGDISSAALAGALQTARGLNSR HHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FNELTAEQQKLINECIKSLVTFKCGEHLGAIWAYFTASTVVALNPTATMDHVKAAILEEA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH KELDNSSFQLASSIKSAMTSIVNSSGSFSVTVNSSTLQYTIYSEKNGKVEINQILLNYGS HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCEEEEEEEECCCCCEEHHHHHHHCCC TGFLPEITKLAKTNAESTARSYFRFKALAAVESENVQNKIEDLQSQLQQFTNMKTELFDG CCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCC QLLSQASELRALPLPSAVASVLIDRYMPKEVDYLNEIYKKLYYSNLGSSVGNSIIDAISQ HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH YVNGATYFNFASYVGQQPAVGAGGANAFPGSQESAQAKLDQERKQAALYLQETRGALTVI HHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH EEQRARVLKDDKITNEQRSTILDSLRNYEDNINSISGSLVLLQNYLQPLSIAGGSVAGTF HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEE EVKEGQEQWQARLQILEEALVSGLVGNMINGGMFPLQSTIQSDQQSFADMGQNFQLDLQM EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHH HLTSMQQEWTVVATSLQLLNQMYLSLARSLTG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASERYRSAVEKLHKYEVERATV CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AKSIPVAAIHEKPLSSTHASVQVTASTPAATGSGVGAYYNAVKQKWAQDLIVELNTVMTT HHCCCHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IMASVNSKNPANKDVFDKLNTELQALVAAGNNLTEENFQTLYNFPEEIFTAIQRADTFTG HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCC GMKTDFTNQLAGKYGNQATLTQTFADGRVEGFKDILTAVQGVLTPEQFTIFAEIATELQA CCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH LADHVGNFDEAGLQRIEDAGEKLAAVINSSDLTRNDKIMFCQHITDLYSDQVAALGSFDT HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH VLDASIYVNQHQGTMFSNLSSFVGSLIGTFAPIDLSSSQGDISSAALAGALQTARGLNSR HHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FNELTAEQQKLINECIKSLVTFKCGEHLGAIWAYFTASTVVALNPTATMDHVKAAILEEA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH KELDNSSFQLASSIKSAMTSIVNSSGSFSVTVNSSTLQYTIYSEKNGKVEINQILLNYGS HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCEEEEEEEECCCCCEEHHHHHHHCCC TGFLPEITKLAKTNAESTARSYFRFKALAAVESENVQNKIEDLQSQLQQFTNMKTELFDG CCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCC QLLSQASELRALPLPSAVASVLIDRYMPKEVDYLNEIYKKLYYSNLGSSVGNSIIDAISQ HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH YVNGATYFNFASYVGQQPAVGAGGANAFPGSQESAQAKLDQERKQAALYLQETRGALTVI HHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH EEQRARVLKDDKITNEQRSTILDSLRNYEDNINSISGSLVLLQNYLQPLSIAGGSVAGTF HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEE EVKEGQEQWQARLQILEEALVSGLVGNMINGGMFPLQSTIQSDQQSFADMGQNFQLDLQM EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHH HLTSMQQEWTVVATSLQLLNQMYLSLARSLTG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA