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The map label for this gene is siaT [H]

Identifier: 16272114

GI number: 16272114

Start: 162558

End: 164459

Strand: Direct

Name: siaT [H]

Synonym: HI0147

Alternate gene names: 16272114

Gene position: 162558-164459 (Clockwise)

Preceding gene: 16272113

Following gene: 16272115

Centisome position: 8.88

GC content: 37.8

Gene sequence:

>1902_bases
GTGTGCCGTAATGGCCCTACATTCCCTTATTCTTCATCAAACGGAGTGAGTATGAAATATATTAATAAGCTTGAGGAATG
GCTGGGTGGCGCATTATTTATCGCCATTTTCGGTATTCTTATCGCTCAAATTCTTTCACGCCAAGTTTTTCATTCTCCGT
TAATTTGGAGTGAAGAACTCGCCAAGCTCTTATTTGTTTACGTGGGTATGTTGGGTATCAGCGTTGCTGTGAGAAAACAA
GAACACGTATTTATTGATTTTTTAACTAATCTAATGCCCGAAAAAATCAGAAAATTCACAAATACGTTTGTACAATTATT
AGTCTTTATATGTATTTTCTTATTTATTCATTTCGGTATTCGTACTTTTAACGGTGCATCATTCCCTATTGATGCCTTAG
GAGGCATTTCTGAAAAATGGATTTTCGCAGCACTGCCTGTTGTCGCAATATTAATGATGTTTCGCTTTATCCAAGCGCAA
ACCCTAAACTTTAAGACTGGGAAAAGCTATTTACCTGCAACTTTCTTTATCATAAGTGCGGTCATTTTATTTGCGATTTT
ATTTTTCGCGCCAGATTGGTTCAAAGTATTGCGTATTAGCAATTATATAAAACTCGGTTCAAGTTCAGTCTATGTCGCCT
TACTCGTTTGGCTAATCATTATGTTTATCGGTGTCCCTGTAGGTTGGTCCTTATTTATTGCTACTCTACTTTATTTTTCT
ATGACACGTTGGAACGTCGTAAATGCCGCAACTGAAAAATTAGTCTATAGCCTAGACAGCTTCCCATTACTTGCCGTGCC
ATTTTATATTTTAACGGGCATTCTAATGAATACAGGTGGGATTACCGAACGTATTTTTAATTTTGCTAAAGCCTTACTCG
GTCATTACACAGGAGGAATGGGACACGTTAATATCGGCGCAAGTTTATTGTTCTCTGGTATGTCAGGTTCAGCACTTGCT
GATGCGGGGGGCTTAGGTCAATTGGAAATCAAAGCAATGCGTGATGCTGGTTATGACGATGATATTTGCGGAGGAATTAC
TGCTGCTTCTTGTATTATTGGGCCATTAGTTCCGCCAAGTATTGCAATGATTATTTACGGTGTAATTGCCAATGAATCTA
TCGCAAAACTCTTTATTGCAGGTTTTATTCCAGGTGTATTAATTACTTTAGCTTTAATGGCAATGAATTATCGCATTGCA
AAAAAACGAGGTTATCCACGTACACCAAAAGCTACGAGAGAACAACTTTGCAGCAGCTTTAAACAATCTTTTTGGGCAAT
CTTAACGCCGTTATTAATTATCGGTGGTATTTTTTCAGGCTTATTCAGTCCAACAGAATCTGCCATTGTTGCAGCAGCAT
ACTCTGTAATTATTGGTAAATTCGTGTATAAAGAATTAACCTTAAAAAGCTTATTTAATAGTTGCATAGAAGCAATGGCA
ATTACGGGCGTAGTCGCCTTAATGATTATGACCGTGACTTTCTTTGGCGATATGATTGCGCGTGAACAAGTCGCAATGCG
TGTTGCTGATGTGTTTGTTGCCGTTGCCGATTCGCCTTTAACCGTATTGATAATGATTAACGCACTGTTACTTTTTCTTG
GAATGTTCATTGATGCCCTAGCATTACAATTTTTAGTATTACCAATGCTTATTCCTATCGCAATGCAGTTCAATATTGAC
TTAATCTTCTTTGGTGTAATGACCACATTAAATATGATGGTTGGTATTCTTACCCCACCAATGGGAATGGCTCTCTTTGT
TGTTGCTCGTGTAGGAAATATGTCAGTTTCCACGGTAACCAAAGGCGTATTACCGTTCTTGATTCCCGTTTTCGTCACAT
TAGTATTAATCACGATTTTCCCACAAATCATCACATTTGTGCCAAATCTATTGATACCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCAATGAAGCCGTATTATGCTGAGTTTGTAAAACAAACTGGTCAAAAAGGTGAATCAGCTTTAAAACAAATTGAAGCAAT
CAATCCATAATCCCTCTTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAAAAGTGCGGTTGAAAAACATTAAATTTTTTAACCGCACTTTCATCGTTTTCGTAAGTTACATCTGCCGTATCTTACA
ATACAAAAGGGTGCAATAAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: N-acetylneuraminic acid permease; N-acetylneuraminic acid transporter; Neu5Ac permease [H]

Number of amino acids: Translated: 633; Mature: 633

Protein sequence:

>633_residues
MCRNGPTFPYSSSNGVSMKYINKLEEWLGGALFIAIFGILIAQILSRQVFHSPLIWSEELAKLLFVYVGMLGISVAVRKQ
EHVFIDFLTNLMPEKIRKFTNTFVQLLVFICIFLFIHFGIRTFNGASFPIDALGGISEKWIFAALPVVAILMMFRFIQAQ
TLNFKTGKSYLPATFFIISAVILFAILFFAPDWFKVLRISNYIKLGSSSVYVALLVWLIIMFIGVPVGWSLFIATLLYFS
MTRWNVVNAATEKLVYSLDSFPLLAVPFYILTGILMNTGGITERIFNFAKALLGHYTGGMGHVNIGASLLFSGMSGSALA
DAGGLGQLEIKAMRDAGYDDDICGGITAASCIIGPLVPPSIAMIIYGVIANESIAKLFIAGFIPGVLITLALMAMNYRIA
KKRGYPRTPKATREQLCSSFKQSFWAILTPLLIIGGIFSGLFSPTESAIVAAAYSVIIGKFVYKELTLKSLFNSCIEAMA
ITGVVALMIMTVTFFGDMIAREQVAMRVADVFVAVADSPLTVLIMINALLLFLGMFIDALALQFLVLPMLIPIAMQFNID
LIFFGVMTTLNMMVGILTPPMGMALFVVARVGNMSVSTVTKGVLPFLIPVFVTLVLITIFPQIITFVPNLLIP

Sequences:

>Translated_633_residues
MCRNGPTFPYSSSNGVSMKYINKLEEWLGGALFIAIFGILIAQILSRQVFHSPLIWSEELAKLLFVYVGMLGISVAVRKQ
EHVFIDFLTNLMPEKIRKFTNTFVQLLVFICIFLFIHFGIRTFNGASFPIDALGGISEKWIFAALPVVAILMMFRFIQAQ
TLNFKTGKSYLPATFFIISAVILFAILFFAPDWFKVLRISNYIKLGSSSVYVALLVWLIIMFIGVPVGWSLFIATLLYFS
MTRWNVVNAATEKLVYSLDSFPLLAVPFYILTGILMNTGGITERIFNFAKALLGHYTGGMGHVNIGASLLFSGMSGSALA
DAGGLGQLEIKAMRDAGYDDDICGGITAASCIIGPLVPPSIAMIIYGVIANESIAKLFIAGFIPGVLITLALMAMNYRIA
KKRGYPRTPKATREQLCSSFKQSFWAILTPLLIIGGIFSGLFSPTESAIVAAAYSVIIGKFVYKELTLKSLFNSCIEAMA
ITGVVALMIMTVTFFGDMIAREQVAMRVADVFVAVADSPLTVLIMINALLLFLGMFIDALALQFLVLPMLIPIAMQFNID
LIFFGVMTTLNMMVGILTPPMGMALFVVARVGNMSVSTVTKGVLPFLIPVFVTLVLITIFPQIITFVPNLLIP
>Mature_633_residues
MCRNGPTFPYSSSNGVSMKYINKLEEWLGGALFIAIFGILIAQILSRQVFHSPLIWSEELAKLLFVYVGMLGISVAVRKQ
EHVFIDFLTNLMPEKIRKFTNTFVQLLVFICIFLFIHFGIRTFNGASFPIDALGGISEKWIFAALPVVAILMMFRFIQAQ
TLNFKTGKSYLPATFFIISAVILFAILFFAPDWFKVLRISNYIKLGSSSVYVALLVWLIIMFIGVPVGWSLFIATLLYFS
MTRWNVVNAATEKLVYSLDSFPLLAVPFYILTGILMNTGGITERIFNFAKALLGHYTGGMGHVNIGASLLFSGMSGSALA
DAGGLGQLEIKAMRDAGYDDDICGGITAASCIIGPLVPPSIAMIIYGVIANESIAKLFIAGFIPGVLITLALMAMNYRIA
KKRGYPRTPKATREQLCSSFKQSFWAILTPLLIIGGIFSGLFSPTESAIVAAAYSVIIGKFVYKELTLKSLFNSCIEAMA
ITGVVALMIMTVTFFGDMIAREQVAMRVADVFVAVADSPLTVLIMINALLLFLGMFIDALALQFLVLPMLIPIAMQFNID
LIFFGVMTTLNMMVGILTPPMGMALFVVARVGNMSVSTVTKGVLPFLIPVFVTLVLITIFPQIITFVPNLLIP

Specific function: Part of the tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) transport system siaPT involved in the uptake of sialic acid [H]

COG id: COG1593

COG function: function code G; TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: In the C-terminal section; belongs to the TRAP transporter large permease family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI48994950, Length=384, Percent_Identity=36.1979166666667, Blast_Score=222, Evalue=5e-59,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010656
- InterPro:   IPR007387
- InterPro:   IPR004681 [H]

Pfam domain/function: PF06808 DctM; PF04290 DctQ [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69380; Mature: 69380

Theoretical pI: Translated: 9.43; Mature: 9.43

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
4.7 %Met     (Translated Protein)
5.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
4.7 %Met     (Mature Protein)
5.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MCRNGPTFPYSSSNGVSMKYINKLEEWLGGALFIAIFGILIAQILSRQVFHSPLIWSEEL
CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
AKLLFVYVGMLGISVAVRKQEHVFIDFLTNLMPEKIRKFTNTFVQLLVFICIFLFIHFGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RTFNGASFPIDALGGISEKWIFAALPVVAILMMFRFIQAQTLNFKTGKSYLPATFFIISA
HHCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
VILFAILFFAPDWFKVLRISNYIKLGSSSVYVALLVWLIIMFIGVPVGWSLFIATLLYFS
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
MTRWNVVNAATEKLVYSLDSFPLLAVPFYILTGILMNTGGITERIFNFAKALLGHYTGGM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
GHVNIGASLLFSGMSGSALADAGGLGQLEIKAMRDAGYDDDICGGITAASCIIGPLVPPS
CEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
IAMIIYGVIANESIAKLFIAGFIPGVLITLALMAMNYRIAKKRGYPRTPKATREQLCSSF
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
KQSFWAILTPLLIIGGIFSGLFSPTESAIVAAAYSVIIGKFVYKELTLKSLFNSCIEAMA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITGVVALMIMTVTFFGDMIAREQVAMRVADVFVAVADSPLTVLIMINALLLFLGMFIDAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALQFLVLPMLIPIAMQFNIDLIFFGVMTTLNMMVGILTPPMGMALFVVARVGNMSVSTVT
HHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
KGVLPFLIPVFVTLVLITIFPQIITFVPNLLIP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]