Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yoeA [H]

Identifier: 162447628

GI number: 162447628

Start: 804313

End: 805722

Strand: Direct

Name: yoeA [H]

Synonym: ACL_0768

Alternate gene names: 162447628

Gene position: 804313-805722 (Clockwise)

Preceding gene: 162447625

Following gene: 162447637

Centisome position: 53.73

GC content: 32.13

Gene sequence:

>1410_bases
ATGAAAAGATTTTGTAAATATTTTGGCGATAAAGCCTTCTATAAAATGGCATTAGCAATCATAATTCCAGTAGTTATTCA
ACAATTAATTTTAAACCTAGCAGGTCTTATTGATACCTTTATGATCAATGGGTTTTCACAAACAGCATATACCGGTGTAT
CCACAGCTAACAGATTTATGTTTATAATCAACTTCTTTTGGATCGGATTAGCAGCAGGTATTAGTGTGTTTGTTTCACAA
TATTTTGGGGCCAAGAATAAAAAAGGTATTATCGGAACCTTTCAACTAGGTATCTTATTAGCAATCGTTTTTGGTATTTT
TTCTACTTTCTTAATTAATGTATTAGGTCCTGAAATGATAAAAATGTTCTTACCAACAACTGACCCTGAACAAGTTGAGT
CTGTAATGTTTGGTATTGAGTATATTAAGATTATAGGATATGGTGCGATTGTATTTTTATCATCTTTTATGATTGCAACC
TTCTTTAGATCAGTTGGTCGTGCTAAGGCACCATTATTTGCAGGTGTCATTGGTATTGTTGTAAATATGGTTTTAAATAT
GATATTAATATATGGTTTCTTAGGTTTCCCGGCAATGGGTGCGATTGGTGCAGCTTGGGCTACTGTAATATCTAAGATTG
TGGAATTAGTAGTTTTACTTGTGATTGCATTCTTCTATAGTAATGAGAATTATGCTAGAGAAATATTTAAAAAATTCCTA
ATAACAAAACGCTTAGTCATAATGTATATATCAAAGGGTGGTCCAATAATTATAAATGAAATATTATGGTCAATCGCAAT
GGTACTTTATGCAATGTTTATTACTAGTGGTATTTATGAATGGGTAACTGCTTATGGCTACTCACAAAATGCTACAGACA
TCTTCTTTGTATATTACTCAGGTATGGCAACCGCAACAGGGGTAATACTTGGTCAAGCCCTTGGTGAAGGTGATTTTGAA
AATGCAAAAGACTACCTTATCAAACTACGTGCCGTCATGATGGTAACAAATATAGGTATTATGTTATTAATTGTTCTATT
ATCCCCTATAATACTCCTCATGTTTACACCCGTTAACTCGCTTTATTGGTTGGCATATCAGCTGATATTAATAAATGTTA
TCTTCATTGCAATTTATGGCTATAATGTAATGAGTTATTACGCACTAAGAGCTGGAGGCGATTCAATTAGAACATTTTTA
CTAGATCAACTTCCAACATACTTAGTCGGGTTACCTATAGTTATGTTATTAAGTCATTATAGAGTAGAATTAGGTGTGAA
TATTCTAATTATATTCCTTGCAAGTAAGTCAACAGATGTTGTAAAACTCATATTTGCTAGACATATTATTAAAAAAGGGA
CTTGGTTAAATAACTTAACTCTTGATGAAGTCAAAATAAAAACAGCCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAAGGATATCATGTGATTTCTCATAAGATGTGTAGAATGTCTTTATTATTGTATACTTTATGATTATTGTTTGCTACAA
TTATCTTTGAGGTATTTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCTGTTTTTTTATTAATTTATGTAATTAAATATTTATTTATAAATTATTTAAGTATTCGAACTTCATCAGTTAATATGTA
TGAATCATTCACAACATCCA

Product: multi anti extrusion (MATE) family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 469; Mature: 469

Protein sequence:

>469_residues
MKRFCKYFGDKAFYKMALAIIIPVVIQQLILNLAGLIDTFMINGFSQTAYTGVSTANRFMFIINFFWIGLAAGISVFVSQ
YFGAKNKKGIIGTFQLGILLAIVFGIFSTFLINVLGPEMIKMFLPTTDPEQVESVMFGIEYIKIIGYGAIVFLSSFMIAT
FFRSVGRAKAPLFAGVIGIVVNMVLNMILIYGFLGFPAMGAIGAAWATVISKIVELVVLLVIAFFYSNENYAREIFKKFL
ITKRLVIMYISKGGPIIINEILWSIAMVLYAMFITSGIYEWVTAYGYSQNATDIFFVYYSGMATATGVILGQALGEGDFE
NAKDYLIKLRAVMMVTNIGIMLLIVLLSPIILLMFTPVNSLYWLAYQLILINVIFIAIYGYNVMSYYALRAGGDSIRTFL
LDQLPTYLVGLPIVMLLSHYRVELGVNILIIFLASKSTDVVKLIFARHIIKKGTWLNNLTLDEVKIKTA

Sequences:

>Translated_469_residues
MKRFCKYFGDKAFYKMALAIIIPVVIQQLILNLAGLIDTFMINGFSQTAYTGVSTANRFMFIINFFWIGLAAGISVFVSQ
YFGAKNKKGIIGTFQLGILLAIVFGIFSTFLINVLGPEMIKMFLPTTDPEQVESVMFGIEYIKIIGYGAIVFLSSFMIAT
FFRSVGRAKAPLFAGVIGIVVNMVLNMILIYGFLGFPAMGAIGAAWATVISKIVELVVLLVIAFFYSNENYAREIFKKFL
ITKRLVIMYISKGGPIIINEILWSIAMVLYAMFITSGIYEWVTAYGYSQNATDIFFVYYSGMATATGVILGQALGEGDFE
NAKDYLIKLRAVMMVTNIGIMLLIVLLSPIILLMFTPVNSLYWLAYQLILINVIFIAIYGYNVMSYYALRAGGDSIRTFL
LDQLPTYLVGLPIVMLLSHYRVELGVNILIIFLASKSTDVVKLIFARHIIKKGTWLNNLTLDEVKIKTA
>Mature_469_residues
MKRFCKYFGDKAFYKMALAIIIPVVIQQLILNLAGLIDTFMINGFSQTAYTGVSTANRFMFIINFFWIGLAAGISVFVSQ
YFGAKNKKGIIGTFQLGILLAIVFGIFSTFLINVLGPEMIKMFLPTTDPEQVESVMFGIEYIKIIGYGAIVFLSSFMIAT
FFRSVGRAKAPLFAGVIGIVVNMVLNMILIYGFLGFPAMGAIGAAWATVISKIVELVVLLVIAFFYSNENYAREIFKKFL
ITKRLVIMYISKGGPIIINEILWSIAMVLYAMFITSGIYEWVTAYGYSQNATDIFFVYYSGMATATGVILGQALGEGDFE
NAKDYLIKLRAVMMVTNIGIMLLIVLLSPIILLMFTPVNSLYWLAYQLILINVIFIAIYGYNVMSYYALRAGGDSIRTFL
LDQLPTYLVGLPIVMLLSHYRVELGVNILIIFLASKSTDVVKLIFARHIIKKGTWLNNLTLDEVKIKTA

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI226510954, Length=374, Percent_Identity=21.9251336898396, Blast_Score=72, Evalue=5e-14,
Organism=Escherichia coli, GI48994890, Length=318, Percent_Identity=24.2138364779874, Blast_Score=67, Evalue=2e-12,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 52339; Mature: 52339

Theoretical pI: Translated: 9.72; Mature: 9.72

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
4.5 %Met     (Translated Protein)
4.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
4.5 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECEEEECC
>Mature Secondary Structure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HHHHCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]