| Definition | Shewanella baltica OS195 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009997 |
| Length | 5,347,283 |
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The map label for this gene is 160876603
Identifier: 160876603
GI number: 160876603
Start: 4115846
End: 4118854
Strand: Reverse
Name: 160876603
Synonym: Sbal195_3497
Alternate gene names: NA
Gene position: 4118854-4115846 (Counterclockwise)
Preceding gene: 160876617
Following gene: 160876602
Centisome position: 77.03
GC content: 33.53
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases ACTAATAATTTTAACTGCTTTGCGATAGGGGTTCAACTTGGAAAAGTCTGATGTTACGTGTTTTCATACAGGATGGTCTG TGTTTTTAGATATTACTATG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1002; Mature: 1002
Protein sequence:
>1002_residues MDKKMFSRDYISLADVYLAYRKAKAEAFYDSFYPNAIAFSEFEKNIKTKILNLHSKIINGSDSDSWWEDIKFIGDFRYIP KELDDNNWNNKVNVHYRSVDPITDWKQRFKENSNKRLNVKYRQILCPSVEYQILSALWILKVGHLFEAKLDKELSYGNRL RRRSGLVPDSDSLQDQLNLDASGLFSPYFSAYKNWRGNGLNAMKKLISEGHDVTAITMDLAGFYHNASPNFLLRPSFLRK LGLSLSSDERKFTRLILESINNWYLTTPDYEQRTDGALPVGSSISKIISNVLLYELDKQISEGLEPEYYGRYVDDIFLVF KTPDEELTGDSILSHMSKHVECLKINRVKGEQPDLRLRFVYAQDSDLKFTASKQKIFSLSSKHGLDFINQISSQIRAQSS EYRMLPEVPRDSVVMADKTLLASPDASLIPDALRKADVVSIRRLGLSLLLRDIESYSEDLSSANWIVVRNEFYGLVERYL LTPKGLFDMFGYLHRVFQVMISNYDFIYANKFIDKLQVCLDLIGKTTVRSKLNRVSMENFHVYLFEKLSEAALKASTKKD FIKWESLRKLIVKLSGISKNDIYKKTKSQLKAISNELLLADFGVRSYKDYWYYSQVTDSKAIAIPRARSVRAVLRLDSIH QFATDANLKKPYWPALAFSTRPLSVQEIALICPKVLDDSVFFEDVLFGLRGAKTNQYNISRKYSALDGCWINVPKPVSSK IYVALTNFETTQVQYDSALNEIPDESLDRYEKINRLINDILKSSPKSDYIVFPECSLPRRWAVNIASKMAKQKISLIAGI EYYKHSKGKNIIRNDCLVSLVTNWPGYNSNFLFMQPKILPSHCEKNRLETKRLKLFTPNNELDLLPIYRHGDFNFGVLIC SDLTNPRNRVRFQGEVDCLFVLEWNQDVKTFSYLVEGAAHDIHSFVIQVNNREYGDSRVRAPFRVDYKRDLVRVKGGLSD TFLISEVDFKSLRKFQKNGVMTDDNSDFKPVPIGFKMSDYRK
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 115772; Mature: 115772
Theoretical pI: Translated: 9.44; Mature: 9.44
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDKKMFSRDYISLADVYLAYRKAKAEAFYDSFYPNAIAFSEFEKNIKTKILNLHSKIING CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC SDSDSWWEDIKFIGDFRYIPKELDDNNWNNKVNVHYRSVDPITDWKQRFKENSNKRLNVK CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEE YRQILCPSVEYQILSALWILKVGHLFEAKLDKELSYGNRLRRRSGLVPDSDSLQDQLNLD EHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCCC ASGLFSPYFSAYKNWRGNGLNAMKKLISEGHDVTAITMDLAGFYHNASPNFLLRPSFLRK HHHCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHCCCCCCEEECHHHHHH LGLSLSSDERKFTRLILESINNWYLTTPDYEQRTDGALPVGSSISKIISNVLLYELDKQI HCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SEGLEPEYYGRYVDDIFLVFKTPDEELTGDSILSHMSKHVECLKINRVKGEQPDLRLRFV HCCCCCHHHCCEEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCEEEEEE YAQDSDLKFTASKQKIFSLSSKHGLDFINQISSQIRAQSSEYRMLPEVPRDSVVMADKTL EECCCCCEEEECHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCEE LASPDASLIPDALRKADVVSIRRLGLSLLLRDIESYSEDLSSANWIVVRNEFYGLVERYL ECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHH LTPKGLFDMFGYLHRVFQVMISNYDFIYANKFIDKLQVCLDLIGKTTVRSKLNRVSMENF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHE HVYLFEKLSEAALKASTKKDFIKWESLRKLIVKLSGISKNDIYKKTKSQLKAISNELLLA EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE DFGVRSYKDYWYYSQVTDSKAIAIPRARSVRAVLRLDSIHQFATDANLKKPYWPALAFST ECCCHHHHHHEEEEECCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEECC RPLSVQEIALICPKVLDDSVFFEDVLFGLRGAKTNQYNISRKYSALDGCWINVPKPVSSK CCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCHHHHCCCCEEEECCCCCCCE IYVALTNFETTQVQYDSALNEIPDESLDRYEKINRLINDILKSSPKSDYIVFPECSLPRR EEEEEECCCEEEEEHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCHH WAVNIASKMAKQKISLIAGIEYYKHSKGKNIIRNDCLVSLVTNWPGYNSNFLFMQPKILP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCH SHCEKNRLETKRLKLFTPNNELDLLPIYRHGDFNFGVLICSDLTNPRNRVRFQGEVDCLF HHHHHCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCHHHEEEECCCEEEE VLEWNQDVKTFSYLVEGAAHDIHSFVIQVNNREYGDSRVRAPFRVDYKRDLVRVKGGLSD EEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHCCCCCC TFLISEVDFKSLRKFQKNGVMTDDNSDFKPVPIGFKMSDYRK EEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCC >Mature Secondary Structure MDKKMFSRDYISLADVYLAYRKAKAEAFYDSFYPNAIAFSEFEKNIKTKILNLHSKIING CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC SDSDSWWEDIKFIGDFRYIPKELDDNNWNNKVNVHYRSVDPITDWKQRFKENSNKRLNVK CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEE YRQILCPSVEYQILSALWILKVGHLFEAKLDKELSYGNRLRRRSGLVPDSDSLQDQLNLD EHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCCC ASGLFSPYFSAYKNWRGNGLNAMKKLISEGHDVTAITMDLAGFYHNASPNFLLRPSFLRK HHHCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHCCCCCCEEECHHHHHH LGLSLSSDERKFTRLILESINNWYLTTPDYEQRTDGALPVGSSISKIISNVLLYELDKQI HCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SEGLEPEYYGRYVDDIFLVFKTPDEELTGDSILSHMSKHVECLKINRVKGEQPDLRLRFV HCCCCCHHHCCEEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCEEEEEE YAQDSDLKFTASKQKIFSLSSKHGLDFINQISSQIRAQSSEYRMLPEVPRDSVVMADKTL EECCCCCEEEECHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCEE LASPDASLIPDALRKADVVSIRRLGLSLLLRDIESYSEDLSSANWIVVRNEFYGLVERYL ECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHH LTPKGLFDMFGYLHRVFQVMISNYDFIYANKFIDKLQVCLDLIGKTTVRSKLNRVSMENF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHE HVYLFEKLSEAALKASTKKDFIKWESLRKLIVKLSGISKNDIYKKTKSQLKAISNELLLA EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE DFGVRSYKDYWYYSQVTDSKAIAIPRARSVRAVLRLDSIHQFATDANLKKPYWPALAFST ECCCHHHHHHEEEEECCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEECC RPLSVQEIALICPKVLDDSVFFEDVLFGLRGAKTNQYNISRKYSALDGCWINVPKPVSSK CCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCHHHHCCCCEEEECCCCCCCE IYVALTNFETTQVQYDSALNEIPDESLDRYEKINRLINDILKSSPKSDYIVFPECSLPRR EEEEEECCCEEEEEHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCHH WAVNIASKMAKQKISLIAGIEYYKHSKGKNIIRNDCLVSLVTNWPGYNSNFLFMQPKILP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCH SHCEKNRLETKRLKLFTPNNELDLLPIYRHGDFNFGVLICSDLTNPRNRVRFQGEVDCLF HHHHHCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCHHHEEEECCCEEEE VLEWNQDVKTFSYLVEGAAHDIHSFVIQVNNREYGDSRVRAPFRVDYKRDLVRVKGGLSD EEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHCCCCCC TFLISEVDFKSLRKFQKNGVMTDDNSDFKPVPIGFKMSDYRK EEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA