| Definition | Shewanella baltica OS195 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009997 |
| Length | 5,347,283 |
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The map label for this gene is 160873455
Identifier: 160873455
GI number: 160873455
Start: 372288
End: 376904
Strand: Direct
Name: 160873455
Synonym: Sbal195_0330
Alternate gene names: NA
Gene position: 372288-376904 (Clockwise)
Preceding gene: 160873453
Following gene: 160873486
Centisome position: 6.96
GC content: 50.34
Gene sequence:
>4617_bases ATGGTTGAAACTAAGAATTCTATAACCTCCATTCTTTCCGCGTATGAGCAACAGGAAAAACGGCGAGCACTTGGTGGGAT ATACGCTCTGGCAGGCTTTGACTACCAATTGCGTTTCTATCTGGCCGACTTTGTAGAGTCTCTCGCTAATCAAGGTATAA ATTTAGACGCCGCTGGTCGCGTATATCTGGAAGCGCTTTCAGATATAGCCAAGCAGGATGCGAATAACCATTTAGTATGT ATCCAAGTGAAGCGCACTTTAACAGTTGCGACACTAAAGGATGCCGCGTCCGAGGTTCTAGCCATAGACCGCTTCCTGAA AGACCATTACCCCAGCATGCGTGATCAGGTGAAGTTTAATCTTGTTGCCTCGCAAGGCTGTCCAGATATTCAATGGAGCC ATATTCCAGAAACGCACGAAACCCACTCCATCATCAGCCAACTTCTAACAAGAGGGCAACTTTTACCACCTCGTATAGAA CCAGATCCTTGGTGGCGTGCAATTACGGCAACATGGCCGCATTTAAAGGATCCTTTCGGCTTCCTGCACTTTGCACTGGT AAGAGCCTTAAGTCGGGGGCCAACAGCCGCTGATGCACAGCGTGTTCGTGACGAAATATGCGAGCGTTTTAAGCAAGACC AGTTAGCGAAAGAGCCACCGGGTCAACTCCTCACGCCAGCAGATTTCCAACTCAAAGAAGATCCAAGCACACATTTGGAC GTTGGACGTGAAATCACACTTGCTCGACTTCGGGATCGTCAGTACATGGCGCTTACCCAGCGCCTAAATACCCTGTATGT CAATTTATTTGAATACAAGGATATCAGCCAGCGAGAACTCCGGAGTGAAGTGCAAGTATTCTGGCTTAGTGGCCGTTCTG GTGCAGGCAAGAGTGTGCTACTGCTGCAAACCCTTGAACGACTTGTGTGCGAAGGCTGGCGAGTGCTGTGGTTAAAGGGA GATGCAGAGTTACTTGAGCCAGCTTTACGCGCTATTAAAGAAACCCATGAGCAAGACCGCCCTGATTTTATTGCGATAGA CGACTTATATGACCGTGATGCACGAAACCGTATTGATTTAAGCCGCTTAGGCGAATTTATTGACGAGAGTGATCACCAAA ACTGGCCAATAATCCTGACCTGTGGCCCAACAGAGTTTGCGGATTCTTTCCAAGAAGATGCGACTTATCGCGGTTTCAAT CTGAATTGCTACCAGATTAGACCTATTGCGGCTCAAGAGGCTGAAGAAATAGAGGTTTGGTATCAACAACGTACTTGCAA GCCTGCACAAAGAGGTACTGCATTTACTCAGGCGGCAGAAGAAGATAATGGCCTGTTTATCTCATTAGCAGTAGAACTTG CACACGGCGATCTCAAAACCTTTGCGCAACGCTTTGCTCGGCGGGTTGAACTTAATGGCTTAAACAAGGCGCTATTGCTC CCCCTGGCGCTAAACAGGCTGTATCTGCGTGCGCCCTACGATTGGCTGGCGAGAGAGGATCGTGAAAAGCTTGCCACACT CAATCATGAAGGCGATTTTAATTTACTGGAAACTGCCGATGAAGGACAAATCGTTCGCCTTACGCATCCGCATCTGGCAA ATGCCTTGTACCTTGCTCTTCGCAAACCAGCCAACAATGAAGCCTACACCAACGATCTAGTCGATACTTTCCATCGCGCT TTAACTGAACAAAACGCTAACTTGGTGTCCCAACTACTGCGCTTGTTCTCAGGACGCGAACAGGGTATGGCGATAGATAG ATTAAGCATCGTGAAACTTCCTGACTTAGCGCTGAAATGTGCCAAGCACTGGCACGAACTCCCACCCGTGGCATCTGATG CAGATAGTTTGGCTGATATGGCAACCAGCTGGGCCTGCTGGGCAACAACTGCACCGAACATTACAAGCACAATGGAAACA AAGGTGTTGTCTGCTGCGCTCAATTCTTTGGAAGATGCTCATAAAGTATGGCCAATCTGTTGGCAGCATCTTGCAAAACA TTATCCTAAAAATGAAGAACTATTTTCCTGGGCCGTTACACACTTATCTAATCCTTTGTTCATAAGTCATCCCACTTGGT CTTTTGTATGGGAGCACTGTCTGCAACATGATCCCAATCACTCTGATATTTGGCACAACATAGGGCTGGAATGGTTGCAA TGTTCTCTGCGTCGCCCTGATTGGCATATCGTTTGGCAAAAACTCTTGCCAAAAAATAGCGAGCCTGATTGGGAACACGA TCCAATTTTGATTTTGGGACGGCGCCGCTTGCGTGCAGAAAAGGATGGCCCAGACTGGGCTTTTGTGCTGCAAGATCTAC TCCGTTTTGCACCTAATAGTCTAACCTCAATTGAATTGGTCAACCTGGCACACACCTGGCTGACAGGGCGTGAAGACCGC GCCGAGTGGGCGCATGTCTGGCGAGCCTTATTGGAACAGCGGAACGCACTGCCAGAGAGCTTGCCGCTGAGCGAATTGCT CCAGCGTGGCGCAACCTGGCTGACAGGGCGTGAAGACCGCGCCGAGTGGGCGCATGTTTGGCAAGACTTATTGGAACAGC GGAACGCACTGCCAAAGAGCTTGCCGCTGAGCGAATTGCTTCAGCGTGGCGCAACATGGCTAACTAGGCGTGAAGACCGC GCCGAGTGGTCGCATGTCTGGCGAGCCTTATTGGAACAGCGGAACGCACTGCCAGAGAGCTTGCCGCTGAGCGAATTGCT CCAGCGTGGCGCAACCTGGCTGACAGGGCGTGAAGACCGCGCCGAGTGGTCGTATGTCTGGCGAGCCTTATTGGAACAGC GGAACGCACTGCCAGAGAGCTTACCGCTGAGCGAATTGCTTCAGCGTGGCGCAACCTGGCTGACAGGGCGTGAAGACCGC GCCGAGTGGTCGTATGTCTGGCGAGCCTTATTGGAACAGCGGAACGCACTGCCAGAGAGCTTGCCGCTGAGCGAATTGCT CCAGCGTGGCGCAACCTGGCTGACAGGGCGTGAAGACCGCGCCGAGTGGTCGTATGTCTGGCGAGCCTTATTGGAACAGC GGAACGCACTGCCAGAGAGCTTGCCGCTGAGCGAATTGCTCCAGAGTGGCGCAACATGGCTGACAGGGCGTGAAGACCGC GCCGAGTGGGCGCATGTTTGGCAAGACTTATTGGAACAGCGGAACGCACTGCCAGAGAGCTTACCGCTGAGCGAATTGCT CCAGCGTGGCGCAACCTGGCTGACAGGGCGTGAAGACCGCGCCGAGTGGGCGCATGTTTGGCAAGACTTATTGGAACAGC GGAACGCACTGCCAGAGAGCTTACCGCTGAGCGAATTGCTCCAGCGTGGCGCAACCTGGCTGACAGGGCGTGAAGACCGC GCCGAGTGGGCGCATGTTTGGCAAGACTTATTGGAACAGCGGAACGCACTGCCAGAGAGCTTACCGCTGAGCGAATTGCT CCAGCGTGGCGCAACCTGGCTGACAGGGCGTGAAGACCGCGCCGAGTGGGCGCATGTTTGGCAAGCCTTATTGGAACAGC GGGACGCACTGCCAGAGAGCTTACCGCTGAGCGAATTGCTTCAGCGTGGCGCAACCTGGCTGACATGGCGTGAAGACCGC GCCGAAGAATGGGGCTTTGTTTGTGAGAGGTTGCTAGAGCAGCAGTATCAAGATAGTAATTTTTTTGAGATTGCAGCAAA TTGGCTGACTCAGGCCTGTGAAAAACCAGAGTGGCCAGTCCTCGCAGCGAAATTCATTGTGGCAGCACCTCACCATACTG CATCAAAAAAGTTTGCAGTGACTTTGGCTGAGCGGATCAAAGCGAATCCGAACAATACGCATTGGTTTAAAACACAGAAC TTGGTGGCTAACTTAATCACGTCGGAAACTTTGCCACCAGAGGTTAAAGACTGGTTGCAAGTATTATATGCGCGTAGAAA TCTCCCTGCATGGGCTGAAGTACGCCGAAGCTTTAATGAAGGGCTTCCGATTAAAGGACGCGTAATTCGCCATCAAGGTT CAAACGCCCATAGCATTGAGTTAGAAAACGGCTTGCTTGCTTTATATTCAATCTCTCGACATAACCGTAAGCTCACTAAA ACTGACTCCTTTGATTTTTTTGTGCAACAGATAAACCTTGATAGAGATTTTATTCTAGTGGGGCTTAATAAATCCGTTCA GCTTAAAATCGGAGCGAAATACGATGGACTTGTGCGTGAATACAAGGAGTACGGGGTTTTTGTAATGATAGACGTACAAC AGGGGTTGCTTCATAAAACCCAGTGTTCCAACTGGGGTGATCTAGTTAAAAAATTCCCTAAAGGCAGTGAGATTAGTGTT GAAATTGTGGCAGTAACTGATAAAGGGTTTAATTTGCGATACGCTGGCCCAGAGTTGGCGTCTGAAGTTGATACAGGGGC CCTCACCATTGGTCAAGTCTATAAAGCTTGTATTAACGGTATACAAGAATACGGCCTATTTCTTCAGATTGGCGTACATA GTGGGCTGCTCCATCGTACTCGATTGCCATCCAATACAGATATCTTGCGTCAATATGCCAAAGGCCGAGAACTGGATGTC CAAATAGTCGAAATAAAGGACGATGGCAAGCTTGTGTTAAAACTACCTGAGCAATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TGTAGACAAACCAAAAGTGAATTATGTTGTTGATTTAAAATGAATAGCCTGATTTACTCTTTCTATTGCCTACGCCTTGA ATTGGAGCTTGTGTTTTTTA
Downstream 100 bases:
>100_bases AGCTCTAAAAGAGCTTATACAAGGTTTGGTGCTGTAATATTCCTTTGAAGTTGAACTCGCTCTACTCCTTAAGAAATGTA ATAGGCAGAAATTTAATTAG
Product: RNA-binding S1 domain-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1538; Mature: 1538
Protein sequence:
>1538_residues MVETKNSITSILSAYEQQEKRRALGGIYALAGFDYQLRFYLADFVESLANQGINLDAAGRVYLEALSDIAKQDANNHLVC IQVKRTLTVATLKDAASEVLAIDRFLKDHYPSMRDQVKFNLVASQGCPDIQWSHIPETHETHSIISQLLTRGQLLPPRIE PDPWWRAITATWPHLKDPFGFLHFALVRALSRGPTAADAQRVRDEICERFKQDQLAKEPPGQLLTPADFQLKEDPSTHLD VGREITLARLRDRQYMALTQRLNTLYVNLFEYKDISQRELRSEVQVFWLSGRSGAGKSVLLLQTLERLVCEGWRVLWLKG DAELLEPALRAIKETHEQDRPDFIAIDDLYDRDARNRIDLSRLGEFIDESDHQNWPIILTCGPTEFADSFQEDATYRGFN LNCYQIRPIAAQEAEEIEVWYQQRTCKPAQRGTAFTQAAEEDNGLFISLAVELAHGDLKTFAQRFARRVELNGLNKALLL PLALNRLYLRAPYDWLAREDREKLATLNHEGDFNLLETADEGQIVRLTHPHLANALYLALRKPANNEAYTNDLVDTFHRA LTEQNANLVSQLLRLFSGREQGMAIDRLSIVKLPDLALKCAKHWHELPPVASDADSLADMATSWACWATTAPNITSTMET KVLSAALNSLEDAHKVWPICWQHLAKHYPKNEELFSWAVTHLSNPLFISHPTWSFVWEHCLQHDPNHSDIWHNIGLEWLQ CSLRRPDWHIVWQKLLPKNSEPDWEHDPILILGRRRLRAEKDGPDWAFVLQDLLRFAPNSLTSIELVNLAHTWLTGREDR AEWAHVWRALLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDRAEWAHVWQDLLEQRNALPKSLPLSELLQRGATWLTRREDR AEWSHVWRALLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDRAEWSYVWRALLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDR AEWSYVWRALLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDRAEWSYVWRALLEQRNALPESLPLSELLQSGATWLTGREDR AEWAHVWQDLLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDRAEWAHVWQDLLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDR AEWAHVWQDLLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDRAEWAHVWQALLEQRDALPESLPLSELLQRGATWLTWREDR AEEWGFVCERLLEQQYQDSNFFEIAANWLTQACEKPEWPVLAAKFIVAAPHHTASKKFAVTLAERIKANPNNTHWFKTQN LVANLITSETLPPEVKDWLQVLYARRNLPAWAEVRRSFNEGLPIKGRVIRHQGSNAHSIELENGLLALYSISRHNRKLTK TDSFDFFVQQINLDRDFILVGLNKSVQLKIGAKYDGLVREYKEYGVFVMIDVQQGLLHKTQCSNWGDLVKKFPKGSEISV EIVAVTDKGFNLRYAGPELASEVDTGALTIGQVYKACINGIQEYGLFLQIGVHSGLLHRTRLPSNTDILRQYAKGRELDV QIVEIKDDGKLVLKLPEQ
Sequences:
>Translated_1538_residues MVETKNSITSILSAYEQQEKRRALGGIYALAGFDYQLRFYLADFVESLANQGINLDAAGRVYLEALSDIAKQDANNHLVC IQVKRTLTVATLKDAASEVLAIDRFLKDHYPSMRDQVKFNLVASQGCPDIQWSHIPETHETHSIISQLLTRGQLLPPRIE PDPWWRAITATWPHLKDPFGFLHFALVRALSRGPTAADAQRVRDEICERFKQDQLAKEPPGQLLTPADFQLKEDPSTHLD VGREITLARLRDRQYMALTQRLNTLYVNLFEYKDISQRELRSEVQVFWLSGRSGAGKSVLLLQTLERLVCEGWRVLWLKG DAELLEPALRAIKETHEQDRPDFIAIDDLYDRDARNRIDLSRLGEFIDESDHQNWPIILTCGPTEFADSFQEDATYRGFN LNCYQIRPIAAQEAEEIEVWYQQRTCKPAQRGTAFTQAAEEDNGLFISLAVELAHGDLKTFAQRFARRVELNGLNKALLL PLALNRLYLRAPYDWLAREDREKLATLNHEGDFNLLETADEGQIVRLTHPHLANALYLALRKPANNEAYTNDLVDTFHRA LTEQNANLVSQLLRLFSGREQGMAIDRLSIVKLPDLALKCAKHWHELPPVASDADSLADMATSWACWATTAPNITSTMET KVLSAALNSLEDAHKVWPICWQHLAKHYPKNEELFSWAVTHLSNPLFISHPTWSFVWEHCLQHDPNHSDIWHNIGLEWLQ CSLRRPDWHIVWQKLLPKNSEPDWEHDPILILGRRRLRAEKDGPDWAFVLQDLLRFAPNSLTSIELVNLAHTWLTGREDR AEWAHVWRALLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDRAEWAHVWQDLLEQRNALPKSLPLSELLQRGATWLTRREDR AEWSHVWRALLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDRAEWSYVWRALLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDR AEWSYVWRALLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDRAEWSYVWRALLEQRNALPESLPLSELLQSGATWLTGREDR AEWAHVWQDLLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDRAEWAHVWQDLLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDR AEWAHVWQDLLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDRAEWAHVWQALLEQRDALPESLPLSELLQRGATWLTWREDR AEEWGFVCERLLEQQYQDSNFFEIAANWLTQACEKPEWPVLAAKFIVAAPHHTASKKFAVTLAERIKANPNNTHWFKTQN LVANLITSETLPPEVKDWLQVLYARRNLPAWAEVRRSFNEGLPIKGRVIRHQGSNAHSIELENGLLALYSISRHNRKLTK TDSFDFFVQQINLDRDFILVGLNKSVQLKIGAKYDGLVREYKEYGVFVMIDVQQGLLHKTQCSNWGDLVKKFPKGSEISV EIVAVTDKGFNLRYAGPELASEVDTGALTIGQVYKACINGIQEYGLFLQIGVHSGLLHRTRLPSNTDILRQYAKGRELDV QIVEIKDDGKLVLKLPEQ >Mature_1538_residues MVETKNSITSILSAYEQQEKRRALGGIYALAGFDYQLRFYLADFVESLANQGINLDAAGRVYLEALSDIAKQDANNHLVC IQVKRTLTVATLKDAASEVLAIDRFLKDHYPSMRDQVKFNLVASQGCPDIQWSHIPETHETHSIISQLLTRGQLLPPRIE PDPWWRAITATWPHLKDPFGFLHFALVRALSRGPTAADAQRVRDEICERFKQDQLAKEPPGQLLTPADFQLKEDPSTHLD VGREITLARLRDRQYMALTQRLNTLYVNLFEYKDISQRELRSEVQVFWLSGRSGAGKSVLLLQTLERLVCEGWRVLWLKG DAELLEPALRAIKETHEQDRPDFIAIDDLYDRDARNRIDLSRLGEFIDESDHQNWPIILTCGPTEFADSFQEDATYRGFN LNCYQIRPIAAQEAEEIEVWYQQRTCKPAQRGTAFTQAAEEDNGLFISLAVELAHGDLKTFAQRFARRVELNGLNKALLL PLALNRLYLRAPYDWLAREDREKLATLNHEGDFNLLETADEGQIVRLTHPHLANALYLALRKPANNEAYTNDLVDTFHRA LTEQNANLVSQLLRLFSGREQGMAIDRLSIVKLPDLALKCAKHWHELPPVASDADSLADMATSWACWATTAPNITSTMET KVLSAALNSLEDAHKVWPICWQHLAKHYPKNEELFSWAVTHLSNPLFISHPTWSFVWEHCLQHDPNHSDIWHNIGLEWLQ CSLRRPDWHIVWQKLLPKNSEPDWEHDPILILGRRRLRAEKDGPDWAFVLQDLLRFAPNSLTSIELVNLAHTWLTGREDR AEWAHVWRALLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDRAEWAHVWQDLLEQRNALPKSLPLSELLQRGATWLTRREDR AEWSHVWRALLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDRAEWSYVWRALLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDR AEWSYVWRALLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDRAEWSYVWRALLEQRNALPESLPLSELLQSGATWLTGREDR AEWAHVWQDLLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDRAEWAHVWQDLLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDR AEWAHVWQDLLEQRNALPESLPLSELLQRGATWLTGREDRAEWAHVWQALLEQRDALPESLPLSELLQRGATWLTWREDR AEEWGFVCERLLEQQYQDSNFFEIAANWLTQACEKPEWPVLAAKFIVAAPHHTASKKFAVTLAERIKANPNNTHWFKTQN LVANLITSETLPPEVKDWLQVLYARRNLPAWAEVRRSFNEGLPIKGRVIRHQGSNAHSIELENGLLALYSISRHNRKLTK TDSFDFFVQQINLDRDFILVGLNKSVQLKIGAKYDGLVREYKEYGVFVMIDVQQGLLHKTQCSNWGDLVKKFPKGSEISV EIVAVTDKGFNLRYAGPELASEVDTGALTIGQVYKACINGIQEYGLFLQIGVHSGLLHRTRLPSNTDILRQYAKGRELDV QIVEIKDDGKLVLKLPEQ
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 176987; Mature: 176987
Theoretical pI: Translated: 5.89; Mature: 5.89
Prosite motif: PS50126 S1 ; PS00589 PTS_HPR_SER
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 0.5 %Met (Translated Protein) 1.5 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 0.5 %Met (Mature Protein) 1.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVETKNSITSILSAYEQQEKRRALGGIYALAGFDYQLRFYLADFVESLANQGINLDAAGR CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHH VYLEALSDIAKQDANNHLVCIQVKRTLTVATLKDAASEVLAIDRFLKDHYPSMRDQVKFN HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCEEEE LVASQGCPDIQWSHIPETHETHSIISQLLTRGQLLPPRIEPDPWWRAITATWPHLKDPFG EEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHEEHHCCCCCCCCHHH FLHFALVRALSRGPTAADAQRVRDEICERFKQDQLAKEPPGQLLTPADFQLKEDPSTHLD HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCHHHH VGREITLARLRDRQYMALTQRLNTLYVNLFEYKDISQRELRSEVQVFWLSGRSGAGKSVL CCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCHHH LLQTLERLVCEGWRVLWLKGDAELLEPALRAIKETHEQDRPDFIAIDDLYDRDARNRIDL HHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHCCCCCCCCCH SRLGEFIDESDHQNWPIILTCGPTEFADSFQEDATYRGFNLNCYQIRPIAAQEAEEIEVW HHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHH YQQRTCKPAQRGTAFTQAAEEDNGLFISLAVELAHGDLKTFAQRFARRVELNGLNKALLL 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA