| Definition | Shewanella baltica OS195 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009997 |
| Length | 5,347,283 |
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The map label for this gene is 160873253
Identifier: 160873253
GI number: 160873253
Start: 147728
End: 149413
Strand: Reverse
Name: 160873253
Synonym: Sbal195_0127
Alternate gene names: NA
Gene position: 149413-147728 (Counterclockwise)
Preceding gene: 160873256
Following gene: 160873252
Centisome position: 2.79
GC content: 49.82
Gene sequence:
>1686_bases ATGGCGTTTTTTCAGCAAATTTCCGTGGAATCCATGCTCTATCTTCTTGCTAGTTGTATCGCACTCTTAATTGGGCCACT GTTTTATCGCTACTTTTCATCGGGCAGCGGATTACAGAAGGGGCTCGATGGCTTTATATTCGTCTCATTAGGCGGATTAG TGCTGATCCACATCTTGCCAGAGCTACTGCAGCATGGCGGTTTGTTAGCCGTAATCTTTGTATTCCTAGGTATCTGGGGA CCGACCGCTAGCGAACGCCTTTTCCACCGTTATTCAGAAATCACCCATAATCTCACCTTATCCCTAGGGATTGGCGGCTT GCTACTGCACACCATCACAGACGGTGGCGCTATGGTATTGGCGCAGCAAGACGGCAGTTCGATCTTACTTGCCCTCGGGG TCATTATGCATCGCCTCCCCGTCGGCCTCGCCATTTGGTGGTTACTCAAACCTCAAGTCGGCACCCGCTGGGCTAGCTTA GTGCTGGTCGCTATGATGCTACTTACGGGTGTTGGTTACTTTGCAGGCGAGCAATTAATCACTCAGCTCAGTTTAGAAAA TACCGTTTATTTACAAGCCTTTGTTACCGGTTCTATTTTGCATGTGGTGCTACATCAACCCCACGGACAGCACGATACCG ACAAGCAAGGCAAATACGAATACCAAGCTGGCATCGGCAGTTTGCTCGGCATAGGCTTGCTCGTGATGCTGCTCTTGATG GATTCTGGCGGCCACGAACATGCCCACCATGATCACAGCACAGAACAATTAATAACTTGGCTACTGACACTCGCGCCCAT ATTACTGCTGAGCTATGGTGCGGCGGCGCTGCGCTTTAAATTAGGTCTGACACCGCAGGATAGCAGCTTAGCCCGTCGCT GGTTCCAACGCTTAGCGGGGCCCGAAGCTCTCGTCATCACCGCCCTGTTACTCGGTCCTTGGCTAGCATTATTCCAGTTA CTTGTGGTCTTTATTCTTAGCACTTATTTAAGCCACGCTAACGTCACTATTACCGATCCACACACTAAATTACCTAGCAA TGCCCTGCGTTTCGGCTTTGCACATTTAGTCGATCGCAGCGCACCGTGGATTTTACTCAGCCTAGTACTAGTGAATTTAA TCGGCCATCCTTCGGTGCCATTAAGCAATCCGCTGCTGCAGGTTATAGTGCTGTTACTTGTATTTTTACCTATGCGTTTC TGCAACTTAGGCGCTGCGGTACTGGCTCTTGCACTGGCCTATAGTGGCTGGAGTCCTATCGCGATTATCATGCCGCTGAT TGCCGCACCTGTGCTTAACATTGCGCAGCTTAAGTTAATGACATGGCCGCAAAGGGCAATATTACTGAGTATTATTGCGT TGAGTTTAGTCGCAGCACTACGTTTGCCACTGTGGTTCTCCCTATTCACTTTGCCAGAAGTGGTGAACTTAGTCGCGCTA CTGATCCTGTCGGGATTATTTGCCGCCAGCTTACTGCGCTTAGGCCCACGTAAATTTCTACGCCGCTTAATGCTGAGCAA ACCAGCAGCTCATGCGCATGGCCATTCCCACGCGCATGCACATAGCCATGAACCTAGCGCTTCGCACACATCTGTGCAGA GCACTGCTGAAACGCCTAGTGCCCATGATCATTCCGATGAACATACACACGATAAAGCAAAAGCAAATAAGCACTCGCAC CACTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAAAGTGAATAAAATTCGCCCCCGAAAACCCCAGCGCAAAATGTCAGTTTGGTAAATTGCCAGCAAGTCACTGCTCACTT TGACTTACAGCTGGTATACT
Downstream 100 bases:
>100_bases CACTGTTCATTTATGAGCAGACAGGCTAAGTTAATCTACCTTTGGATTAATTTAGCCTGCTATGTGCATACTCTTTGTCG CCATTAATGCCCATCCTAAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 561; Mature: 560
Protein sequence:
>561_residues MAFFQQISVESMLYLLASCIALLIGPLFYRYFSSGSGLQKGLDGFIFVSLGGLVLIHILPELLQHGGLLAVIFVFLGIWG PTASERLFHRYSEITHNLTLSLGIGGLLLHTITDGGAMVLAQQDGSSILLALGVIMHRLPVGLAIWWLLKPQVGTRWASL VLVAMMLLTGVGYFAGEQLITQLSLENTVYLQAFVTGSILHVVLHQPHGQHDTDKQGKYEYQAGIGSLLGIGLLVMLLLM DSGGHEHAHHDHSTEQLITWLLTLAPILLLSYGAAALRFKLGLTPQDSSLARRWFQRLAGPEALVITALLLGPWLALFQL LVVFILSTYLSHANVTITDPHTKLPSNALRFGFAHLVDRSAPWILLSLVLVNLIGHPSVPLSNPLLQVIVLLLVFLPMRF CNLGAAVLALALAYSGWSPIAIIMPLIAAPVLNIAQLKLMTWPQRAILLSIIALSLVAALRLPLWFSLFTLPEVVNLVAL LILSGLFAASLLRLGPRKFLRRLMLSKPAAHAHGHSHAHAHSHEPSASHTSVQSTAETPSAHDHSDEHTHDKAKANKHSH H
Sequences:
>Translated_561_residues MAFFQQISVESMLYLLASCIALLIGPLFYRYFSSGSGLQKGLDGFIFVSLGGLVLIHILPELLQHGGLLAVIFVFLGIWG PTASERLFHRYSEITHNLTLSLGIGGLLLHTITDGGAMVLAQQDGSSILLALGVIMHRLPVGLAIWWLLKPQVGTRWASL VLVAMMLLTGVGYFAGEQLITQLSLENTVYLQAFVTGSILHVVLHQPHGQHDTDKQGKYEYQAGIGSLLGIGLLVMLLLM DSGGHEHAHHDHSTEQLITWLLTLAPILLLSYGAAALRFKLGLTPQDSSLARRWFQRLAGPEALVITALLLGPWLALFQL LVVFILSTYLSHANVTITDPHTKLPSNALRFGFAHLVDRSAPWILLSLVLVNLIGHPSVPLSNPLLQVIVLLLVFLPMRF CNLGAAVLALALAYSGWSPIAIIMPLIAAPVLNIAQLKLMTWPQRAILLSIIALSLVAALRLPLWFSLFTLPEVVNLVAL LILSGLFAASLLRLGPRKFLRRLMLSKPAAHAHGHSHAHAHSHEPSASHTSVQSTAETPSAHDHSDEHTHDKAKANKHSH H >Mature_560_residues AFFQQISVESMLYLLASCIALLIGPLFYRYFSSGSGLQKGLDGFIFVSLGGLVLIHILPELLQHGGLLAVIFVFLGIWGP TASERLFHRYSEITHNLTLSLGIGGLLLHTITDGGAMVLAQQDGSSILLALGVIMHRLPVGLAIWWLLKPQVGTRWASLV LVAMMLLTGVGYFAGEQLITQLSLENTVYLQAFVTGSILHVVLHQPHGQHDTDKQGKYEYQAGIGSLLGIGLLVMLLLMD SGGHEHAHHDHSTEQLITWLLTLAPILLLSYGAAALRFKLGLTPQDSSLARRWFQRLAGPEALVITALLLGPWLALFQLL VVFILSTYLSHANVTITDPHTKLPSNALRFGFAHLVDRSAPWILLSLVLVNLIGHPSVPLSNPLLQVIVLLLVFLPMRFC NLGAAVLALALAYSGWSPIAIIMPLIAAPVLNIAQLKLMTWPQRAILLSIIALSLVAALRLPLWFSLFTLPEVVNLVALL ILSGLFAASLLRLGPRKFLRRLMLSKPAAHAHGHSHAHAHSHEPSASHTSVQSTAETPSAHDHSDEHTHDKAKANKHSHH
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 61095; Mature: 60964
Theoretical pI: Translated: 8.96; Mature: 8.96
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAFFQQISVESMLYLLASCIALLIGPLFYRYFSSGSGLQKGLDGFIFVSLGGLVLIHILP CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH ELLQHGGLLAVIFVFLGIWGPTASERLFHRYSEITHNLTLSLGIGGLLLHTITDGGAMVL HHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECHHHHHHHHCCCCCEEEE AQQDGSSILLALGVIMHRLPVGLAIWWLLKPQVGTRWASLVLVAMMLLTGVGYFAGEQLI EECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH TQLSLENTVYLQAFVTGSILHVVLHQPHGQHDTDKQGKYEYQAGIGSLLGIGLLVMLLLM HHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DSGGHEHAHHDHSTEQLITWLLTLAPILLLSYGAAALRFKLGLTPQDSSLARRWFQRLAG CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCC PEALVITALLLGPWLALFQLLVVFILSTYLSHANVTITDPHTKLPSNALRFGFAHLVDRS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCC APWILLSLVLVNLIGHPSVPLSNPLLQVIVLLLVFLPMRFCNLGAAVLALALAYSGWSPI CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH AIIMPLIAAPVLNIAQLKLMTWPQRAILLSIIALSLVAALRLPLWFSLFTLPEVVNLVAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LILSGLFAASLLRLGPRKFLRRLMLSKPAAHAHGHSHAHAHSHEPSASHTSVQSTAETPS HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCC AHDHSDEHTHDKAKANKHSHH CCCCCCCHHHHHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure AFFQQISVESMLYLLASCIALLIGPLFYRYFSSGSGLQKGLDGFIFVSLGGLVLIHILP CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH ELLQHGGLLAVIFVFLGIWGPTASERLFHRYSEITHNLTLSLGIGGLLLHTITDGGAMVL HHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECHHHHHHHHCCCCCEEEE AQQDGSSILLALGVIMHRLPVGLAIWWLLKPQVGTRWASLVLVAMMLLTGVGYFAGEQLI EECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH TQLSLENTVYLQAFVTGSILHVVLHQPHGQHDTDKQGKYEYQAGIGSLLGIGLLVMLLLM HHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DSGGHEHAHHDHSTEQLITWLLTLAPILLLSYGAAALRFKLGLTPQDSSLARRWFQRLAG CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCC PEALVITALLLGPWLALFQLLVVFILSTYLSHANVTITDPHTKLPSNALRFGFAHLVDRS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCC APWILLSLVLVNLIGHPSVPLSNPLLQVIVLLLVFLPMRFCNLGAAVLALALAYSGWSPI CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH AIIMPLIAAPVLNIAQLKLMTWPQRAILLSIIALSLVAALRLPLWFSLFTLPEVVNLVAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LILSGLFAASLLRLGPRKFLRRLMLSKPAAHAHGHSHAHAHSHEPSASHTSVQSTAETPS HHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCC AHDHSDEHTHDKAKANKHSHH CCCCCCCHHHHHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA