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The map label for this gene is yfmI

Identifier: 16077813

GI number: 16077813

Start: 819311

End: 820531

Strand: Reverse

Name: yfmI

Synonym: BSU07460

Alternate gene names: 16077813

Gene position: 820531-819311 (Counterclockwise)

Preceding gene: 16077816

Following gene: 16077812

Centisome position: 19.46

GC content: 30.63

Gene sequence:

>1221_bases
ATGAGTAAAGGTTATTATTCTATTTTATTTAGCCAGACCACTACAAATTTAGGTTTTTCTCTATATACTATGGTAGTGAT
TTCGTTTTTGTTTAAAATGACCAATTCGACAACCATCGCCTCTATGGTGACATTAATAAGTATTATTTTTCGTATTTTTG
GAAGTGCTATATTACCGTTAATAACAATTCGATTAAAACTGCCTCTTACAATAATTATTTCTCAATTGATACAAATGCTG
TTATTAATATGTTTGTTCTATGCTTTATTAAGAACTTACTCTAATCAAACTCTCATTTTAGTCTTTATTATTATTAGCTG
TATTTCCTTTTTTAATGGATGGTTCTCACCTTTAAAAAGTGCAATTATAGGGGAAATAATCTCTCCTGATAGAAGAGTAA
AAGCAAATGGATTATTATCTACAGTGGACCAAACTTTTCAATTTGTAGGCTGGTCTTTAGGTGGTCTCATAATTGCATTT
TTAGGTGAGGGATATACCATTATACTTACTATCTTTTTGTTGTTTACATCTCTTCTTTCTCTTTTATTTTGTCTACCACA
TGGCCACGCTAATTCTGTCATACGTGAAAAAAATTCTCCCAATAAGAGTATAGTAAGTGGTTGGCGGTATTTATTTAGCC
AAAAGAAACTTAGAACAATTATTATTATGGATTTAATTGAGTCATGGGCAGGAATGATTTGGATAGGATCTGTCTCTTTA
GCTTTCGTTAACGAAGTCTTGCATAAAGGAGAATCATGGTGGGGATTTATTAATGGAGCATATTATTTAGGTTCGATGAT
AGGGGGATTTATAATATATAAGCTGTCGGAGAGATTTCAAAATAAGTTAATTAATTTTATGTTAATTGGCGCTGTCTCAT
ATGGAAGTTTAACTTTAATATATGGTTTTATAAGTAATTCATACTTAGCTCTAATTTTGGTTCTCTTTATGGGGCCGGCT
TATATATTAAGAGATCTTACACAAGAAACACTTATTCAGAACATAACAACCGAGCAAACTCGAATTAATATAATGTCTGC
AAGGTCTTCTTTAGTACAGTTCATTTTTATGTTTTCAATTCTGGCTATAGGGGCTATTTCAGATTTCCTTGGAGTTCGTT
TAGTTTATGTTTCAGCAGGTATTCTTTTATTAGTGTCCGCAATATATGGATTTTCTCAATTACAATTCAAAAAAAAGGTA
AATAAACATATAAGCTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAGTTTACAAGGAAATTTTTTCTTTACTTTTGTTGTTTTAAGGTGTTTAAATATGTTTAAGCTCTTTACCGAGAAAAAT
TATTCCAAGGGAGGATACAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAATATATAAAATTTAATTATGTTTTCGTTTGCTTTTTCGCGTGTTTAATTAATAAGTAAACATTACTTTATTGACCAA
AAGAAAATGGTTGAGTACCA

Product: efflux transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 406; Mature: 405

Protein sequence:

>406_residues
MSKGYYSILFSQTTTNLGFSLYTMVVISFLFKMTNSTTIASMVTLISIIFRIFGSAILPLITIRLKLPLTIIISQLIQML
LLICLFYALLRTYSNQTLILVFIIISCISFFNGWFSPLKSAIIGEIISPDRRVKANGLLSTVDQTFQFVGWSLGGLIIAF
LGEGYTIILTIFLLFTSLLSLLFCLPHGHANSVIREKNSPNKSIVSGWRYLFSQKKLRTIIIMDLIESWAGMIWIGSVSL
AFVNEVLHKGESWWGFINGAYYLGSMIGGFIIYKLSERFQNKLINFMLIGAVSYGSLTLIYGFISNSYLALILVLFMGPA
YILRDLTQETLIQNITTEQTRINIMSARSSLVQFIFMFSILAIGAISDFLGVRLVYVSAGILLLVSAIYGFSQLQFKKKV
NKHISF

Sequences:

>Translated_406_residues
MSKGYYSILFSQTTTNLGFSLYTMVVISFLFKMTNSTTIASMVTLISIIFRIFGSAILPLITIRLKLPLTIIISQLIQML
LLICLFYALLRTYSNQTLILVFIIISCISFFNGWFSPLKSAIIGEIISPDRRVKANGLLSTVDQTFQFVGWSLGGLIIAF
LGEGYTIILTIFLLFTSLLSLLFCLPHGHANSVIREKNSPNKSIVSGWRYLFSQKKLRTIIIMDLIESWAGMIWIGSVSL
AFVNEVLHKGESWWGFINGAYYLGSMIGGFIIYKLSERFQNKLINFMLIGAVSYGSLTLIYGFISNSYLALILVLFMGPA
YILRDLTQETLIQNITTEQTRINIMSARSSLVQFIFMFSILAIGAISDFLGVRLVYVSAGILLLVSAIYGFSQLQFKKKV
NKHISF
>Mature_405_residues
SKGYYSILFSQTTTNLGFSLYTMVVISFLFKMTNSTTIASMVTLISIIFRIFGSAILPLITIRLKLPLTIIISQLIQMLL
LICLFYALLRTYSNQTLILVFIIISCISFFNGWFSPLKSAIIGEIISPDRRVKANGLLSTVDQTFQFVGWSLGGLIIAFL
GEGYTIILTIFLLFTSLLSLLFCLPHGHANSVIREKNSPNKSIVSGWRYLFSQKKLRTIIIMDLIESWAGMIWIGSVSLA
FVNEVLHKGESWWGFINGAYYLGSMIGGFIIYKLSERFQNKLINFMLIGAVSYGSLTLIYGFISNSYLALILVLFMGPAY
ILRDLTQETLIQNITTEQTRINIMSARSSLVQFIFMFSILAIGAISDFLGVRLVYVSAGILLLVSAIYGFSQLQFKKKVN
KHISF

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential)

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): YFMI_BACSU (O34440)

Other databases:

- EMBL:   D86417
- EMBL:   AL009126
- PIR:   H69812
- RefSeq:   NP_388627.1
- ProteinModelPortal:   O34440
- EnsemblBacteria:   EBBACT00000003257
- GeneID:   936105
- GenomeReviews:   AL009126_GR
- KEGG:   bsu:BSU07460
- NMPDR:   fig|224308.1.peg.746
- GenoList:   BSU07460
- GeneTree:   EBGT00050000000127
- HOGENOM:   HBG337352
- OMA:   GAITMAY
- ProtClustDB:   CLSK886850
- BioCyc:   BSUB:BSU07460-MONOMER
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1; SSF103473 MFS_gen_substrate_transporter

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45607; Mature: 45476

Theoretical pI: Translated: 10.13; Mature: 10.13

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

HASH(0xc2bf178)-; HASH(0xdb10fb8)-; HASH(0xd6c6038)-; HASH(0xd9cbaec)-; HASH(0xdb10f10)-; HASH(0xcfcaf50)-; HASH(0xdb0e380)-; HASH(0xddbb574)-; HASH(0xc9d7694)-; HASH(0xd1ea310)-;

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSKGYYSILFSQTTTNLGFSLYTMVVISFLFKMTNSTTIASMVTLISIIFRIFGSAILPL
CCCCEEEEEEECHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITIRLKLPLTIIISQLIQMLLLICLFYALLRTYSNQTLILVFIIISCISFFNGWFSPLKS
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIIGEIISPDRRVKANGLLSTVDQTFQFVGWSLGGLIIAFLGEGYTIILTIFLLFTSLLS
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LLFCLPHGHANSVIREKNSPNKSIVSGWRYLFSQKKLRTIIIMDLIESWAGMIWIGSVSL
HHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHH
AFVNEVLHKGESWWGFINGAYYLGSMIGGFIIYKLSERFQNKLINFMLIGAVSYGSLTLI
HHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
YGFISNSYLALILVLFMGPAYILRDLTQETLIQNITTEQTRINIMSARSSLVQFIFMFSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAIGAISDFLGVRLVYVSAGILLLVSAIYGFSQLQFKKKVNKHISF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
>Mature Secondary Structure 
SKGYYSILFSQTTTNLGFSLYTMVVISFLFKMTNSTTIASMVTLISIIFRIFGSAILPL
CCCEEEEEEECHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITIRLKLPLTIIISQLIQMLLLICLFYALLRTYSNQTLILVFIIISCISFFNGWFSPLKS
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIIGEIISPDRRVKANGLLSTVDQTFQFVGWSLGGLIIAFLGEGYTIILTIFLLFTSLLS
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LLFCLPHGHANSVIREKNSPNKSIVSGWRYLFSQKKLRTIIIMDLIESWAGMIWIGSVSL
HHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHH
AFVNEVLHKGESWWGFINGAYYLGSMIGGFIIYKLSERFQNKLINFMLIGAVSYGSLTLI
HHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
YGFISNSYLALILVLFMGPAYILRDLTQETLIQNITTEQTRINIMSARSSLVQFIFMFSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAIGAISDFLGVRLVYVSAGILLLVSAIYGFSQLQFKKKVNKHISF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9272861; 9384377