| Definition | Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009972 |
| Length | 6,346,587 |
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The map label for this gene is ppc [H]
Identifier: 159900750
GI number: 159900750
Start: 5400885
End: 5403674
Strand: Direct
Name: ppc [H]
Synonym: Haur_4237
Alternate gene names: 159900750
Gene position: 5400885-5403674 (Clockwise)
Preceding gene: 159900749
Following gene: 159900755
Centisome position: 85.1
GC content: 52.54
Gene sequence:
>2790_bases ATGTATACACCTGAAACCGACCGCACGCCGCTTTCAATGCTGATCCATTCCCTCGGGAATGTGCTTGGCGATGTGATTGT GGCCCAAGATGGGGTGTCAGCGTTTGAGCTTGAAGAAGATGTGCGCCAACGCACCAAGCAACGCCGAAGCGATGGAACAT TGCAAGAGACTCAAACCCTGACTGAGTTGATTAGTCAATTGCCAGTTGCCCAACTCATGGGGCTGATTAAGGCCTTTACT CATTATTTTGGCTTGGTCAATTTGGCCGAAAGCGTTGAGCGCCTACGAGTGCTGGCCGAACGCGACCGCCAAAATGGCGA TGCACCACGCTCTGAATCGGTCGAATTGGCATTGCAAGAGTTGCGTGATCGTGGCATTACCGCCCAGCAAGTGCAAGATT TGCTTGATCATGCCGAGATTCGGCCAGTTTTTACTGCCCACCCGACCGAGGCCAAACGCCGAACGACGCTCAAAAAGCAC CATCGCATTGCAGGGGCGGCGCGGCAATTAACCGCCGATACGACCTTTCAACGCCAGCGCGAACGCTTGCTCGAATCAAT TCGTGAGGAAGTGATCTCGCTCTGGCAAAGCGATGAGGTGCGGATTATCAAGCCAACCGTGATCGACGAAGTGAAGAATA ATCTCTATTACTTCGAAGAATCGCTGTTCGATATGATTCCGCAACTCTACCGTGATACCGAGGCCTCGTTGCGCCAAATT TACCCTGAGCACGAATGGCGTGTGCCAGCCTTCCTGCGCTTTGGCTCATGGGTTGGCGGCGATCGCGATGGCAATCCCTT TGTAATTCCCTCGGTCACGGTTGAAACGCTTAAACTGTTGATGGGCCGTTCGTTGCGTGAGCATATTCATTCAGTTGAGC GCTTGAGTCATCGTTTAAGCCAATCGTCGCGCCAAGTACCAATTAGCGAAGAATTAGCCCAATCGCTAATCCATGATGCG CCGTTGTTCCCCGAATTGGCCCAAGTGCTGGAGCGGCGCAATCCGCATGAGCCATATCGCCAAAAATGCTCCTACATTCA CGCCAAATTGCATGCCACCTTGGCCTATGTTGAGCGCTACGAGCCAGATTGGGCACGCGGCGGCCATCGCCCAGCTGAAG GCACCTGGTATGCCAATGCCAACCAATATCTCGCCGATTTAGCAACCATGGAATATAGCTTGCGCACCAATGGCGCGGCC TCAGTCGCCGATGGCTTTTTGCGCGATATCCAATGCTCGGCCAAAGTCTTTGGTTTGCACACCGCCACCCTCGATATTCG CCAACACAGCAGCCGCCACACCAACGCCCTGAGCGAAATTTTTGAATATGCAGGCATCTGCGACGATTACGCCAGCCTGA GCCAAGCCGAACGCACGGCTGTATTGGAACGCGAGCTAGCCAATAATCGTCCGTTGATTCCAACTCATCTCTACTACAGC CCCGAAACCGTTGAGATTATCGAAACCTTCCGCACAATTCGCGCAGTGCTTTCCGATTTAAATGCTGAGGCCATCGAAAC TTACATCATTTCGATGACCGAAGGCCCAAGCGATATTTTGGCGGTGCTGTTGCTGGCTCGCGAGGCGGGCATTTATCAGC CAGGTGAGCATAGTTGGCTGAATATTGTGCCATTATTTGAAACCGGAGCCGACCTCATCGCCGCGCCGGAGATAATGCAC ACGCTGCTTTCGAGCGAAGCCTATCGCCAACATTTGGTGTTGCGCAACGATGTGCAAGAAATTATGTTGGGCTACAGCGA TTCCAACAAAGATGGTGGTTTTGCCGATGCGCACTGGGCGCTCTATCTCGCTCAAGTGGCCTTGGCCGAAACCTGTTTCC GACATCGAGTGGCCATGCGGCTGTTCCATGGCCGTGGTGGGGCGGTTGGCCGTGGTGGCGGGCCTGCCAACCGTGCGATT TTGGGTCAACCACCAGGCACAGTCGGTGGGCGGATCAAAATCACTGAACAAGGCGAAGTGATTAGCGATCGTTATGCCGA GCCAGAAACGGCCTATCGCCATCAAGAGCAAATTATCAACGCAGTATTGCGCTCATCGTTAGGCGTGAGCATCGCGCATA TCAGCCAAGAATGGCACGACGCGATGAGTAGTTTGGCCAAGGTTTCGCGTAAAGTCTATCGCGGCTTGGTCTACGATCAT CCGCACTTCTTGGAATACTTCCGCAATGCTACGCCGATTACCGAAATTAGCCGCTTGAACATTGGCTCACGCCCAGCCAG CCGCAAAGCCAGTGACCGGATCGAAGATTTGCGAGCGATTCCCTGGGTTTTTAGTTGGATGCAAAGTCGGCATACCTTGC CAGGTTGGTATGGCTTGGGCAGTGCCTTGGAGCATTTAATCCAAGCTGATGCCAATGGCTTGACCACCTTGCAGGGAATG TACAACGATTGGCCATTTTTCCGCACCATGCTGGATAATGCCCAAATGATTTTATCCAAGGCTGATATGGATATTGCGGC GCAATATGCCCTGCTTGTGCCCGACCAAGCCTTAGCCAACGAAATCTTTGGCCTGATCAAAGCTGAATACACCCGCACCG TTAAATGGATTTGCGAGGTGGCGCAAATTAATGAGCTGCTGGATACTAGCCCAATTTTGCAGCACTCAATTAAGCAGCGC AACCCGTATGTTGACCCATTAAGTTTCGTACAAATCGAATTGCTCCGGCGTTTGCGCACCGATCCCGATGGACTTGAGCA TAGCGATCTTGAAGATGCAATTTTGTTAAGTATCAACGGGATTGCCGCAGGCTTGAAAAATACGGGTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TCTCGAAAAGCCAATCGCGATCGACGATTTGATGCGTGTGGTGCGTCGCTATTGTGATTAGGCTGCGGCCAGCGTGCCGC TTATGGTTTGGAGTGTGGCG
Downstream 100 bases:
>100_bases GGTTCAGGGTCTAGGATTCAGGGGTCAGATCTACGAAGGACACGAAGAAAAGGCTATAGGCGATGGGCTATCGGAACAAT TCTCCATCGCCTATAGCCTA
Product: phosphoenolpyruvate carboxylase
Products: NA
Alternate protein names: PEPC; PEPCase [H]
Number of amino acids: Translated: 929; Mature: 929
Protein sequence:
>929_residues MYTPETDRTPLSMLIHSLGNVLGDVIVAQDGVSAFELEEDVRQRTKQRRSDGTLQETQTLTELISQLPVAQLMGLIKAFT HYFGLVNLAESVERLRVLAERDRQNGDAPRSESVELALQELRDRGITAQQVQDLLDHAEIRPVFTAHPTEAKRRTTLKKH HRIAGAARQLTADTTFQRQRERLLESIREEVISLWQSDEVRIIKPTVIDEVKNNLYYFEESLFDMIPQLYRDTEASLRQI YPEHEWRVPAFLRFGSWVGGDRDGNPFVIPSVTVETLKLLMGRSLREHIHSVERLSHRLSQSSRQVPISEELAQSLIHDA PLFPELAQVLERRNPHEPYRQKCSYIHAKLHATLAYVERYEPDWARGGHRPAEGTWYANANQYLADLATMEYSLRTNGAA SVADGFLRDIQCSAKVFGLHTATLDIRQHSSRHTNALSEIFEYAGICDDYASLSQAERTAVLERELANNRPLIPTHLYYS PETVEIIETFRTIRAVLSDLNAEAIETYIISMTEGPSDILAVLLLAREAGIYQPGEHSWLNIVPLFETGADLIAAPEIMH TLLSSEAYRQHLVLRNDVQEIMLGYSDSNKDGGFADAHWALYLAQVALAETCFRHRVAMRLFHGRGGAVGRGGGPANRAI LGQPPGTVGGRIKITEQGEVISDRYAEPETAYRHQEQIINAVLRSSLGVSIAHISQEWHDAMSSLAKVSRKVYRGLVYDH PHFLEYFRNATPITEISRLNIGSRPASRKASDRIEDLRAIPWVFSWMQSRHTLPGWYGLGSALEHLIQADANGLTTLQGM YNDWPFFRTMLDNAQMILSKADMDIAAQYALLVPDQALANEIFGLIKAEYTRTVKWICEVAQINELLDTSPILQHSIKQR NPYVDPLSFVQIELLRRLRTDPDGLEHSDLEDAILLSINGIAAGLKNTG
Sequences:
>Translated_929_residues MYTPETDRTPLSMLIHSLGNVLGDVIVAQDGVSAFELEEDVRQRTKQRRSDGTLQETQTLTELISQLPVAQLMGLIKAFT HYFGLVNLAESVERLRVLAERDRQNGDAPRSESVELALQELRDRGITAQQVQDLLDHAEIRPVFTAHPTEAKRRTTLKKH HRIAGAARQLTADTTFQRQRERLLESIREEVISLWQSDEVRIIKPTVIDEVKNNLYYFEESLFDMIPQLYRDTEASLRQI YPEHEWRVPAFLRFGSWVGGDRDGNPFVIPSVTVETLKLLMGRSLREHIHSVERLSHRLSQSSRQVPISEELAQSLIHDA PLFPELAQVLERRNPHEPYRQKCSYIHAKLHATLAYVERYEPDWARGGHRPAEGTWYANANQYLADLATMEYSLRTNGAA SVADGFLRDIQCSAKVFGLHTATLDIRQHSSRHTNALSEIFEYAGICDDYASLSQAERTAVLERELANNRPLIPTHLYYS PETVEIIETFRTIRAVLSDLNAEAIETYIISMTEGPSDILAVLLLAREAGIYQPGEHSWLNIVPLFETGADLIAAPEIMH TLLSSEAYRQHLVLRNDVQEIMLGYSDSNKDGGFADAHWALYLAQVALAETCFRHRVAMRLFHGRGGAVGRGGGPANRAI LGQPPGTVGGRIKITEQGEVISDRYAEPETAYRHQEQIINAVLRSSLGVSIAHISQEWHDAMSSLAKVSRKVYRGLVYDH PHFLEYFRNATPITEISRLNIGSRPASRKASDRIEDLRAIPWVFSWMQSRHTLPGWYGLGSALEHLIQADANGLTTLQGM YNDWPFFRTMLDNAQMILSKADMDIAAQYALLVPDQALANEIFGLIKAEYTRTVKWICEVAQINELLDTSPILQHSIKQR NPYVDPLSFVQIELLRRLRTDPDGLEHSDLEDAILLSINGIAAGLKNTG >Mature_929_residues MYTPETDRTPLSMLIHSLGNVLGDVIVAQDGVSAFELEEDVRQRTKQRRSDGTLQETQTLTELISQLPVAQLMGLIKAFT HYFGLVNLAESVERLRVLAERDRQNGDAPRSESVELALQELRDRGITAQQVQDLLDHAEIRPVFTAHPTEAKRRTTLKKH HRIAGAARQLTADTTFQRQRERLLESIREEVISLWQSDEVRIIKPTVIDEVKNNLYYFEESLFDMIPQLYRDTEASLRQI YPEHEWRVPAFLRFGSWVGGDRDGNPFVIPSVTVETLKLLMGRSLREHIHSVERLSHRLSQSSRQVPISEELAQSLIHDA PLFPELAQVLERRNPHEPYRQKCSYIHAKLHATLAYVERYEPDWARGGHRPAEGTWYANANQYLADLATMEYSLRTNGAA SVADGFLRDIQCSAKVFGLHTATLDIRQHSSRHTNALSEIFEYAGICDDYASLSQAERTAVLERELANNRPLIPTHLYYS PETVEIIETFRTIRAVLSDLNAEAIETYIISMTEGPSDILAVLLLAREAGIYQPGEHSWLNIVPLFETGADLIAAPEIMH TLLSSEAYRQHLVLRNDVQEIMLGYSDSNKDGGFADAHWALYLAQVALAETCFRHRVAMRLFHGRGGAVGRGGGPANRAI LGQPPGTVGGRIKITEQGEVISDRYAEPETAYRHQEQIINAVLRSSLGVSIAHISQEWHDAMSSLAKVSRKVYRGLVYDH PHFLEYFRNATPITEISRLNIGSRPASRKASDRIEDLRAIPWVFSWMQSRHTLPGWYGLGSALEHLIQADANGLTTLQGM YNDWPFFRTMLDNAQMILSKADMDIAAQYALLVPDQALANEIFGLIKAEYTRTVKWICEVAQINELLDTSPILQHSIKQR NPYVDPLSFVQIELLRRLRTDPDGLEHSDLEDAILLSINGIAAGLKNTG
Specific function: Forms oxaloacetate, a four-carbon dicarboxylic acid source for the tricarboxylic acid cycle [H]
COG id: COG2352
COG function: function code C; Phosphoenolpyruvate carboxylase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm [C]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the PEPCase type 1 family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1790393, Length=924, Percent_Identity=33.6580086580087, Blast_Score=457, Evalue=1e-130,
Paralogues:
None
Copy number: 3,500 Molecules/Cell In: Glucose minimal media [C]
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR021135 - InterPro: IPR018129 - InterPro: IPR022805 - InterPro: IPR015813 [H]
Pfam domain/function: PF00311 PEPcase [H]
EC number: =4.1.1.31 [H]
Molecular weight: Translated: 104939; Mature: 104939
Theoretical pI: Translated: 6.12; Mature: 6.12
Prosite motif: PS00781 PEPCASE_1 ; PS00393 PEPCASE_2
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MYTPETDRTPLSMLIHSLGNVLGDVIVAQDGVSAFELEEDVRQRTKQRRSDGTLQETQTL CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH TELISQLPVAQLMGLIKAFTHYFGLVNLAESVERLRVLAERDRQNGDAPRSESVELALQE HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHH LRDRGITAQQVQDLLDHAEIRPVFTAHPTEAKRRTTLKKHHRIAGAARQLTADTTFQRQR HHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ERLLESIREEVISLWQSDEVRIIKPTVIDEVKNNLYYFEESLFDMIPQLYRDTEASLRQI HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YPEHEWRVPAFLRFGSWVGGDRDGNPFVIPSVTVETLKLLMGRSLREHIHSVERLSHRLS CCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QSSRQVPISEELAQSLIHDAPLFPELAQVLERRNPHEPYRQKCSYIHAKLHATLAYVERY HHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC EPDWARGGHRPAEGTWYANANQYLADLATMEYSLRTNGAASVADGFLRDIQCSAKVFGLH CCCHHCCCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE TATLDIRQHSSRHTNALSEIFEYAGICDDYASLSQAERTAVLERELANNRPLIPTHLYYS HHEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEC PETVEIIETFRTIRAVLSDLNAEAIETYIISMTEGPSDILAVLLLAREAGIYQPGEHSWL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCE NIVPLFETGADLIAAPEIMHTLLSSEAYRQHLVLRNDVQEIMLGYSDSNKDGGFADAHWA EEEEHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHH LYLAQVALAETCFRHRVAMRLFHGRGGAVGRGGGPANRAILGQPPGTVGGRIKITEQGEV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCEEEEECCCCH ISDRYAEPETAYRHQEQIINAVLRSSLGVSIAHISQEWHDAMSSLAKVSRKVYRGLVYDH HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC PHFLEYFRNATPITEISRLNIGSRPASRKASDRIEDLRAIPWVFSWMQSRHTLPGWYGLG HHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH SALEHLIQADANGLTTLQGMYNDWPFFRTMLDNAQMILSKADMDIAAQYALLVPDQALAN HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHH EIFGLIKAEYTRTVKWICEVAQINELLDTSPILQHSIKQRNPYVDPLSFVQIELLRRLRT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC DPDGLEHSDLEDAILLSINGIAAGLKNTG CCCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHCCCCCC >Mature Secondary Structure MYTPETDRTPLSMLIHSLGNVLGDVIVAQDGVSAFELEEDVRQRTKQRRSDGTLQETQTL CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH TELISQLPVAQLMGLIKAFTHYFGLVNLAESVERLRVLAERDRQNGDAPRSESVELALQE HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHH LRDRGITAQQVQDLLDHAEIRPVFTAHPTEAKRRTTLKKHHRIAGAARQLTADTTFQRQR HHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ERLLESIREEVISLWQSDEVRIIKPTVIDEVKNNLYYFEESLFDMIPQLYRDTEASLRQI HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YPEHEWRVPAFLRFGSWVGGDRDGNPFVIPSVTVETLKLLMGRSLREHIHSVERLSHRLS CCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QSSRQVPISEELAQSLIHDAPLFPELAQVLERRNPHEPYRQKCSYIHAKLHATLAYVERY HHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC EPDWARGGHRPAEGTWYANANQYLADLATMEYSLRTNGAASVADGFLRDIQCSAKVFGLH CCCHHCCCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE TATLDIRQHSSRHTNALSEIFEYAGICDDYASLSQAERTAVLERELANNRPLIPTHLYYS HHEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEC PETVEIIETFRTIRAVLSDLNAEAIETYIISMTEGPSDILAVLLLAREAGIYQPGEHSWL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCE NIVPLFETGADLIAAPEIMHTLLSSEAYRQHLVLRNDVQEIMLGYSDSNKDGGFADAHWA EEEEHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHH LYLAQVALAETCFRHRVAMRLFHGRGGAVGRGGGPANRAILGQPPGTVGGRIKITEQGEV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCEEEEECCCCH ISDRYAEPETAYRHQEQIINAVLRSSLGVSIAHISQEWHDAMSSLAKVSRKVYRGLVYDH HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC PHFLEYFRNATPITEISRLNIGSRPASRKASDRIEDLRAIPWVFSWMQSRHTLPGWYGLG HHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH SALEHLIQADANGLTTLQGMYNDWPFFRTMLDNAQMILSKADMDIAAQYALLVPDQALAN HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHH EIFGLIKAEYTRTVKWICEVAQINELLDTSPILQHSIKQRNPYVDPLSFVQIELLRRLRT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC DPDGLEHSDLEDAILLSINGIAAGLKNTG CCCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA