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The map label for this gene is yycG [H]

Identifier: 159900627

GI number: 159900627

Start: 5251387

End: 5261799

Strand: Reverse

Name: yycG [H]

Synonym: Haur_4114

Alternate gene names: 159900627

Gene position: 5261799-5251387 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159900628

Following gene: 159900626

Centisome position: 82.91

GC content: 51.6

Gene sequence:

>10413_bases
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CAAACAAAGCGGCATGTTTGCTCAAGGGGCGATCTTACGCCTTGGTCAACAACGTTCGTTGTTGACTGCATGGGGCATGA
ATAAACGCGCAACCAATCGGTTGTTGCCTGCTCGCGTTTTAAATGGTGGAAGTGAGGTTCGCCTGCCAGATGGTTGGCAG
ATGTTTGAGATTGGCACTGCCGAGGTGCCTGGCGTTTTGGTCGCTCCAGTTACAATTGAGCCTGAACCACTGACGGTTTT
GGTCGCGCAACTAACCAGTTTGTGGCAGGGCGTGGCCTTGCAAGAGGAATTTGCCCGCCGTGAACGCACGGTTGCAGCCA
TGACTGAATCGTTGCAAGGGTTGGCTCAGCAACTCAATGCCGACGATTTCTTGCAAACCTTGGTCACTCAAGCAACCGAA
TTACTGGGCGCTGCTGGCGGTGGGGTCTACATGACCGATTCCAACCAGCAATACTTGGAGTTGCGCCAAGTTGTGCAATT
TCCGGCCAATTGGAATGGCGCACGGATTCAGGTTGGCAAGGGTGTGGCTGGCAAGGTGGCCCAAAGTGGCAAGCCGATGC
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CAACGTTCATGGCTCAAGTCCCGTGGCATTCGCAGCGCTTTAGGTTTGCCGATGCTGCTCAAGGAGCGGGTAATTGGGAC
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Product: multi-sensor signal transduction histidine kinase

Products: NA

Alternate protein names: NA

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Protein sequence:

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>Translated_3470_residues
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TDNAYIVFYDAPTNMISTTVGFSNGQPYSLISHVLSNNFLKTMLFEQRPLMFNSSSDLLNERFSPRLEGIPDAIEPESVI
AASITMGSQTYGMNINQPLGVLVIQSPQPNTFSRAQLQFLESLANQSSAAVQKAMLFTERERRIRELDTLNRISQGITST
ISLDEILERLYAGLGEIVDVSTAFIGLYDPQTHSMEFREAHDRGAPVTIGSRRLSVGVPAWVIEHRQPLLLNTSEEANEY
RDAQTQITSETSAMRVGGQGEIEQSYLVVPIVVGVDVIGIINIQSYEEYSFSEYDMSFVTTVAAQAGAAIANARLFSERE
QSIQRLNTLNNIGQALSSTVRFDDLLRVIYEQTGKLVKTENFYLALYDERNKEVTFPLYYEYGHPINVMPQRGVNGLTEY
VIRKRQPLLLQGPHIAERMTEMKVDQVGDMARSWLGIPLIAADKVVGVMTVQSYEQDNAYSDELVQLLLTIASQAAQALE
NARLFSESRQSVRELSTLSETSVSLASTLEIDELMAISASSAIEMSRADFGGIIVVGGDGYTITNSLALNRDHMELELPD
TNELDVGSMEILRPLRSGHPLALFDASTDEGLAPFVNSIGMRGSIFLPMLREGLRGVVFVGMDEPFTFNERTISSLMILA
TQIGQAINNAQLFDQIRRFNLELEEIVDQRTLELKGEKERVEALYNIATELGTTLDRDELLLRTLDLAASALMVRRGAVF
LLDRESKDLVCHAVLNEELGLKSIETRVRFQHPGLANWIIEHNEGVVISDVWLDERWTNAQSGRGDDVRSVIAVPLLSSD
APQGVLMLYSNEIGFFTQDHLRFLSTIGGEVSSALHNADLYTLVYDSADRLSDAMWQQREEASKTAAILQSVSEGVMVLD
HQTEKIILYNPAAEDVLRIPRSEVMHNSLQVVAAPRNEEELHEEGRSLLLYAGLHEGIQVVQRSEGVHRSMIELPGQSIA
ANFAPVVGEESSRFGVVVVLRDITREVEADRAKRDFVATVSHELRTPLTPIRGFVDLLLLGAVGQLSDPQREMLNTVKTN
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NAIKYTYAGGDVIIRTFINEDKMIQLDVKDTGVGLTAEQQKSMFKRFYRADSPLRDEVGGTGLGLSIAKSFIELHNGDMW
VQSVYGEGSTFSFSLPEVQPRPDLGERDEV
>Mature_3470_residues
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SAKLTSGVSLQVALESIGESVVQLFDNIDLEICLYDPQNQVLNSQFATPRTRQHYASEGGSYGIDQGLTGWLARHRSTLR
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DEVLRERVRELLALQRISRELTSTLQLEQLLPAMLTEITQATGCGYGIVVLHNEDESLQVIAQTGYNSAEAAGVLALPLL
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LSLQHNEAGRYGERDAAVLDTIANQLAVAIENSRLYTDTQSRLNELALINKIGSLTNSTLDFVEILKGVYESLRTTLELN
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VPLKIRDDTAVGMLSVQHYEPNIYSEREAELLQTIASQVALAVQNARLFGDRERQIRELDAISQIGQLMSASLDLGEMLG
LTAEYLQEVTSAPVFYTMIYDAEHDQITDGYAVQEGVPAERTPRGKPRPGSPSAWVVQNRAPLILADVNNKAELQQKGVQ
PMANPIEGKNKSPRSWIGVPIIARDGAPIGMLSLQDYRTNAFDQRTVAFLTNVVSHISLGVQKVQLFNERDRQIKELDVI
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LLFKHVDEEMKAYPDIHPRVQSADTVLSQSLMGVPLLTSNDEPLGILLLQHYKQAMFDERDLQLLINVAYQVTLGMQNVL
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EVPVANNGTIPWMQRHRRPLVINNPLEHELTESFRETISQLGIQALMLVPLIVKGEVVGSIGLDHIGQGRHFSQRDAETC
QTIANQISQGLENARLFAETERQAHVLSRKVGELSVLLEAGQALSSIHEPTQVLDTLVRLVARQLNIETVILFTGDEELQ
PAASLGLPTDFVQSLRVKRGEGLVGTVAEQRKPLTTSATDGESPIISQHVEFNRDHGLSVFMGVPIVYRNELLGVLSVMS
GAGASFNEDDTALLSALADQAAIAIENTRLFVERERQITVLQALNDVTQAITSTLDPQTLLRQLHLRLSSVVDTRYSFIV
LYDSDHNVLTFPVVMNAGREERLEPQALAEGVLSRVIRGRRTIVLNTIEETANASRFLLGHDTPMASWVGIPIMLGDMVL
GVITIQSPHQRAFSTETIQFLQAVASQTAIALENARLFADRERQVTEAAILSSISQSMTATLSPEELASSILKGLTEIYN
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LLDRESKDLVCHAVLNEELGLKSIETRVRFQHPGLANWIIEHNEGVVISDVWLDERWTNAQSGRGDDVRSVIAVPLLSSD
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NAIKYTYAGGDVIIRTFINEDKMIQLDVKDTGVGLTAEQQKSMFKRFYRADSPLRDEVGGTGLGLSIAKSFIELHNGDMW
VQSVYGEGSTFSFSLPEVQPRPDLGERDEV

Specific function: Member of the two-component regulatory system YycG/YycF involved in the regulation of the ftsAZ operon, the yocH and ykvT, cwlO, lytE, ydjM, yjeA, yoeB genes and the tagAB and tagDEF operons. Probably phosphorylates YycF [H]

COG id: COG5002

COG function: function code T; Signal transduction histidine kinase

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 PAS (PER-ARNT-SIM) domain [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI116536085, Length=305, Percent_Identity=26.2295081967213, Blast_Score=72, Evalue=1e-11,
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Organism=Escherichia coli, GI87082128, Length=228, Percent_Identity=28.9473684210526, Blast_Score=98, Evalue=8e-21,
Organism=Escherichia coli, GI87081816, Length=232, Percent_Identity=28.0172413793103, Blast_Score=94, Evalue=1e-19,
Organism=Escherichia coli, GI1790436, Length=248, Percent_Identity=29.8387096774194, Blast_Score=92, Evalue=7e-19,
Organism=Escherichia coli, GI1790346, Length=212, Percent_Identity=28.7735849056604, Blast_Score=84, Evalue=2e-16,
Organism=Escherichia coli, GI1786783, Length=228, Percent_Identity=27.1929824561404, Blast_Score=80, Evalue=2e-15,
Organism=Escherichia coli, GI1790300, Length=236, Percent_Identity=30.9322033898305, Blast_Score=80, Evalue=2e-15,
Organism=Escherichia coli, GI1790861, Length=247, Percent_Identity=28.3400809716599, Blast_Score=74, Evalue=1e-13,
Organism=Escherichia coli, GI1788279, Length=224, Percent_Identity=24.1071428571429, Blast_Score=72, Evalue=8e-13,
Organism=Escherichia coli, GI1790551, Length=234, Percent_Identity=27.7777777777778, Blast_Score=69, Evalue=5e-12,
Organism=Escherichia coli, GI1787894, Length=233, Percent_Identity=27.8969957081545, Blast_Score=65, Evalue=8e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003594
- InterPro:   IPR003660
- InterPro:   IPR001610
- InterPro:   IPR000014
- InterPro:   IPR000700
- InterPro:   IPR004358
- InterPro:   IPR003661
- InterPro:   IPR005467
- InterPro:   IPR009082 [H]

Pfam domain/function: PF00672 HAMP; PF02518 HATPase_c; PF00512 HisKA [H]

EC number: =2.7.13.3 [H]

Molecular weight: Translated: 384925; Mature: 384925

Theoretical pI: Translated: 4.63; Mature: 4.63

Prosite motif: PS50112 PAS ; PS50109 HIS_KIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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CCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHE
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEHHH
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CCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCC
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCC
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CEEEEEEEEEECCHHHHHHHHCCCCHHCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCC
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HHHHHHEEEEECCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE
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EEEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHC
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CCEEEEECCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEE
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ECCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEECCCHHHHHHCCCC
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CCCCCCCCCCCCCCCEECCEEEECCCCCEEEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEECC
DLTIRIHSFVIDRGLIIQYPKATPITPHSLTAWILEHRQPLLFKHVDEEMKAYPDIHPRV
CEEEEEEEEHHCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
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HHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHE
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EEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEE
DYEAQVGYTRAEFPKGDMSIEVPVANNGTIPWMQRHRRPLVINNPLEHELTESFRETISQ
EECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHH
LGIQALMLVPLIVKGEVVGSIGLDHIGQGRHFSQRDAETCQTIANQISQGLENARLFAET
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCC
PAASLGLPTDFVQSLRVKRGEGLVGTVAEQRKPLTTSATDGESPIISQHVEFNRDHGLSV
CHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEE
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EECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEEECCEEEEECCHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCH
ERLEPQALAEGVLSRVIRGRRTIVLNTIEETANASRFLLGHDTPMASWVGIPIMLGDMVL
HCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHCHHHHHHHHHH
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HHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
TLSPEELASSILKGLTEIYNTDNAYIVFYDAPTNMISTTVGFSNGQPYSLISHVLSNNFL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCHHH
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HHHHHHCCCCEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHEEEEEEECCCEECCCCCCCCE
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EEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
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CCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCCEEECCCEEECCCCH
WVIEHRQPLLLNTSEEANEYRDAQTQITSETSAMRVGGQGEIEQSYLVVPIVVGVDVIGI
HHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCCCCCCEEEEEHHHCCCEEEE
INIQSYEEYSFSEYDMSFVTTVAAQAGAAIANARLFSEREQSIQRLNTLNNIGQALSSTV
EEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHCCCEEEECCEEEEEEECCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHH
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HHHCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCEEEEEEECCCCCCCCH
SDELVQLLLTIASQAAQALENARLFSESRQSVRELSTLSETSVSLASTLEIDELMAISAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
SAIEMSRADFGGIIVVGGDGYTITNSLALNRDHMELELPDTNELDVGSMEILRPLRSGHP
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LALFDASTDEGLAPFVNSIGMRGSIFLPMLREGLRGVVFVGMDEPFTFNERTISSLMILA
EEEEECCCCCCHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHH
TQIGQAINNAQLFDQIRRFNLELEEIVDQRTLELKGEKERVEALYNIATELGTTLDRDEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEEHHHHHHHCCCHHHHHHHEECCCCCEEEEE
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ECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHH
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HHHHHHHCHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEE
HQTEKIILYNPAAEDVLRIPRSEVMHNSLQVVAAPRNEEELHEEGRSLLLYAGLHEGIQV
CCCCEEEEECCCHHHHHHCCHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHH
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HHHCCCHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
KIVLNTAPNQINQLVRDIVATWGLEIEKKNMTLKLELDDTLPLIEYDSKRIGQVLTNMVS
EEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCEEEEEEECCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHH
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>Mature Secondary Structure
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CCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHCCCCHHHHHC
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EEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
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EEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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