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The map label for this gene is 159899935

Identifier: 159899935

GI number: 159899935

Start: 4305180

End: 4308101

Strand: Reverse

Name: 159899935

Synonym: Haur_3418

Alternate gene names: NA

Gene position: 4308101-4305180 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159899944

Following gene: 159899932

Centisome position: 67.88

GC content: 49.66

Gene sequence:

>2922_bases
ATGAGTTTTTATCCGACCTATGTTGAACGCCCACGTTTACTCACTTTGACCCAACATGCGCCACGGGTAGTTTTAATCAT
TGGGTTGCCAAGCAGCGGCAAATCCACAGTGTTAGAGGCACTCAAGCATTCCATCAACGCCCCGTCTGCCTTGATTCGGC
TTGAAGAGTCAGCGCATGATCCCCTAGCGCTGCTTCAGGCTATTTGCCAACAACTTGGCTTACCTAGCGATCATGCACAT
GAGCAGCTTTTAAGGTTACGCCAACCAAGCTGGATTTTGATCGACGATTTGGATCGGATCTTGGATGCGTGGGGGACGTT
CTTGCCTGAGCATGCTTGGCTGAGCGAATTATTGAAAAACCCAGCCCTGCATATTGCTGCTACTTCGTTACATCTGCCCA
ATTTGCCCATGATTCAACAATCGATTATTCGTCGGCAATTGCGCATAGTGGGTATGCAGGAACTGGCCTTCACCAGCGCA
GAATTAATCGAGCTGGCGCAACAACGGCAACTCCACCTAACCCACGCTCAAGCTGAGCAATTAATCGCCTTGACCGATGG
TTGGGTTGCTCCTTGTATTTTTGCGCTCAATCGTTCTGGTGTGCTCAATCAATCGGCGGTAGAGTGGGTGATGCAAGATG
TGATGGCGAGTTTGCCAGCGCCGTTGCATCAGATGCTTGAAGCTTGGCTTTGGCTTGCCCCCGATTCGACCGAATTGCTC
CAAGCGTTACTGCCACACTATGATCTGCATCGTCTGATGATGAGTTGGGAATATGCGGGGTTGTTGGCGCAGTCGAGTCT
TCAGTTGCAGCGTTTGCCCGAGGTCGGTCTGCGCCAGCGTTCTGATCCACAGGCCAGCTATCTGAGCCCATGGTTTGAGC
AGGCTGGCGATTGGTATCTGGCGCAACAACAATTATTGCCATTTGTACAAAAAATGCAGCGCTTGCAACGTTGGGATGTG
ATTAACCATAGCCTAACGCGCAATTTGGCATTGATTGATCGTCAGCAGTTTTTTGCTGAGATTGTCAATGCCTTGAATGC
GGTTCCAGTTCAGCAGCTTAGCTCAAAAGTAGGTTGGTTGTTGGTGCGCAGCTACCATCTTGGGTTACGGAATGGTGAGA
AAGCCTTGCTTTTGGTTAATCAGCTGCTAGGCATTCATCAGCAGCCCGATGATCAGCGCATGTTGCGCTTGCTCAAGGCC
GATATGTTGCGAGCACAGGGCGCAATTGTCGAGGCTGATGGTTTAATTCAGCCCTATCTGGATGACCCTGATTTATCGCC
AGCCGATCAGGCGCGGGTGCTCCGAACGCATGCAAGTTATCTTGTATCGTTGGGTCAAGATGATAATGCGATTACCCATT
TTGAGCGGGCATATGGCTATATTCAACATTCTGGCATTAATCGTTTGCTCGGGTTGATTCTCGGTGATTATGCGAATGCG
GCGGCACGCGCCGGACGCTACTCGTTGGCCGATCGACTGTTACGCCAAGCGACGTTGCTGTGGAATGAATTAAATTCGCC
TGCGGGTTTATCGCAGACGATGAATCTGCGGGCGGTGGTGGCACTGCATCGTGGCCAAATTCGTGATGCAGCCCGCTACG
CTCAAGAAGCCCTCGATAATGCCTTGATTTCCGATAATCGGGCTGCCAATGGTGCCTTGATCACGTTGGGCGATGTAGCG
TTAGCTGATCGTGATTGGACAAGTGCGATTGCGCGTTATCGTTCGGCGCGTGAGCAATTACGCAATAGTAATATGGTCGA
TTATCATATTTTGACCTATGCCTTGGCCTTGGAATCGCAAGCTACGCGCCATAGTTCGATCGAGCAGTTGCAACGCTTAT
TGATTGAGATCGATACTACGACGGCCCAAAATCCGCTTGATCAGGCTTGGTTGGCAGTAGCTCGTAGTGCTGCTAACTTG
ACATTGAAGCTTGATGGCACGATTCCGTTATTGCAGCGAGCGTTGGCTGGGCTTGATAGCGAAGGTGCGTTGGCCAAAGG
TTTATTGTATCTCTTGCTCAGCGAAGCTTTTTGGCAGCGTGATCAATTTGGTGAGGCTCGCCAAGCGTGGGAAGCCCTTG
ATAAGTTGATTATTGATGGGCGCAGTGGCTTGCCCGTGCTATTGTCGGCGCTGACCGTGCATCTCCCTGAATTGGTTCAT
GAGGCCTATACCCAATGGAATTCACCATTTGCGGCACGGGTGCTGCACCATAGTTTGCCAATGCCGCAAGCACCAAAATT
GATTATTCGCTTAATGGGGCAGGTGCGTGTCGAGATGCACGGCAAGCCTGTCAAAATTCCTAAACAAGGTATTTTATTAA
TTGCCCTGTTGCTTATGAACCCTAGCGGGATGACTGCTGATGAATTACGGGCAAAAATTTGGGGATTTGATAGTAGCAAT
GATGGCTGGCGTAAAATGTTGCAACGTACTCGCAAAGAATTGCCCGATTGCGTTATTTCTGATGGTTCGATTTATCGTTT
GTGTTTCCCATTGTCTGAGATCGACGCTGATATTTTGGTGATCAATCAGACTCCATTACAAGGCTCTGATGCGACGCTTG
ATCGTCTGCAAATAGCCGCCGATTATGCAAGCCAAGTGTTTTTATCGGGCCATGAGGCTCCTTGGATTGAATGGGAACGT
AAGCAGTTATCCAAACGTGGAGCCGAAATTTGGATTTCAATCGGCATTCAATGCTATGATGCCCTGCGCTTTGATCAGGC
TCAAAAGGCCTTTGCTCAAGCATTGAGACTAGATATTTCGAATGGGCGTGCGGTTTCGCAGGCAATGAACTTGGAGATTA
ACCAAGGTCGTCGGCTTGAGGCCTTGGCAATCTATGACCGTTACCGTGAGGCCTTGTTTGAAGAATATGGGCTAGACCCT
TCGGCAGAGCTGCAAGCTTTGCAAAAACGTGCTTTGGATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATTGGAACAACCTAGCCTCTCAACGGTTGAGCACGATTGCGCTGTACTGCTTAATGGTTGGTGGGGTAGCATCGTACCA
AGCATCTTGAGGAAACTGCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGAGTTAAGGTCGGGCTGATTGGCTCGGTCGGGCTAATTGGCTCGGTTGGGCTAATTGGCTCGGTCACGGTTGGCGTAGC
GATTGGCGTAGTTGCTGGCT

Product: TPR repeat-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 973; Mature: 972

Protein sequence:

>973_residues
MSFYPTYVERPRLLTLTQHAPRVVLIIGLPSSGKSTVLEALKHSINAPSALIRLEESAHDPLALLQAICQQLGLPSDHAH
EQLLRLRQPSWILIDDLDRILDAWGTFLPEHAWLSELLKNPALHIAATSLHLPNLPMIQQSIIRRQLRIVGMQELAFTSA
ELIELAQQRQLHLTHAQAEQLIALTDGWVAPCIFALNRSGVLNQSAVEWVMQDVMASLPAPLHQMLEAWLWLAPDSTELL
QALLPHYDLHRLMMSWEYAGLLAQSSLQLQRLPEVGLRQRSDPQASYLSPWFEQAGDWYLAQQQLLPFVQKMQRLQRWDV
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DMLRAQGAIVEADGLIQPYLDDPDLSPADQARVLRTHASYLVSLGQDDNAITHFERAYGYIQHSGINRLLGLILGDYANA
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TLKLDGTIPLLQRALAGLDSEGALAKGLLYLLLSEAFWQRDQFGEARQAWEALDKLIIDGRSGLPVLLSALTVHLPELVH
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DGWRKMLQRTRKELPDCVISDGSIYRLCFPLSEIDADILVINQTPLQGSDATLDRLQIAADYASQVFLSGHEAPWIEWER
KQLSKRGAEIWISIGIQCYDALRFDQAQKAFAQALRLDISNGRAVSQAMNLEINQGRRLEALAIYDRYREALFEEYGLDP
SAELQALQKRALD

Sequences:

>Translated_973_residues
MSFYPTYVERPRLLTLTQHAPRVVLIIGLPSSGKSTVLEALKHSINAPSALIRLEESAHDPLALLQAICQQLGLPSDHAH
EQLLRLRQPSWILIDDLDRILDAWGTFLPEHAWLSELLKNPALHIAATSLHLPNLPMIQQSIIRRQLRIVGMQELAFTSA
ELIELAQQRQLHLTHAQAEQLIALTDGWVAPCIFALNRSGVLNQSAVEWVMQDVMASLPAPLHQMLEAWLWLAPDSTELL
QALLPHYDLHRLMMSWEYAGLLAQSSLQLQRLPEVGLRQRSDPQASYLSPWFEQAGDWYLAQQQLLPFVQKMQRLQRWDV
INHSLTRNLALIDRQQFFAEIVNALNAVPVQQLSSKVGWLLVRSYHLGLRNGEKALLLVNQLLGIHQQPDDQRMLRLLKA
DMLRAQGAIVEADGLIQPYLDDPDLSPADQARVLRTHASYLVSLGQDDNAITHFERAYGYIQHSGINRLLGLILGDYANA
AARAGRYSLADRLLRQATLLWNELNSPAGLSQTMNLRAVVALHRGQIRDAARYAQEALDNALISDNRAANGALITLGDVA
LADRDWTSAIARYRSAREQLRNSNMVDYHILTYALALESQATRHSSIEQLQRLLIEIDTTTAQNPLDQAWLAVARSAANL
TLKLDGTIPLLQRALAGLDSEGALAKGLLYLLLSEAFWQRDQFGEARQAWEALDKLIIDGRSGLPVLLSALTVHLPELVH
EAYTQWNSPFAARVLHHSLPMPQAPKLIIRLMGQVRVEMHGKPVKIPKQGILLIALLLMNPSGMTADELRAKIWGFDSSN
DGWRKMLQRTRKELPDCVISDGSIYRLCFPLSEIDADILVINQTPLQGSDATLDRLQIAADYASQVFLSGHEAPWIEWER
KQLSKRGAEIWISIGIQCYDALRFDQAQKAFAQALRLDISNGRAVSQAMNLEINQGRRLEALAIYDRYREALFEEYGLDP
SAELQALQKRALD
>Mature_972_residues
SFYPTYVERPRLLTLTQHAPRVVLIIGLPSSGKSTVLEALKHSINAPSALIRLEESAHDPLALLQAICQQLGLPSDHAHE
QLLRLRQPSWILIDDLDRILDAWGTFLPEHAWLSELLKNPALHIAATSLHLPNLPMIQQSIIRRQLRIVGMQELAFTSAE
LIELAQQRQLHLTHAQAEQLIALTDGWVAPCIFALNRSGVLNQSAVEWVMQDVMASLPAPLHQMLEAWLWLAPDSTELLQ
ALLPHYDLHRLMMSWEYAGLLAQSSLQLQRLPEVGLRQRSDPQASYLSPWFEQAGDWYLAQQQLLPFVQKMQRLQRWDVI
NHSLTRNLALIDRQQFFAEIVNALNAVPVQQLSSKVGWLLVRSYHLGLRNGEKALLLVNQLLGIHQQPDDQRMLRLLKAD
MLRAQGAIVEADGLIQPYLDDPDLSPADQARVLRTHASYLVSLGQDDNAITHFERAYGYIQHSGINRLLGLILGDYANAA
ARAGRYSLADRLLRQATLLWNELNSPAGLSQTMNLRAVVALHRGQIRDAARYAQEALDNALISDNRAANGALITLGDVAL
ADRDWTSAIARYRSAREQLRNSNMVDYHILTYALALESQATRHSSIEQLQRLLIEIDTTTAQNPLDQAWLAVARSAANLT
LKLDGTIPLLQRALAGLDSEGALAKGLLYLLLSEAFWQRDQFGEARQAWEALDKLIIDGRSGLPVLLSALTVHLPELVHE
AYTQWNSPFAARVLHHSLPMPQAPKLIIRLMGQVRVEMHGKPVKIPKQGILLIALLLMNPSGMTADELRAKIWGFDSSND
GWRKMLQRTRKELPDCVISDGSIYRLCFPLSEIDADILVINQTPLQGSDATLDRLQIAADYASQVFLSGHEAPWIEWERK
QLSKRGAEIWISIGIQCYDALRFDQAQKAFAQALRLDISNGRAVSQAMNLEINQGRRLEALAIYDRYREALFEEYGLDPS
AELQALQKRALD

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 109322; Mature: 109191

Theoretical pI: Translated: 6.57; Mature: 6.57

Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSFYPTYVERPRLLTLTQHAPRVVLIIGLPSSGKSTVLEALKHSINAPSALIRLEESAHD
CCCCCCHHCCCCEEEEECCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHEEHHCCCC
PLALLQAICQQLGLPSDHAHEQLLRLRQPSWILIDDLDRILDAWGTFLPEHAWLSELLKN
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCC
PALHIAATSLHLPNLPMIQQSIIRRQLRIVGMQELAFTSAELIELAQQRQLHLTHAQAEQ
CCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIALTDGWVAPCIFALNRSGVLNQSAVEWVMQDVMASLPAPLHQMLEAWLWLAPDSTELL
EEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHEECCCCHHHHH
QALLPHYDLHRLMMSWEYAGLLAQSSLQLQRLPEVGLRQRSDPQASYLSPWFEQAGDWYL
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCHHHCCHHHHHCCCHHH
AQQQLLPFVQKMQRLQRWDVINHSLTRNLALIDRQQFFAEIVNALNAVPVQQLSSKVGWL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
LVRSYHLGLRNGEKALLLVNQLLGIHQQPDDQRMLRLLKADMLRAQGAIVEADGLIQPYL
HHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCC
DDPDLSPADQARVLRTHASYLVSLGQDDNAITHFERAYGYIQHSGINRLLGLILGDYANA
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALISDNRAANGALITLGDVALADRDWTSAIARYRSAREQLRNSNMVDYHILTYALALESQ
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HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHCCCC
EGALAKGLLYLLLSEAFWQRDQFGEARQAWEALDKLIIDGRSGLPVLLSALTVHLPELVH
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CCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCEEEEEECHHHCCCCEEE
INQTPLQGSDATLDRLQIAADYASQVFLSGHEAPWIEWERKQLSKRGAEIWISIGIQCYD
EECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHH
ALRFDQAQKAFAQALRLDISNGRAVSQAMNLEINQGRRLEALAIYDRYREALFEEYGLDP
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SAELQALQKRALD
CHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SFYPTYVERPRLLTLTQHAPRVVLIIGLPSSGKSTVLEALKHSINAPSALIRLEESAHD
CCCCCHHCCCCEEEEECCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHEEHHCCCC
PLALLQAICQQLGLPSDHAHEQLLRLRQPSWILIDDLDRILDAWGTFLPEHAWLSELLKN
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCC
PALHIAATSLHLPNLPMIQQSIIRRQLRIVGMQELAFTSAELIELAQQRQLHLTHAQAEQ
CCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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CCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCEEEEEECHHHCCCCEEE
INQTPLQGSDATLDRLQIAADYASQVFLSGHEAPWIEWERKQLSKRGAEIWISIGIQCYD
EECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHH
ALRFDQAQKAFAQALRLDISNGRAVSQAMNLEINQGRRLEALAIYDRYREALFEEYGLDP
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SAELQALQKRALD
CHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA