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The map label for this gene is 159898894

Identifier: 159898894

GI number: 159898894

Start: 3024060

End: 3026816

Strand: Reverse

Name: 159898894

Synonym: Haur_2373

Alternate gene names: NA

Gene position: 3026816-3024060 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159898895

Following gene: 159898892

Centisome position: 47.69

GC content: 49.98

Gene sequence:

>2757_bases
ATGCATGCTCCTGAGCGAATGCTTGAGCGGCAGCAACGCTATCAGGTAGCTGACGACCATGAGTTTGCATGGCGACAATA
TTGTCTTGGTTTGGCCAACCTTCGGCTTCAGCGGCTTGCGGCGTTGCAGTTGGCCCTGAGCCAAGCCCGCCAAGCATTTG
GGCTGAGCCATGATCCGCTTGGCCTTTTGTATTGTGAGGGTTTGGCTTTAGCTGGGGCTTGGCTCGCTGGAACAAATGTC
GAGAATTTGCAGCGACTGGAAGGCTTGGCTCACCGCTTTCGTGCGCTTGGCTATCCACTTGAGGCAACTCGGACGGATCT
GCTGCGGGTTTTGCATTATTATAGTCTTGGTCAGGTTGAGCGAGGGTTGAGCTTGATTCAGCCGCTTGAAGCCTCGATTG
ATCAGTTGGGCAGCAGATACGACCAAGCCTATTGGCTATGGATTAGTGGGATGACCTATAGTCATAACCATGATTTTAAC
CAAGCTGGTCGTCTGCTTGATCAGGCATTTGTGCTTTTTAGCAGCTTGCACATGCAACCAGAGTGTGCCCGTTGCTTGTT
TGATCGTTCATGGTTGTGGCAGCGCCAAGAGCGCTATGCTGCGGCCTTTAACGACCTCGCGGCGGCTCAGACACTTGCCG
ATGATCTGAATTTGGTTTATTTGATTGCCGCATGTGCCAAAAATACAGGCTTGGCGTTAAGTCGTTTGGGGCGTTATGCT
GCCGCGTTGGATTGGACACTAGATGCCCGTCGGCGCTATGGGCAGCTGGCGCGGCACGATTTTATCAATGGTTGCGAGCT
GAATCTCGCCAATATTCTCTATTATGCTGGCTTGTATGAGCTTGCGCTTAAAATGTTCGAACGGCTTGAGGGGAATTATC
GTCGGCTAAATTTGCTGCGGATGGCAGCTGGGAGTGTCCGCAATCAGGCACTTGTATTGCGTGCTCAACATCAAGCACAG
GCTGCCTATGATCTATTGCGTTCGATTGAAGCGCCGATTTTGCAGGGTACTAATCAATTAGAACAAGCCGAATATTGGCA
AGCGCTGGCTTTTGCACTTGCTGAGCAGGGTGATATTGAGCAAGCAACCACCATCTTCGGCCACGCCGAAAGCCTTTTTA
AGCAACTTGATAATCAACCTGCTGCTGCAAAATGCCGTTTAGAGTTAGCTTGGCTGGCGCTTAAACAACATCAATCAACA
GATGATTCTGATAATGCCCAGATACACACAATTAAACACCAGCTTCAGCAAACTTTGGGCTATTTGGATGATCGCCCATT
CTATCGCTGGCGCATTTTGTATGGGCTAGGTTTGTGCGAGGCGGCCTTTGGTAAAACCGCAGCAGCCCTTGATTACTATA
CCCAAGTTAGTCTTATTATCACCAATTTGCGCCTCGAATTTTTCGATGAACATGCCTCAAGTGCGATCTTTGTGCAGGCC
CACGATCTTTTTACGGCGGCGCTTGATTTGACTCTCCAAGCGAATAATCCGCTGGCCTTATTGCAATTGAGCGAACAACA
ACGCGCCTTGGTATTACGCCAACATCTGGATTCAGGGCGCTCCAATCGTCGGATTCCGCGGGCGTTGCAGGCACAGTTGT
GGCGTGGTTTGCGCACGGATAGTCTGGGTTTCTTGGATGATCTGCCGCCTGTTGGCAAACTTGAGATTCCAGAGATTCAA
TTTGACATCACTGAAGCCTTTGATCAGCTTGATATTGCCCAGCTTCGGCAGCATTTAACGGCGGTATATCAGGCGCGTTG
GGTGGTGTTGGCCTATATTTGTCATGGCTCACGGTTAATTCGCTTAACCCTCACCCCAACCATGCTGCAAGCTGATGTGA
TTGTGCTTGATGCTGGCTTGAAACGCTTGATCGAACGAGCAAGTTTGGCACGATATCGCTGGTTTACCTATAGTGGTCAG
CAAGCAAGCGATCAGCCGATTTGGCCTGAGCTTGAGTCGCTTGCGTCTCACTTATTGCCCCCAATTGTTTCACAACCCCT
TGATTACTTGCTGATTGTGCCCGCTGAGCCGTTACATGGAATTGCATGGGGCACGTTACGACTTAACCAAAAATGGTTGG
CTCAGCATACAGCGATTAATATTCTGCCTAATCTTAGCCACATTCAACCAACCGCCATGGTGGTCAAACCATATAGTCAG
GGGGTTATGATTGGGTGTAGCGAGTTTCGTGATGATTTGCCAGCGTTGCCAAATGTTGAACCTGAAATAGCCCAACTTGA
AGCAATTTATGCTGATCAGCCTACTCTGACCCTCCAGAATGCGGCTGTAACCAAAGCCCGAATCTTCGAGCTATCCAACG
CCGGGAGCTTGCTAGGCTGTCGATTTTTGCATATTGCCAGTCATGCCCAGCTACGCTCTGGCGCAGGCCAAGCTGCCTAT
ATTCAATTGTGGGATGAGCGTTTAAGCTTCGATCAGATTATTGATCTGCAACTCCAAGGAACATGGGTTATTTTATCGGT
CTGTGATGGCTCGGCGAGCGATGTTTTGGCGGGCGAAGAGGTGTTGAGCTTGAGTCGGGCTTTTTTGGCAGCAGGAGCTA
CGGCGGTAATTGCCAACCTTTGGAAGCAAGCAGATGATGCTTCGCCTCGCTTGATGGCCCGCTTGCATAGCTTGCTCCAT
GCTGGTAGCGACCCAGTACGAGCACTATGTTTGCTCCAAAATGATTGGCTTATGCACTATGATAACGCTTCTCCCTTAGT
TTGGGGCGGGCTTCAAGTTATTAGTAGTTTGGCCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGTTTTTTGATTGGTATGCTGAACGCGTAACTTTGAAACGGAGGGAGCATTGATTCCTGCAACTGCACCGAAGCCAATTC
GTCGTTGGTTGTTGCTAGCG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTTCTTCGATTTGGCATGCCCTCACCACCTAGCCCCTGCTTCTGCCCGGATGGCGATCGGAATCACCGTATCATGAAGG
GTGGAGCACCCCTCTCCCGC

Product: tetratricopeptide domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: Tetratricopeptide Domain-Containing Protein; Tetratricopeptide Domain Protein; TPR Domain-Containing Protein

Number of amino acids: Translated: 918; Mature: 918

Protein sequence:

>918_residues
MHAPERMLERQQRYQVADDHEFAWRQYCLGLANLRLQRLAALQLALSQARQAFGLSHDPLGLLYCEGLALAGAWLAGTNV
ENLQRLEGLAHRFRALGYPLEATRTDLLRVLHYYSLGQVERGLSLIQPLEASIDQLGSRYDQAYWLWISGMTYSHNHDFN
QAGRLLDQAFVLFSSLHMQPECARCLFDRSWLWQRQERYAAAFNDLAAAQTLADDLNLVYLIAACAKNTGLALSRLGRYA
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HDLFTAALDLTLQANNPLALLQLSEQQRALVLRQHLDSGRSNRRIPRALQAQLWRGLRTDSLGFLDDLPPVGKLEIPEIQ
FDITEAFDQLDIAQLRQHLTAVYQARWVVLAYICHGSRLIRLTLTPTMLQADVIVLDAGLKRLIERASLARYRWFTYSGQ
QASDQPIWPELESLASHLLPPIVSQPLDYLLIVPAEPLHGIAWGTLRLNQKWLAQHTAINILPNLSHIQPTAMVVKPYSQ
GVMIGCSEFRDDLPALPNVEPEIAQLEAIYADQPTLTLQNAAVTKARIFELSNAGSLLGCRFLHIASHAQLRSGAGQAAY
IQLWDERLSFDQIIDLQLQGTWVILSVCDGSASDVLAGEEVLSLSRAFLAAGATAVIANLWKQADDASPRLMARLHSLLH
AGSDPVRALCLLQNDWLMHYDNASPLVWGGLQVISSLA

Sequences:

>Translated_918_residues
MHAPERMLERQQRYQVADDHEFAWRQYCLGLANLRLQRLAALQLALSQARQAFGLSHDPLGLLYCEGLALAGAWLAGTNV
ENLQRLEGLAHRFRALGYPLEATRTDLLRVLHYYSLGQVERGLSLIQPLEASIDQLGSRYDQAYWLWISGMTYSHNHDFN
QAGRLLDQAFVLFSSLHMQPECARCLFDRSWLWQRQERYAAAFNDLAAAQTLADDLNLVYLIAACAKNTGLALSRLGRYA
AALDWTLDARRRYGQLARHDFINGCELNLANILYYAGLYELALKMFERLEGNYRRLNLLRMAAGSVRNQALVLRAQHQAQ
AAYDLLRSIEAPILQGTNQLEQAEYWQALAFALAEQGDIEQATTIFGHAESLFKQLDNQPAAAKCRLELAWLALKQHQST
DDSDNAQIHTIKHQLQQTLGYLDDRPFYRWRILYGLGLCEAAFGKTAAALDYYTQVSLIITNLRLEFFDEHASSAIFVQA
HDLFTAALDLTLQANNPLALLQLSEQQRALVLRQHLDSGRSNRRIPRALQAQLWRGLRTDSLGFLDDLPPVGKLEIPEIQ
FDITEAFDQLDIAQLRQHLTAVYQARWVVLAYICHGSRLIRLTLTPTMLQADVIVLDAGLKRLIERASLARYRWFTYSGQ
QASDQPIWPELESLASHLLPPIVSQPLDYLLIVPAEPLHGIAWGTLRLNQKWLAQHTAINILPNLSHIQPTAMVVKPYSQ
GVMIGCSEFRDDLPALPNVEPEIAQLEAIYADQPTLTLQNAAVTKARIFELSNAGSLLGCRFLHIASHAQLRSGAGQAAY
IQLWDERLSFDQIIDLQLQGTWVILSVCDGSASDVLAGEEVLSLSRAFLAAGATAVIANLWKQADDASPRLMARLHSLLH
AGSDPVRALCLLQNDWLMHYDNASPLVWGGLQVISSLA
>Mature_918_residues
MHAPERMLERQQRYQVADDHEFAWRQYCLGLANLRLQRLAALQLALSQARQAFGLSHDPLGLLYCEGLALAGAWLAGTNV
ENLQRLEGLAHRFRALGYPLEATRTDLLRVLHYYSLGQVERGLSLIQPLEASIDQLGSRYDQAYWLWISGMTYSHNHDFN
QAGRLLDQAFVLFSSLHMQPECARCLFDRSWLWQRQERYAAAFNDLAAAQTLADDLNLVYLIAACAKNTGLALSRLGRYA
AALDWTLDARRRYGQLARHDFINGCELNLANILYYAGLYELALKMFERLEGNYRRLNLLRMAAGSVRNQALVLRAQHQAQ
AAYDLLRSIEAPILQGTNQLEQAEYWQALAFALAEQGDIEQATTIFGHAESLFKQLDNQPAAAKCRLELAWLALKQHQST
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FDITEAFDQLDIAQLRQHLTAVYQARWVVLAYICHGSRLIRLTLTPTMLQADVIVLDAGLKRLIERASLARYRWFTYSGQ
QASDQPIWPELESLASHLLPPIVSQPLDYLLIVPAEPLHGIAWGTLRLNQKWLAQHTAINILPNLSHIQPTAMVVKPYSQ
GVMIGCSEFRDDLPALPNVEPEIAQLEAIYADQPTLTLQNAAVTKARIFELSNAGSLLGCRFLHIASHAQLRSGAGQAAY
IQLWDERLSFDQIIDLQLQGTWVILSVCDGSASDVLAGEEVLSLSRAFLAAGATAVIANLWKQADDASPRLMARLHSLLH
AGSDPVRALCLLQNDWLMHYDNASPLVWGGLQVISSLA

Specific function: Unknown

COG id: COG4995

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 103109; Mature: 103109

Theoretical pI: Translated: 6.39; Mature: 6.39

Prosite motif: PS00018 EF_HAND_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MHAPERMLERQQRYQVADDHEFAWRQYCLGLANLRLQRLAALQLALSQARQAFGLSHDPL
CCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
GLLYCEGLALAGAWLAGTNVENLQRLEGLAHRFRALGYPLEATRTDLLRVLHYYSLGQVE
HHHEECHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RGLSLIQPLEASIDQLGSRYDQAYWLWISGMTYSHNHDFNQAGRLLDQAFVLFSSLHMQP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
ECARCLFDRSWLWQRQERYAAAFNDLAAAQTLADDLNLVYLIAACAKNTGLALSRLGRYA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
AALDWTLDARRRYGQLARHDFINGCELNLANILYYAGLYELALKMFERLEGNYRRLNLLR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
MAAGSVRNQALVLRAQHQAQAAYDLLRSIEAPILQGTNQLEQAEYWQALAFALAEQGDIE
HHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
QATTIFGHAESLFKQLDNQPAAAKCRLELAWLALKQHQSTDDSDNAQIHTIKHQLQQTLG
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHC
YLDDRPFYRWRILYGLGLCEAAFGKTAAALDYYTQVSLIITNLRLEFFDEHASSAIFVQA
CCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
HDLFTAALDLTLQANNPLALLQLSEQQRALVLRQHLDSGRSNRRIPRALQAQLWRGLRTD
HHHHEEHEEEEEECCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCC
SLGFLDDLPPVGKLEIPEIQFDITEAFDQLDIAQLRQHLTAVYQARWVVLAYICHGSRLI
CCCCHHCCCCCCCEECCCEEEEHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
RLTLTPTMLQADVIVLDAGLKRLIERASLARYRWFTYSGQQASDQPIWPELESLASHLLP
EEEECCHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCC
PIVSQPLDYLLIVPAEPLHGIAWGTLRLNQKWLAQHTAINILPNLSHIQPTAMVVKPYSQ
HHHCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEECCC
GVMIGCSEFRDDLPALPNVEPEIAQLEAIYADQPTLTLQNAAVTKARIFELSNAGSLLGC
CEEEEHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCHHHHHHHEEECCCCCHHHH
RFLHIASHAQLRSGAGQAAYIQLWDERLSFDQIIDLQLQGTWVILSVCDGSASDVLAGEE
HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHCCCCCEEEEEEECCEEEEEECCCCCCCHHHHHH
VLSLSRAFLAAGATAVIANLWKQADDASPRLMARLHSLLHAGSDPVRALCLLQNDWLMHY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEEECCCEEEE
DNASPLVWGGLQVISSLA
CCCCCCHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MHAPERMLERQQRYQVADDHEFAWRQYCLGLANLRLQRLAALQLALSQARQAFGLSHDPL
CCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
GLLYCEGLALAGAWLAGTNVENLQRLEGLAHRFRALGYPLEATRTDLLRVLHYYSLGQVE
HHHEECHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RGLSLIQPLEASIDQLGSRYDQAYWLWISGMTYSHNHDFNQAGRLLDQAFVLFSSLHMQP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
ECARCLFDRSWLWQRQERYAAAFNDLAAAQTLADDLNLVYLIAACAKNTGLALSRLGRYA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
AALDWTLDARRRYGQLARHDFINGCELNLANILYYAGLYELALKMFERLEGNYRRLNLLR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
MAAGSVRNQALVLRAQHQAQAAYDLLRSIEAPILQGTNQLEQAEYWQALAFALAEQGDIE
HHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
QATTIFGHAESLFKQLDNQPAAAKCRLELAWLALKQHQSTDDSDNAQIHTIKHQLQQTLG
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHC
YLDDRPFYRWRILYGLGLCEAAFGKTAAALDYYTQVSLIITNLRLEFFDEHASSAIFVQA
CCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
HDLFTAALDLTLQANNPLALLQLSEQQRALVLRQHLDSGRSNRRIPRALQAQLWRGLRTD
HHHHEEHEEEEEECCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCC
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CCCCHHCCCCCCCEECCCEEEEHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
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EEEECCHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCC
PIVSQPLDYLLIVPAEPLHGIAWGTLRLNQKWLAQHTAINILPNLSHIQPTAMVVKPYSQ
HHHCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEECCC
GVMIGCSEFRDDLPALPNVEPEIAQLEAIYADQPTLTLQNAAVTKARIFELSNAGSLLGC
CEEEEHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCHHHHHHHEEECCCCCHHHH
RFLHIASHAQLRSGAGQAAYIQLWDERLSFDQIIDLQLQGTWVILSVCDGSASDVLAGEE
HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHCCCCCEEEEEEECCEEEEEECCCCCCCHHHHHH
VLSLSRAFLAAGATAVIANLWKQADDASPRLMARLHSLLHAGSDPVRALCLLQNDWLMHY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEEECCCEEEE
DNASPLVWGGLQVISSLA
CCCCCCHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA