| Definition | Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009972 |
| Length | 6,346,587 |
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The map label for this gene is 159898777
Identifier: 159898777
GI number: 159898777
Start: 2881809
End: 2885696
Strand: Reverse
Name: 159898777
Synonym: Haur_2256
Alternate gene names: NA
Gene position: 2885696-2881809 (Counterclockwise)
Preceding gene: 159898779
Following gene: 159898775
Centisome position: 45.47
GC content: 44.98
Gene sequence:
>3888_bases ATGTCATCATTATTGCCATTGCTTCCCTCACCATTGCTCAGACTTCTGAACGCCTCTGACCAGCCAAACACATTAATGGC CGAACAGCAGTTTAACGCGGTTGTCTTATTTGCTGATATTGCAGGGTTTACCACATTGAGCGATCAGGTGCGCGACGTTG GTGCTCGTGGGACTGAACAGCTAACTCTGCTGTTAAATCATGTTTTTGAGGCGATGATCGACTTGATTCAGGCAGCGGGC GGGATGGTTTGGGGCTTTAGTGGCGATGCATTAACTGCGCTTTTTCGGTATGAAACTGAGAATCAAGCGGCGATTGCCCA ACAAGCCTTAACGTGTAGTCTTGCAATGCAAGCAGCCATGGCCCAATTTCAGACAAGTGCTATGCTTGATGAGCTGGCAA CTATTCGCTTAACCATGAAAATTGGTTTGGCTCATGGTGTGCTTATGTGTGGTATGGCAGGTATTCCCCACCAGCGATTA GTCGCATTATTGGCTGGCCAGCCTTTAATTGAAAGTAGTTTGGTTGAACACCAAGCAAGCGAGGGCTCAATTGGCTTAAC CACTGAGCTTTGGCTGGTTGTTCAGAGCTATGCTCAGGCACAATTGCGCGATGGTTATTATTGGTTGCAAGGCTGCGAAA CGGGAGTTGCAACTGCTTATCCATCATTAGCAGCGCCGCCACTGCCTACATGGGCTGAAAGCTTTATTCACCCCCTAATT GCCAAACGGCTGCACGATAATCAAGCTGCGTTCATTAATGAACATCGGCTGGTCTATGTTTTATTTGCCCAATTATGTAT CGAACAACCAGCCCATGAGCTTGCGATCATTCGTGAATGGGCGAGCATGCTTACAACAGTTAGTGCTCAGTATGATGGTT ATCTTAGCCATGTCGCAGTTGGTGATAAAGGCATCACGAGCATGATTTTGTTTGGAGCACCAATTGCTCACGAAGATGAT CCTTTGCGCATTTTAGATTGTGGCTTGGCTGTACGTGAGCAAACCAGCCAAATGGGCTATCAATCGGCTTTAGGCTTAAA TAGTGGTGTAGTGTATTGTGGGCTGGTGGGTTCAGTTATTCGCCGCGATTATACAACGATTGGCGATGCAATTAATGTGG CGGCCCGCTTGATGGAGCATGCTAAGGCTGATCAGATTTTGGTGAGTATGGAGCTTGCCAAGCTGGCCCAAACCCAATTT CGTTGGCAACTCTTACCTGATGCTCGACTCAAAGGCAAACCACAACCAATTGCCCTGATGGCCTTACAGCAACGAGCTTT TGAAGCCTCAGTCCGCTTGCCTGAATTTGTTAGTAATCTGCGATTAATTGGGCGTGCCAGCGAATTAACCATGTTATTGC AAGCAACCGAGCAAACCTTGACTGGTCATGGGCAAATTATAGCGATTGTTGGCGATGCTGGGATCGGAAAATCGCATTTG ATTAATACATTCATCCAACAACTTGACGCTGAGCGCTGGAATATTTATCGTGGCGAGTGCGAGGCCTATGGTGAAAATAG CCCTTATTTGGTCTGGAATGCAATTTGGCGAGCCTTCTTCTGTATTGAGCCAATGTGGGATCTGGCTACCCAAATTCGGG TTTTGAGCTTCCAATTAGAACTAATCGATCCAAGTTTACTCAATCGCCTACCGTTACTGGGAACGATCTTCAACCTAATG ATTCCACCCAACGAAACGACAGCCTTACTTGAACCCCAACTGCAAAAACTGGCTCGTGAAGCGATTTTGGTTCAATGCTT ACGAACTCGCGCTACCAATCAACCAATGATCTTAGTATTAGAGGATTGTCATTGGATCGACCCATTGTCGGCGGATTTAC TATGGGCGATTAGTCAAATAATTGAAGCGTTACCAATTTGTATTATTTTAGGATTTCGCCCATCGATACAGAATGAAGTA ATTGCTCAGCGCTTACCGCAATTGACGTATTGGCATCGCTTGAACCTTAATGAATTTAATCAGAGCGAAGCGAGCCAATT GGTTGCTTATAAAATGCAGCATTGGCCTGGCGAGCACCATATCTCAAGTCTATTAGCCGACCATTTAATTAATCAGGCCG AGGGAAATCCTTTTTACTTGGAGGAATTACTCAATTATGTGTATACGCAAGGCTTAGATCTCAATGATGCTGCGGTTATT GGTAAATTACAACTTCCTGCAAGTTTATCGAGCTTGATTCTAAGCAGAATTGATCAGCTTAATCAGCGCCAGCAATTGAC AATTAAAGTTGCGAGTATTATTGGTCGGTTGTTTAAATTGCACTGGTTATGGGGTGTTTATCCTCAGCTGGGTGAGCATC AGACAATTCAAACCGATCTTGAAACGCTTGATCGACTGGAGTTAACAATTAAATATAGTTTTGAACCAGAGGTTGCCTAT ATTTTTAAGCATATGTTGACCTATGAAGTAACCTACGAGAGTTTAACCTATGCGACACGCTCAACCTTACATGAGCAATT TGGCCATTTTCTTGAGCAACACTATGCTGATGATCCCGCCTATCTTGATCTGATTTGCTATCATTTTATGCGTAGCGATA ATCGTAGTAAGCAGATTGAATATTTATGGAAGGCTGCTGATGCTGCCCAACGATCCTATGCCAATGAAGCAGCCTTATTG TTTTATCAACAATTATTGAGTTTATTAGCGGACGTTGAGCATTGGTCAGTGTTGTTGCCTATTGGTGAGATTCTCCAAAT TATTGGTAAGCCGCATGCAGCGATTGAAACCTATCAAACGATTATTAATGGGCTATTAGCTCCTGATGCGGCTATTGGTA AAAGCCATTGGAGCATTGGCAAGATTTATGGCGAACTTGGACAATTTCGTCAAGGCTTGGATTGGCTTGAACAAGCTCGA ACCCGTTATTTAACGCGAGGCAATGCGGAAGGTGTTGCCGAAGTGTTAATCGATATTGCGAATATTCTGTGGCAACAAGG CCATTATGAGCAAGGTCTTGCTCATGTGGAGCAAAGCCTTGCGCTTTGGCGACAGTTATCTAACTCGTTGGGAACAGCTC GCGCCTTGTTTCAATTAGGAGTGATTTTATCCGATCAACGGCGATATACCGAGGCTTATCATGCCTTAGAGCAAAGTTTA GAGCTACGGCGTGAGGCCGGAGACTTGTTCGCGATGGCGAGTTCGCTGAACGATCTCGGCATTATTGCTTTTGATCGTGG TGATCATACGACAGCTGAGCAATTGTATACCGAGGCTTTTACTATTCGCCGTGATTTGGGTTTTGTCCGTGGGATGGCTC AATCGTTAAGCAATTTAGCCAATGCAGTGTTTGTTTCGGGTGATTATCAGCGAACTCGTCAGTTGCTTGAGGAAGCTTTA GTTTATCGGCGACAAGTCGGCCATCAACGCGGGATTGCCATCTCACTGGCGCATTTGGGCAATACATACGCGGCTTTAGG GGATTTCAAAGCGGCTTGGATGCATCATCGTGATGCATTTACGATTCGTTGCGCGATTAATCATCGTTTAGGAATTGCTC AATCGCAGGTAGCAATGGGCTTTTTGGCACTGCGAACAGACGATTTTTATCAGGCTTATGGCTTGTTCCAGCAAAGTATT CATGGTTTTTTAGCACTTGATGATCAGCGTGGATTGGCTGAAAATTTGGTCGGGTTTGGCTGTGTCGCGGCTGGAATGCT TAAATATCGGCTTGCACATCAGTTTATGCTCGCAGCTGAAACAATTATTGCAAGCCTCGATACGATTTTTGAGCCAGAAT TTCGCGATGGTCATGCTTGGTTGAAACGCCAATTAGATCAAAATTCATCCGACGTGGTTGGTTTAAGTGAGTCAAACACT GCGCGTGCTATCGCAACACTGCTGAACTTGAGTTATCATTTGTATTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TTGTCTATAGCGTGGGGCTGGTTGTTGGGGATAGCATTTTCGTCTAGGTATGCTAGGATAGTGATTGTACAGCGATGATC ATGCTACTAGGGCTTTATCT
Downstream 100 bases:
>100_bases GCTGCGCCTGAGCAAGTTGTGCTGCAAAATGCTCAGCCTGCGTCGAATTGCTAGCTTGAAGATAATTGACATAAGCTTGT AATAACGTCATCGCCTCATG
Product: TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase
Products: 3',5'-cyclic AMP; diphosphate
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1295; Mature: 1294
Protein sequence:
>1295_residues MSSLLPLLPSPLLRLLNASDQPNTLMAEQQFNAVVLFADIAGFTTLSDQVRDVGARGTEQLTLLLNHVFEAMIDLIQAAG GMVWGFSGDALTALFRYETENQAAIAQQALTCSLAMQAAMAQFQTSAMLDELATIRLTMKIGLAHGVLMCGMAGIPHQRL VALLAGQPLIESSLVEHQASEGSIGLTTELWLVVQSYAQAQLRDGYYWLQGCETGVATAYPSLAAPPLPTWAESFIHPLI AKRLHDNQAAFINEHRLVYVLFAQLCIEQPAHELAIIREWASMLTTVSAQYDGYLSHVAVGDKGITSMILFGAPIAHEDD PLRILDCGLAVREQTSQMGYQSALGLNSGVVYCGLVGSVIRRDYTTIGDAINVAARLMEHAKADQILVSMELAKLAQTQF RWQLLPDARLKGKPQPIALMALQQRAFEASVRLPEFVSNLRLIGRASELTMLLQATEQTLTGHGQIIAIVGDAGIGKSHL INTFIQQLDAERWNIYRGECEAYGENSPYLVWNAIWRAFFCIEPMWDLATQIRVLSFQLELIDPSLLNRLPLLGTIFNLM IPPNETTALLEPQLQKLAREAILVQCLRTRATNQPMILVLEDCHWIDPLSADLLWAISQIIEALPICIILGFRPSIQNEV IAQRLPQLTYWHRLNLNEFNQSEASQLVAYKMQHWPGEHHISSLLADHLINQAEGNPFYLEELLNYVYTQGLDLNDAAVI GKLQLPASLSSLILSRIDQLNQRQQLTIKVASIIGRLFKLHWLWGVYPQLGEHQTIQTDLETLDRLELTIKYSFEPEVAY IFKHMLTYEVTYESLTYATRSTLHEQFGHFLEQHYADDPAYLDLICYHFMRSDNRSKQIEYLWKAADAAQRSYANEAALL FYQQLLSLLADVEHWSVLLPIGEILQIIGKPHAAIETYQTIINGLLAPDAAIGKSHWSIGKIYGELGQFRQGLDWLEQAR TRYLTRGNAEGVAEVLIDIANILWQQGHYEQGLAHVEQSLALWRQLSNSLGTARALFQLGVILSDQRRYTEAYHALEQSL ELRREAGDLFAMASSLNDLGIIAFDRGDHTTAEQLYTEAFTIRRDLGFVRGMAQSLSNLANAVFVSGDYQRTRQLLEEAL VYRRQVGHQRGIAISLAHLGNTYAALGDFKAAWMHHRDAFTIRCAINHRLGIAQSQVAMGFLALRTDDFYQAYGLFQQSI HGFLALDDQRGLAENLVGFGCVAAGMLKYRLAHQFMLAAETIIASLDTIFEPEFRDGHAWLKRQLDQNSSDVVGLSESNT ARAIATLLNLSYHLY
Sequences:
>Translated_1295_residues MSSLLPLLPSPLLRLLNASDQPNTLMAEQQFNAVVLFADIAGFTTLSDQVRDVGARGTEQLTLLLNHVFEAMIDLIQAAG GMVWGFSGDALTALFRYETENQAAIAQQALTCSLAMQAAMAQFQTSAMLDELATIRLTMKIGLAHGVLMCGMAGIPHQRL VALLAGQPLIESSLVEHQASEGSIGLTTELWLVVQSYAQAQLRDGYYWLQGCETGVATAYPSLAAPPLPTWAESFIHPLI AKRLHDNQAAFINEHRLVYVLFAQLCIEQPAHELAIIREWASMLTTVSAQYDGYLSHVAVGDKGITSMILFGAPIAHEDD PLRILDCGLAVREQTSQMGYQSALGLNSGVVYCGLVGSVIRRDYTTIGDAINVAARLMEHAKADQILVSMELAKLAQTQF RWQLLPDARLKGKPQPIALMALQQRAFEASVRLPEFVSNLRLIGRASELTMLLQATEQTLTGHGQIIAIVGDAGIGKSHL INTFIQQLDAERWNIYRGECEAYGENSPYLVWNAIWRAFFCIEPMWDLATQIRVLSFQLELIDPSLLNRLPLLGTIFNLM IPPNETTALLEPQLQKLAREAILVQCLRTRATNQPMILVLEDCHWIDPLSADLLWAISQIIEALPICIILGFRPSIQNEV IAQRLPQLTYWHRLNLNEFNQSEASQLVAYKMQHWPGEHHISSLLADHLINQAEGNPFYLEELLNYVYTQGLDLNDAAVI GKLQLPASLSSLILSRIDQLNQRQQLTIKVASIIGRLFKLHWLWGVYPQLGEHQTIQTDLETLDRLELTIKYSFEPEVAY IFKHMLTYEVTYESLTYATRSTLHEQFGHFLEQHYADDPAYLDLICYHFMRSDNRSKQIEYLWKAADAAQRSYANEAALL FYQQLLSLLADVEHWSVLLPIGEILQIIGKPHAAIETYQTIINGLLAPDAAIGKSHWSIGKIYGELGQFRQGLDWLEQAR TRYLTRGNAEGVAEVLIDIANILWQQGHYEQGLAHVEQSLALWRQLSNSLGTARALFQLGVILSDQRRYTEAYHALEQSL ELRREAGDLFAMASSLNDLGIIAFDRGDHTTAEQLYTEAFTIRRDLGFVRGMAQSLSNLANAVFVSGDYQRTRQLLEEAL VYRRQVGHQRGIAISLAHLGNTYAALGDFKAAWMHHRDAFTIRCAINHRLGIAQSQVAMGFLALRTDDFYQAYGLFQQSI HGFLALDDQRGLAENLVGFGCVAAGMLKYRLAHQFMLAAETIIASLDTIFEPEFRDGHAWLKRQLDQNSSDVVGLSESNT ARAIATLLNLSYHLY >Mature_1294_residues SSLLPLLPSPLLRLLNASDQPNTLMAEQQFNAVVLFADIAGFTTLSDQVRDVGARGTEQLTLLLNHVFEAMIDLIQAAGG MVWGFSGDALTALFRYETENQAAIAQQALTCSLAMQAAMAQFQTSAMLDELATIRLTMKIGLAHGVLMCGMAGIPHQRLV ALLAGQPLIESSLVEHQASEGSIGLTTELWLVVQSYAQAQLRDGYYWLQGCETGVATAYPSLAAPPLPTWAESFIHPLIA KRLHDNQAAFINEHRLVYVLFAQLCIEQPAHELAIIREWASMLTTVSAQYDGYLSHVAVGDKGITSMILFGAPIAHEDDP LRILDCGLAVREQTSQMGYQSALGLNSGVVYCGLVGSVIRRDYTTIGDAINVAARLMEHAKADQILVSMELAKLAQTQFR WQLLPDARLKGKPQPIALMALQQRAFEASVRLPEFVSNLRLIGRASELTMLLQATEQTLTGHGQIIAIVGDAGIGKSHLI NTFIQQLDAERWNIYRGECEAYGENSPYLVWNAIWRAFFCIEPMWDLATQIRVLSFQLELIDPSLLNRLPLLGTIFNLMI PPNETTALLEPQLQKLAREAILVQCLRTRATNQPMILVLEDCHWIDPLSADLLWAISQIIEALPICIILGFRPSIQNEVI AQRLPQLTYWHRLNLNEFNQSEASQLVAYKMQHWPGEHHISSLLADHLINQAEGNPFYLEELLNYVYTQGLDLNDAAVIG KLQLPASLSSLILSRIDQLNQRQQLTIKVASIIGRLFKLHWLWGVYPQLGEHQTIQTDLETLDRLELTIKYSFEPEVAYI FKHMLTYEVTYESLTYATRSTLHEQFGHFLEQHYADDPAYLDLICYHFMRSDNRSKQIEYLWKAADAAQRSYANEAALLF YQQLLSLLADVEHWSVLLPIGEILQIIGKPHAAIETYQTIINGLLAPDAAIGKSHWSIGKIYGELGQFRQGLDWLEQART RYLTRGNAEGVAEVLIDIANILWQQGHYEQGLAHVEQSLALWRQLSNSLGTARALFQLGVILSDQRRYTEAYHALEQSLE LRREAGDLFAMASSLNDLGIIAFDRGDHTTAEQLYTEAFTIRRDLGFVRGMAQSLSNLANAVFVSGDYQRTRQLLEEALV YRRQVGHQRGIAISLAHLGNTYAALGDFKAAWMHHRDAFTIRCAINHRLGIAQSQVAMGFLALRTDDFYQAYGLFQQSIH GFLALDDQRGLAENLVGFGCVAAGMLKYRLAHQFMLAAETIIASLDTIFEPEFRDGHAWLKRQLDQNSSDVVGLSESNTA RAIATLLNLSYHLY
Specific function: Unknown
COG id: COG3899
COG function: function code R; Predicted ATPase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 guanylate cyclase domain [H]
Homologues:
Organism=Homo sapiens, GI209976994, Length=896, Percent_Identity=22.4330357142857, Blast_Score=144, Evalue=5e-34, Organism=Homo sapiens, GI268370055, Length=667, Percent_Identity=21.5892053973013, Blast_Score=99, Evalue=4e-20, Organism=Homo sapiens, GI224028289, Length=359, Percent_Identity=20.891364902507, Blast_Score=72, Evalue=3e-12, Organism=Homo sapiens, GI164519122, Length=320, Percent_Identity=22.5, Blast_Score=71, Evalue=5e-12, Organism=Drosophila melanogaster, GI24650658, Length=296, Percent_Identity=23.3108108108108, Blast_Score=72, Evalue=3e-12,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR001054 - InterPro: IPR011579 [H]
Pfam domain/function: PF01637 Arch_ATPase; PF00211 Guanylate_cyc [H]
EC number: 4.6.1.1
Molecular weight: Translated: 144943; Mature: 144812
Theoretical pI: Translated: 5.58; Mature: 5.58
Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION ; PS50125 GUANYLATE_CYCLASES_2
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 3.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSSLLPLLPSPLLRLLNASDQPNTLMAEQQFNAVVLFADIAGFTTLSDQVRDVGARGTEQ CCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHCCCCEEEEEEHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHH LTLLLNHVFEAMIDLIQAAGGMVWGFSGDALTALFRYETENQAAIAQQALTCSLAMQAAM HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AQFQTSAMLDELATIRLTMKIGLAHGVLMCGMAGIPHQRLVALLAGQPLIESSLVEHQAS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCC EGSIGLTTELWLVVQSYAQAQLRDGYYWLQGCETGVATAYPSLAAPPLPTWAESFIHPLI CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH AKRLHDNQAAFINEHRLVYVLFAQLCIEQPAHELAIIREWASMLTTVSAQYDGYLSHVAV HHHHCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEEE GDKGITSMILFGAPIAHEDDPLRILDCGLAVREQTSQMGYQSALGLNSGVVYCGLVGSVI CCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH RRDYTTIGDAINVAARLMEHAKADQILVSMELAKLAQTQFRWQLLPDARLKGKPQPIALM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCHHHH ALQQRAFEASVRLPEFVSNLRLIGRASELTMLLQATEQTLTGHGQIIAIVGDAGIGKSHL 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: ATP
Specific reaction: ATP = 3',5'-cyclic AMP + diphosphate
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11481430 [H]