Definition Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome.
Accession NC_009972
Length 6,346,587

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The map label for this gene is 159898775

Identifier: 159898775

GI number: 159898775

Start: 2876027

End: 2880355

Strand: Reverse

Name: 159898775

Synonym: Haur_2254

Alternate gene names: NA

Gene position: 2880355-2876027 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159898777

Following gene: 159898773

Centisome position: 45.38

GC content: 48.16

Gene sequence:

>4329_bases
ATGATGACGACCCCAAACACTCAGGTTTTGCATGAAGCCGCCAACCAGCGTGAAAGTGCCCGTTTGTTGCAATTGCGGCT
CACTGGCTTCGTTGGTCGTCAAGCCGAACAAACAGCGATTCGCGGATTAATCGACCAAACCCGCCCAAGCGGTGGCTATG
TGTTGGTGACGGGTGAGGCTGGGGCGGGCAAAAGTAGTCTGCTCGCCCAACTAATTGTGAATGCTGGGCTAGACCAAACC
CCGCAGCATTTTATTGCGCTGACTCCAGGCCGCGCCTATCAACTCGACGTGTTGCGTAGCATCGTTGCTCAACTGCTGCT
TAAACATGATCTGGCGAGCAACTATTTTCCTGCCGATAGCTACCCCGCCTTGCGCCTCGAATTTGGTCAGTTGTTACAAA
CCCTCTCGGCGCGTGGCATCAGTGAAACGATCTATCTCGATGGACTGGATCAATTGCAGCCTGAGGTGGATGGAACCCGC
GATCTCAGCTTTTTACCCTTGCAGCTGCCGCCTGGCATCGTGATAGTGCTTGGCTCGCGTCCCAACGAGACGATCGATAG
TTTAGCACTTGAGCATGGGGTCGTTTATCAGGTTCCACCGTTGCACGAACAGGATGCGATTGGGCGTTGGCAGCAGGTGC
AGCCGACGCTGGAGCCAGCGTTGTTGCACGGTTTAGCGCAAGCCGTCAAGGGCAATGCCTTGTTGATCGAACTGGCGGCC
AATGTGCTGCGCCACACTTCGACTAGTGAAATGCTTGCATTACTCGACCACGCCAGCGCTGACGCAACCAATCTCTTTCG
GCTGAGCCTTGGGCGGATCGAACAAGCAGCGCCGCGCCACTGGCAACCGCTGATTCGCCCGTTGTTGGCGGTGTTGTTGA
TAACCCAAGAACCGCTTGAGCCAGCGGTGCTTGCGGCGATTATTGAACGACCAACCGCTACAGTGGTCGAGGCGCTGACC
CTGATGAGCGATTGGGTGAGTGTTGCCGCCGATCAGCGCGTGGCGCTACGCCATTTGTTGTTTCACGATTTTCTGATCCA
ACACGAATTTACCCAGCCAGAATTGCAAGTGTGGCATGGACGCATGACGCAATGGTGTGGCGCAGCACTTGACCAGATTT
GGCACGATAGTACAGAATCCGTTGAACAGGCACGGCGCTGGTATGCACGCCAGCATTACATCACCCATTTGGATTGCGCA
GAACAATGGGAAGCATTGTGGCAAGTGATCGATGCGGGCGATTATGGCGAGCACAAAGTGCGGTTTGAGCCAAGCACGCG
CTTGTATGGCTTGGATTTGGATCGGGCCCGCGAGAGCGTAATTGCCGCTGGCCAGAGCATCGAACAGCAGCTTGAATTAT
TGCCACGCTTGTGGCGCTATAGCCTGCTGCGCACCAGCCTCACGGCCCATGCCGATCAATGGCATGATGATGTATTTGTG
ATTTTGGCGATGCTTGGGCGGGTATCTGAGGCGCTTGCCCAGATTGAAATTTGCTCGGATCAAGTACGTCAAGTGCTGTT
ATGGTCACGTGTAGTTGCTTATACAGAGCCTGAGCTGCGTTTGCATATTTTTCAGCGCATGGAACAAGTTGCGCGAAGCT
TGCATGAGTCTGAAGAGCGTGATTATGCGTTGCATCTCGTTGCAATGGCCTATGCTGACCATGGCTTGCTAAATATGGCC
TACCCGATTGCGATTAGCCTGGGGAATACTCGTGATGAAACGCTTGCTTATTTGGTTGACGTGGTGATTAAACAGCATGA
TTTGGCAAGAGTTAAGCTGATCATTGGACAAATTCAAACTCCAAAATATCGAATTAAGAGTTCTATGCTGCTAGCTAATG
CCCTGATTGAAGAAACTGAATTTATCGAGGCTCGACAACTATTAATTGAAACGTTACCATTTGCTCAAAACGAGCAAGTA
GTTGAAATTAAAAGCTTACTTGCAACAATTGCATGGCGGTTGGGTGATCATCAACAGGCCGATATATTACTAGCTGAAGC
TCGATCCATGCACAAATATTTTGCTGATGATGCAAAAATTGCAGCACTTTTGGCAATAATTAAAGGGTACTTGGCACAAG
GGAATTTAGCACAAGCCTATAATTTGCATGATGAGATCAAATTAAATCGATTTCGTCGGGAATTAGTTGATATCTATATT
AATCGTGATGATATTGCAATCGCGGTTGAGCTTGCGGCTACCATTACCCACTGGCACTCCAGTGATCTGGCTTATGCCGC
ACTAGTTGCCTGGTATTGTAAGGAAGCTGATTTCTCGAAGGCCGAGCAAGCGCTTGGATTAATCAAAGCGCCTGATCAAC
AGATTAAAAGCTATTGTTTATTGGCAAATAGCCATGCCGATCGATTTCAATGGATGCGGCTGCTGGAGTCGGCCCAGCTG
TCTTTGAGTTCGGTTATAAGCTCGATCTCTTTAGCAAAATGCTGGCTGCAACTTGCCGATGCATATGCTTTTCAGCATGC
GCATGACCGTGCTCAGTCTATGTTTGAGCATGCGTTGACAGCGATTTTGGCCACATCAAACTCGTTTTTGAATGACCAAA
TGTATGATTTATTGCAGCTTGCTCATTTTGCTAAACGCTATAACTATGATGATCTCTGTCAGCGAGTGATCTACACCACG
TTTTTAGTTGGTAAACACGAGGATTTTGAGTATTCTTTGCCGTTTGAGCATGCTATGCTCCATCTTAATCATGGTGAGAT
AGACCAAGTTCGCCAGATTATTGACACAAGTGTTGGACCATATGTGGCAGTTAACTTATTACAAATACTTATAGCTGAAT
CAATTAAGCAACAGGATCATCCTCAAGCTCAACTATACTTGTTCGAGGCGTTGAACCATGCACGAAAGCTTGAAAATCCT
AGCTATCGGGTGAGTCTCCTGGGTGAACTTGCTGATATAGCCTTAGCTAGTGGGTTTGAGCTACTCGCTAAAACAATTCT
CGGCGAAGCTACGCAACTGCTGCCCGTAATCACTGCTGAAAACGAGCAGCGTTGGGCTGGGGTGGGCCTTGTTCGTCGCT
ATTATAGCCATGGGATGCTAGCGAGTGCGGCTACGATAACCCAGGTAATGACCGTTTCGCAAACACACGATCACATTATG
GTAGAAATAAGTCTTTGTTATGCTGATAGTGGACAGCTAGCCCAAGCTTATGCAACGCTGAAGGTTATCAATACTCAAAC
TGAAGTGTATGCACGGAATTTGTGCCAGATTATTATTAAAGCGCATGAGCATGGTTTAGCTACGCTTGCAGCAGAGTATT
ATGATGAGTTGATTGAAGCATGGAGTGTAATTGCCGATCCGATTCGCTTGCTTAAGGATCTAAAGGATCTGGCGATTGCC
CAGATTAACTATGGCTCCAATCAGTATCTCCCCAGCCTATTGGAGGCCATCCGCACTATTCGACATCCAGCCTTGGCTGA
GTATCAGTATGTGGAAGTGCTTTGTGAAATTGCCAGAGCCTATATCAAACAAGCCAATTACCCAGATTTTGCCGATTGGT
TAGCGTATGCCCATTCCATTGCTCAATCGATTGTGATTGAGTCGCGTCCCAAAGTTGCTGCTTATCATTATGTTGCGATC
ACATATCTTTGCCATGCTACCGATTCAGATACAGAGATATTTTTGGCTGATATGCTTCGTTTAGCCAATGGTATTGCACC
GAGTAGCTATGCAAATGATCTATTTAATGCATTAGCCAATAGCTGTGCGTCCTATGCGGTGCGTGGGCATCCAGATTTTT
TTGCCAAAGCCTATCAGTTTGCTATGGCTATTTCAGTGCCGTGGCAGCGTGCCCAAGCCCTAAGAAGCGTCGCCAATGGC
TATGCTAAAGTTGATGACCGCGTGATGGTAGAAATGATTATTGCTGAAATAAGCCGACTTTCGCCTAATTACTTAAGTCT
TGATGCTGTCGCTTTGATCTATGCGCAACGAGGCGATTTGGCTTTTGCTCAAACGCTGATTGCCAATGATGAAGCATCTG
AAGAACGAGATGCTGTCTTGGATTATCTGATTCCAGCTTTGCTGCAAACCGATGCTGTCGTTGCTGCATATCAGATCTCG
CATGGGTTTACTAGGCTGACGAAACGGATTAAGTTCTTGCACCAAATCGTTAACTACTACGTTGAGCGTGGGCAGATTGC
CGAAAGTATTCAGATTATTCAAGCCGCATGGCGTAATTGTGGTGCTGCTGCTGATCTATGGGAGCTGCGGACAATCGTCT
TGCCGTTTGATTCAACCCATCCTTGGCTTGGCACTGCCGTGCTCGATAGCGTGCCATGGGTTGAGCAGCAATTAGCCCGA
TTGAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTCTTCGTGGTTTCAGCCTTCGTGCCCTTCGTGGATCAACGATATAATTAAATCCATCTGTGCTATGCTCTGGCACGAT
AGGTTGAATTGAGGAGAAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AACGTTTGAATAAAAGCTGTGTTGGCTTGAAGCTTGGGAGTGGTCAGAACCACGAAGGACGCGAAGGTTAAGTTTTTTGC
CACAGATGAGCACAGATTTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1442; Mature: 1442

Protein sequence:

>1442_residues
MMTTPNTQVLHEAANQRESARLLQLRLTGFVGRQAEQTAIRGLIDQTRPSGGYVLVTGEAGAGKSSLLAQLIVNAGLDQT
PQHFIALTPGRAYQLDVLRSIVAQLLLKHDLASNYFPADSYPALRLEFGQLLQTLSARGISETIYLDGLDQLQPEVDGTR
DLSFLPLQLPPGIVIVLGSRPNETIDSLALEHGVVYQVPPLHEQDAIGRWQQVQPTLEPALLHGLAQAVKGNALLIELAA
NVLRHTSTSEMLALLDHASADATNLFRLSLGRIEQAAPRHWQPLIRPLLAVLLITQEPLEPAVLAAIIERPTATVVEALT
LMSDWVSVAADQRVALRHLLFHDFLIQHEFTQPELQVWHGRMTQWCGAALDQIWHDSTESVEQARRWYARQHYITHLDCA
EQWEALWQVIDAGDYGEHKVRFEPSTRLYGLDLDRARESVIAAGQSIEQQLELLPRLWRYSLLRTSLTAHADQWHDDVFV
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YPIAISLGNTRDETLAYLVDVVIKQHDLARVKLIIGQIQTPKYRIKSSMLLANALIEETEFIEARQLLIETLPFAQNEQV
VEIKSLLATIAWRLGDHQQADILLAEARSMHKYFADDAKIAALLAIIKGYLAQGNLAQAYNLHDEIKLNRFRRELVDIYI
NRDDIAIAVELAATITHWHSSDLAYAALVAWYCKEADFSKAEQALGLIKAPDQQIKSYCLLANSHADRFQWMRLLESAQL
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FLVGKHEDFEYSLPFEHAMLHLNHGEIDQVRQIIDTSVGPYVAVNLLQILIAESIKQQDHPQAQLYLFEALNHARKLENP
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YAKVDDRVMVEMIIAEISRLSPNYLSLDAVALIYAQRGDLAFAQTLIANDEASEERDAVLDYLIPALLQTDAVVAAYQIS
HGFTRLTKRIKFLHQIVNYYVERGQIAESIQIIQAAWRNCGAAADLWELRTIVLPFDSTHPWLGTAVLDSVPWVEQQLAR
LN

Sequences:

>Translated_1442_residues
MMTTPNTQVLHEAANQRESARLLQLRLTGFVGRQAEQTAIRGLIDQTRPSGGYVLVTGEAGAGKSSLLAQLIVNAGLDQT
PQHFIALTPGRAYQLDVLRSIVAQLLLKHDLASNYFPADSYPALRLEFGQLLQTLSARGISETIYLDGLDQLQPEVDGTR
DLSFLPLQLPPGIVIVLGSRPNETIDSLALEHGVVYQVPPLHEQDAIGRWQQVQPTLEPALLHGLAQAVKGNALLIELAA
NVLRHTSTSEMLALLDHASADATNLFRLSLGRIEQAAPRHWQPLIRPLLAVLLITQEPLEPAVLAAIIERPTATVVEALT
LMSDWVSVAADQRVALRHLLFHDFLIQHEFTQPELQVWHGRMTQWCGAALDQIWHDSTESVEQARRWYARQHYITHLDCA
EQWEALWQVIDAGDYGEHKVRFEPSTRLYGLDLDRARESVIAAGQSIEQQLELLPRLWRYSLLRTSLTAHADQWHDDVFV
ILAMLGRVSEALAQIEICSDQVRQVLLWSRVVAYTEPELRLHIFQRMEQVARSLHESEERDYALHLVAMAYADHGLLNMA
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FLVGKHEDFEYSLPFEHAMLHLNHGEIDQVRQIIDTSVGPYVAVNLLQILIAESIKQQDHPQAQLYLFEALNHARKLENP
SYRVSLLGELADIALASGFELLAKTILGEATQLLPVITAENEQRWAGVGLVRRYYSHGMLASAATITQVMTVSQTHDHIM
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TYLCHATDSDTEIFLADMLRLANGIAPSSYANDLFNALANSCASYAVRGHPDFFAKAYQFAMAISVPWQRAQALRSVANG
YAKVDDRVMVEMIIAEISRLSPNYLSLDAVALIYAQRGDLAFAQTLIANDEASEERDAVLDYLIPALLQTDAVVAAYQIS
HGFTRLTKRIKFLHQIVNYYVERGQIAESIQIIQAAWRNCGAAADLWELRTIVLPFDSTHPWLGTAVLDSVPWVEQQLAR
LN
>Mature_1442_residues
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FLVGKHEDFEYSLPFEHAMLHLNHGEIDQVRQIIDTSVGPYVAVNLLQILIAESIKQQDHPQAQLYLFEALNHARKLENP
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VEISLCYADSGQLAQAYATLKVINTQTEVYARNLCQIIIKAHEHGLATLAAEYYDELIEAWSVIADPIRLLKDLKDLAIA
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TYLCHATDSDTEIFLADMLRLANGIAPSSYANDLFNALANSCASYAVRGHPDFFAKAYQFAMAISVPWQRAQALRSVANG
YAKVDDRVMVEMIIAEISRLSPNYLSLDAVALIYAQRGDLAFAQTLIANDEASEERDAVLDYLIPALLQTDAVVAAYQIS
HGFTRLTKRIKFLHQIVNYYVERGQIAESIQIIQAAWRNCGAAADLWELRTIVLPFDSTHPWLGTAVLDSVPWVEQQLAR
LN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 161989; Mature: 161989

Theoretical pI: Translated: 5.57; Mature: 5.57

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MMTTPNTQVLHEAANQRESARLLQLRLTGFVGRQAEQTAIRGLIDQTRPSGGYVLVTGEA
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CCHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
NVLRHTSTSEMLALLDHASADATNLFRLSLGRIEQAAPRHWQPLIRPLLAVLLITQEPLE
HHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
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ILAMLGRVSEALAQIEICSDQVRQVLLWSRVVAYTEPELRLHIFQRMEQVARSLHESEER
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
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DILLAEARSMHKYFADDAKIAALLAIIKGYLAQGNLAQAYNLHDEIKLNRFRRELVDIYI
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AILATSNSFLNDQMYDLLQLAHFAKRYNYDDLCQRVIYTTFLVGKHEDFEYSLPFEHAML
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HLNHGEIDQVRQIIDTSVGPYVAVNLLQILIAESIKQQDHPQAQLYLFEALNHARKLENP
ECCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SYRVSLLGELADIALASGFELLAKTILGEATQLLPVITAENEQRWAGVGLVRRYYSHGML
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AHEHGLATLAAEYYDELIEAWSVIADPIRLLKDLKDLAIAQINYGSNQYLPSLLEAIRTI
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
RHPALAEYQYVEVLCEIARAYIKQANYPDFADWLAYAHSIAQSIVIESRPKVAAYHYVAI
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TYLCHATDSDTEIFLADMLRLANGIAPSSYANDLFNALANSCASYAVRGHPDFFAKAYQF
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HHHEECCHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCH
AFAQTLIANDEASEERDAVLDYLIPALLQTDAVVAAYQISHGFTRLTKRIKFLHQIVNYY
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VERGQIAESIQIIQAAWRNCGAAADLWELRTIVLPFDSTHPWLGTAVLDSVPWVEQQLAR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHEEEEEECCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHH
LN
CC
>Mature Secondary Structure
MMTTPNTQVLHEAANQRESARLLQLRLTGFVGRQAEQTAIRGLIDQTRPSGGYVLVTGEA
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCC
GAGKSSLLAQLIVNAGLDQTPQHFIALTPGRAYQLDVLRSIVAQLLLKHDLASNYFPADS
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HHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
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HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
DYALHLVAMAYADHGLLNMAYPIAISLGNTRDETLAYLVDVVIKQHDLARVKLIIGQIQT
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CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
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NRDDIAIAVELAATITHWHSSDLAYAALVAWYCKEADFSKAEQALGLIKAPDQQIKSYCL
CCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
LANSHADRFQWMRLLESAQLSLSSVISSISLAKCWLQLADAYAFQHAHDRAQSMFEHALT
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHEE
HLNHGEIDQVRQIIDTSVGPYVAVNLLQILIAESIKQQDHPQAQLYLFEALNHARKLENP
ECCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SYRVSLLGELADIALASGFELLAKTILGEATQLLPVITAENEQRWAGVGLVRRYYSHGML
CHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHH
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AHEHGLATLAAEYYDELIEAWSVIADPIRLLKDLKDLAIAQINYGSNQYLPSLLEAIRTI
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
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CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
TYLCHATDSDTEIFLADMLRLANGIAPSSYANDLFNALANSCASYAVRGHPDFFAKAYQF
HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
AMAISVPWQRAQALRSVANGYAKVDDRVMVEMIIAEISRLSPNYLSLDAVALIYAQRGDL
HHHEECCHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCH
AFAQTLIANDEASEERDAVLDYLIPALLQTDAVVAAYQISHGFTRLTKRIKFLHQIVNYY
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VERGQIAESIQIIQAAWRNCGAAADLWELRTIVLPFDSTHPWLGTAVLDSVPWVEQQLAR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHEEEEEECCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHH
LN
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA