Definition Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome.
Accession NC_009972
Length 6,346,587

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The map label for this gene is 159898567

Identifier: 159898567

GI number: 159898567

Start: 2550200

End: 2554693

Strand: Direct

Name: 159898567

Synonym: Haur_2043

Alternate gene names: NA

Gene position: 2550200-2554693 (Clockwise)

Preceding gene: 159898563

Following gene: 159898568

Centisome position: 40.18

GC content: 50.69

Gene sequence:

>4494_bases
ATGGATGATCGCGCCCTGCGTCTTGCCCTTGAATCCCTGCTGGATGAACCCACCCTCAAATCAGCGCATCGTGCGTCACT
TGAGCGTGGCCTTGCCGATCTCAGAGCGCAGCGCCTCACCTCCGATGAGCGTGACTATCTTTGCTATCTCATCGAGCACT
ATGGGCAGTCAAACCCATCCCCTGATCCCGTGGCCGCCTTAATCGCCGCGTTCCAAGACAAGCTACCAACCTACGATCCC
GCAGCCGTGGCCACGGCAGTTCACCATGCCCTCGCCCAGCAACCCGCCACGCTCAACGGCGCTCCGGTCACAATCACGAT
GAACGGCGATACCTATGCGCACCAGGCAAACTTGGCCATTGGGAATCAGGTGGGCGGCAATCTCGTCCAGGTCACGGTCA
CGATTCCGATTCCTGATGTCCGCTTTGATGCCCTCTTGGCCACCGCCCTCAGAACCCATGAGCACGAAAAAACACGCGAA
CGCCTGATCAACGCCGCCCAACAAATCGAAAGTGATCGGCTCCTGAATCTCCGGCTCAAAGGCTTCGTCGGTCGCGTCAC
CGAACTGGCGGCGATCCGCGAGCATATTGAGACCATGCGCTCCACGGGTGGCTATGTGTTGATCAAGGCAGCGGCAGGTG
AAGGCAAGAGCAGTAGCATTGCCAAGCTGATTCAGGAAGCGGGGATTGCGCAAACACCCCATCACTTTATTGCCCTGACG
ACGGGTCGTGAATATCAATTAGGGTTGTTGCGGGCGGTGGCGGCCCAATTGATTTTGAAACACAATCTTACCGTTTCGTA
CTTCCCCGAAGAAAGCTATCCAGCGATGAAGGGTGAGTTTGTGCGGATTCTTGACGAGCTTTCCAAGCAAGGCATTGAGG
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CCACCCCCAGGCATCGTGATGGTGCTTGGTTCGAGACCGGATGAAACCTTAAAACCGCTCGAGATTCTGCATCGGGTCGA
TTATGACCTGCCGCCACTCAGTGAAGCCGATGCGCTGGCATTGTGGCGATCCGTCCAGCCTGCTGTGGCGGATGGCCTCC
TGCATGACCTCTATGCCGCACTGAAGGGCAATGCGTTGTTCGTCCACTTGGCTGCCAATACCATGCGTGATCAATCAGTG
GTCGATGCGACCAGCCTGATTCGCCAGATCGAGCAGAATCCCAGCAATCTCTTTGGGATTACGCTCGATCGGATTAAGGG
TCGATCACGGTCGCAATGGGATGTGGTCTGGAAGCCAATGCTGGTGCTCTTGCTCGTGGCCCAAGAACCATTGCGGCTGG
ATGTGGTAGGCGATTTGCTGGAACATGATCACGACACGATGCAGGATGCCGTGAGAGTTTTAGGTGGCTTGGTGAGTCAA
GGGATTGATCAACGAGTCGCGCTGCATCACCTACTGTTTCGCGATTATTTGGCAGCAGTGGTCTTTAATGCCCGTGAGGT
GAAACGTTGGCAGCAACGGCTAGCAGACTGGTGTTCCGTTGATTTGGAGATGATTTGGGGTGATCATTCCGATCCTATTG
AACAAGCACGACGGGTCTATGCGCGGTATCATTACATCACGCATCTTTCATTGGCGGAAAATTGGCCAACGCTGTGGCAA
GTTTTGGATGCGGGTGACTATGGCGAACAGAAAACCCGCTTCGATCCGAGTACCCGACTCTATGCCTTGGATTTGGATCG
CGGGCGTGAGAGTGCCATCAACGCGGGACAATCGACCGAGGAACATCTTCAGAACCTGCCACGCCTGTGGAAGTATAGTT
TGCTGCGAACAAGTTTAACCAGTCGCGTTGATCAGTGGCCGGATGATCTGTTTGTGGTCTTAGTGATGCTTGGACGCACA
CAGGAGGCTTTAGATCGGATTGATTTATGTACTGATCATGGGCGGCAAATACAGCTTTGGAAGAAGATTTTGGTATTGTG
CGAACCACAATACCAAAGTACGATTATTATACTTATGCATCAGGTAGCCAGTCACCTTTCAGGCATCGAGAAATTTCGAC
TCCTCGGATTAATTGCGACAACGATTGCAACTCTTGGCGCTATCGACCAAGCCCATCAAATTGCCCAATCCATTACCGAT
CTAACCCATCGTTTCGGTGCATTCAGGGATATCGCCATAACGGCTGACAAACTTGGCAATAGGGAACAAGCGTTAGAGAT
ACTCAATCATGCACTTATCATTGCCCAATCCATTGACGATCCTAAGTCACGAGCTGAACCTCTCTACGCAATTGCGACAA
CGATTGCAACCCTTGGCGCTATCGACCAAGCCCACCAAATTACTTGCCAAATTGATCTTCCTGAGTTGCGTGATGATGCT
CTCGCTGTTGTTGTAACGGTCACTGCCACCTTTGGTGATATCGACCGTGCTTTAGCCATGGCCCAACCCATTGAGGGTCT
ATGGCAACAAGCCCATGCCCTCAGATCTATTGCGATAACCACCACCCATGGTAGTATTAGCCGTGCTCTCGTCATTGCCC
AATCTATTAATGACCCTATTTTCCGTGCTGATGCATTCGGAACTATTGCGACAATCGTTGCCACCCTTGGCGATATCAAC
CAAGCCCTCGCCATTGCCCAATCTATTGATAGTTGGTCTCACCGCGTTGATGCACTCGGAACTATTGCGACAACCGTTGC
CACCCTTGGCGATATCAACCAAGCCCTCGCCATTGCCCAATCTATTGATAGTTGGTCTCACCGCAGTCATGTCTTCAGGA
CCATTGCGGCAACCACCAATATCCTTGGCAATAGGGCAAAAGCAATAAGTATACTCGACCATGCCCGCCAACTTGCCCAA
TCCATTAACGATCGATGGCAAAAGGCCGATGCCCTCAAGGCCATTGCAACAACGGCTGCTACCTTTAATGACCAGGAACA
AGCGATAAGGATACTAGACCAAGCCCTCGCCATTGCCCAATCTATCAAAAGTCTTCGTCAGCGTGCCGATACCCTCAGGG
ATATTGCGATAATCGCCGCCACGATTGGCAGTATCGATCAAGCCTTTGCCATTGCCCAATCTATTGACCATCCTAAACAA
TGTGTTGATACTCTTGGTGTCATCACTATAACGGCTACGGCTGCTTATGGTAATGGCCAACCTGCAATAACAATTTTTAA
CAAGACCAGATCCATTATCCAATCCATTAACTATCCTGAACAACGAGCCGATGCCCTTGGTGTTATTGCAACCACAACTG
CCACCTTCGGCGAAATCAACCGTGCGCTAGCCATTGCTCAATCCATTGATGATTCTGAACGACATGCCGATACACTGAGG
GCTATTGCGACAACTATCGCCACCTTCGGCGAAATCAACCGTGCGCTAGCCATCGCCCAATCCATTAACAATCGATGGCA
ACGTGCTGATGCCCTCAAGGCCATTGCAACAACGGCTGCAGCCTTTGGGGATATCGACCATGCACTTGTTATTACTAAAT
TCATTAATGAATTTTTCCAGCAGACCAATGCCCTAAGGTCTATTGCAATAACCACCGCCACCTTCGGTGATATCAACCGT
GCGCTAACCATCGCTCAATCTATTAATGACCTTGGTCAACAGGCTGACACGCTCAAGGTTATTGCAACCATCACTTCAAC
CCTTGGTGATACTAACCGTGCACTAGCCATCGCTCAATCTATTAATGATCTTGTGCATCGTGTGGATGTTCTCTGTTTCC
TCGCGTTAATCGCCACTAAACTCGGCAACAGAGAAAAAGGCACAGATCTACTCAATTATGCTATTGTTATTGCTCAATCC
ATTGTTCGCCCCGAGCGATGTGCCGATGCATTCAAAGTTATTGCGATAACCACCGCTACTCTTGGCGATATCAGTCAAGC
CCTTGCGATTGCTCAATCCATTGTTCGCCCTGAGCGGCGTGCCGATGCATTCAAAGTTATTGCGATAACCACCGCTACTC
TTGGCGATATCAGTCAAGCCCTTGCGATTGCCCAATCCATTACCCAGCCCGAGCAATGTGTTGATGCACTCGGAACTATT
GCTGCGAGGGCTGCCGATACTTACGGTAACGATCAACTTCCAATGGCAATTCTCGAGAAGGCTCACCAAATTGCCCAATC
TATTGCCCAGCCTGAGCGACGTGCCGATGCGCTCGGGACTATTGCGACAACCACCGCTACCCTTGGCGATATCGATCGTG
CCATTGCCATTGTCCAATCCATTGTCAGTCCTGATAAACATGACCATTCTCTTAGGATGATTGTAAAAACAGTACGATCA
ATAACAAGAATTCTCGCTATCATTCAGAGAATATGGTTTCATAGCAAAACATCCGGTAGCATATGGGGAATGACCCCAAT
TATCGCTCCACTATTAAATGACTATCCATGGCTTGGAACAGCAATTCTGAAGGAAGAGGCATGGGTCAATGAGCAACTCA
AACGACTGGGGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATCAACGCATCACGAACAAACCGTGAGCAATTGCTTGCATCGGAACCATTGCTTTGCTAGGATAGTGGAACACACCTGC
CAGCTCTGAAGGATCGTGCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAGAGGAGTACCAACTTTGCTGTTTCAAGTCAAGTATTAACCCCAAGGGCCAACTTGGTTGCAGTGTCAGTTTTATG
CGCCTGCGACGATCCCGCGT

Product: tetratricopeptide domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1497; Mature: 1497

Protein sequence:

>1497_residues
MDDRALRLALESLLDEPTLKSAHRASLERGLADLRAQRLTSDERDYLCYLIEHYGQSNPSPDPVAALIAAFQDKLPTYDP
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VDATSLIRQIEQNPSNLFGITLDRIKGRSRSQWDVVWKPMLVLLLVAQEPLRLDVVGDLLEHDHDTMQDAVRVLGGLVSQ
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AIATTIATFGEINRALAIAQSINNRWQRADALKAIATTAAAFGDIDHALVITKFINEFFQQTNALRSIAITTATFGDINR
ALTIAQSINDLGQQADTLKVIATITSTLGDTNRALAIAQSINDLVHRVDVLCFLALIATKLGNREKGTDLLNYAIVIAQS
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AARAADTYGNDQLPMAILEKAHQIAQSIAQPERRADALGTIATTTATLGDIDRAIAIVQSIVSPDKHDHSLRMIVKTVRS
ITRILAIIQRIWFHSKTSGSIWGMTPIIAPLLNDYPWLGTAILKEEAWVNEQLKRLG

Sequences:

>Translated_1497_residues
MDDRALRLALESLLDEPTLKSAHRASLERGLADLRAQRLTSDERDYLCYLIEHYGQSNPSPDPVAALIAAFQDKLPTYDP
AAVATAVHHALAQQPATLNGAPVTITMNGDTYAHQANLAIGNQVGGNLVQVTVTIPIPDVRFDALLATALRTHEHEKTRE
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TGREYQLGLLRAVAAQLILKHNLTVSYFPEESYPAMKGEFVRILDELSKQGIEETIYLDGLDQLQPEIDGSRDLSFLPPQ
PPPGIVMVLGSRPDETLKPLEILHRVDYDLPPLSEADALALWRSVQPAVADGLLHDLYAALKGNALFVHLAANTMRDQSV
VDATSLIRQIEQNPSNLFGITLDRIKGRSRSQWDVVWKPMLVLLLVAQEPLRLDVVGDLLEHDHDTMQDAVRVLGGLVSQ
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CVDTLGVITITATAAYGNGQPAITIFNKTRSIIQSINYPEQRADALGVIATTTATFGEINRALAIAQSIDDSERHADTLR
AIATTIATFGEINRALAIAQSINNRWQRADALKAIATTAAAFGDIDHALVITKFINEFFQQTNALRSIAITTATFGDINR
ALTIAQSINDLGQQADTLKVIATITSTLGDTNRALAIAQSINDLVHRVDVLCFLALIATKLGNREKGTDLLNYAIVIAQS
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AARAADTYGNDQLPMAILEKAHQIAQSIAQPERRADALGTIATTTATLGDIDRAIAIVQSIVSPDKHDHSLRMIVKTVRS
ITRILAIIQRIWFHSKTSGSIWGMTPIIAPLLNDYPWLGTAILKEEAWVNEQLKRLG
>Mature_1497_residues
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QEALDRIDLCTDHGRQIQLWKKILVLCEPQYQSTIIILMHQVASHLSGIEKFRLLGLIATTIATLGAIDQAHQIAQSITD
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LAVVVTVTATFGDIDRALAMAQPIEGLWQQAHALRSIAITTTHGSISRALVIAQSINDPIFRADAFGTIATIVATLGDIN
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AIATTIATFGEINRALAIAQSINNRWQRADALKAIATTAAAFGDIDHALVITKFINEFFQQTNALRSIAITTATFGDINR
ALTIAQSINDLGQQADTLKVIATITSTLGDTNRALAIAQSINDLVHRVDVLCFLALIATKLGNREKGTDLLNYAIVIAQS
IVRPERCADAFKVIAITTATLGDISQALAIAQSIVRPERRADAFKVIAITTATLGDISQALAIAQSITQPEQCVDALGTI
AARAADTYGNDQLPMAILEKAHQIAQSIAQPERRADALGTIATTTATLGDIDRAIAIVQSIVSPDKHDHSLRMIVKTVRS
ITRILAIIQRIWFHSKTSGSIWGMTPIIAPLLNDYPWLGTAILKEEAWVNEQLKRLG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI224028289, Length=717, Percent_Identity=20.6415620641562, Blast_Score=81, Evalue=7e-15,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 163880; Mature: 163880

Theoretical pI: Translated: 6.22; Mature: 6.22

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.0 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.0 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
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CCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE
TTHGSISRALVIAQSINDPIFRADAFGTIATIVATLGDINQALAIAQSIDSWSHRVDALG
ECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIATTVATLGDINQALAIAQSIDSWSHRSHVFRTIAATTNILGNRAKAISILDHARQLAQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
SINDRWQKADALKAIATTAATFNDQEQAIRILDQALAIAQSIKSLRQRADTLRDIAIIAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHH
ALTIAQSINDLGQQADTLKVIATITSTLGDTNRALAIAQSINDLVHRVDVLCFLALIATK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
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CCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE
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ECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCEEEEEEEEECCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
ITRILAIIQRIWFHSKTSGSIWGMTPIIAPLLNDYPWLGTAILKEEAWVNEQLKRLG
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA