| Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003106 |
| Length | 2,694,756 |
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The map label for this gene is bps2 [H]
Identifier: 15922443
GI number: 15922443
Start: 2124642
End: 2126396
Strand: Direct
Name: bps2 [H]
Synonym: ST2117
Alternate gene names: 15922443
Gene position: 2124642-2126396 (Clockwise)
Preceding gene: 15922441
Following gene: 15922446
Centisome position: 78.84
GC content: 29.74
Gene sequence:
>1755_bases ATGAAGGTTAGAGTATCAAATATAGGAGGAATAACTAGGGAACTTACTCTATCAGTAGAAAAAGGACTAACACTGTATAA AGCGCCAAATGCGTATGGAAAAACATCTTTAACAAAGGCATTAGTTTCTCTCTTAACTTCTTCAATAACGGCTGCAGACC TGTTAAATGTTTTTAGTGATGAAGGTTATGTAGAGGTAGAACTTGATAACAAACTATATTATAGAAGATTTCATAGAATA AAGAACAAAATAGAAGAAGAAAAGAATTTAATAATGGATGATGATAGAGCACTACTACTTTCTTATTTCTCTCCAGAGAA TCAGTTATTAGCTAGAATTATTACTGGAGATGAAAATGTTGAATGGTTTATTTCAAAAACATCTAAAGTACAAGAATTAA AAGCAAAAAAAGAAGAATTAGAAAGAAAACTAACTGAACTTAAAACAAGACAAGAAGAATTAACAAAAAAATACCAAGAA ATTAAAGATATCAGCAGAGAATTAGAAAGAATAAATGAGGAAATAGATAAACTAGAAAGAGAAAGAAAAAATTTACAGAA AAATGCTGCACAGACCATAATTCTTACAAGACAAAATAGGTTAACTGAGTTAAAGAGTAGAGTAGAAACTAGGCAAAAAG AGCTTAGAGATAACCAAGCTAGATTAGAAAAACTTGATAAGGAAATTGAGGAACTTAAGCAAAAAGCAGATCAAACTTTA AAAGAAAAAATTAGAAGTGAATTAACTGAGTTAGATAAAAAACTACAAGAATTAAGTTCTAAAAAGAACAGTATAGATAT AGAAATCGGAGTACTTAATAGAGTTCTTGATGAAATTAAAGAATCAGAAAAAGAGCATGCATCAGTATGCCATGTATGTG GAAGCAAGGTAGACCCATCTATATGGAAAACAAGAATGGACATTATATCAAAGGAATTAGAAAATGCTAATAGAAGCAAA AATGAGCTCTTAACCGAACTAAATTCTACTATAGCTAGGAAAAATGAACTAGAAGCAAAAATCAAAGAAATAGAAAAAGC AGAAAAAATGTTAGCTGAGAAGCAAATTCAAAGAGAAAACTTAGCGATAAAAATAGAAACTATTAAACATCAAATAGCCG AGTATGAGAGACAGATAAAGGAATTAGAGGAAAAAATAAATGAAATAAATGAAATTTATTCTATGGGAGAAGGAGAAAGC GAGATTGATAAGAAGTTAGAAGAATTAAAGAAAAAGAGGGGAGACTTAGAATATCAGTTGCAAACTCTAGGAGTTTCAAG CAAGATTCTTGAAGAAATTACTACTGTGCAGAACCAGATAGAAGAAATAACAAAACAAATAGATGATTTACAAAGAGAAT ATATTAGAAGATTAACTGTAATTAGAGAGAGATTTACTGAGATGGCAACATCATTACTTAAAGAACTGGAATTTGATTTC ACTGCTGAAATTGATAATAATTATAGACTTATAGTAAAAAGAATGGGGGCTCAACTAGAAATTAGAAAGCTTTCATCATC TGAAAGAACAACATTAGCATTAATCTTAGTATTAGTTGCCCTAAAAGAATACTTCAAAACTCCATACTTCATCGTTGATG AATCATTTATGACTTTCGATCAAAAAAGATTTGAAAAACTAGTAAAATATCTAAATGGAGTTGTAGATTATATAATCATA ACGAAGAGCGATGAAATGGTACAGCTAACTAATGAGATAATTCCGGCGACCATGGCACATCAAGTTGTTTCATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAAATTATTATAAATTTGCTAGAAAAATATGATAAATTTATATATAGTATATTAGAAATATGGCATAACATTTTTAAGGT ATAAAAAGAAAAAGCACATA
Downstream 100 bases:
>100_bases GCAATTTATTTAAATCAGTTTTTACGGCTTCTTCAACATCTGGTGGAATATTAGTTATTTCAGTAAACCAACCAACTAAG GCAACCATTCCTAACTCTTC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 584; Mature: 584
Protein sequence:
>584_residues MKVRVSNIGGITRELTLSVEKGLTLYKAPNAYGKTSLTKALVSLLTSSITAADLLNVFSDEGYVEVELDNKLYYRRFHRI KNKIEEEKNLIMDDDRALLLSYFSPENQLLARIITGDENVEWFISKTSKVQELKAKKEELERKLTELKTRQEELTKKYQE IKDISRELERINEEIDKLERERKNLQKNAAQTIILTRQNRLTELKSRVETRQKELRDNQARLEKLDKEIEELKQKADQTL KEKIRSELTELDKKLQELSSKKNSIDIEIGVLNRVLDEIKESEKEHASVCHVCGSKVDPSIWKTRMDIISKELENANRSK NELLTELNSTIARKNELEAKIKEIEKAEKMLAEKQIQRENLAIKIETIKHQIAEYERQIKELEEKINEINEIYSMGEGES EIDKKLEELKKKRGDLEYQLQTLGVSSKILEEITTVQNQIEEITKQIDDLQREYIRRLTVIRERFTEMATSLLKELEFDF TAEIDNNYRLIVKRMGAQLEIRKLSSSERTTLALILVLVALKEYFKTPYFIVDESFMTFDQKRFEKLVKYLNGVVDYIII TKSDEMVQLTNEIIPATMAHQVVS
Sequences:
>Translated_584_residues MKVRVSNIGGITRELTLSVEKGLTLYKAPNAYGKTSLTKALVSLLTSSITAADLLNVFSDEGYVEVELDNKLYYRRFHRI KNKIEEEKNLIMDDDRALLLSYFSPENQLLARIITGDENVEWFISKTSKVQELKAKKEELERKLTELKTRQEELTKKYQE IKDISRELERINEEIDKLERERKNLQKNAAQTIILTRQNRLTELKSRVETRQKELRDNQARLEKLDKEIEELKQKADQTL KEKIRSELTELDKKLQELSSKKNSIDIEIGVLNRVLDEIKESEKEHASVCHVCGSKVDPSIWKTRMDIISKELENANRSK NELLTELNSTIARKNELEAKIKEIEKAEKMLAEKQIQRENLAIKIETIKHQIAEYERQIKELEEKINEINEIYSMGEGES EIDKKLEELKKKRGDLEYQLQTLGVSSKILEEITTVQNQIEEITKQIDDLQREYIRRLTVIRERFTEMATSLLKELEFDF TAEIDNNYRLIVKRMGAQLEIRKLSSSERTTLALILVLVALKEYFKTPYFIVDESFMTFDQKRFEKLVKYLNGVVDYIII TKSDEMVQLTNEIIPATMAHQVVS >Mature_584_residues MKVRVSNIGGITRELTLSVEKGLTLYKAPNAYGKTSLTKALVSLLTSSITAADLLNVFSDEGYVEVELDNKLYYRRFHRI KNKIEEEKNLIMDDDRALLLSYFSPENQLLARIITGDENVEWFISKTSKVQELKAKKEELERKLTELKTRQEELTKKYQE IKDISRELERINEEIDKLERERKNLQKNAAQTIILTRQNRLTELKSRVETRQKELRDNQARLEKLDKEIEELKQKADQTL KEKIRSELTELDKKLQELSSKKNSIDIEIGVLNRVLDEIKESEKEHASVCHVCGSKVDPSIWKTRMDIISKELENANRSK NELLTELNSTIARKNELEAKIKEIEKAEKMLAEKQIQRENLAIKIETIKHQIAEYERQIKELEEKINEINEIYSMGEGES EIDKKLEELKKKRGDLEYQLQTLGVSSKILEEITTVQNQIEEITKQIDDLQREYIRRLTVIRERFTEMATSLLKELEFDF TAEIDNNYRLIVKRMGAQLEIRKLSSSERTTLALILVLVALKEYFKTPYFIVDESFMTFDQKRFEKLVKYLNGVVDYIII TKSDEMVQLTNEIIPATMAHQVVS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 zinc-hook domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013134 [H]
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 68361; Mature: 68361
Theoretical pI: Translated: 5.67; Mature: 5.67
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKVRVSNIGGITRELTLSVEKGLTLYKAPNAYGKTSLTKALVSLLTSSITAADLLNVFSD CEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC EGYVEVELDNKLYYRRFHRIKNKIEEEKNLIMDDDRALLLSYFSPENQLLARIITGDENV CCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCC EWFISKTSKVQELKAKKEELERKLTELKTRQEELTKKYQEIKDISRELERINEEIDKLER EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ERKNLQKNAAQTIILTRQNRLTELKSRVETRQKELRDNQARLEKLDKEIEELKQKADQTL HHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KEKIRSELTELDKKLQELSSKKNSIDIEIGVLNRVLDEIKESEKEHASVCHVCGSKVDPS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH IWKTRMDIISKELENANRSKNELLTELNSTIARKNELEAKIKEIEKAEKMLAEKQIQREN HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC LAIKIETIKHQIAEYERQIKELEEKINEINEIYSMGEGESEIDKKLEELKKKRGDLEYQL CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH QTLGVSSKILEEITTVQNQIEEITKQIDDLQREYIRRLTVIRERFTEMATSLLKELEFDF HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCE TAEIDNNYRLIVKRMGAQLEIRKLSSSERTTLALILVLVALKEYFKTPYFIVDESFMTFD EEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHH QKRFEKLVKYLNGVVDYIIITKSDEMVQLTNEIIPATMAHQVVS HHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MKVRVSNIGGITRELTLSVEKGLTLYKAPNAYGKTSLTKALVSLLTSSITAADLLNVFSD CEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC EGYVEVELDNKLYYRRFHRIKNKIEEEKNLIMDDDRALLLSYFSPENQLLARIITGDENV CCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCC EWFISKTSKVQELKAKKEELERKLTELKTRQEELTKKYQEIKDISRELERINEEIDKLER EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ERKNLQKNAAQTIILTRQNRLTELKSRVETRQKELRDNQARLEKLDKEIEELKQKADQTL HHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KEKIRSELTELDKKLQELSSKKNSIDIEIGVLNRVLDEIKESEKEHASVCHVCGSKVDPS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH IWKTRMDIISKELENANRSKNELLTELNSTIARKNELEAKIKEIEKAEKMLAEKQIQREN HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC LAIKIETIKHQIAEYERQIKELEEKINEINEIYSMGEGESEIDKKLEELKKKRGDLEYQL CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH QTLGVSSKILEEITTVQNQIEEITKQIDDLQREYIRRLTVIRERFTEMATSLLKELEFDF HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCE TAEIDNNYRLIVKRMGAQLEIRKLSSSERTTLALILVLVALKEYFKTPYFIVDESFMTFD EEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHH QKRFEKLVKYLNGVVDYIIITKSDEMVQLTNEIIPATMAHQVVS HHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA