Definition Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome.
Accession NC_003106
Length 2,694,756

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The map label for this gene is cbsB [H]

Identifier: 15921968

GI number: 15921968

Start: 1662184

End: 1663128

Strand: Direct

Name: cbsB [H]

Synonym: ST1665

Alternate gene names: 15921968

Gene position: 1662184-1663128 (Clockwise)

Preceding gene: 15921967

Following gene: 15921969

Centisome position: 61.68

GC content: 28.99

Gene sequence:

>945_bases
ATGAGAATTTCATCCTTTTTAGAAAAAGATATAAAATATTTTTTTATAATTCTAGGCATTTCTGCATTTCTTCAATTTAT
GTTTTCTGAAGCTTTCGTTTTTCCTTCAGCCTTACCTATTCACATCCCTGCTGAAATGATCCTCCTTAGAATAGGTGCAG
TTTCTTTTTACATCTTTTTCATTTCTCTTATCCTAGTCTCACTTCTTTTATCTAACAAAGTAAAAGCTCTTCTACCTTTA
TCAATAGTGCTTATAATATCCCCTATTTTAGCGTATTTAAACGTCAGTTATACATATTATTACGGTATTGAAATATTTAT
AATAATAGTAGCTATTATGGCACTGATAGAAGCTACTGTTAAAAGTGACGTAAAAGTAGTACTTCTTATCCCATCTGGAA
TACTAGTAGGATTAGGTTTAATAGCGTCATTTTTCATTACTTTCTATCATACTACTCTTTACATAAGTTATTTAGATTTT
CTCATTTTTTCTGCAATTACATTTTTAGTCTATACTGTATTTTGGAGAAAGATAATTAGCAAAAGGAGTGTTATTGCCTA
TATTGTGGGCTTAATAAGTATGTATCCGTTTGTTATGTTTGCTCATGAGATTATAACAAACAGATATATACAAATCCTAA
TGGAAATGATACTTCCGTCAGCTCTCGGTATAACTATCTATAATCCTTCCCACTTACTCTATTTAGTTTACTTCTTAGGG
ATAATTACATTTTCTATTATTTCTATCATTATTAAGGGTAATAGCGCAGCAGGGATTGGTTATTTTATGCTTATATCTAC
TGTATTTTTCGGAATATACGGCTATCTATTACTAATGTATATGCTAGTTCCCACTATTGGTTATGTTCTCATGTGTTATA
ACGAGATGAGAGAAGAAAATATTATTAAATATTTATCACAAAAATTGAAGATAAAAAATCAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTACATCAGCAGCAATTCCATCAACCACAGTAGATGTGACTGTGGCTGGTGCAGTTATAGCTATTTTAGCTCTAGTAATA
CTCTATGTGGTGTATAGAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAATTAAACTCTTTTTTAATTTAATATCTTTAGTCCAACGGCAAAAAGTTATATGAGATACTGCATATTTTTATTGTGA
TAAAAAATGATAAAAATAAG

Product: cytochrome b558/566 subunit B

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 314; Mature: 314

Protein sequence:

>314_residues
MRISSFLEKDIKYFFIILGISAFLQFMFSEAFVFPSALPIHIPAEMILLRIGAVSFYIFFISLILVSLLLSNKVKALLPL
SIVLIISPILAYLNVSYTYYYGIEIFIIIVAIMALIEATVKSDVKVVLLIPSGILVGLGLIASFFITFYHTTLYISYLDF
LIFSAITFLVYTVFWRKIISKRSVIAYIVGLISMYPFVMFAHEIITNRYIQILMEMILPSALGITIYNPSHLLYLVYFLG
IITFSIISIIIKGNSAAGIGYFMLISTVFFGIYGYLLLMYMLVPTIGYVLMCYNEMREENIIKYLSQKLKIKNQ

Sequences:

>Translated_314_residues
MRISSFLEKDIKYFFIILGISAFLQFMFSEAFVFPSALPIHIPAEMILLRIGAVSFYIFFISLILVSLLLSNKVKALLPL
SIVLIISPILAYLNVSYTYYYGIEIFIIIVAIMALIEATVKSDVKVVLLIPSGILVGLGLIASFFITFYHTTLYISYLDF
LIFSAITFLVYTVFWRKIISKRSVIAYIVGLISMYPFVMFAHEIITNRYIQILMEMILPSALGITIYNPSHLLYLVYFLG
IITFSIISIIIKGNSAAGIGYFMLISTVFFGIYGYLLLMYMLVPTIGYVLMCYNEMREENIIKYLSQKLKIKNQ
>Mature_314_residues
MRISSFLEKDIKYFFIILGISAFLQFMFSEAFVFPSALPIHIPAEMILLRIGAVSFYIFFISLILVSLLLSNKVKALLPL
SIVLIISPILAYLNVSYTYYYGIEIFIIIVAIMALIEATVKSDVKVVLLIPSGILVGLGLIASFFITFYHTTLYISYLDF
LIFSAITFLVYTVFWRKIISKRSVIAYIVGLISMYPFVMFAHEIITNRYIQILMEMILPSALGITIYNPSHLLYLVYFLG
IITFSIISIIIKGNSAAGIGYFMLISTVFFGIYGYLLLMYMLVPTIGYVLMCYNEMREENIIKYLSQKLKIKNQ

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR017573 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 35854; Mature: 35854

Theoretical pI: Translated: 9.37; Mature: 9.37

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
4.1 %Met     (Mature Protein)
4.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRISSFLEKDIKYFFIILGISAFLQFMFSEAFVFPSALPIHIPAEMILLRIGAVSFYIFF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISLILVSLLLSNKVKALLPLSIVLIISPILAYLNVSYTYYYGIEIFIIIVAIMALIEATV
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KSDVKVVLLIPSGILVGLGLIASFFITFYHTTLYISYLDFLIFSAITFLVYTVFWRKIIS
HCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KRSVIAYIVGLISMYPFVMFAHEIITNRYIQILMEMILPSALGITIYNPSHLLYLVYFLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCEEEECHHHHHHHHHHHH
IITFSIISIIIKGNSAAGIGYFMLISTVFFGIYGYLLLMYMLVPTIGYVLMCYNEMREEN
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIKYLSQKLKIKNQ
HHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MRISSFLEKDIKYFFIILGISAFLQFMFSEAFVFPSALPIHIPAEMILLRIGAVSFYIFF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISLILVSLLLSNKVKALLPLSIVLIISPILAYLNVSYTYYYGIEIFIIIVAIMALIEATV
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KSDVKVVLLIPSGILVGLGLIASFFITFYHTTLYISYLDFLIFSAITFLVYTVFWRKIIS
HCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KRSVIAYIVGLISMYPFVMFAHEIITNRYIQILMEMILPSALGITIYNPSHLLYLVYFLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCEEEECHHHHHHHHHHHH
IITFSIISIIIKGNSAAGIGYFMLISTVFFGIYGYLLLMYMLVPTIGYVLMCYNEMREEN
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIKYLSQKLKIKNQ
HHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 7.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11427726 [H]