| Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003106 |
| Length | 2,694,756 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 15921961
Identifier: 15921961
GI number: 15921961
Start: 1652957
End: 1655629
Strand: Reverse
Name: 15921961
Synonym: ST1658
Alternate gene names: NA
Gene position: 1655629-1652957 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15921964
Following gene: 15921956
Centisome position: 61.44
GC content: 30.19
Gene sequence:
>2673_bases GTGAAAATGTTATTCTCGTATTATAGCTTTTTAAATCTTGTTTTTTATTCTTATACAATGAAATCCTATTTACTTATTCC TCTTTTCCTAGTCCTTCTCTCAATCATCCCTTCATCTATGTTTATTATTCATACAGTCTCACAAGAATCAAGTGTTACTG CAGTACAACCATTAGGTATAACTACAGGTGGTAATTACTTATATGTTACTACGCTTAATGGTATCGTTACCTTAACTCCT AATTTATCAGTAGAGGATTTTATACCGCTTTATGGTTCTACAATACCTTTAATAGTAAATAACACTTTGTATGCGACTAA CTATTTTAATAATATATTAAGTATAATTAAAGATAATGAAATTGTTGGAAATATTTCTTTAGGAGGAAACTTTAAACTCA TAGGTAAAGCTCCTTCATTACCAAGAATGTTTTATGGATATGGTATGGCTTTCGATCCTCAAAAAAATATACTTTACGTT GCAGATAGTAACTTAGATTATGTAGTTGCTATTAACATTACTAATGATAATAAGACTTTCATTTACGGTTTAGAAGAGCC AACAGATATCATTTATTACAACGGGCTAACTTATGTATTATGTTATTATAGTGATCATATTGTAGTCCTAGATGGAACTC AAGAAATAGAGACTATAAATGTAGCTTTACCCCCCTCGATGGGAATTATAGTAAACAATCTAATGTATATATCATCCTTT GATTATAGTTACGTTATAGTATTAAACTTAACAAGTGGTAAACAAACTCTTATCCCTACTGGTAACAATCCCTATTTCTT TGCTTATGATCCAAATAATGGAAATGTGTATTTAACTGAATTTGGTGCAGGGAAAATTGCTGTTATCCACGATACCAGAG TTGTAGGAAATTACTCTATAGGTTCTCAACCAGCCGATATTATATACTTTAATGGTCTTTTATACGTGGTTCTATATGGA AATAACGAGATAGTAGCACTAAATCCTAATAATATGAGTGTAGTCTATTCCATTACTTTAACAGCTACTTATACTGATGC GATTGCTTATGGCTCATCAGTTTACGTTACAGAATATTATAATAATAGAATAGTTCAAATAAATTCTTCTGGGGAATTTG AGATAAATCTAGATTCAAATCCTTATAGTATAACTGAAGGTAACGGAATCATTTATGTTACTTGCCCTAATTCGAATAGA GTAATCGAATTATCGCCAACATTAAAAATACTAGGCTACATAAAAATCGACGATCCTACGTGGATAATTTACTATAATGG ATATTTATATGTCACAAGTTACAATAAGAACCTTCTATATGTCATACCCCCTTACGGGGGGAATATTACTATTAGTACTG GTAAAGGACCAAATTATATAACCGTCTATAATGGAGAAATAATAGTTACTGATCAATTATCTAACCAGCTTACAATTTAC CAAAATGGCATAACAAAAAATATAAACTTGAGTTTTCGCCCTCTGAGTGTTATAGGTTATGACGACTACATTTACGTAAT AGGGAACGATAGAATAGCTATATATAATGATAACTTCACGCTGTTAAACGTTATTTATTTTACACCCGTTAGCTTACCTA TTCCAATTCTACCATTTGAAGAAGCATTAGTCTATAACAACTCAGTTGTTATCGCTTATGGAAATAATTTAGGAATATTT AAAGGAGTGAACGAGATATCCTCTTATCACTTTAATACTACGATTATGAGCGTAACAACGCTTAATGGAAATATTTATGT ATTTTCACCAGAATCAGAAGTAGTTATATTACAAAAACCTCCCGTATATTCACTAGTAATTCATGAGGAAGGCTTACCTA AAGGGACTGAATGGGGGATCGAAATAAATGGAAGTGTGATTAAAACCATTAGCTCGACATTAATATTAAACTTAACTGAG GGAGTTTACAATTTAACAATTCTAATACCGAAATATTACTATTCTAATATTACATACGAAATTGTAAACTTAACATCAAA TCTTACAATTTCTGTTCACTTTTCAGCAATATTATTCAAAGTCTTATTTGAAGAAAAAGGTTTACCTAATGGAAGTCAAT GGGGAGTAATAATAAACGGAACTAAAATATTATCATCCAATATTTCAATAGTCTTAACTTTACCAGAAGGTATTTATAAC GTGAGTATTATTAGTCCAGTCTTCTATAAAACTAATCAGAGCGTTATGATTATTAATATATCGGGTAATCAAACCTTTAA ACTACTATTTACACCAATTCTTTTCAACGTGATATTTAATGGGTCTGGATTACGTAATGGCATGGAATGGGAGGTAATAA TAAACGGATCTACTTATTCGACGAATTCCTCCACACTAATTATTAAACTACCACATGGAATATATTCATATACCGTTATA GCCCCTAAAGGATATAATTCCTCAATTGTTAGAGGAGAATTTACTTTAAGTAATAACTTAACAATTACTATATCATTTCA AAAAATTGTTATAAACACTTCAACTAGTACAACAACTAAAGCAACAACTACAAAAACAACAGCAGTAACTACTTCATCCT CTTTTACCTTTGTTCATTCAAATAATTCTACTAATGTTAAAGTGTATATTGGAGTCTTATTAATCATTATAATTGGGGTT ATCCTTTCGGTATTTATAATGAGAAAACGTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTCTCACCCATTGAGTTGTTTTCTTAATTATCATTATTTCAAAATATTATAAATTTCTCGAGAATGGAAGAGGAAAGAA GTTTTTACTTTGCATATTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases GTAGTTTCGTATTTTATTTTTATTACCTGATCTGGGTAATATATATTATAGGTTCTTAAAGTAAGGTAAAGTTTATACTC TTTTCCTTTTAATAACCCTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 890; Mature: 890
Protein sequence:
>890_residues MKMLFSYYSFLNLVFYSYTMKSYLLIPLFLVLLSIIPSSMFIIHTVSQESSVTAVQPLGITTGGNYLYVTTLNGIVTLTP NLSVEDFIPLYGSTIPLIVNNTLYATNYFNNILSIIKDNEIVGNISLGGNFKLIGKAPSLPRMFYGYGMAFDPQKNILYV ADSNLDYVVAINITNDNKTFIYGLEEPTDIIYYNGLTYVLCYYSDHIVVLDGTQEIETINVALPPSMGIIVNNLMYISSF DYSYVIVLNLTSGKQTLIPTGNNPYFFAYDPNNGNVYLTEFGAGKIAVIHDTRVVGNYSIGSQPADIIYFNGLLYVVLYG NNEIVALNPNNMSVVYSITLTATYTDAIAYGSSVYVTEYYNNRIVQINSSGEFEINLDSNPYSITEGNGIIYVTCPNSNR VIELSPTLKILGYIKIDDPTWIIYYNGYLYVTSYNKNLLYVIPPYGGNITISTGKGPNYITVYNGEIIVTDQLSNQLTIY QNGITKNINLSFRPLSVIGYDDYIYVIGNDRIAIYNDNFTLLNVIYFTPVSLPIPILPFEEALVYNNSVVIAYGNNLGIF KGVNEISSYHFNTTIMSVTTLNGNIYVFSPESEVVILQKPPVYSLVIHEEGLPKGTEWGIEINGSVIKTISSTLILNLTE GVYNLTILIPKYYYSNITYEIVNLTSNLTISVHFSAILFKVLFEEKGLPNGSQWGVIINGTKILSSNISIVLTLPEGIYN VSIISPVFYKTNQSVMIINISGNQTFKLLFTPILFNVIFNGSGLRNGMEWEVIINGSTYSTNSSTLIIKLPHGIYSYTVI APKGYNSSIVRGEFTLSNNLTITISFQKIVINTSTSTTTKATTTKTTAVTTSSSFTFVHSNNSTNVKVYIGVLLIIIIGV ILSVFIMRKR
Sequences:
>Translated_890_residues MKMLFSYYSFLNLVFYSYTMKSYLLIPLFLVLLSIIPSSMFIIHTVSQESSVTAVQPLGITTGGNYLYVTTLNGIVTLTP NLSVEDFIPLYGSTIPLIVNNTLYATNYFNNILSIIKDNEIVGNISLGGNFKLIGKAPSLPRMFYGYGMAFDPQKNILYV ADSNLDYVVAINITNDNKTFIYGLEEPTDIIYYNGLTYVLCYYSDHIVVLDGTQEIETINVALPPSMGIIVNNLMYISSF DYSYVIVLNLTSGKQTLIPTGNNPYFFAYDPNNGNVYLTEFGAGKIAVIHDTRVVGNYSIGSQPADIIYFNGLLYVVLYG NNEIVALNPNNMSVVYSITLTATYTDAIAYGSSVYVTEYYNNRIVQINSSGEFEINLDSNPYSITEGNGIIYVTCPNSNR VIELSPTLKILGYIKIDDPTWIIYYNGYLYVTSYNKNLLYVIPPYGGNITISTGKGPNYITVYNGEIIVTDQLSNQLTIY QNGITKNINLSFRPLSVIGYDDYIYVIGNDRIAIYNDNFTLLNVIYFTPVSLPIPILPFEEALVYNNSVVIAYGNNLGIF KGVNEISSYHFNTTIMSVTTLNGNIYVFSPESEVVILQKPPVYSLVIHEEGLPKGTEWGIEINGSVIKTISSTLILNLTE GVYNLTILIPKYYYSNITYEIVNLTSNLTISVHFSAILFKVLFEEKGLPNGSQWGVIINGTKILSSNISIVLTLPEGIYN VSIISPVFYKTNQSVMIINISGNQTFKLLFTPILFNVIFNGSGLRNGMEWEVIINGSTYSTNSSTLIIKLPHGIYSYTVI APKGYNSSIVRGEFTLSNNLTITISFQKIVINTSTSTTTKATTTKTTAVTTSSSFTFVHSNNSTNVKVYIGVLLIIIIGV ILSVFIMRKR >Mature_890_residues MKMLFSYYSFLNLVFYSYTMKSYLLIPLFLVLLSIIPSSMFIIHTVSQESSVTAVQPLGITTGGNYLYVTTLNGIVTLTP NLSVEDFIPLYGSTIPLIVNNTLYATNYFNNILSIIKDNEIVGNISLGGNFKLIGKAPSLPRMFYGYGMAFDPQKNILYV ADSNLDYVVAINITNDNKTFIYGLEEPTDIIYYNGLTYVLCYYSDHIVVLDGTQEIETINVALPPSMGIIVNNLMYISSF DYSYVIVLNLTSGKQTLIPTGNNPYFFAYDPNNGNVYLTEFGAGKIAVIHDTRVVGNYSIGSQPADIIYFNGLLYVVLYG NNEIVALNPNNMSVVYSITLTATYTDAIAYGSSVYVTEYYNNRIVQINSSGEFEINLDSNPYSITEGNGIIYVTCPNSNR VIELSPTLKILGYIKIDDPTWIIYYNGYLYVTSYNKNLLYVIPPYGGNITISTGKGPNYITVYNGEIIVTDQLSNQLTIY QNGITKNINLSFRPLSVIGYDDYIYVIGNDRIAIYNDNFTLLNVIYFTPVSLPIPILPFEEALVYNNSVVIAYGNNLGIF KGVNEISSYHFNTTIMSVTTLNGNIYVFSPESEVVILQKPPVYSLVIHEEGLPKGTEWGIEINGSVIKTISSTLILNLTE GVYNLTILIPKYYYSNITYEIVNLTSNLTISVHFSAILFKVLFEEKGLPNGSQWGVIINGTKILSSNISIVLTLPEGIYN VSIISPVFYKTNQSVMIINISGNQTFKLLFTPILFNVIFNGSGLRNGMEWEVIINGSTYSTNSSTLIIKLPHGIYSYTVI APKGYNSSIVRGEFTLSNNLTITISFQKIVINTSTSTTTKATTTKTTAVTTSSSFTFVHSNNSTNVKVYIGVLLIIIIGV ILSVFIMRKR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 98874; Mature: 98874
Theoretical pI: Translated: 5.00; Mature: 5.00
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 1.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 1.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKMLFSYYSFLNLVFYSYTMKSYLLIPLFLVLLSIIPSSMFIIHTVSQESSVTAVQPLGI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEEEE TTGGNYLYVTTLNGIVTLTPNLSVEDFIPLYGSTIPLIVNNTLYATNYFNNILSIIKDNE EECCCEEEEEEECCEEEECCCCCHHHHHHHCCCEEEEEEECEEEEEHHHHHHHHHHCCCE IVGNISLGGNFKLIGKAPSLPRMFYGYGMAFDPQKNILYVADSNLDYVVAINITNDNKTF EEEEEEECCCEEEEECCCCCCEEHHCCCEEECCCCCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCEEE IYGLEEPTDIIYYNGLTYVLCYYSDHIVVLDGTQEIETINVALPPSMGIIVNNLMYISSF EEECCCCCEEEEECCEEEEEEEECCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEEEEC DYSYVIVLNLTSGKQTLIPTGNNPYFFAYDPNNGNVYLTEFGAGKIAVIHDTRVVGNYSI CCEEEEEEEECCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCEEEEEEEEEEEEECCC GSQPADIIYFNGLLYVVLYGNNEIVALNPNNMSVVYSITLTATYTDAIAYGSSVYVTEYY CCCCCEEEEECCEEEEEEECCCEEEEECCCCEEEEEEEEEEEEEEHHHHCCCEEEEEEEC NNRIVQINSSGEFEINLDSNPYSITEGNGIIYVTCPNSNRVIELSPTLKILGYIKIDDPT CCEEEEECCCCEEEEEECCCCEEEECCCCEEEEEECCCCCEEEECCCEEEEEEEEECCCE WIIYYNGYLYVTSYNKNLLYVIPPYGGNITISTGKGPNYITVYNGEIIVTDQLSNQLTIY EEEEECCEEEEEEECCCEEEEECCCCCEEEEECCCCCCEEEEECCEEEEEECCCCEEEEE QNGITKNINLSFRPLSVIGYDDYIYVIGNDRIAIYNDNFTLLNVIYFTPVSLPIPILPFE ECCCEEEEEEEEEEEEEEECCCEEEEEECCEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCEEECCCC EALVYNNSVVIAYGNNLGIFKGVNEISSYHFNTTIMSVTTLNGNIYVFSPESEVVILQKP HHEEECCEEEEEECCCEEEECCCHHHHCEEEEEEEEEEEEECCEEEEECCCCCEEEEECC PVYSLVIHEEGLPKGTEWGIEINGSVIKTISSTLILNLTEGVYNLTILIPKYYYSNITYE CEEEEEEECCCCCCCCEECEEECCCEEEEECCEEEEEECCCEEEEEEEEEEHHHCCEEEE IVNLTSNLTISVHFSAILFKVLFEEKGLPNGSQWGVIINGTKILSSNISIVLTLPEGIYN EEEECCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCEEEECCCEEEEECCCCCEE VSIISPVFYKTNQSVMIINISGNQTFKLLFTPILFNVIFNGSGLRNGMEWEVIINGSTYS EEEECEEEEECCCEEEEEEECCCCEEEEEEHEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCEEC TNSSTLIIKLPHGIYSYTVIAPKGYNSSIVRGEFTLSNNLTITISFQKIVINTSTSTTTK CCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEECCCEEEEEEEEEEEEECCCCCEEE ATTTKTTAVTTSSSFTFVHSNNSTNVKVYIGVLLIIIIGVILSVFIMRKR EEEEEEEEEEECCEEEEEECCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHEECCC >Mature Secondary Structure MKMLFSYYSFLNLVFYSYTMKSYLLIPLFLVLLSIIPSSMFIIHTVSQESSVTAVQPLGI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEEEE TTGGNYLYVTTLNGIVTLTPNLSVEDFIPLYGSTIPLIVNNTLYATNYFNNILSIIKDNE EECCCEEEEEEECCEEEECCCCCHHHHHHHCCCEEEEEEECEEEEEHHHHHHHHHHCCCE IVGNISLGGNFKLIGKAPSLPRMFYGYGMAFDPQKNILYVADSNLDYVVAINITNDNKTF EEEEEEECCCEEEEECCCCCCEEHHCCCEEECCCCCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCEEE IYGLEEPTDIIYYNGLTYVLCYYSDHIVVLDGTQEIETINVALPPSMGIIVNNLMYISSF EEECCCCCEEEEECCEEEEEEEECCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEEEEC DYSYVIVLNLTSGKQTLIPTGNNPYFFAYDPNNGNVYLTEFGAGKIAVIHDTRVVGNYSI CCEEEEEEEECCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCEEEEEEEEEEEEECCC GSQPADIIYFNGLLYVVLYGNNEIVALNPNNMSVVYSITLTATYTDAIAYGSSVYVTEYY CCCCCEEEEECCEEEEEEECCCEEEEECCCCEEEEEEEEEEEEEEHHHHCCCEEEEEEEC NNRIVQINSSGEFEINLDSNPYSITEGNGIIYVTCPNSNRVIELSPTLKILGYIKIDDPT CCEEEEECCCCEEEEEECCCCEEEECCCCEEEEEECCCCCEEEECCCEEEEEEEEECCCE WIIYYNGYLYVTSYNKNLLYVIPPYGGNITISTGKGPNYITVYNGEIIVTDQLSNQLTIY EEEEECCEEEEEEECCCEEEEECCCCCEEEEECCCCCCEEEEECCEEEEEECCCCEEEEE QNGITKNINLSFRPLSVIGYDDYIYVIGNDRIAIYNDNFTLLNVIYFTPVSLPIPILPFE ECCCEEEEEEEEEEEEEEECCCEEEEEECCEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCEEECCCC EALVYNNSVVIAYGNNLGIFKGVNEISSYHFNTTIMSVTTLNGNIYVFSPESEVVILQKP HHEEECCEEEEEECCCEEEECCCHHHHCEEEEEEEEEEEEECCEEEEECCCCCEEEEECC PVYSLVIHEEGLPKGTEWGIEINGSVIKTISSTLILNLTEGVYNLTILIPKYYYSNITYE CEEEEEEECCCCCCCCEECEEECCCEEEEECCEEEEEECCCEEEEEEEEEEHHHCCEEEE IVNLTSNLTISVHFSAILFKVLFEEKGLPNGSQWGVIINGTKILSSNISIVLTLPEGIYN EEEECCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCEEEECCCEEEEECCCCCEE VSIISPVFYKTNQSVMIINISGNQTFKLLFTPILFNVIFNGSGLRNGMEWEVIINGSTYS EEEECEEEEECCCEEEEEEECCCCEEEEEEHEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCEEC TNSSTLIIKLPHGIYSYTVIAPKGYNSSIVRGEFTLSNNLTITISFQKIVINTSTSTTTK CCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEECCCEEEEEEEEEEEEECCCCCEEE ATTTKTTAVTTSSSFTFVHSNNSTNVKVYIGVLLIIIIGVILSVFIMRKR EEEEEEEEEEECCEEEEEECCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHEECCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA