| Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003106 |
| Length | 2,694,756 |
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The map label for this gene is 15921946
Identifier: 15921946
GI number: 15921946
Start: 1635565
End: 1636719
Strand: Reverse
Name: 15921946
Synonym: ST1643
Alternate gene names: NA
Gene position: 1636719-1635565 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15921949
Following gene: 15921943
Centisome position: 60.74
GC content: 32.47
Gene sequence:
>1155_bases ATGACTGAAAATAGAAATAGCTTGATCTTAGCTTCGATTATTTTAGTCCTTATGACAGTATCAGCAAGATCAGTAAACAA TATGGTAACCACAACAGTACCACTTCTGGGAAAATATGTTCTCTCTTTACCAGATTCTATAGTTGGACTTTTATCCACAG TCATGTTCGCCTTTACTTTTCTTTCAACATCTTATCTTAATCCTAGATTAAACGCACAATTTAGAAGAAAAGTGTTTATA GCTTCTAATGTAATAATAGCACTCTCATTAATCTTATTTAGTTATTCAAACGTTATAACTATTTGGATTATTTCAGCATT AGCCGGTTTAGTTTTTGGCTTTATAATGCCAAACCTCGTCACAGCAGCTAGTTTAACAAAGGATAGGAGATCGGCAGAGA GATTATTATCGCTTTATTCTACAAGTTTAAGCCTAAGTCTAATAATAGGCCCAGCTCTGGAGTCTTACTTATTGACAATG TTTAACTACAGACAAATTTTCCTTTGGTTCTTACCATTAGCTATCCTAGGAACAATAATTTCCTTTAACATAAAATTCCC TGATGTAAAAAGAGAAGAATCTGGAATTTCTGTGCTTAAAAATAAGGGATTAATTGCATCTATTTTATCAATAACTACCT ATAATGTACCGTTTGCAGCATTTACAACATTCTTAGCAATTTTAGCAAAAGAAAGGTTTGACTTATCTAACTTTGAGGCT TACTCTGTCTTTTTACCTTTCTATATTATATCATTTTTAACTAGGTTGTCAATGACTATAAGACCATTTAGGGATTTAAG ACTACCGTTATTAGTTTCAATACTTATTACCATAGCTGGTCTAATAGGTATACTATATGCACCTTCATACTCTCTGTTTC TAGTCGTAATAGCACTATTAGGAATTCCTCACGGTTCAATATTCCCGATGTCTACAATAATGATAAGTAGGGCTACAAGG ATAGAAGAAAGAAACGCTGTAAACTCCTACTTCTTAGCGTATAACAATATATTATTCCTTTTAGTTCCAGCTATTATTGG TTTTATAGCAATCTTCATAGGCTTAACATTAGCAATTACTTTACTAGTAATTCCAGTAGTTTTGTCGTCAATACTCTTCT TTAAGATGTTCTGGAATGATGAGATCACACGATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases ACTCATACTATCATTAATGATAAAACTTCATTATGTTTTAAAAAATTTTAAAAAGTAATAATTAAAGCTTAAATTTGACA CCCAACAATTAAGTTTTGCA
Downstream 100 bases:
>100_bases AGGTTAACAAGTTCTTATTTTCTAGTTATAATTTGAATTAAGTAGACTATTTCTAAATTAAATATTAATAAGATTTTCAA TAAATATTAAATTATCTATT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Multidrug Efflux Permease; Facilitator Superfamily Protein; Multidrug Resistance Protein
Number of amino acids: Translated: 384; Mature: 383
Protein sequence:
>384_residues MTENRNSLILASIILVLMTVSARSVNNMVTTTVPLLGKYVLSLPDSIVGLLSTVMFAFTFLSTSYLNPRLNAQFRRKVFI ASNVIIALSLILFSYSNVITIWIISALAGLVFGFIMPNLVTAASLTKDRRSAERLLSLYSTSLSLSLIIGPALESYLLTM FNYRQIFLWFLPLAILGTIISFNIKFPDVKREESGISVLKNKGLIASILSITTYNVPFAAFTTFLAILAKERFDLSNFEA YSVFLPFYIISFLTRLSMTIRPFRDLRLPLLVSILITIAGLIGILYAPSYSLFLVVIALLGIPHGSIFPMSTIMISRATR IEERNAVNSYFLAYNNILFLLVPAIIGFIAIFIGLTLAITLLVIPVVLSSILFFKMFWNDEITR
Sequences:
>Translated_384_residues MTENRNSLILASIILVLMTVSARSVNNMVTTTVPLLGKYVLSLPDSIVGLLSTVMFAFTFLSTSYLNPRLNAQFRRKVFI ASNVIIALSLILFSYSNVITIWIISALAGLVFGFIMPNLVTAASLTKDRRSAERLLSLYSTSLSLSLIIGPALESYLLTM FNYRQIFLWFLPLAILGTIISFNIKFPDVKREESGISVLKNKGLIASILSITTYNVPFAAFTTFLAILAKERFDLSNFEA YSVFLPFYIISFLTRLSMTIRPFRDLRLPLLVSILITIAGLIGILYAPSYSLFLVVIALLGIPHGSIFPMSTIMISRATR IEERNAVNSYFLAYNNILFLLVPAIIGFIAIFIGLTLAITLLVIPVVLSSILFFKMFWNDEITR >Mature_383_residues TENRNSLILASIILVLMTVSARSVNNMVTTTVPLLGKYVLSLPDSIVGLLSTVMFAFTFLSTSYLNPRLNAQFRRKVFIA SNVIIALSLILFSYSNVITIWIISALAGLVFGFIMPNLVTAASLTKDRRSAERLLSLYSTSLSLSLIIGPALESYLLTMF NYRQIFLWFLPLAILGTIISFNIKFPDVKREESGISVLKNKGLIASILSITTYNVPFAAFTTFLAILAKERFDLSNFEAY SVFLPFYIISFLTRLSMTIRPFRDLRLPLLVSILITIAGLIGILYAPSYSLFLVVIALLGIPHGSIFPMSTIMISRATRI EERNAVNSYFLAYNNILFLLVPAIIGFIAIFIGLTLAITLLVIPVVLSSILFFKMFWNDEITR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 42844; Mature: 42713
Theoretical pI: Translated: 10.37; Mature: 10.37
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTENRNSLILASIILVLMTVSARSVNNMVTTTVPLLGKYVLSLPDSIVGLLSTVMFAFTF CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH LSTSYLNPRLNAQFRRKVFIASNVIIALSLILFSYSNVITIWIISALAGLVFGFIMPNLV HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TAASLTKDRRSAERLLSLYSTSLSLSLIIGPALESYLLTMFNYRQIFLWFLPLAILGTII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SFNIKFPDVKREESGISVLKNKGLIASILSITTYNVPFAAFTTFLAILAKERFDLSNFEA HCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH YSVFLPFYIISFLTRLSMTIRPFRDLRLPLLVSILITIAGLIGILYAPSYSLFLVVIALL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH GIPHGSIFPMSTIMISRATRIEERNAVNSYFLAYNNILFLLVPAIIGFIAIFIGLTLAIT CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLVIPVVLSSILFFKMFWNDEITR HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC >Mature Secondary Structure TENRNSLILASIILVLMTVSARSVNNMVTTTVPLLGKYVLSLPDSIVGLLSTVMFAFTF CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH LSTSYLNPRLNAQFRRKVFIASNVIIALSLILFSYSNVITIWIISALAGLVFGFIMPNLV HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TAASLTKDRRSAERLLSLYSTSLSLSLIIGPALESYLLTMFNYRQIFLWFLPLAILGTII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SFNIKFPDVKREESGISVLKNKGLIASILSITTYNVPFAAFTTFLAILAKERFDLSNFEA HCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH YSVFLPFYIISFLTRLSMTIRPFRDLRLPLLVSILITIAGLIGILYAPSYSLFLVVIALL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH GIPHGSIFPMSTIMISRATRIEERNAVNSYFLAYNNILFLLVPAIIGFIAIFIGLTLAIT CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLVIPVVLSSILFFKMFWNDEITR HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA