| Definition | Chlamydophila pneumoniae J138, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002491 |
| Length | 1,226,565 |
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Identifier: 15836284
GI number: 15836284
Start: 845929
End: 847758
Strand: Direct
Name: Not Available
Synonym: CPj0751
Alternate gene names: NA
Gene position: 845929-847758 (Clockwise)
Preceding gene: 15836279
Following gene: 15836285
Centisome position: 68.97
GC content: 38.25
Gene sequence:
>1830_bases ATGTTTCGTTGCATATTGTTTGGTATTTTCCTACTCACGTGTTTTTCTTCTGGCGGGGTGTTATATTACTTATTCTGTTC CCATGATTTTTCTATAGGGCCTAAGGAAAAATCACGATCCGTGTGGATTGAGGAAGAAAAAGAGTTCACGGATTCCGTAT TACATCATCTGCCATCGCAACATCAGCATTTGCATATTCTTTGTTTCCAAGGGTTTTTACTACAGAAGCAACAAAAGTTT TCTCAAGCAGAAAAGATTTTCTCTAAAGTTTACGACGAGGCTCAGGACGGTCCTTTTCTTTTTAAGGAGGAAATTTTAGG ATCCCGACTGATCAACAGTTTTTTTTTAGAAAAAACAGACGTCATGGAGACCATTCTTTGTCTTCTGAATCAGCGCTGTC CCAACTCCCCTTACTACCACTTATTTAAGGCTCTAGTATGCTATAAGCAAAAGCTATACCGTGAGGTCATAGAGCAACTA GCCTACTGGCAAGAAGAGAAAACTCGAGCGCTTGCTCCTTTATTGAATATAAGTATTGAACAGCTGCTAACAGATTTTCT GTTAGATTATATTTCTGCGCATTCTCTGATAGAACAGAAAATGTTCCCCGAAGGCAGAGTAATTCTTAATCGCAATATCA ATAGGTTATTAAAACACGAATGTGAGTGGAATGCGAAGACATACGATCGTATTGCGATTCTTCTTAGCCGGAGTTATTTT CTAGAGTTGGTAGAATCTAAGTCTGCAGATATTTATTTTGATTATTATGAGATGGTGCTTTTCTATCTCAAAAAGATCTA TATTTTAGAGCAGTGTCCTTATGCAGAACTTCTCCCCGAGGAAGAGCTTGTTTCCTTGATTATGGAACACGTGTTTATCC TTCCTAAAGATAAATTATATCCTTTAATTCAGCTCCTAGAGATGTGGCAGAAGCATTATGTTCACCCAAATAGTTCTTTA GTAGTTCAGATATTGGTAGACCGCTTTTCTACACATATGGAAGGGGCTATTCGGTTTTGTGAGGCTTTAGTTTCTTTCTC TGGATTGGAAGAATTACATCAGCAAATTATTACCACTTTTGAAGAGCTGCTTTCAAATAAAGTACAGCAGATAAAAACTG AAGAGGCTAAACAATGTGTTGCCCTACTTCATATTTTGGATCCTTCTATTTCCATTAGTGAAAAATTAGCTCTTTCTTCG GATACATTACAAAATATAGTTTCTGGGGACGACGAGCAGCATACAAAACTCCGCAATTACCTAGATCTTTGGGAAGCCAT ACAGTCTTATGATATTGATCGCCAACAGCTCGTTCATCACTTAGTTTATGGTGCAAAAGATCTTTGGAAAAAAGGAGGAA ATGATGAAAAGGCATTGAACCTTCTTCAGCTGGTCTTGAGGTTTACAAGCTACGATATAGAATGCGAAAGTGTTGTGTTT CTTTTTATAAAACAGGCGTATAAGCAAGCACTGTCTTCCCATGCCATTGCTCGTCTTTTAAAGTTAGAAAAATTTATATC GGAAGCGAATATTCCCTCTATAGTGATTAGTGAGGCTGAGAAGGCCAATTTCTTAGCAGATGCTGAATATCTTTTTGCTC ATGAAGACTATGACAAATGCTATTTGTATAGCATGTGGTTGACTAAGGTGGCCCCCTCCCCTCAATCCTATCGCTTAGCA GGGTTATGCCTGATGGAAAATAAGCGTTACGACGAAGCTTTAGAATTTCTCTGTATGCTCTCACCCAATAATAGTATCAA CGACTATAAGACGCAGAAGGCATTAGCATTTTGCCAAAAACATCAATCTAAGGACCGAGTTGCCTCTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AATAGTTTTGCATAAACACAACACTATATATATAATTTAAAATTAATAATTTAGAAGCGACATAGTTTTTTAACTTCTTT GAAGGCCGTTCAGGACGTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases CATTCTCCCCCCATCTTTTCACTCTTAAAGTAAAGAGTTTTTGTGTAGTAAATTTTTTATAGTTTTGCTTAGGAACTATT CTCCGAGTGTTTAGGAAAAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 609; Mature: 609
Protein sequence:
>609_residues MFRCILFGIFLLTCFSSGGVLYYLFCSHDFSIGPKEKSRSVWIEEEKEFTDSVLHHLPSQHQHLHILCFQGFLLQKQQKF SQAEKIFSKVYDEAQDGPFLFKEEILGSRLINSFFLEKTDVMETILCLLNQRCPNSPYYHLFKALVCYKQKLYREVIEQL AYWQEEKTRALAPLLNISIEQLLTDFLLDYISAHSLIEQKMFPEGRVILNRNINRLLKHECEWNAKTYDRIAILLSRSYF LELVESKSADIYFDYYEMVLFYLKKIYILEQCPYAELLPEEELVSLIMEHVFILPKDKLYPLIQLLEMWQKHYVHPNSSL VVQILVDRFSTHMEGAIRFCEALVSFSGLEELHQQIITTFEELLSNKVQQIKTEEAKQCVALLHILDPSISISEKLALSS DTLQNIVSGDDEQHTKLRNYLDLWEAIQSYDIDRQQLVHHLVYGAKDLWKKGGNDEKALNLLQLVLRFTSYDIECESVVF LFIKQAYKQALSSHAIARLLKLEKFISEANIPSIVISEAEKANFLADAEYLFAHEDYDKCYLYSMWLTKVAPSPQSYRLA GLCLMENKRYDEALEFLCMLSPNNSINDYKTQKALAFCQKHQSKDRVAS
Sequences:
>Translated_609_residues MFRCILFGIFLLTCFSSGGVLYYLFCSHDFSIGPKEKSRSVWIEEEKEFTDSVLHHLPSQHQHLHILCFQGFLLQKQQKF SQAEKIFSKVYDEAQDGPFLFKEEILGSRLINSFFLEKTDVMETILCLLNQRCPNSPYYHLFKALVCYKQKLYREVIEQL AYWQEEKTRALAPLLNISIEQLLTDFLLDYISAHSLIEQKMFPEGRVILNRNINRLLKHECEWNAKTYDRIAILLSRSYF LELVESKSADIYFDYYEMVLFYLKKIYILEQCPYAELLPEEELVSLIMEHVFILPKDKLYPLIQLLEMWQKHYVHPNSSL VVQILVDRFSTHMEGAIRFCEALVSFSGLEELHQQIITTFEELLSNKVQQIKTEEAKQCVALLHILDPSISISEKLALSS DTLQNIVSGDDEQHTKLRNYLDLWEAIQSYDIDRQQLVHHLVYGAKDLWKKGGNDEKALNLLQLVLRFTSYDIECESVVF LFIKQAYKQALSSHAIARLLKLEKFISEANIPSIVISEAEKANFLADAEYLFAHEDYDKCYLYSMWLTKVAPSPQSYRLA GLCLMENKRYDEALEFLCMLSPNNSINDYKTQKALAFCQKHQSKDRVAS >Mature_609_residues MFRCILFGIFLLTCFSSGGVLYYLFCSHDFSIGPKEKSRSVWIEEEKEFTDSVLHHLPSQHQHLHILCFQGFLLQKQQKF SQAEKIFSKVYDEAQDGPFLFKEEILGSRLINSFFLEKTDVMETILCLLNQRCPNSPYYHLFKALVCYKQKLYREVIEQL AYWQEEKTRALAPLLNISIEQLLTDFLLDYISAHSLIEQKMFPEGRVILNRNINRLLKHECEWNAKTYDRIAILLSRSYF LELVESKSADIYFDYYEMVLFYLKKIYILEQCPYAELLPEEELVSLIMEHVFILPKDKLYPLIQLLEMWQKHYVHPNSSL VVQILVDRFSTHMEGAIRFCEALVSFSGLEELHQQIITTFEELLSNKVQQIKTEEAKQCVALLHILDPSISISEKLALSS DTLQNIVSGDDEQHTKLRNYLDLWEAIQSYDIDRQQLVHHLVYGAKDLWKKGGNDEKALNLLQLVLRFTSYDIECESVVF LFIKQAYKQALSSHAIARLLKLEKFISEANIPSIVISEAEKANFLADAEYLFAHEDYDKCYLYSMWLTKVAPSPQSYRLA GLCLMENKRYDEALEFLCMLSPNNSINDYKTQKALAFCQKHQSKDRVAS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 71199; Mature: 71199
Theoretical pI: Translated: 5.89; Mature: 5.89
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.6 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 4.3 %Cys+Met (Translated Protein) 2.6 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 4.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFRCILFGIFLLTCFSSGGVLYYLFCSHDFSIGPKEKSRSVWIEEEKEFTDSVLHHLPSQ CHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC HQHLHILCFQGFLLQKQQKFSQAEKIFSKVYDEAQDGPFLFKEEILGSRLINSFFLEKTD CCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VMETILCLLNQRCPNSPYYHLFKALVCYKQKLYREVIEQLAYWQEEKTRALAPLLNISIE HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QLLTDFLLDYISAHSLIEQKMFPEGRVILNRNINRLLKHECEWNAKTYDRIAILLSRSYF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH LELVESKSADIYFDYYEMVLFYLKKIYILEQCPYAELLPEEELVSLIMEHVFILPKDKLY HHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH PLIQLLEMWQKHYVHPNSSLVVQILVDRFSTHMEGAIRFCEALVSFSGLEELHQQIITTF HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EELLSNKVQQIKTEEAKQCVALLHILDPSISISEKLALSSDTLQNIVSGDDEQHTKLRNY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH LDLWEAIQSYDIDRQQLVHHLVYGAKDLWKKGGNDEKALNLLQLVLRFTSYDIECESVVF HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH LFIKQAYKQALSSHAIARLLKLEKFISEANIPSIVISEAEKANFLADAEYLFAHEDYDKC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHHCHHHHEEECCCCHH YLYSMWLTKVAPSPQSYRLAGLCLMENKRYDEALEFLCMLSPNNSINDYKTQKALAFCQK HHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH HQSKDRVAS HCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MFRCILFGIFLLTCFSSGGVLYYLFCSHDFSIGPKEKSRSVWIEEEKEFTDSVLHHLPSQ CHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC HQHLHILCFQGFLLQKQQKFSQAEKIFSKVYDEAQDGPFLFKEEILGSRLINSFFLEKTD CCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VMETILCLLNQRCPNSPYYHLFKALVCYKQKLYREVIEQLAYWQEEKTRALAPLLNISIE HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QLLTDFLLDYISAHSLIEQKMFPEGRVILNRNINRLLKHECEWNAKTYDRIAILLSRSYF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH LELVESKSADIYFDYYEMVLFYLKKIYILEQCPYAELLPEEELVSLIMEHVFILPKDKLY HHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH PLIQLLEMWQKHYVHPNSSLVVQILVDRFSTHMEGAIRFCEALVSFSGLEELHQQIITTF HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EELLSNKVQQIKTEEAKQCVALLHILDPSISISEKLALSSDTLQNIVSGDDEQHTKLRNY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH LDLWEAIQSYDIDRQQLVHHLVYGAKDLWKKGGNDEKALNLLQLVLRFTSYDIECESVVF HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH LFIKQAYKQALSSHAIARLLKLEKFISEANIPSIVISEAEKANFLADAEYLFAHEDYDKC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHHCHHHHEEECCCCHH YLYSMWLTKVAPSPQSYRLAGLCLMENKRYDEALEFLCMLSPNNSINDYKTQKALAFCQK HHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH HQSKDRVAS HCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA