| Definition | Chlamydophila pneumoniae J138, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002491 |
| Length | 1,226,565 |
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Identifier: 15835828
GI number: 15835828
Start: 329571
End: 332348
Strand: Direct
Name: Not Available
Synonym: CPj0293
Alternate gene names: NA
Gene position: 329571-332348 (Clockwise)
Preceding gene: 15835827
Following gene: 15835829
Centisome position: 26.87
GC content: 38.84
Gene sequence:
>2778_bases ATGCAGAGAGTTTTGCGACTGCTGTTTAACCTACATCATGGGGAAGAAAAAAGGGCTTTCCTTTTTTTTCTCTTGGGATT GGTCTGGGGGATAGGTTGTTACGGCACTCTCTCTCTAGCTGAAGGCTTATTCATTGAAAAATTAGGATCGGCAGAATTAC CAAAAATTTATTTAGGTTCTTCTCTGATCCTTTGCGTTCTTTCATCCCTAATTCTTTACAATCTTTTTAAAAAACACATC TCAGCAACAGCTCTTTTCTTAATTCCTGTTTCTTTATCTATCCTTTGTAATTTTTATCTTATTCTCTCTTCTATCTTTGC TATCGATCCCCCCCGGTCTCCTCTGTTTTTCTATCGGATTGTAATTTGGAGTTTAACGATTCTCTCTTACACGAGTTTTT GGGGATTTGTAGATCAATTTTTTAATTTACAAGATGGAAAACGACACTTCTGTATTTTTAATGCTATCATCTTCTTAGGA GATGCTATCGGCAGCGGAATCATAGCTAGCCTGGTACACACAATAGGAATCCAGGGCATCCTGATTTTATTTACAGCAGC CCTGGTCCTGACATTCCCTATCGTATTCTATGTTTCAAAATCTCTAAAGTCGCTTTCCGATGACCATGACCTTTTCATAG ATACAGGCCACCCACCACCCTTATCAAAAGCATTGAAACTCTGTTTTTATGATAAATATACTTTTTATCTGCTTTGCTTT TATTTTCTCATGCAATTGCTAGCGATTGCTACAGAGTTTAACTATTTAAAAATCTTTGAAATTCAATTTGCCTCTAAGGA AGAATTCGAACTCGTCGCACACATAGGAAAGTGTTCCCTGTGGATTTCTTTAGGAAATATGTGCTTTGCTCTTTTCGCCT ACAGTAGAATAGTAAAGCGTCTTGGAGTCAATAATATCATTTTATTTGCTCCGCTATGTTTCTTAAGCCTCTTTCTATTT TGGACCTTTAAAACAACCCTAAGCATTGCTGTCCTTGCTATGGTAGTACGTGAAGGCGTTACCTACGCTCTTGATGACAA CAACCTCCAACTACTCATCTATGGAGTCCCCAACAAAATCCGAAACCAAATTCGCATCGTAGTGGAATCCTTTATAGAAC CTATCGGGATGTTGGTCTGGTCCTTAGTCTGTTTCTTGTCTTCTCAACAATATGTGTTCTGCCTAATCATCTCACTAATC GCCACTATTCTGGTTTGCCTCGTACGCTCTTATTATGCGAAGGCGATTCTCAAAAATCTATCTGCACAAGCCCTACAACT TACCCGCTCTATGCAAGATTGGATCAAATCTATGACAGTTAAACAAAAGAGACAAGTCGAACTCTTCTTACTTGCTCATC TTAAACACCCCAGTGAGCGTCATCAAACCTTTGCTTTTCAACATCTCTTAAATCTAGCAAGCCGCAGTGTCCTTCCAAGC CTCCTTGCCCATATGAACAAGCTCAGCCTCCCTAATAAACTCAAGACTATAGAAATGGTAAAATCTAGCTTATGGGCCAA AGATTTTCTAACCTTAGAGCTCCTGAAACGTTGGACAAGTATTTTCCCCCATCCTGCCATCGCATCAGCAATACATCTTT ATTTTGCAGAACACGATCTCCTACATATCACTCATATTGCTGAAGACCTCTATGATACTGTTGGTGATAGACTTCTTGCC GCAATTCTTACAGTAAGAAGACAGGAAGCTTATGGGCCCTATCGAGACCTTGCAGACAAGCGCCTGAAAGAACTACTCAA CTCGGATCAACCTGAAGATATAGTCATGGGGTTGACCATACTGAAATTAGAAAAGAATCCACAGAACTTCCCAATTCTTT TAGACTTCTTGAACACCAAAAACGAAGATATCTTAATTGTCACCTGCAAAGCCCTACACACTTCTGTTAGAGCTAATCAT AAACCTTATTGCCCCGAACTTCTGAAAAGACTACGACAATGCTCGCATAATGATGAAGCAAGTCAATATCTATTAAAAAC AATTAGCATTGCTTTAGATATCTCATTCGTAAAAGACTTACTGATGACAACATCACAACTAAAAAACACCTCTAGAAAAT ATGCTGAGGCTATGATTGGAGAGTTGGATAAAGAAGTCGCCCCAGCATTTCTCCAAGTCCTCACCGATGAGGGAACACAC AATCGTTGTCGTATCCTTGCCGCCAAAGCCCTCTGTAAAATCGATAATTGGCTGCTGAAAAAACACGCGTATAAAATTGT GAAGTCTAAAGCAAGTAAGGCTCTGTTCTATTCCTATCACGGCCATTACATTCAAAAGAAATACCCCACATACAACCTCA GCTTGCTGGCAAACACATTAAATTCTAATTATTATGCAGAAGTAAACTTCATGCTCTCTCTCCTAGGGATTCTTGGTTCC ATGGAGCACTCTGGTGTACTGATTCGAGCATTAACTAGTAAAAACCAAAAAATCAAAGCACAAGCACTAGAATCTTTAGA AAAAAACTGCGATAGCCACTTATTCTCTTTACTAGAACCCTTTGTTAATCAACCAGGCATGTGCTATAGCGAAAAATACT ACTTCAAATGTGGTGTGATTCCTCTAACTCTTAAAGAACTTTTAAATATGATGGAAAACTCCCCATCATCTTTAAACAAA CTAACAGCACAGCAACTCAAAGAAGAACTTTCCTATTGCGATCCAGACTTCCAATCTGTAAATACAATCTATAACCAAGA ACATGAAGACTTCAGGACAGAGGAATCAGAAACCCTAATATCTTTCTTATCTATCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTGAATTAGAATAAGTAATAGTAATTTTCTTCATACCTCCCTTGCAATTAATCACTTTGTTCTTATAAAATGTCTTCTTT TGCTTGGGTAGGTATGGAGT
Downstream 100 bases:
>100_bases ACTTCAATGATTCCAATTTAGATATCCACAGAAAAACCTTGGGAAACTGAAGATTTAAAAAATCCAAGATTGATTTATAA GTTTCGACTGCAAGAAAAAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Lipoprotein
Number of amino acids: Translated: 925; Mature: 925
Protein sequence:
>925_residues MQRVLRLLFNLHHGEEKRAFLFFLLGLVWGIGCYGTLSLAEGLFIEKLGSAELPKIYLGSSLILCVLSSLILYNLFKKHI SATALFLIPVSLSILCNFYLILSSIFAIDPPRSPLFFYRIVIWSLTILSYTSFWGFVDQFFNLQDGKRHFCIFNAIIFLG DAIGSGIIASLVHTIGIQGILILFTAALVLTFPIVFYVSKSLKSLSDDHDLFIDTGHPPPLSKALKLCFYDKYTFYLLCF YFLMQLLAIATEFNYLKIFEIQFASKEEFELVAHIGKCSLWISLGNMCFALFAYSRIVKRLGVNNIILFAPLCFLSLFLF WTFKTTLSIAVLAMVVREGVTYALDDNNLQLLIYGVPNKIRNQIRIVVESFIEPIGMLVWSLVCFLSSQQYVFCLIISLI ATILVCLVRSYYAKAILKNLSAQALQLTRSMQDWIKSMTVKQKRQVELFLLAHLKHPSERHQTFAFQHLLNLASRSVLPS LLAHMNKLSLPNKLKTIEMVKSSLWAKDFLTLELLKRWTSIFPHPAIASAIHLYFAEHDLLHITHIAEDLYDTVGDRLLA AILTVRRQEAYGPYRDLADKRLKELLNSDQPEDIVMGLTILKLEKNPQNFPILLDFLNTKNEDILIVTCKALHTSVRANH KPYCPELLKRLRQCSHNDEASQYLLKTISIALDISFVKDLLMTTSQLKNTSRKYAEAMIGELDKEVAPAFLQVLTDEGTH NRCRILAAKALCKIDNWLLKKHAYKIVKSKASKALFYSYHGHYIQKKYPTYNLSLLANTLNSNYYAEVNFMLSLLGILGS MEHSGVLIRALTSKNQKIKAQALESLEKNCDSHLFSLLEPFVNQPGMCYSEKYYFKCGVIPLTLKELLNMMENSPSSLNK LTAQQLKEELSYCDPDFQSVNTIYNQEHEDFRTEESETLISFLSI
Sequences:
>Translated_925_residues MQRVLRLLFNLHHGEEKRAFLFFLLGLVWGIGCYGTLSLAEGLFIEKLGSAELPKIYLGSSLILCVLSSLILYNLFKKHI SATALFLIPVSLSILCNFYLILSSIFAIDPPRSPLFFYRIVIWSLTILSYTSFWGFVDQFFNLQDGKRHFCIFNAIIFLG DAIGSGIIASLVHTIGIQGILILFTAALVLTFPIVFYVSKSLKSLSDDHDLFIDTGHPPPLSKALKLCFYDKYTFYLLCF YFLMQLLAIATEFNYLKIFEIQFASKEEFELVAHIGKCSLWISLGNMCFALFAYSRIVKRLGVNNIILFAPLCFLSLFLF WTFKTTLSIAVLAMVVREGVTYALDDNNLQLLIYGVPNKIRNQIRIVVESFIEPIGMLVWSLVCFLSSQQYVFCLIISLI ATILVCLVRSYYAKAILKNLSAQALQLTRSMQDWIKSMTVKQKRQVELFLLAHLKHPSERHQTFAFQHLLNLASRSVLPS LLAHMNKLSLPNKLKTIEMVKSSLWAKDFLTLELLKRWTSIFPHPAIASAIHLYFAEHDLLHITHIAEDLYDTVGDRLLA AILTVRRQEAYGPYRDLADKRLKELLNSDQPEDIVMGLTILKLEKNPQNFPILLDFLNTKNEDILIVTCKALHTSVRANH KPYCPELLKRLRQCSHNDEASQYLLKTISIALDISFVKDLLMTTSQLKNTSRKYAEAMIGELDKEVAPAFLQVLTDEGTH NRCRILAAKALCKIDNWLLKKHAYKIVKSKASKALFYSYHGHYIQKKYPTYNLSLLANTLNSNYYAEVNFMLSLLGILGS MEHSGVLIRALTSKNQKIKAQALESLEKNCDSHLFSLLEPFVNQPGMCYSEKYYFKCGVIPLTLKELLNMMENSPSSLNK LTAQQLKEELSYCDPDFQSVNTIYNQEHEDFRTEESETLISFLSI >Mature_925_residues MQRVLRLLFNLHHGEEKRAFLFFLLGLVWGIGCYGTLSLAEGLFIEKLGSAELPKIYLGSSLILCVLSSLILYNLFKKHI SATALFLIPVSLSILCNFYLILSSIFAIDPPRSPLFFYRIVIWSLTILSYTSFWGFVDQFFNLQDGKRHFCIFNAIIFLG DAIGSGIIASLVHTIGIQGILILFTAALVLTFPIVFYVSKSLKSLSDDHDLFIDTGHPPPLSKALKLCFYDKYTFYLLCF YFLMQLLAIATEFNYLKIFEIQFASKEEFELVAHIGKCSLWISLGNMCFALFAYSRIVKRLGVNNIILFAPLCFLSLFLF WTFKTTLSIAVLAMVVREGVTYALDDNNLQLLIYGVPNKIRNQIRIVVESFIEPIGMLVWSLVCFLSSQQYVFCLIISLI ATILVCLVRSYYAKAILKNLSAQALQLTRSMQDWIKSMTVKQKRQVELFLLAHLKHPSERHQTFAFQHLLNLASRSVLPS LLAHMNKLSLPNKLKTIEMVKSSLWAKDFLTLELLKRWTSIFPHPAIASAIHLYFAEHDLLHITHIAEDLYDTVGDRLLA AILTVRRQEAYGPYRDLADKRLKELLNSDQPEDIVMGLTILKLEKNPQNFPILLDFLNTKNEDILIVTCKALHTSVRANH KPYCPELLKRLRQCSHNDEASQYLLKTISIALDISFVKDLLMTTSQLKNTSRKYAEAMIGELDKEVAPAFLQVLTDEGTH NRCRILAAKALCKIDNWLLKKHAYKIVKSKASKALFYSYHGHYIQKKYPTYNLSLLANTLNSNYYAEVNFMLSLLGILGS MEHSGVLIRALTSKNQKIKAQALESLEKNCDSHLFSLLEPFVNQPGMCYSEKYYFKCGVIPLTLKELLNMMENSPSSLNK LTAQQLKEELSYCDPDFQSVNTIYNQEHEDFRTEESETLISFLSI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 105604; Mature: 105604
Theoretical pI: Translated: 8.57; Mature: 8.57
Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.3 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 4.1 %Cys+Met (Translated Protein) 2.3 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 4.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MQRVLRLLFNLHHGEEKRAFLFFLLGLVWGIGCYGTLSLAEGLFIEKLGSAELPKIYLGS CHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCH SLILCVLSSLILYNLFKKHISATALFLIPVSLSILCNFYLILSSIFAIDPPRSPLFFYRI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH VIWSLTILSYTSFWGFVDQFFNLQDGKRHFCIFNAIIFLGDAIGSGIIASLVHTIGIQGI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LILFTAALVLTFPIVFYVSKSLKSLSDDHDLFIDTGHPPPLSKALKLCFYDKYTFYLLCF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YFLMQLLAIATEFNYLKIFEIQFASKEEFELVAHIGKCSLWISLGNMCFALFAYSRIVKR HHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGVNNIILFAPLCFLSLFLFWTFKTTLSIAVLAMVVREGVTYALDDNNLQLLIYGVPNKI HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEEEECCHHH RNQIRIVVESFIEPIGMLVWSLVCFLSSQQYVFCLIISLIATILVCLVRSYYAKAILKNL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SAQALQLTRSMQDWIKSMTVKQKRQVELFLLAHLKHPSERHQTFAFQHLLNLASRSVLPS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLAHMNKLSLPNKLKTIEMVKSSLWAKDFLTLELLKRWTSIFPHPAIASAIHLYFAEHDL HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCH LHITHIAEDLYDTVGDRLLAAILTVRRQEAYGPYRDLADKRLKELLNSDQPEDIVMGLTI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHEE LKLEKNPQNFPILLDFLNTKNEDILIVTCKALHTSVRANHKPYCPELLKRLRQCSHNDEA EEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHH SQYLLKTISIALDISFVKDLLMTTSQLKNTSRKYAEAMIGELDKEVAPAFLQVLTDEGTH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NRCRILAAKALCKIDNWLLKKHAYKIVKSKASKALFYSYHGHYIQKKYPTYNLSLLANTL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEECCCCCCCHHHHHHHH NSNYYAEVNFMLSLLGILGSMEHSGVLIRALTSKNQKIKAQALESLEKNCDSHLFSLLEP CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVNQPGMCYSEKYYFKCGVIPLTLKELLNMMENSPSSLNKLTAQQLKEELSYCDPDFQSV HHCCCCCEECCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH NTIYNQEHEDFRTEESETLISFLSI HHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MQRVLRLLFNLHHGEEKRAFLFFLLGLVWGIGCYGTLSLAEGLFIEKLGSAELPKIYLGS CHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCH SLILCVLSSLILYNLFKKHISATALFLIPVSLSILCNFYLILSSIFAIDPPRSPLFFYRI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH VIWSLTILSYTSFWGFVDQFFNLQDGKRHFCIFNAIIFLGDAIGSGIIASLVHTIGIQGI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LILFTAALVLTFPIVFYVSKSLKSLSDDHDLFIDTGHPPPLSKALKLCFYDKYTFYLLCF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YFLMQLLAIATEFNYLKIFEIQFASKEEFELVAHIGKCSLWISLGNMCFALFAYSRIVKR HHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGVNNIILFAPLCFLSLFLFWTFKTTLSIAVLAMVVREGVTYALDDNNLQLLIYGVPNKI HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEEEECCHHH RNQIRIVVESFIEPIGMLVWSLVCFLSSQQYVFCLIISLIATILVCLVRSYYAKAILKNL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SAQALQLTRSMQDWIKSMTVKQKRQVELFLLAHLKHPSERHQTFAFQHLLNLASRSVLPS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLAHMNKLSLPNKLKTIEMVKSSLWAKDFLTLELLKRWTSIFPHPAIASAIHLYFAEHDL HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCH LHITHIAEDLYDTVGDRLLAAILTVRRQEAYGPYRDLADKRLKELLNSDQPEDIVMGLTI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHEE LKLEKNPQNFPILLDFLNTKNEDILIVTCKALHTSVRANHKPYCPELLKRLRQCSHNDEA EEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHH SQYLLKTISIALDISFVKDLLMTTSQLKNTSRKYAEAMIGELDKEVAPAFLQVLTDEGTH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NRCRILAAKALCKIDNWLLKKHAYKIVKSKASKALFYSYHGHYIQKKYPTYNLSLLANTL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEECCCCCCCHHHHHHHH NSNYYAEVNFMLSLLGILGSMEHSGVLIRALTSKNQKIKAQALESLEKNCDSHLFSLLEP CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVNQPGMCYSEKYYFKCGVIPLTLKELLNMMENSPSSLNKLTAQQLKEELSYCDPDFQSV HHCCCCCEECCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH NTIYNQEHEDFRTEESETLISFLSI HHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA