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The map label for this gene is 157962672

Identifier: 157962672

GI number: 157962672

Start: 3483446

End: 3485026

Strand: Reverse

Name: 157962672

Synonym: Spea_2853

Alternate gene names: NA

Gene position: 3485026-3483446 (Counterclockwise)

Preceding gene: 157962673

Following gene: 157962670

Centisome position: 67.35

GC content: 47.31

Gene sequence:

>1581_bases
ATGACAATTATAAGCTATGCCGATTCGGCTCTGTCGCTACTGCCTCCGGTAGTGGCAATCGTACTGGCGATGTTAACGCG
CCGTGTTTTACTGTCTTTGGGTGTGGGTATCGTATTGGGGGCATTGCTGCTTACCGATTTCTCTGCCATGCAAACAGCGC
AGTACCTTGGTGAAAAGGTGTCAGCTCTGGTTTGGGATGATGGCGCCTTGAACAGTTGGAACCTATATATTCTTGGTTTC
TTAGTGTTACTTGGAATGATCACCGCGCTAATCACCGTTAGTGGCTCGGCCAGAGCCTTTGCCGATTGGGCTCGTACCCA
TATCCGCAATAAACGTGATGCTAAACTACTGACTATGTTCTTAGGTTGTGTTGTGTTTATCGATGACTACTTTAACAGCT
TAGTTGTGGGTAGCGTCGCCAGACCACTGACCGACCGTTACTACATCTCACGCAGCAAACTCGCTTACCTGCTTGATTCT
ACAGCAGCGCCGATTTGTGTTATCTCGCCAGTATCGAGCTGGGGGGCTTATATTATCGCCTTGATTGGCGGCATTCTTAC
GGCTCACGGCTTCACAGATACAGGACACTTAAGTGTGTTCGTACAGATGATCCCAATGAACTTCTACGCCATTTTTGCAC
TCTTGCTGCTACTTTGTGTTGCCTTGATGGGTCTAGATATTGGTCCAATGCGCCAACATGAATTAAAAGCGCAGAAGGGC
GAGCTTTATGACGAATCTAAAGGTCTACCACCAGGAGCCAATTCAGACTTACCAGAAGCGGATACCGGTAAGATCATGGG
GCTATTCCTACCTATCACAGTATTAGTGTTTGCCACTTTCTACTTTATGGTTAGCAGCGGCGGCGATGCGCTAGCGGCAA
AGGGCCAAGCATTTAGCCTAATTGGTGCATTCGAAAATACCGATGTGGGTTCATCATTGTTCTTCGGTGCTGCAATTGGT
CTAGCGGTTACTTTAGCTTTGGTTATCTACCAAGGCGTAGAGAAATTGATGATCGCTAAAGGGCTGTTTGAAGGTGCTAA
GTCGATGCTACCTGCGATTTATATTCTACTGTTTGCTTGGACAATCGCCGGTGTGATTGGTCAGCTTGAAACCGGTAAAT
ATATGGCGAGCTTAGCAACAGGCAATATTCCTTTTGCTATGTTACCTGCCGTGCTATTTATTCTTGCAGGCCTAACCGCA
TTCTCGACCGGTACCAGCTGGGGTACCTTCGGTATCATGTTACCAATCGCTGCCGATATGGCGATGGGTAGTCATACCGG
AATGATGCTACCTATGCTTGCGTCAGTACTCGCTGGTGCGGTATTTGGTGACCACTGTTCACCGATTTCTGATACCACGA
TTTTGTCGTCAACAGGTGCAAACTGTCACCATATTGACCACGTGATGACTCAGTTACCTTATGCCTTAATCGTTGCAGGC
ATTAGCTTGGTAGGTTACTTAGTACTGGGCTTCACTGAGTCAGTAACAGCTGGCCTAATAGCTTGTAGCGTACTGTTTGT
GATTAGCATTATCGTACTGCGCATCAAGGCATGTTCGCCAGATGCAGCGTGTAAACAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCTATGGAGCGCTACTGATAGGGCAGGTGTAAACAGATATCTATGCTATATCCCACCAGTTCAGTCGGCCTCCATTCGTA
TTTAGCGAAGAAATTAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGGTTTATAATCTAAATTGCATGAGAAGGTGATTCTATACTGCTAGCGCTATACTGCTAGCGCTATACTGCTAGCGCTAT
ACTGCTTGTATTAGTCGCTG

Product: Na+/H+ antiporter NhaC

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 526; Mature: 525

Protein sequence:

>526_residues
MTIISYADSALSLLPPVVAIVLAMLTRRVLLSLGVGIVLGALLLTDFSAMQTAQYLGEKVSALVWDDGALNSWNLYILGF
LVLLGMITALITVSGSARAFADWARTHIRNKRDAKLLTMFLGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPLTDRYYISRSKLAYLLDS
TAAPICVISPVSSWGAYIIALIGGILTAHGFTDTGHLSVFVQMIPMNFYAIFALLLLLCVALMGLDIGPMRQHELKAQKG
ELYDESKGLPPGANSDLPEADTGKIMGLFLPITVLVFATFYFMVSSGGDALAAKGQAFSLIGAFENTDVGSSLFFGAAIG
LAVTLALVIYQGVEKLMIAKGLFEGAKSMLPAIYILLFAWTIAGVIGQLETGKYMASLATGNIPFAMLPAVLFILAGLTA
FSTGTSWGTFGIMLPIAADMAMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGANCHHIDHVMTQLPYALIVAG
ISLVGYLVLGFTESVTAGLIACSVLFVISIIVLRIKACSPDAACKQ

Sequences:

>Translated_526_residues
MTIISYADSALSLLPPVVAIVLAMLTRRVLLSLGVGIVLGALLLTDFSAMQTAQYLGEKVSALVWDDGALNSWNLYILGF
LVLLGMITALITVSGSARAFADWARTHIRNKRDAKLLTMFLGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPLTDRYYISRSKLAYLLDS
TAAPICVISPVSSWGAYIIALIGGILTAHGFTDTGHLSVFVQMIPMNFYAIFALLLLLCVALMGLDIGPMRQHELKAQKG
ELYDESKGLPPGANSDLPEADTGKIMGLFLPITVLVFATFYFMVSSGGDALAAKGQAFSLIGAFENTDVGSSLFFGAAIG
LAVTLALVIYQGVEKLMIAKGLFEGAKSMLPAIYILLFAWTIAGVIGQLETGKYMASLATGNIPFAMLPAVLFILAGLTA
FSTGTSWGTFGIMLPIAADMAMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGANCHHIDHVMTQLPYALIVAG
ISLVGYLVLGFTESVTAGLIACSVLFVISIIVLRIKACSPDAACKQ
>Mature_525_residues
TIISYADSALSLLPPVVAIVLAMLTRRVLLSLGVGIVLGALLLTDFSAMQTAQYLGEKVSALVWDDGALNSWNLYILGFL
VLLGMITALITVSGSARAFADWARTHIRNKRDAKLLTMFLGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPLTDRYYISRSKLAYLLDST
AAPICVISPVSSWGAYIIALIGGILTAHGFTDTGHLSVFVQMIPMNFYAIFALLLLLCVALMGLDIGPMRQHELKAQKGE
LYDESKGLPPGANSDLPEADTGKIMGLFLPITVLVFATFYFMVSSGGDALAAKGQAFSLIGAFENTDVGSSLFFGAAIGL
AVTLALVIYQGVEKLMIAKGLFEGAKSMLPAIYILLFAWTIAGVIGQLETGKYMASLATGNIPFAMLPAVLFILAGLTAF
STGTSWGTFGIMLPIAADMAMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGANCHHIDHVMTQLPYALIVAGI
SLVGYLVLGFTESVTAGLIACSVLFVISIIVLRIKACSPDAACKQ

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55608; Mature: 55476

Theoretical pI: Translated: 6.23; Mature: 6.23

Prosite motif: PS00678 WD_REPEATS_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
4.2 %Met     (Translated Protein)
5.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
4.0 %Met     (Mature Protein)
5.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTIISYADSALSLLPPVVAIVLAMLTRRVLLSLGVGIVLGALLLTDFSAMQTAQYLGEKV
CEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SALVWDDGALNSWNLYILGFLVLLGMITALITVSGSARAFADWARTHIRNKRDAKLLTMF
HEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
LGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPLTDRYYISRSKLAYLLDSTAAPICVISPVSSWGAYIIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHH
LIGGILTAHGFTDTGHLSVFVQMIPMNFYAIFALLLLLCVALMGLDIGPMRQHELKAQKG
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHC
ELYDESKGLPPGANSDLPEADTGKIMGLFLPITVLVFATFYFMVSSGGDALAAKGQAFSL
CCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEE
IGAFENTDVGSSLFFGAAIGLAVTLALVIYQGVEKLMIAKGLFEGAKSMLPAIYILLFAW
EECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIAGVIGQLETGKYMASLATGNIPFAMLPAVLFILAGLTAFSTGTSWGTFGIMLPIAADM
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
AMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGANCHHIDHVMTQLPYALIVAG
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISLVGYLVLGFTESVTAGLIACSVLFVISIIVLRIKACSPDAACKQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TIISYADSALSLLPPVVAIVLAMLTRRVLLSLGVGIVLGALLLTDFSAMQTAQYLGEKV
EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SALVWDDGALNSWNLYILGFLVLLGMITALITVSGSARAFADWARTHIRNKRDAKLLTMF
HEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
LGCVVFIDDYFNSLVVGSVARPLTDRYYISRSKLAYLLDSTAAPICVISPVSSWGAYIIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHH
LIGGILTAHGFTDTGHLSVFVQMIPMNFYAIFALLLLLCVALMGLDIGPMRQHELKAQKG
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHC
ELYDESKGLPPGANSDLPEADTGKIMGLFLPITVLVFATFYFMVSSGGDALAAKGQAFSL
CCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEE
IGAFENTDVGSSLFFGAAIGLAVTLALVIYQGVEKLMIAKGLFEGAKSMLPAIYILLFAW
EECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIAGVIGQLETGKYMASLATGNIPFAMLPAVLFILAGLTAFSTGTSWGTFGIMLPIAADM
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
AMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGANCHHIDHVMTQLPYALIVAG
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISLVGYLVLGFTESVTAGLIACSVLFVISIIVLRIKACSPDAACKQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]