| Definition | Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009901 |
| Length | 5,174,581 |
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The map label for this gene is 157961882
Identifier: 157961882
GI number: 157961882
Start: 2493222
End: 2496497
Strand: Reverse
Name: 157961882
Synonym: Spea_2061
Alternate gene names: NA
Gene position: 2496497-2493222 (Counterclockwise)
Preceding gene: 157961883
Following gene: 157961880
Centisome position: 48.25
GC content: 35.99
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TACTATAAACAGGTAGTGAAGTGTGTGCGTAACAGAAATTATGGTTGATCGACTTACTTTTAGTAATCTCTATCTGGTGA GATAGAGCAAATAATCTAGC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1091; Mature: 1091
Protein sequence:
>1091_residues MFVSIEKLLNSLQHHVNKNIDETLYQNKAFLSSKWNLLEHNILRWSQRHSYYTFLTFVLASLLVANLLLWKEELTPFAIE YFPNWRRLIDWQGGFLAGQLTIVGVVYPLVIGLIGVLFQNKSAKKTLFPIYQLYSGFMFAGLSGLFLSIFIIVGYFLSAS MDQSTYLAICITTALWLTFNVLLTSWFFTATFLMLDETKRDRIVVRFTIHELCETDIRHRIHELLLQNSVRNNVLANPDE GVLKVSTYKFSDDKYNEIMVPSPDPIRVTNVYFSIINAIIHYQVKKLKVLRWLNRQSLVKRLVSKKGFSWLHLDLNAEPE FVLQPIWTNENETGLVIVRYSGFDLDWLSKLLIKLSFTIKKNKYNDERSLTSMMLGLVGSANDSIREKNIGEFKYALDNI VKWHIEIASALSFINDNKEDDNWLLLPTTNFFSRSYLDEILTEYYQIAKSAVELIPENIEFFDEVIYLHKRLFSRREKLV KREGFLLIQGSYFTWSLLMEWRSYSSSSSDMRVANKYEDVLFDFVGSWESWLDYIEPRRKRLDSLTESLPLFLAHLEFTA HTAITALRYNNDEAAGWGVDMLNNWCEKLSVRDYGHGLEEYRWHSELVTHDMLLKSLDDKNWIVILNGHQFNLKSAFNIA FENAAFDLRVITACYMLLKPNLNDNERIRQYIKALLSNAAIHPTGAIGRRTKSISNASDVVGTYIRHRDYPNYGSGSYGS WISKVLESFGRVNEKRRVSGRIYSGWGRNDAQSMNIAYVEIAVSFSNSQWQLGRKWFDIIFSDAFRYQDQQSLVRDLQEW LRLVDEIKEPFLISKEQFDSNLDNFKTSIQQVIDQLNQRQNQLVAEADIDEDLITKFGIACSKAFMGEDANFEFPINLFK SVGFNGNPVEETLYKLNIQGYHKENIAKNIEANRAVNEESWLKESTRNNVEVNILRKLLQYKTSNSKVYTNAENNIFDIS NLTKDITNPVLFSGSSELNQLLREARYKPEIANKFDISFIDGFGNNYICNLGDIIVYSLHFSDVNFSLLTTRDLFESIVF GKVMDNQFVEVNYVPSQNENVGELSINYWMKVDLVDELPCIKTEIKSIDKE
Sequences:
>Translated_1091_residues MFVSIEKLLNSLQHHVNKNIDETLYQNKAFLSSKWNLLEHNILRWSQRHSYYTFLTFVLASLLVANLLLWKEELTPFAIE YFPNWRRLIDWQGGFLAGQLTIVGVVYPLVIGLIGVLFQNKSAKKTLFPIYQLYSGFMFAGLSGLFLSIFIIVGYFLSAS MDQSTYLAICITTALWLTFNVLLTSWFFTATFLMLDETKRDRIVVRFTIHELCETDIRHRIHELLLQNSVRNNVLANPDE GVLKVSTYKFSDDKYNEIMVPSPDPIRVTNVYFSIINAIIHYQVKKLKVLRWLNRQSLVKRLVSKKGFSWLHLDLNAEPE FVLQPIWTNENETGLVIVRYSGFDLDWLSKLLIKLSFTIKKNKYNDERSLTSMMLGLVGSANDSIREKNIGEFKYALDNI VKWHIEIASALSFINDNKEDDNWLLLPTTNFFSRSYLDEILTEYYQIAKSAVELIPENIEFFDEVIYLHKRLFSRREKLV KREGFLLIQGSYFTWSLLMEWRSYSSSSSDMRVANKYEDVLFDFVGSWESWLDYIEPRRKRLDSLTESLPLFLAHLEFTA HTAITALRYNNDEAAGWGVDMLNNWCEKLSVRDYGHGLEEYRWHSELVTHDMLLKSLDDKNWIVILNGHQFNLKSAFNIA FENAAFDLRVITACYMLLKPNLNDNERIRQYIKALLSNAAIHPTGAIGRRTKSISNASDVVGTYIRHRDYPNYGSGSYGS WISKVLESFGRVNEKRRVSGRIYSGWGRNDAQSMNIAYVEIAVSFSNSQWQLGRKWFDIIFSDAFRYQDQQSLVRDLQEW LRLVDEIKEPFLISKEQFDSNLDNFKTSIQQVIDQLNQRQNQLVAEADIDEDLITKFGIACSKAFMGEDANFEFPINLFK SVGFNGNPVEETLYKLNIQGYHKENIAKNIEANRAVNEESWLKESTRNNVEVNILRKLLQYKTSNSKVYTNAENNIFDIS NLTKDITNPVLFSGSSELNQLLREARYKPEIANKFDISFIDGFGNNYICNLGDIIVYSLHFSDVNFSLLTTRDLFESIVF GKVMDNQFVEVNYVPSQNENVGELSINYWMKVDLVDELPCIKTEIKSIDKE >Mature_1091_residues MFVSIEKLLNSLQHHVNKNIDETLYQNKAFLSSKWNLLEHNILRWSQRHSYYTFLTFVLASLLVANLLLWKEELTPFAIE YFPNWRRLIDWQGGFLAGQLTIVGVVYPLVIGLIGVLFQNKSAKKTLFPIYQLYSGFMFAGLSGLFLSIFIIVGYFLSAS MDQSTYLAICITTALWLTFNVLLTSWFFTATFLMLDETKRDRIVVRFTIHELCETDIRHRIHELLLQNSVRNNVLANPDE GVLKVSTYKFSDDKYNEIMVPSPDPIRVTNVYFSIINAIIHYQVKKLKVLRWLNRQSLVKRLVSKKGFSWLHLDLNAEPE FVLQPIWTNENETGLVIVRYSGFDLDWLSKLLIKLSFTIKKNKYNDERSLTSMMLGLVGSANDSIREKNIGEFKYALDNI VKWHIEIASALSFINDNKEDDNWLLLPTTNFFSRSYLDEILTEYYQIAKSAVELIPENIEFFDEVIYLHKRLFSRREKLV KREGFLLIQGSYFTWSLLMEWRSYSSSSSDMRVANKYEDVLFDFVGSWESWLDYIEPRRKRLDSLTESLPLFLAHLEFTA HTAITALRYNNDEAAGWGVDMLNNWCEKLSVRDYGHGLEEYRWHSELVTHDMLLKSLDDKNWIVILNGHQFNLKSAFNIA FENAAFDLRVITACYMLLKPNLNDNERIRQYIKALLSNAAIHPTGAIGRRTKSISNASDVVGTYIRHRDYPNYGSGSYGS WISKVLESFGRVNEKRRVSGRIYSGWGRNDAQSMNIAYVEIAVSFSNSQWQLGRKWFDIIFSDAFRYQDQQSLVRDLQEW LRLVDEIKEPFLISKEQFDSNLDNFKTSIQQVIDQLNQRQNQLVAEADIDEDLITKFGIACSKAFMGEDANFEFPINLFK SVGFNGNPVEETLYKLNIQGYHKENIAKNIEANRAVNEESWLKESTRNNVEVNILRKLLQYKTSNSKVYTNAENNIFDIS NLTKDITNPVLFSGSSELNQLLREARYKPEIANKFDISFIDGFGNNYICNLGDIIVYSLHFSDVNFSLLTTRDLFESIVF GKVMDNQFVEVNYVPSQNENVGELSINYWMKVDLVDELPCIKTEIKSIDKE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 126783; Mature: 126783
Theoretical pI: Translated: 6.19; Mature: 6.19
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFVSIEKLLNSLQHHVNKNIDETLYQNKAFLSSKWNLLEHNILRWSQRHSYYTFLTFVLA CEEEHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH SLLVANLLLWKEELTPFAIEYFPNWRRLIDWQGGFLAGQLTIVGVVYPLVIGLIGVLFQN HHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KSAKKTLFPIYQLYSGFMFAGLSGLFLSIFIIVGYFLSASMDQSTYLAICITTALWLTFN CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH VLLTSWFFTATFLMLDETKRDRIVVRFTIHELCETDIRHRIHELLLQNSVRNNVLANPDE HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC GVLKVSTYKFSDDKYNEIMVPSPDPIRVTNVYFSIINAIIHYQVKKLKVLRWLNRQSLVK CEEEEEEEEECCCCCCEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHH RLVSKKGFSWLHLDLNAEPEFVLQPIWTNENETGLVIVRYSGFDLDWLSKLLIKLSFTIK HHHHHCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHEEE KNKYNDERSLTSMMLGLVGSANDSIREKNIGEFKYALDNIVKWHIEIASALSFINDNKED CCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC DNWLLLPTTNFFSRSYLDEILTEYYQIAKSAVELIPENIEFFDEVIYLHKRLFSRREKLV CCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KREGFLLIQGSYFTWSLLMEWRSYSSSSSDMRVANKYEDVLFDFVGSWESWLDYIEPRRK HHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH RLDSLTESLPLFLAHLEFTAHTAITALRYNNDEAAGWGVDMLNNWCEKLSVRDYGHGLEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHH YRWHSELVTHDMLLKSLDDKNWIVILNGHQFNLKSAFNIAFENAAFDLRVITACYMLLKP HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCEECCCHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCC NLNDNERIRQYIKALLSNAAIHPTGAIGRRTKSISNASDVVGTYIRHRDYPNYGSGSYGS CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH WISKVLESFGRVNEKRRVSGRIYSGWGRNDAQSMNIAYVEIAVSFSNSQWQLGRKWFDII HHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHH FSDAFRYQDQQSLVRDLQEWLRLVDEIKEPFLISKEQFDSNLDNFKTSIQQVIDQLNQRQ HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NQLVAEADIDEDLITKFGIACSKAFMGEDANFEFPINLFKSVGFNGNPVEETLYKLNIQG HHEEHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHEECCCC YHKENIAKNIEANRAVNEESWLKESTRNNVEVNILRKLLQYKTSNSKVYTNAENNIFDIS CCHHHHHHHCHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEEHH NLTKDITNPVLFSGSSELNQLLREARYKPEIANKFDISFIDGFGNNYICNLGDIIVYSLH HHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEECCCEEEEEEE FSDVNFSLLTTRDLFESIVFGKVMDNQFVEVNYVPSQNENVGELSINYWMKVDLVDELPC ECCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEHHCCCH IKTEIKSIDKE HHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MFVSIEKLLNSLQHHVNKNIDETLYQNKAFLSSKWNLLEHNILRWSQRHSYYTFLTFVLA CEEEHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH SLLVANLLLWKEELTPFAIEYFPNWRRLIDWQGGFLAGQLTIVGVVYPLVIGLIGVLFQN HHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KSAKKTLFPIYQLYSGFMFAGLSGLFLSIFIIVGYFLSASMDQSTYLAICITTALWLTFN CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH VLLTSWFFTATFLMLDETKRDRIVVRFTIHELCETDIRHRIHELLLQNSVRNNVLANPDE HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC GVLKVSTYKFSDDKYNEIMVPSPDPIRVTNVYFSIINAIIHYQVKKLKVLRWLNRQSLVK CEEEEEEEEECCCCCCEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHH RLVSKKGFSWLHLDLNAEPEFVLQPIWTNENETGLVIVRYSGFDLDWLSKLLIKLSFTIK HHHHHCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHEEE KNKYNDERSLTSMMLGLVGSANDSIREKNIGEFKYALDNIVKWHIEIASALSFINDNKED CCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC DNWLLLPTTNFFSRSYLDEILTEYYQIAKSAVELIPENIEFFDEVIYLHKRLFSRREKLV CCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KREGFLLIQGSYFTWSLLMEWRSYSSSSSDMRVANKYEDVLFDFVGSWESWLDYIEPRRK HHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH RLDSLTESLPLFLAHLEFTAHTAITALRYNNDEAAGWGVDMLNNWCEKLSVRDYGHGLEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHH YRWHSELVTHDMLLKSLDDKNWIVILNGHQFNLKSAFNIAFENAAFDLRVITACYMLLKP HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCEECCCHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCC NLNDNERIRQYIKALLSNAAIHPTGAIGRRTKSISNASDVVGTYIRHRDYPNYGSGSYGS CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH WISKVLESFGRVNEKRRVSGRIYSGWGRNDAQSMNIAYVEIAVSFSNSQWQLGRKWFDII HHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHH FSDAFRYQDQQSLVRDLQEWLRLVDEIKEPFLISKEQFDSNLDNFKTSIQQVIDQLNQRQ HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NQLVAEADIDEDLITKFGIACSKAFMGEDANFEFPINLFKSVGFNGNPVEETLYKLNIQG HHEEHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHEECCCC YHKENIAKNIEANRAVNEESWLKESTRNNVEVNILRKLLQYKTSNSKVYTNAENNIFDIS CCHHHHHHHCHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEEHH NLTKDITNPVLFSGSSELNQLLREARYKPEIANKFDISFIDGFGNNYICNLGDIIVYSLH HHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEECCCEEEEEEE FSDVNFSLLTTRDLFESIVFGKVMDNQFVEVNYVPSQNENVGELSINYWMKVDLVDELPC ECCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEHHCCCH IKTEIKSIDKE HHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
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Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA