Definition Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome, complete genome.
Accession NC_009901
Length 5,174,581

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The map label for this gene is 157961882

Identifier: 157961882

GI number: 157961882

Start: 2493222

End: 2496497

Strand: Reverse

Name: 157961882

Synonym: Spea_2061

Alternate gene names: NA

Gene position: 2496497-2493222 (Counterclockwise)

Preceding gene: 157961883

Following gene: 157961880

Centisome position: 48.25

GC content: 35.99

Gene sequence:

>3276_bases
GTGTTTGTTAGTATTGAGAAGCTGTTAAATTCACTTCAGCATCATGTAAATAAAAACATTGATGAAACGCTCTACCAAAA
TAAGGCGTTCCTCTCAAGTAAATGGAACCTTTTAGAGCACAACATATTACGTTGGTCTCAAAGGCATAGTTATTACACCT
TTCTCACCTTCGTCTTAGCTAGTTTACTTGTAGCCAATTTATTGCTTTGGAAAGAAGAATTAACTCCATTTGCTATCGAG
TATTTTCCTAACTGGAGAAGACTAATCGACTGGCAAGGTGGTTTTCTTGCTGGTCAGTTAACCATTGTCGGTGTTGTATA
TCCACTTGTTATTGGTTTGATTGGTGTACTTTTTCAGAATAAGTCAGCTAAGAAGACATTGTTTCCTATTTATCAGCTGT
ACTCTGGCTTCATGTTTGCTGGTTTAAGTGGATTGTTTTTGTCCATCTTTATAATTGTGGGCTACTTCCTCAGCGCTAGT
ATGGATCAGTCAACTTATCTAGCGATTTGCATAACTACCGCGTTATGGTTGACATTTAATGTTTTATTAACGAGTTGGTT
TTTTACAGCTACATTCTTGATGTTAGATGAAACGAAACGTGACAGGATAGTTGTTCGATTCACTATTCATGAACTATGTG
AGACTGATATTAGGCACAGGATTCATGAATTATTACTACAAAACTCAGTAAGAAATAATGTTCTGGCTAACCCAGATGAG
GGCGTACTCAAAGTAAGCACCTATAAGTTCTCTGATGATAAATACAATGAAATTATGGTTCCGTCACCAGATCCAATTCG
AGTAACTAACGTCTACTTTTCAATCATCAATGCGATAATTCATTACCAAGTTAAGAAGCTCAAAGTGCTTCGTTGGCTTA
ATCGCCAGAGTTTGGTGAAGAGGCTAGTTTCGAAAAAAGGTTTTAGCTGGCTCCATTTAGATTTAAATGCTGAACCAGAA
TTTGTACTACAACCTATTTGGACTAATGAAAATGAAACAGGTCTAGTAATTGTTAGGTATTCTGGCTTCGATCTGGATTG
GCTATCTAAGTTGTTGATTAAATTAAGCTTTACAATCAAGAAAAACAAATATAATGATGAAAGAAGCCTAACTTCCATGA
TGCTAGGCTTAGTTGGCTCAGCTAATGATTCGATTCGAGAAAAGAACATAGGAGAATTTAAATACGCTTTAGACAACATC
GTGAAATGGCATATAGAGATTGCTTCTGCCTTAAGCTTTATTAACGATAATAAAGAAGACGATAATTGGCTTTTGTTGCC
AACTACCAATTTTTTCAGTAGGAGCTATCTCGATGAAATTTTGACAGAATATTATCAAATTGCTAAATCTGCTGTCGAAC
TAATTCCTGAAAATATTGAATTCTTTGACGAAGTCATTTATTTGCATAAACGACTGTTTTCACGGCGGGAAAAACTGGTT
AAGCGTGAAGGCTTTTTATTGATCCAAGGTAGTTACTTTACTTGGTCATTATTGATGGAATGGCGTTCATATAGTTCTTC
CTCGTCAGATATGCGCGTGGCAAATAAATATGAAGACGTACTTTTTGATTTTGTTGGGTCGTGGGAGTCTTGGCTGGATT
ATATTGAACCGAGACGTAAACGGCTTGATAGCCTAACTGAGTCACTACCATTGTTCCTTGCCCATTTAGAGTTTACAGCG
CATACCGCGATAACAGCTTTGAGGTATAACAATGACGAGGCTGCTGGATGGGGTGTTGACATGCTGAACAATTGGTGTGA
AAAGCTATCAGTTAGAGATTATGGTCATGGACTAGAAGAATATAGATGGCACTCTGAATTAGTGACTCATGATATGTTGC
TTAAAAGCTTAGATGACAAAAATTGGATTGTGATCTTAAATGGTCATCAGTTTAACCTTAAATCAGCTTTTAATATTGCA
TTTGAGAATGCAGCGTTTGACCTTAGAGTTATTACTGCTTGTTACATGTTGCTAAAACCGAACTTAAATGATAATGAAAG
AATAAGACAATACATTAAAGCGTTACTTTCTAACGCTGCAATTCACCCAACAGGTGCAATTGGTCGAAGAACTAAGTCTA
TATCCAACGCTAGTGACGTAGTTGGAACGTATATTAGGCATAGGGATTATCCCAATTATGGAAGCGGTAGCTACGGCTCA
TGGATTTCAAAAGTACTTGAGTCCTTTGGGCGAGTTAATGAAAAGAGAAGAGTATCGGGTCGTATCTATTCAGGTTGGGG
ACGCAACGACGCTCAAAGTATGAATATTGCTTATGTTGAGATAGCAGTTTCCTTTTCAAATAGCCAATGGCAACTGGGAC
GTAAATGGTTCGATATTATTTTTTCGGATGCATTTCGCTATCAAGACCAACAATCCCTTGTTCGTGACTTACAAGAGTGG
CTTAGATTGGTTGACGAAATCAAAGAACCATTCCTCATCTCTAAAGAACAATTTGATAGTAACCTAGATAACTTTAAAAC
TTCAATTCAACAAGTTATTGACCAACTAAACCAACGACAGAATCAGTTAGTTGCAGAGGCAGATATTGACGAAGATCTGA
TAACTAAATTTGGCATAGCTTGTTCCAAGGCTTTTATGGGCGAAGACGCGAACTTCGAGTTTCCTATAAATTTATTTAAA
TCGGTTGGTTTTAACGGCAATCCTGTGGAGGAAACCTTGTATAAATTAAATATACAGGGATATCATAAAGAAAATATTGC
TAAAAACATTGAAGCCAATAGAGCTGTCAACGAGGAAAGTTGGCTTAAAGAATCAACCAGAAATAATGTTGAAGTAAATA
TTCTAAGAAAGCTATTGCAGTACAAAACTTCTAATTCAAAAGTCTATACCAATGCAGAAAACAACATTTTCGACATTTCT
AACTTAACCAAAGATATTACAAATCCAGTGTTGTTTTCAGGAAGCTCAGAGTTGAATCAATTACTTCGAGAAGCAAGATA
CAAACCAGAAATAGCTAATAAGTTTGATATCTCCTTTATTGATGGCTTCGGGAATAACTATATCTGTAATCTGGGTGATA
TCATTGTATATAGTCTTCATTTTTCGGACGTAAACTTTAGTTTACTGACAACTAGAGATTTATTCGAATCAATCGTATTT
GGCAAGGTTATGGATAATCAATTTGTAGAAGTAAATTATGTGCCATCTCAAAATGAAAATGTCGGTGAATTATCGATAAA
TTATTGGATGAAAGTGGATTTAGTGGATGAGCTACCTTGTATTAAAACTGAAATAAAGAGCATAGATAAAGAGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTAATCAATTCAAAGAGATGCATATCATTGATTAACAGCCGATTTCTAGTAAAGTAGTTGCACTTAAAAAAGAACGAGCT
AGCTCCTGGGGGGCATCTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TACTATAAACAGGTAGTGAAGTGTGTGCGTAACAGAAATTATGGTTGATCGACTTACTTTTAGTAATCTCTATCTGGTGA
GATAGAGCAAATAATCTAGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1091; Mature: 1091

Protein sequence:

>1091_residues
MFVSIEKLLNSLQHHVNKNIDETLYQNKAFLSSKWNLLEHNILRWSQRHSYYTFLTFVLASLLVANLLLWKEELTPFAIE
YFPNWRRLIDWQGGFLAGQLTIVGVVYPLVIGLIGVLFQNKSAKKTLFPIYQLYSGFMFAGLSGLFLSIFIIVGYFLSAS
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NLTKDITNPVLFSGSSELNQLLREARYKPEIANKFDISFIDGFGNNYICNLGDIIVYSLHFSDVNFSLLTTRDLFESIVF
GKVMDNQFVEVNYVPSQNENVGELSINYWMKVDLVDELPCIKTEIKSIDKE

Sequences:

>Translated_1091_residues
MFVSIEKLLNSLQHHVNKNIDETLYQNKAFLSSKWNLLEHNILRWSQRHSYYTFLTFVLASLLVANLLLWKEELTPFAIE
YFPNWRRLIDWQGGFLAGQLTIVGVVYPLVIGLIGVLFQNKSAKKTLFPIYQLYSGFMFAGLSGLFLSIFIIVGYFLSAS
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GVLKVSTYKFSDDKYNEIMVPSPDPIRVTNVYFSIINAIIHYQVKKLKVLRWLNRQSLVKRLVSKKGFSWLHLDLNAEPE
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KREGFLLIQGSYFTWSLLMEWRSYSSSSSDMRVANKYEDVLFDFVGSWESWLDYIEPRRKRLDSLTESLPLFLAHLEFTA
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GKVMDNQFVEVNYVPSQNENVGELSINYWMKVDLVDELPCIKTEIKSIDKE
>Mature_1091_residues
MFVSIEKLLNSLQHHVNKNIDETLYQNKAFLSSKWNLLEHNILRWSQRHSYYTFLTFVLASLLVANLLLWKEELTPFAIE
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SVGFNGNPVEETLYKLNIQGYHKENIAKNIEANRAVNEESWLKESTRNNVEVNILRKLLQYKTSNSKVYTNAENNIFDIS
NLTKDITNPVLFSGSSELNQLLREARYKPEIANKFDISFIDGFGNNYICNLGDIIVYSLHFSDVNFSLLTTRDLFESIVF
GKVMDNQFVEVNYVPSQNENVGELSINYWMKVDLVDELPCIKTEIKSIDKE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 126783; Mature: 126783

Theoretical pI: Translated: 6.19; Mature: 6.19

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFVSIEKLLNSLQHHVNKNIDETLYQNKAFLSSKWNLLEHNILRWSQRHSYYTFLTFVLA
CEEEHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
SLLVANLLLWKEELTPFAIEYFPNWRRLIDWQGGFLAGQLTIVGVVYPLVIGLIGVLFQN
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VLLTSWFFTATFLMLDETKRDRIVVRFTIHELCETDIRHRIHELLLQNSVRNNVLANPDE
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GVLKVSTYKFSDDKYNEIMVPSPDPIRVTNVYFSIINAIIHYQVKKLKVLRWLNRQSLVK
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CCHHHHHHHCHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEEHH
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HHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEECCCEEEEEEE
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ECCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEHHCCCH
IKTEIKSIDKE
HHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MFVSIEKLLNSLQHHVNKNIDETLYQNKAFLSSKWNLLEHNILRWSQRHSYYTFLTFVLA
CEEEHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
SLLVANLLLWKEELTPFAIEYFPNWRRLIDWQGGFLAGQLTIVGVVYPLVIGLIGVLFQN
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CCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
DNWLLLPTTNFFSRSYLDEILTEYYQIAKSAVELIPENIEFFDEVIYLHKRLFSRREKLV
CCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHH
YRWHSELVTHDMLLKSLDDKNWIVILNGHQFNLKSAFNIAFENAAFDLRVITACYMLLKP
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCEECCCHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCC
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CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH
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HHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHH
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HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NQLVAEADIDEDLITKFGIACSKAFMGEDANFEFPINLFKSVGFNGNPVEETLYKLNIQG
HHEEHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHEECCCC
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CCHHHHHHHCHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEEHH
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HHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEECCCEEEEEEE
FSDVNFSLLTTRDLFESIVFGKVMDNQFVEVNYVPSQNENVGELSINYWMKVDLVDELPC
ECCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEHHCCCH
IKTEIKSIDKE
HHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA