Definition Shewanella pealeana ATCC 700345 chromosome, complete genome.
Accession NC_009901
Length 5,174,581

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The map label for this gene is lplT [H]

Identifier: 157959989

GI number: 157959989

Start: 173066

End: 174748

Strand: Direct

Name: lplT [H]

Synonym: Spea_0159

Alternate gene names: 157959989

Gene position: 173066-174748 (Clockwise)

Preceding gene: 157959988

Following gene: 157959993

Centisome position: 3.34

GC content: 44.21

Gene sequence:

>1683_bases
ATGTTATTTAGCCGGCGTTTCTTACCCTATTTTGTGACTCTATGCCTTGGTGCACTGAACGACAATGTATTTAAAAATGT
ACTGCTGCTGTTAGTGACCTATTCACAGGTTGAGCTGCTACCGATCGATATTAACCTCTTTGTTAATCTGGCCGCAGGCC
TATTTATTCTGCCTTTTTTGCTGTTTTCAGCTCACGCGGGGCAGGTGGCGGACAGTGTTGATAAAGCGCTGCTAATTCGA
ATACTTAAGCTACTCGAACTCATCATCATGTCGGTGGCCATTTTCGCAATTATGAGTAATAGCTATCTGGTTATGCTGCT
ATTACTGTTTCTTACTGGGGTGCAGTCCGCGTATTTTGGTCCGGTAAAATACTCACTATTACCAAGAGTGCTACACGAAA
GCGAACTCGTCTCGGGTAATGCCTGGGTTGAGATGGGCACCTTCTTAGCCATTCTGATTGGAACAATTTCGGCAGGAATG
ATTGTTGCCAGTGACATGGCGACATACTGGGCTGCAGCCACGGTATTTATCCTAGCTTTAATTGGTATGGCTGCGAGTTG
GTTTATCCCGAGTATTCCAGCCCACTCCGATGTTAAACCTCGATTTTCTATTATCTCTGCCACCATGGATAACCTTAACA
AGGCGCGTAACAACAAGGCCATTTGGACTGCTATTTTAGCTATCAGTTGGTTTTGGTTTGTGGGGGCGACTTATCTTACT
CAGTTCCCTAATTTTGCTCGAATAACCTTAAATGCCGACCCGACGGTGGTATCACTACTCCTATTGCTGTTTTCGGTGGG
CATTGGTGCTGGTTCATTTTTTTGTGAGCGGCTTTCTTGTCGGCGGGTTGAGCTTGGGATTATGCCTTTAGGCTTGCTGT
TACTCGCTTGCTTCGGAATCGATCTCTATTTTGCTATACCCAATAAAACGACATTAGTTGGGCTTTATCAATTAGATAGC
TTTATTGCAGAGTCTGGGCATTATCGTCTGATGTTTGATCTGTTTATGATTGGCGTCGGAGGTGGCTTATTTATCGTGCC
GCTTTATACCTTTATTCAGGTGCGAGCCAAAGAGGGCGAGTGCGCACAGGCGATTGCGAGTAACAATATCCTCAATGCAT
TATTTATGGTGAGTTCGGCTATATTTGCCATGCTGGCCTTGAATGTATTGCAGTGGCCGATAGAGTTGCTCTTTTTGGTC
TTAGCTGTGGTAAATATCTTGGTGCTACTGTATTTATTTTGGCGCTGGCCAGAACTCTTACTCAGCTGCGAGAGTTACTT
TTATCGCAGGGTTTTACATAAAACCCAAGTGCTAGATCTAGAGTCTTTGCATAAATCGTCTAAATTATTGCTGGTTACCG
AGCAAGCATCTTGGCGAGAGTTAATGGTGATATTTGGCAGCTTTAACCATCCGATTTTGTTTGCAAACTTAAATCAGCAG
ACTTGGCCTAATCGCTTTATTGGGTACGCATTATCTCGATTGAGTTGGTATCCGCATCAACAAATGGAAGTCGATAGCGT
TGTTTGCGTGAATAAGGCCTCACTTGGTGAGTTTAAAGCCCGCGCCGAATTTGCAGACTTCACTGTTGTGTCAGTTAAAT
TTACTGCTATTGAGGGAAGAGTACTGAAGTTAGAAATAACCCCATTAGCTGCCGGTAACAGCGAGCTAATGGGATGGGCT
TAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GACACGGGTTTACAGAATACGGCTTTGAGTCCGACTATTTTGGTGAGAGTGAACCAAGAGTTGTAATGCGTTATGTGAAA
TCGGCTCCTTCGTAATACAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGCAAAGTCGGTGCTTAATGGTCATCTAGCCACTGATGCATAGCTTGATGGTCGCCTTTAAATAAAATACGTTCGGCTTT
CTTATCGATTTGATATTGAT

Product: major facilitator transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 560; Mature: 560

Protein sequence:

>560_residues
MLFSRRFLPYFVTLCLGALNDNVFKNVLLLLVTYSQVELLPIDINLFVNLAAGLFILPFLLFSAHAGQVADSVDKALLIR
ILKLLELIIMSVAIFAIMSNSYLVMLLLLFLTGVQSAYFGPVKYSLLPRVLHESELVSGNAWVEMGTFLAILIGTISAGM
IVASDMATYWAAATVFILALIGMAASWFIPSIPAHSDVKPRFSIISATMDNLNKARNNKAIWTAILAISWFWFVGATYLT
QFPNFARITLNADPTVVSLLLLLFSVGIGAGSFFCERLSCRRVELGIMPLGLLLLACFGIDLYFAIPNKTTLVGLYQLDS
FIAESGHYRLMFDLFMIGVGGGLFIVPLYTFIQVRAKEGECAQAIASNNILNALFMVSSAIFAMLALNVLQWPIELLFLV
LAVVNILVLLYLFWRWPELLLSCESYFYRRVLHKTQVLDLESLHKSSKLLLVTEQASWRELMVIFGSFNHPILFANLNQQ
TWPNRFIGYALSRLSWYPHQQMEVDSVVCVNKASLGEFKARAEFADFTVVSVKFTAIEGRVLKLEITPLAAGNSELMGWA

Sequences:

>Translated_560_residues
MLFSRRFLPYFVTLCLGALNDNVFKNVLLLLVTYSQVELLPIDINLFVNLAAGLFILPFLLFSAHAGQVADSVDKALLIR
ILKLLELIIMSVAIFAIMSNSYLVMLLLLFLTGVQSAYFGPVKYSLLPRVLHESELVSGNAWVEMGTFLAILIGTISAGM
IVASDMATYWAAATVFILALIGMAASWFIPSIPAHSDVKPRFSIISATMDNLNKARNNKAIWTAILAISWFWFVGATYLT
QFPNFARITLNADPTVVSLLLLLFSVGIGAGSFFCERLSCRRVELGIMPLGLLLLACFGIDLYFAIPNKTTLVGLYQLDS
FIAESGHYRLMFDLFMIGVGGGLFIVPLYTFIQVRAKEGECAQAIASNNILNALFMVSSAIFAMLALNVLQWPIELLFLV
LAVVNILVLLYLFWRWPELLLSCESYFYRRVLHKTQVLDLESLHKSSKLLLVTEQASWRELMVIFGSFNHPILFANLNQQ
TWPNRFIGYALSRLSWYPHQQMEVDSVVCVNKASLGEFKARAEFADFTVVSVKFTAIEGRVLKLEITPLAAGNSELMGWA
>Mature_560_residues
MLFSRRFLPYFVTLCLGALNDNVFKNVLLLLVTYSQVELLPIDINLFVNLAAGLFILPFLLFSAHAGQVADSVDKALLIR
ILKLLELIIMSVAIFAIMSNSYLVMLLLLFLTGVQSAYFGPVKYSLLPRVLHESELVSGNAWVEMGTFLAILIGTISAGM
IVASDMATYWAAATVFILALIGMAASWFIPSIPAHSDVKPRFSIISATMDNLNKARNNKAIWTAILAISWFWFVGATYLT
QFPNFARITLNADPTVVSLLLLLFSVGIGAGSFFCERLSCRRVELGIMPLGLLLLACFGIDLYFAIPNKTTLVGLYQLDS
FIAESGHYRLMFDLFMIGVGGGLFIVPLYTFIQVRAKEGECAQAIASNNILNALFMVSSAIFAMLALNVLQWPIELLFLV
LAVVNILVLLYLFWRWPELLLSCESYFYRRVLHKTQVLDLESLHKSSKLLLVTEQASWRELMVIFGSFNHPILFANLNQQ
TWPNRFIGYALSRLSWYPHQQMEVDSVVCVNKASLGEFKARAEFADFTVVSVKFTAIEGRVLKLEITPLAAGNSELMGWA

Specific function: Catalyzes the facilitated diffusion of 2-acyl-glycero-3- phosphoethanolamine (2-acyl-GPE) into the cell [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. LplT (TC 2.A.1.42) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1789200, Length=326, Percent_Identity=27.9141104294479, Blast_Score=74, Evalue=4e-14,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 62481; Mature: 62481

Theoretical pI: Translated: 7.49; Mature: 7.49

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLFSRRFLPYFVTLCLGALNDNVFKNVLLLLVTYSQVELLPIDINLFVNLAAGLFILPFL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFSAHAGQVADSVDKALLIRILKLLELIIMSVAIFAIMSNSYLVMLLLLFLTGVQSAYFG
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PVKYSLLPRVLHESELVSGNAWVEMGTFLAILIGTISAGMIVASDMATYWAAATVFILAL
CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGMAASWFIPSIPAHSDVKPRFSIISATMDNLNKARNNKAIWTAILAISWFWFVGATYLT
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QFPNFARITLNADPTVVSLLLLLFSVGIGAGSFFCERLSCRRVELGIMPLGLLLLACFGI
HCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHCC
DLYFAIPNKTTLVGLYQLDSFIAESGHYRLMFDLFMIGVGGGLFIVPLYTFIQVRAKEGE
EEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCH
CAQAIASNNILNALFMVSSAIFAMLALNVLQWPIELLFLVLAVVNILVLLYLFWRWPELL
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSCESYFYRRVLHKTQVLDLESLHKSSKLLLVTEQASWRELMVIFGSFNHPILFANLNQQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHEECCCCCEEEEECCCC
TWPNRFIGYALSRLSWYPHQQMEVDSVVCVNKASLGEFKARAEFADFTVVSVKFTAIEGR
CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEEECCE
VLKLEITPLAAGNSELMGWA
EEEEEEEEECCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLFSRRFLPYFVTLCLGALNDNVFKNVLLLLVTYSQVELLPIDINLFVNLAAGLFILPFL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFSAHAGQVADSVDKALLIRILKLLELIIMSVAIFAIMSNSYLVMLLLLFLTGVQSAYFG
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PVKYSLLPRVLHESELVSGNAWVEMGTFLAILIGTISAGMIVASDMATYWAAATVFILAL
CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGMAASWFIPSIPAHSDVKPRFSIISATMDNLNKARNNKAIWTAILAISWFWFVGATYLT
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QFPNFARITLNADPTVVSLLLLLFSVGIGAGSFFCERLSCRRVELGIMPLGLLLLACFGI
HCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHCC
DLYFAIPNKTTLVGLYQLDSFIAESGHYRLMFDLFMIGVGGGLFIVPLYTFIQVRAKEGE
EEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCH
CAQAIASNNILNALFMVSSAIFAMLALNVLQWPIELLFLVLAVVNILVLLYLFWRWPELL
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSCESYFYRRVLHKTQVLDLESLHKSSKLLLVTEQASWRELMVIFGSFNHPILFANLNQQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHEECCCCCEEEEECCCC
TWPNRFIGYALSRLSWYPHQQMEVDSVVCVNKASLGEFKARAEFADFTVVSVKFTAIEGR
CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEEEECCE
VLKLEITPLAAGNSELMGWA
EEEEEEEEECCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA