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The map label for this gene is ycgO [H]

Identifier: 157825943

GI number: 157825943

Start: 796216

End: 797625

Strand: Direct

Name: ycgO [H]

Synonym: A1C_04415

Alternate gene names: 157825943

Gene position: 796216-797625 (Clockwise)

Preceding gene: 157825933

Following gene: 157825944

Centisome position: 64.68

GC content: 31.7

Gene sequence:

>1410_bases
ATGTTTAATTTACCTATTGATAATATTACCGTATTCATATACCTAATATCTATTCTACTTATTGGTATATATTACCGAGC
TAAACATAGTAGTTTTAAGAACTATGCAAATGTTGACAGTAAAGCGCAAAATAGTAAGCTGTTACTAATAGCTACAATAT
TTGCAAGCTCTGTCGGAGGTGCTACCACTTTCGGCATTATGGAAAAGGTTTTTTTAGGACAAGAATATTATGCTTATGTT
TTGATGCTTACAATACCTATGGATATATTAATTGCAATCTATATAGTGCCTTTAATTGCCAAACATTACGGAGCTGAAAG
TATCGGCGATATCCTAAGTACATATTACGGTAATATCGGTCGTTTTATCGGAGGTGTTAGTTCGGTTATCGTTTCAGTAG
GGTTTTTGGCTGCTCAAATAAGCGTCAGCGGCTATATTTTTCAATATATCTTAGAAATAAATTATGTAAATGGAGTAATT
TTAAGTTATAGTATGGTACTTATATATACTACAATTGGCGGCTTACAGTCTATTGTTTTTACTAATTTATTACAATTTTT
GGCGATGATAATCGCTATACCGACTATAACTTTTATAAGTTTAAATAAAATCGGTTTTGTAGCTTTGATTAATAACCTAC
CTACGGAAAATGCAAATTTTAATCAGAGCAACCTACTTTCTTATACGATTGCAGCAGCTTTAAGCTTTAGCGTTATGAAT
CTATATCCTACATTTATCCAAAGAGCTTTAATTAATAAAAATCCTACACAAACAACTAAAGCAATATATGCAAAATCTGC
TATATATTTTTTCTTCTTGATTTGCATTACTTTAAACGGTTTAATTGCTTATAAGCTTTATCCAAACCAACCGTCAAATT
TAGTATTACCTTATTTAATCAACCAAATTATTCCGCCTTTAATTCAAGGGGTAGTAATGAGCGGACTCTTAGCTTCCGTT
ATGTCTACTGCCGATTCTGATTTAAACGTTACTTCTATAGCTCTCGTTAAGGACATAATTAACCCTATACTTAAAGTAAA
AAATCAGCAAAAATTATTATTAATTGCCCGAATTATTAATGTTATAATAGGAAGTTTTGCGATCATTGTAGCTTTAAAAT
TTAGTAATGTAATTGATTTAGTAGTGTTCTTTACCGGTTTCTGGGGACCAGTAATATTAGTACCGTTAATAACAACGCTT
TTCGGTATCAGAACATCTAAAACTATAATAGTCTTATCATCACTTGGCGGAGCAGCTACTTTCTTAATATGGGAATATTA
TGCTTTATCGTTACAGTATTTTAACCTTAGAGGGGTGTTTATAGGAACGATGGTGAGTCTGATAATATTTATTTTAGGAC
GTGGCATTATGGCTCTATGTCATGGACGCAAAAGCGAGAATCCAATTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTCTTGGAACAGATTATGACACATAATTATAAATCTAGCATTCTTAACTAAATATATATATTGTGAACAAATGCTAAGTT
TGAGCTTTGAAATCTAATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATGTCTAGACTTTTCAGTGCATGGATTCCCACTTTTGCGTGCATGACATCAAGTATACTTCTGATCATATTCAAAGTTA
GGTAAATCCTTATGCTGCCA

Product: Sodium/pantothenate symporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 469; Mature: 469

Protein sequence:

>469_residues
MFNLPIDNITVFIYLISILLIGIYYRAKHSSFKNYANVDSKAQNSKLLLIATIFASSVGGATTFGIMEKVFLGQEYYAYV
LMLTIPMDILIAIYIVPLIAKHYGAESIGDILSTYYGNIGRFIGGVSSVIVSVGFLAAQISVSGYIFQYILEINYVNGVI
LSYSMVLIYTTIGGLQSIVFTNLLQFLAMIIAIPTITFISLNKIGFVALINNLPTENANFNQSNLLSYTIAAALSFSVMN
LYPTFIQRALINKNPTQTTKAIYAKSAIYFFFLICITLNGLIAYKLYPNQPSNLVLPYLINQIIPPLIQGVVMSGLLASV
MSTADSDLNVTSIALVKDIINPILKVKNQQKLLLIARIINVIIGSFAIIVALKFSNVIDLVVFFTGFWGPVILVPLITTL
FGIRTSKTIIVLSSLGGAATFLIWEYYALSLQYFNLRGVFIGTMVSLIIFILGRGIMALCHGRKSENPI

Sequences:

>Translated_469_residues
MFNLPIDNITVFIYLISILLIGIYYRAKHSSFKNYANVDSKAQNSKLLLIATIFASSVGGATTFGIMEKVFLGQEYYAYV
LMLTIPMDILIAIYIVPLIAKHYGAESIGDILSTYYGNIGRFIGGVSSVIVSVGFLAAQISVSGYIFQYILEINYVNGVI
LSYSMVLIYTTIGGLQSIVFTNLLQFLAMIIAIPTITFISLNKIGFVALINNLPTENANFNQSNLLSYTIAAALSFSVMN
LYPTFIQRALINKNPTQTTKAIYAKSAIYFFFLICITLNGLIAYKLYPNQPSNLVLPYLINQIIPPLIQGVVMSGLLASV
MSTADSDLNVTSIALVKDIINPILKVKNQQKLLLIARIINVIIGSFAIIVALKFSNVIDLVVFFTGFWGPVILVPLITTL
FGIRTSKTIIVLSSLGGAATFLIWEYYALSLQYFNLRGVFIGTMVSLIIFILGRGIMALCHGRKSENPI
>Mature_469_residues
MFNLPIDNITVFIYLISILLIGIYYRAKHSSFKNYANVDSKAQNSKLLLIATIFASSVGGATTFGIMEKVFLGQEYYAYV
LMLTIPMDILIAIYIVPLIAKHYGAESIGDILSTYYGNIGRFIGGVSSVIVSVGFLAAQISVSGYIFQYILEINYVNGVI
LSYSMVLIYTTIGGLQSIVFTNLLQFLAMIIAIPTITFISLNKIGFVALINNLPTENANFNQSNLLSYTIAAALSFSVMN
LYPTFIQRALINKNPTQTTKAIYAKSAIYFFFLICITLNGLIAYKLYPNQPSNLVLPYLINQIIPPLIQGVVMSGLLASV
MSTADSDLNVTSIALVKDIINPILKVKNQQKLLLIARIINVIIGSFAIIVALKFSNVIDLVVFFTGFWGPVILVPLITTL
FGIRTSKTIIVLSSLGGAATFLIWEYYALSLQYFNLRGVFIGTMVSLIIFILGRGIMALCHGRKSENPI

Specific function: Catalyzes the sodium-dependent uptake of extracellular amino acids [H]

COG id: COG0591

COG function: function code ER; Na+/proline symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the sodium:solute symporter (SSF) (TC 2.A.21) family [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI310128183, Length=335, Percent_Identity=25.9701492537313, Blast_Score=66, Evalue=7e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011851
- InterPro:   IPR001734
- InterPro:   IPR018212
- InterPro:   IPR019900 [H]

Pfam domain/function: PF00474 SSF [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 51574; Mature: 51574

Theoretical pI: Translated: 9.66; Mature: 9.66

Prosite motif: PS50283 NA_SOLUT_SYMP_3

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFNLPIDNITVFIYLISILLIGIYYRAKHSSFKNYANVDSKAQNSKLLLIATIFASSVGG
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHCCCC
ATTFGIMEKVFLGQEYYAYVLMLTIPMDILIAIYIVPLIAKHYGAESIGDILSTYYGNIG
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
RFIGGVSSVIVSVGFLAAQISVSGYIFQYILEINYVNGVILSYSMVLIYTTIGGLQSIVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TNLLQFLAMIIAIPTITFISLNKIGFVALINNLPTENANFNQSNLLSYTIAAALSFSVMN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYPTFIQRALINKNPTQTTKAIYAKSAIYFFFLICITLNGLIAYKLYPNQPSNLVLPYLI
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCEEHHHHH
NQIIPPLIQGVVMSGLLASVMSTADSDLNVTSIALVKDIINPILKVKNQQKLLLIARIIN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
VIIGSFAIIVALKFSNVIDLVVFFTGFWGPVILVPLITTLFGIRTSKTIIVLSSLGGAAT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHH
FLIWEYYALSLQYFNLRGVFIGTMVSLIIFILGRGIMALCHGRKSENPI
HHHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFNLPIDNITVFIYLISILLIGIYYRAKHSSFKNYANVDSKAQNSKLLLIATIFASSVGG
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHCCCC
ATTFGIMEKVFLGQEYYAYVLMLTIPMDILIAIYIVPLIAKHYGAESIGDILSTYYGNIG
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
RFIGGVSSVIVSVGFLAAQISVSGYIFQYILEINYVNGVILSYSMVLIYTTIGGLQSIVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TNLLQFLAMIIAIPTITFISLNKIGFVALINNLPTENANFNQSNLLSYTIAAALSFSVMN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYPTFIQRALINKNPTQTTKAIYAKSAIYFFFLICITLNGLIAYKLYPNQPSNLVLPYLI
HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCEEHHHHH
NQIIPPLIQGVVMSGLLASVMSTADSDLNVTSIALVKDIINPILKVKNQQKLLLIARIIN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
VIIGSFAIIVALKFSNVIDLVVFFTGFWGPVILVPLITTLFGIRTSKTIIVLSSLGGAAT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHH
FLIWEYYALSLQYFNLRGVFIGTMVSLIIFILGRGIMALCHGRKSENPI
HHHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969502; 9384377 [H]