Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is ypgH

Identifier: 15673508

GI number: 15673508

Start: 1569495

End: 1570835

Strand: Direct

Name: ypgH

Synonym: L169187

Alternate gene names: NA

Gene position: 1569495-1570835 (Clockwise)

Preceding gene: 15673503

Following gene: 15673535

Centisome position: 66.35

GC content: 30.95

Gene sequence:

>1341_bases
ATGACTCAACAACTAAATTCTTTGGGAAAGTCTGCCCTCTTAATATTAAGTAATACAATTATTGTCCTTCCATTCATGAT
TTTTATTCAAATTGCAAAAGGAACCTCGCTTCTTGCCCTCCTTCCTTTTTTGCTCTTTTATACTTTCAGAATGACTGGCG
TATTCTTTATAAGGGGAATAAAAACAAGAATTAACAGCTATAGTCTTTTAAAAATTTCATTGTATGCCGGTTTACTTGGT
TGCTTGTTAGGATTTATGGGTTCTTTCTACTTTCCTTTCTATACTTTATCCGGTATCCTTTTAGGAGTCAGTGCAGCTTG
GTTGCCGATGTCAAACACTTCGGTAAATTATTATCTAAAAAATACTAACCAGCTTATCAAAGGAAAAACCTTAGTTAGCT
TACTTTTGTTTTTAGCCCTTGGCTTTTCTTTTGTCTTGTCCCCTTCTCTAAAATATCCCTTGTTCTTTGTATTCTATGGA
ATAGTTTATCTTCTCTCCTTCCAATTAGTTGGAAATTTGGATAATTACAAAGTTGATCCAAATGATTTAGAAAAAGCTTC
ATATAAATATCTTATTTTATTTGCTTTATTTTTTGTTTGCCTCTTTCTATTACGTTCAAGTCGATTACTTGCCAATAGTT
TAGAATTTGATTATTTCATTTTCGGATTTTTCTTTTTGGTCACTCTCTATATTGTCGCTACGAATTTTTTCAAAAATAAA
ATTCAAAGAAATATCCCTCGTAAATTATCATATTTGACAGCTATTAATGGGGCAGTGGGAAATTATTTATTTCTTTTTTG
TTCTTTATATGTCGCTGGTTTTTATGGTCATCAGCATTTATTTTTACAGTTTTATCTTCCTTATGTTTTAGGAATTGTCT
TTGCCTCTAAGATCAAAAATTTACTTGGAAATAATGTCAAAACCTACTCTTTAATCGGCATTTTTCTAGGTTTACTTTTG
ATTGTTTTTAGTCCTCTATTTGCTCTAGGTTTATTCCTTACTAGCTTATTCAAAGGAAGTTTAAATTCAAGCTTAACTCA
AGACTATGAAAGTACTATTAATATCGTTGAAGATAAACGGATCTGGGTAAAATATACCATTCAAAATATCGGAAGTATTC
TTCACCAATTTTTGTTGATGCTTTTAGGTTCACTCATCATCATGAAAAACGGCTTATCTATCAAGACCCTGTTCGTTATT
ACTTCAACCCCTATTCCTACAGCTCGAAGTATTGAACTAATGAAATCATGGAATCTTATTGCTACGTCATTGATTATCTT
AATTATCATCGCCTATCTTATTTATCCAAAAATAGTTCCACTTCTTAAAAAATCAAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAATGAATTATTTATGTACTAATCATAGTGAAGCTGTCTTTTTAATACACTTTGCCTTATAATGGATTTAGATGTCAAA
ATAGAAAAGATAGGAGAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTAGAAAAACTCATGTCTAAACATGAGTTTTTTATTTAATACGAGAGGTCAGTGAACTTTCTTTTCCTTCGATAATTTT
ATGAATCTCTTTAGCAAATT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 446; Mature: 445

Protein sequence:

>446_residues
MTQQLNSLGKSALLILSNTIIVLPFMIFIQIAKGTSLLALLPFLLFYTFRMTGVFFIRGIKTRINSYSLLKISLYAGLLG
CLLGFMGSFYFPFYTLSGILLGVSAAWLPMSNTSVNYYLKNTNQLIKGKTLVSLLLFLALGFSFVLSPSLKYPLFFVFYG
IVYLLSFQLVGNLDNYKVDPNDLEKASYKYLILFALFFVCLFLLRSSRLLANSLEFDYFIFGFFFLVTLYIVATNFFKNK
IQRNIPRKLSYLTAINGAVGNYLFLFCSLYVAGFYGHQHLFLQFYLPYVLGIVFASKIKNLLGNNVKTYSLIGIFLGLLL
IVFSPLFALGLFLTSLFKGSLNSSLTQDYESTINIVEDKRIWVKYTIQNIGSILHQFLLMLLGSLIIMKNGLSIKTLFVI
TSTPIPTARSIELMKSWNLIATSLIILIIIAYLIYPKIVPLLKKSK

Sequences:

>Translated_446_residues
MTQQLNSLGKSALLILSNTIIVLPFMIFIQIAKGTSLLALLPFLLFYTFRMTGVFFIRGIKTRINSYSLLKISLYAGLLG
CLLGFMGSFYFPFYTLSGILLGVSAAWLPMSNTSVNYYLKNTNQLIKGKTLVSLLLFLALGFSFVLSPSLKYPLFFVFYG
IVYLLSFQLVGNLDNYKVDPNDLEKASYKYLILFALFFVCLFLLRSSRLLANSLEFDYFIFGFFFLVTLYIVATNFFKNK
IQRNIPRKLSYLTAINGAVGNYLFLFCSLYVAGFYGHQHLFLQFYLPYVLGIVFASKIKNLLGNNVKTYSLIGIFLGLLL
IVFSPLFALGLFLTSLFKGSLNSSLTQDYESTINIVEDKRIWVKYTIQNIGSILHQFLLMLLGSLIIMKNGLSIKTLFVI
TSTPIPTARSIELMKSWNLIATSLIILIIIAYLIYPKIVPLLKKSK
>Mature_445_residues
TQQLNSLGKSALLILSNTIIVLPFMIFIQIAKGTSLLALLPFLLFYTFRMTGVFFIRGIKTRINSYSLLKISLYAGLLGC
LLGFMGSFYFPFYTLSGILLGVSAAWLPMSNTSVNYYLKNTNQLIKGKTLVSLLLFLALGFSFVLSPSLKYPLFFVFYGI
VYLLSFQLVGNLDNYKVDPNDLEKASYKYLILFALFFVCLFLLRSSRLLANSLEFDYFIFGFFFLVTLYIVATNFFKNKI
QRNIPRKLSYLTAINGAVGNYLFLFCSLYVAGFYGHQHLFLQFYLPYVLGIVFASKIKNLLGNNVKTYSLIGIFLGLLLI
VFSPLFALGLFLTSLFKGSLNSSLTQDYESTINIVEDKRIWVKYTIQNIGSILHQFLLMLLGSLIIMKNGLSIKTLFVIT
STPIPTARSIELMKSWNLIATSLIILIIIAYLIYPKIVPLLKKSK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50516; Mature: 50384

Theoretical pI: Translated: 10.24; Mature: 10.24

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTQQLNSLGKSALLILSNTIIVLPFMIFIQIAKGTSLLALLPFLLFYTFRMTGVFFIRGI
CCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTRINSYSLLKISLYAGLLGCLLGFMGSFYFPFYTLSGILLGVSAAWLPMSNTSVNYYLK
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEC
NTNQLIKGKTLVSLLLFLALGFSFVLSPSLKYPLFFVFYGIVYLLSFQLVGNLDNYKVDP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCH
NDLEKASYKYLILFALFFVCLFLLRSSRLLANSLEFDYFIFGFFFLVTLYIVATNFFKNK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IQRNIPRKLSYLTAINGAVGNYLFLFCSLYVAGFYGHQHLFLQFYLPYVLGIVFASKIKN
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLGNNVKTYSLIGIFLGLLLIVFSPLFALGLFLTSLFKGSLNSSLTQDYESTINIVEDKR
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCE
IWVKYTIQNIGSILHQFLLMLLGSLIIMKNGLSIKTLFVITSTPIPTARSIELMKSWNLI
EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHH
ATSLIILIIIAYLIYPKIVPLLKKSK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TQQLNSLGKSALLILSNTIIVLPFMIFIQIAKGTSLLALLPFLLFYTFRMTGVFFIRGI
CCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTRINSYSLLKISLYAGLLGCLLGFMGSFYFPFYTLSGILLGVSAAWLPMSNTSVNYYLK
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEC
NTNQLIKGKTLVSLLLFLALGFSFVLSPSLKYPLFFVFYGIVYLLSFQLVGNLDNYKVDP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCH
NDLEKASYKYLILFALFFVCLFLLRSSRLLANSLEFDYFIFGFFFLVTLYIVATNFFKNK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IQRNIPRKLSYLTAINGAVGNYLFLFCSLYVAGFYGHQHLFLQFYLPYVLGIVFASKIKN
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLGNNVKTYSLIGIFLGLLLIVFSPLFALGLFLTSLFKGSLNSSLTQDYESTINIVEDKR
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCE
IWVKYTIQNIGSILHQFLLMLLGSLIIMKNGLSIKTLFVITSTPIPTARSIELMKSWNLI
EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHH
ATSLIILIIIAYLIYPKIVPLLKKSK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA