Definition Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403, complete genome.
Accession NC_002662
Length 2,365,589

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The map label for this gene is yicA

Identifier: 15672792

GI number: 15672792

Start: 820452

End: 822542

Strand: Direct

Name: yicA

Synonym: L20470

Alternate gene names: NA

Gene position: 820452-822542 (Clockwise)

Preceding gene: 15672790

Following gene: 15672793

Centisome position: 34.68

GC content: 33.09

Gene sequence:

>2091_bases
ATGATTAATTCCATGATTAAGAAAAAATATAAGATATTACTTCTTGTCCTTAGTGCCGCTATTCTTTGTATTAATTTTAT
TTTTATTTTGAATTTGAATCGATTCTCAGGTTATACCGGCGATGATTTTTTATACCATTTTGTTTATACTGGGGCATGGC
CGAGTGAACATTTAAGGGAATATCATAACTTGTGGGACTGGATTTTAGCAGTACATACGCATATGTTGATTTGGAACGCT
CGAATGACTTCAATAATCTTTGAAATTTTTGCGATGCAAATTCCTAAAGGATTATTCAATATCATTAATTCTCTTATCTA
TGTATTAATAGGTCTTTTAATCAATGTTCTTGTTAGTGGAAAAAAAGCATTTTTGAAACCGAGTCACTTATCATTAACCT
TTCTTTTAATGTGGTTTTTTCTTCCGGGGATGGGCTCAACAGTGCTTTGGGTAAGTGGTGCGACAAATTATCTTTGGCCA
AGTCTTGTGATTATTCTTTTCTTATTAGCTTTTCGATTTGATATAGCTGCTAGAAGTAATTGGATAAGTTTAGGACTATT
TATTTTAGGACTTTTGACAGGCTTAACAAATGAAGTGGGTGGTGCAACAGCATTTTTACTTGCCTTGCTTTTTACAATAT
TTAATTATAGAAGACAGCCGAGTGAACGGGTACTTACGCAGATTTTTGGAGTACTTGGTGCAGGAATTGGCTTTTTTATT
CAGTTATTACTTTCTTCAGGCTCTTCAGAAACCCAAAATTATGGAAAGTCAGCAGGTTTTTTACAGCATTTAAGTGATGT
GTTCACAGGTACCATGCAGTATTCAGGCTTTCTCTTATTGCCTATTATTTTGCTTGGTGGTCTTCTTTATCTGCGACGTA
TCCAATGGACTGAAAAAGTAAAAACATTAGTAATAACTAGTCTACTTTTCTTAGGGTCGGCTTTGGCAGGTTCTATTGCA
ATCTTAGCTTCACCAATTAGTCCTGCAAGGCTTTGGTTTGCTCCCAATATATTGCTGATTATAACTTTGTTATTGTTAAT
TGAAGCTTGGCAAGAACTCCGATTACAAGAAATTAAAACTAGTCTACCTGTAATTATTAGCATAATTATCCTCGCTTTTG
TGGCGATTCCGAGTTACGCTTATAATTTAAAAGAGATACAAGCGTCTTATCAATATTTTTATACTGGTCAATCGATGGCT
CAAAAAGCTAAAAAGGGAAAAGAAACCACTGCGCGTGTTCCAGGAATGCCTATCACAACCAATCCCTATAATCCTTATGC
TGGGACACCTTATATAGCTGCAAGTGAGCATCCAGAAAAAGAATGGGTGAATACCTGGTTTGCAAAATACTATGGCTTAA
ATAAAGTTTATTTGGATAATACAGTCCCCTTACAAAAAGTTGCTGATAAAAACTTTAGATTAGTAACATGGACGATTAAT
AACTATGATAAGTATTTAGGAGATTTTCAAAAAGCAACTCTACCAATTGCTCCTAAAATAATTTTGAAAAGAGAAAGCTC
ATCTAATTTAATTACTTCTCCATCAAATTTAAAACCAAACAACAGCAATTTACCGGCTGATAAACCTTGGCTGCGCAATG
CTTTGATTCGTTATGTAAATGTGAAAAATAATCAGGTTGTAGCAACTGAACAAATTACATCGCCATATAATGATGCTTAT
GATATTTCACATGCTTCTACCAAAGGCTACCAAACACTAAAAAATAATCCTAAATCTTATATTTTTAATCAATCATTTGA
ACAAACGATAGATATTAAAGTAAGTCCTGAGGTCCATCTAATCACATTATTCTTTAATGCTAAAGATGGGAAAAATGTAA
GTACTACAAATACTAAAGGAGTAACAGGAGAGGTTCTTACAATCAAATTACCGGCTGGCTATCAGATTAATGGTTCAAAA
ACAATGACCTTATCTATTGATTCAGAGATTTCATGGAACAAAGAAATAAAGATGACTAAAATACCATTTTGGAAAGATTG
GGGTAGATTTTCAAATTTTTATATTTTAATGATAGGATTTTTAATCTTTGGACTTTATGATTACTGGCTGAATCAAAAGA
TGAAAAAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATCTATTAGCTGGTAGTTGCTAAAATGATTGATGAGACTGTTCAAATATTTGAAACAAAAACCAACATAGATTTAGAT
ACAATTAAAGATTTTGAAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
CATATTCTAAAGTTCTAGGTGATTAAACTTCATTGTTTTTATTGCCCTAGATTTAGTTCCAAACAAAATGTCTGACTTTA
GTGAGCATTATTGAACCTGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 696; Mature: 696

Protein sequence:

>696_residues
MINSMIKKKYKILLLVLSAAILCINFIFILNLNRFSGYTGDDFLYHFVYTGAWPSEHLREYHNLWDWILAVHTHMLIWNA
RMTSIIFEIFAMQIPKGLFNIINSLIYVLIGLLINVLVSGKKAFLKPSHLSLTFLLMWFFLPGMGSTVLWVSGATNYLWP
SLVIILFLLAFRFDIAARSNWISLGLFILGLLTGLTNEVGGATAFLLALLFTIFNYRRQPSERVLTQIFGVLGAGIGFFI
QLLLSSGSSETQNYGKSAGFLQHLSDVFTGTMQYSGFLLLPIILLGGLLYLRRIQWTEKVKTLVITSLLFLGSALAGSIA
ILASPISPARLWFAPNILLIITLLLLIEAWQELRLQEIKTSLPVIISIIILAFVAIPSYAYNLKEIQASYQYFYTGQSMA
QKAKKGKETTARVPGMPITTNPYNPYAGTPYIAASEHPEKEWVNTWFAKYYGLNKVYLDNTVPLQKVADKNFRLVTWTIN
NYDKYLGDFQKATLPIAPKIILKRESSSNLITSPSNLKPNNSNLPADKPWLRNALIRYVNVKNNQVVATEQITSPYNDAY
DISHASTKGYQTLKNNPKSYIFNQSFEQTIDIKVSPEVHLITLFFNAKDGKNVSTTNTKGVTGEVLTIKLPAGYQINGSK
TMTLSIDSEISWNKEIKMTKIPFWKDWGRFSNFYILMIGFLIFGLYDYWLNQKMKK

Sequences:

>Translated_696_residues
MINSMIKKKYKILLLVLSAAILCINFIFILNLNRFSGYTGDDFLYHFVYTGAWPSEHLREYHNLWDWILAVHTHMLIWNA
RMTSIIFEIFAMQIPKGLFNIINSLIYVLIGLLINVLVSGKKAFLKPSHLSLTFLLMWFFLPGMGSTVLWVSGATNYLWP
SLVIILFLLAFRFDIAARSNWISLGLFILGLLTGLTNEVGGATAFLLALLFTIFNYRRQPSERVLTQIFGVLGAGIGFFI
QLLLSSGSSETQNYGKSAGFLQHLSDVFTGTMQYSGFLLLPIILLGGLLYLRRIQWTEKVKTLVITSLLFLGSALAGSIA
ILASPISPARLWFAPNILLIITLLLLIEAWQELRLQEIKTSLPVIISIIILAFVAIPSYAYNLKEIQASYQYFYTGQSMA
QKAKKGKETTARVPGMPITTNPYNPYAGTPYIAASEHPEKEWVNTWFAKYYGLNKVYLDNTVPLQKVADKNFRLVTWTIN
NYDKYLGDFQKATLPIAPKIILKRESSSNLITSPSNLKPNNSNLPADKPWLRNALIRYVNVKNNQVVATEQITSPYNDAY
DISHASTKGYQTLKNNPKSYIFNQSFEQTIDIKVSPEVHLITLFFNAKDGKNVSTTNTKGVTGEVLTIKLPAGYQINGSK
TMTLSIDSEISWNKEIKMTKIPFWKDWGRFSNFYILMIGFLIFGLYDYWLNQKMKK
>Mature_696_residues
MINSMIKKKYKILLLVLSAAILCINFIFILNLNRFSGYTGDDFLYHFVYTGAWPSEHLREYHNLWDWILAVHTHMLIWNA
RMTSIIFEIFAMQIPKGLFNIINSLIYVLIGLLINVLVSGKKAFLKPSHLSLTFLLMWFFLPGMGSTVLWVSGATNYLWP
SLVIILFLLAFRFDIAARSNWISLGLFILGLLTGLTNEVGGATAFLLALLFTIFNYRRQPSERVLTQIFGVLGAGIGFFI
QLLLSSGSSETQNYGKSAGFLQHLSDVFTGTMQYSGFLLLPIILLGGLLYLRRIQWTEKVKTLVITSLLFLGSALAGSIA
ILASPISPARLWFAPNILLIITLLLLIEAWQELRLQEIKTSLPVIISIIILAFVAIPSYAYNLKEIQASYQYFYTGQSMA
QKAKKGKETTARVPGMPITTNPYNPYAGTPYIAASEHPEKEWVNTWFAKYYGLNKVYLDNTVPLQKVADKNFRLVTWTIN
NYDKYLGDFQKATLPIAPKIILKRESSSNLITSPSNLKPNNSNLPADKPWLRNALIRYVNVKNNQVVATEQITSPYNDAY
DISHASTKGYQTLKNNPKSYIFNQSFEQTIDIKVSPEVHLITLFFNAKDGKNVSTTNTKGVTGEVLTIKLPAGYQINGSK
TMTLSIDSEISWNKEIKMTKIPFWKDWGRFSNFYILMIGFLIFGLYDYWLNQKMKK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 78890; Mature: 78890

Theoretical pI: Translated: 10.04; Mature: 10.04

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MINSMIKKKYKILLLVLSAAILCINFIFILNLNRFSGYTGDDFLYHFVYTGAWPSEHLRE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCHHHEEHHEECCCCHHHHHH
YHNLWDWILAVHTHMLIWNARMTSIIFEIFAMQIPKGLFNIINSLIYVLIGLLINVLVSG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KKAFLKPSHLSLTFLLMWFFLPGMGSTVLWVSGATNYLWPSLVIILFLLAFRFDIAARSN
CHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
WISLGLFILGLLTGLTNEVGGATAFLLALLFTIFNYRRQPSERVLTQIFGVLGAGIGFFI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLLLSSGSSETQNYGKSAGFLQHLSDVFTGTMQYSGFLLLPIILLGGLLYLRRIQWTEKV
HHHHHCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTLVITSLLFLGSALAGSIAILASPISPARLWFAPNILLIITLLLLIEAWQELRLQEIKT
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLPVIISIIILAFVAIPSYAYNLKEIQASYQYFYTGQSMAQKAKKGKETTARVPGMPITT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC
NPYNPYAGTPYIAASEHPEKEWVNTWFAKYYGLNKVYLDNTVPLQKVADKNFRLVTWTIN
CCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHHCCCCCEEEEEEEC
NYDKYLGDFQKATLPIAPKIILKRESSSNLITSPSNLKPNNSNLPADKPWLRNALIRYVN
CHHHHHCCHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEE
VKNNQVVATEQITSPYNDAYDISHASTKGYQTLKNNPKSYIFNQSFEQTIDIKVSPEVHL
CCCCEEEEEHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCEEECCCCCCEEEEEECCCEEE
ITLFFNAKDGKNVSTTNTKGVTGEVLTIKLPAGYQINGSKTMTLSIDSEISWNKEIKMTK
EEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCEEECCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEE
IPFWKDWGRFSNFYILMIGFLIFGLYDYWLNQKMKK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MINSMIKKKYKILLLVLSAAILCINFIFILNLNRFSGYTGDDFLYHFVYTGAWPSEHLRE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCHHHEEHHEECCCCHHHHHH
YHNLWDWILAVHTHMLIWNARMTSIIFEIFAMQIPKGLFNIINSLIYVLIGLLINVLVSG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KKAFLKPSHLSLTFLLMWFFLPGMGSTVLWVSGATNYLWPSLVIILFLLAFRFDIAARSN
CHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KTLVITSLLFLGSALAGSIAILASPISPARLWFAPNILLIITLLLLIEAWQELRLQEIKT
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLPVIISIIILAFVAIPSYAYNLKEIQASYQYFYTGQSMAQKAKKGKETTARVPGMPITT
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NPYNPYAGTPYIAASEHPEKEWVNTWFAKYYGLNKVYLDNTVPLQKVADKNFRLVTWTIN
CCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHHCCCCCEEEEEEEC
NYDKYLGDFQKATLPIAPKIILKRESSSNLITSPSNLKPNNSNLPADKPWLRNALIRYVN
CHHHHHCCHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEE
VKNNQVVATEQITSPYNDAYDISHASTKGYQTLKNNPKSYIFNQSFEQTIDIKVSPEVHL
CCCCEEEEEHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCEEECCCCCCEEEEEECCCEEE
ITLFFNAKDGKNVSTTNTKGVTGEVLTIKLPAGYQINGSKTMTLSIDSEISWNKEIKMTK
EEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCEEECCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEE
IPFWKDWGRFSNFYILMIGFLIFGLYDYWLNQKMKK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA