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The map label for this gene is ybgB

Identifier: 15672141

GI number: 15672141

Start: 161014

End: 162597

Strand: Direct

Name: ybgB

Synonym: L160937

Alternate gene names: NA

Gene position: 161014-162597 (Clockwise)

Preceding gene: 15672140

Following gene: 15672142

Centisome position: 6.81

GC content: 36.62

Gene sequence:

>1584_bases
ATGTCAAATGAATACAGATCCCGCTCGTCACGTCGTGAGCGGAGAAGCTCTCGTTGGGCAAATAAAGATTCTGATGTCGT
GGAAGCGGCAGCGAATCAAGCAAACAGGCATTTAGAAGAAGAACCAGAAGGTCAAAACGTCGAACGAACTTCAAGACAAA
AATTGACACATGAAAAAACACTCAGAATTCCCTTAGCGGTCTATGGATTACTTACGGGTCTGTCAGTGCTTTTAGCATTA
TCTTTTTATGCATTTCCTTTGTGGAAACCAGTAGCCACAGCCAGCCAATCACAAAACCTTTATTCAGGATTTGCGATGCA
TCATGGTTTAGTTCCTTTTAATGATTTTTATGGGACAGGTGGTACGGTTTTTTATCTCATTAATTGGTTAGGGAATATTG
GTGGGACGACTTGGCTTTTATGGCTTTTTGAAATTATTGCTTTACTAATCAGTGGAATTTTAGTTTACCGCTTAGTGGGT
CAACAAACGAAAAATCAAACAGCATCACTAACTGTATCGGTTTTTACCTTAGTTATTATTGCAGGTTTGGCAAGAGGAGG
AGATAGTCCAACGCTCTTTGCTCTTCCTTTTGCCTTATGGGCGGCACGATTTTTGAGTTCTTATTTCCAAGATAGTTCTA
CAGATAGGGGATTTATTCGATTTGGAATGGCAGCTGCCTTTGCCTTAGTCATTTCTCCTGTCATGTCAGTTTTCTTTATT
TTATCTGCTATCGCTCTCATTATTCATAATGTGGGTAGCCGTAAAATTGGACGTGGTTTTTACCAAATGCTGGCAACAAT
TTTGGGAGTTCTATTAGTAGGTTACTCAGTCGCTTATTATTCTCTTGAAGAACAAACAATCTATACTTCTATTGAACAAT
CTATTTTAATTCCCTTTACACATTTTGGTCCAAGTGGTGATTTATTATTAACTCTTGCTAAAGCCTTAGTTCTCACTCTT
ATTTTTGGAATTGTTGCAGGTTTTGTCCAAGGAATTGTACAACTCAAAAAGGGTGGACCAGCCAGAGTTTGGTATGTCAT
GATGCTTATTGGAATTGTTGGATTGACAACGATGATTGTTTTTGCTCAGACTTTTGATAGTTCTAATCTTTTGGCTGTCC
TGCCATTTACAATAGTTTTTGCAGGTCTTGGGTTGACAGATAGCGATCAAATTTTGTTGAAATATCTTCAAAATCGTTTA
TTTGCTCCGATTTTGGCAATACTTTTTGTCGTTTTTACACCAATTAGTTATCATTTCATGAACCGAACAATTGCTTCAGA
AGAGCAAAGTGTGGCACAATATATTAAGGCAAATGCCACAGGTTCTGACCGAGTTTATGTTGTCGCTGATGGTAAAAATA
TTAACAATTTGACCAAAACAATTTCAACTTTAGATAATGTTCCAGCAAATTATCCAATTAAATTTACCCAAAGTTATGAT
TTGAAAGTGGGTAAATTATCAGATAAATTCGTTGTTTTACAGGCCAGTGAGAAAGCTCCGACTAGTTTGAAAAAAGTTTT
AGATAAAGACTATAAAGTGACTAACTATGCTGGAAAATATTTCCAAGTCTATAAAAAGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTTTCCAAAAATTTGGTATAATTTTTTTACAACTGTGTATTTGAAACAAGCATTTTGTTTATAAAAAAGATTTCCGCTA
AGGAAACATCGGAGGACGTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACTAGTGTTACCAGAATCTGTTTGTAAGTTTTGAAAATCAAAACTTCATAATATTACGGAGGTCAATAATGAGAAAATTT
GAAAAATCGCATAAACTTGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Glycosyltransferase

Number of amino acids: Translated: 527; Mature: 526

Protein sequence:

>527_residues
MSNEYRSRSSRRERRSSRWANKDSDVVEAAANQANRHLEEEPEGQNVERTSRQKLTHEKTLRIPLAVYGLLTGLSVLLAL
SFYAFPLWKPVATASQSQNLYSGFAMHHGLVPFNDFYGTGGTVFYLINWLGNIGGTTWLLWLFEIIALLISGILVYRLVG
QQTKNQTASLTVSVFTLVIIAGLARGGDSPTLFALPFALWAARFLSSYFQDSSTDRGFIRFGMAAAFALVISPVMSVFFI
LSAIALIIHNVGSRKIGRGFYQMLATILGVLLVGYSVAYYSLEEQTIYTSIEQSILIPFTHFGPSGDLLLTLAKALVLTL
IFGIVAGFVQGIVQLKKGGPARVWYVMMLIGIVGLTTMIVFAQTFDSSNLLAVLPFTIVFAGLGLTDSDQILLKYLQNRL
FAPILAILFVVFTPISYHFMNRTIASEEQSVAQYIKANATGSDRVYVVADGKNINNLTKTISTLDNVPANYPIKFTQSYD
LKVGKLSDKFVVLQASEKAPTSLKKVLDKDYKVTNYAGKYFQVYKKK

Sequences:

>Translated_527_residues
MSNEYRSRSSRRERRSSRWANKDSDVVEAAANQANRHLEEEPEGQNVERTSRQKLTHEKTLRIPLAVYGLLTGLSVLLAL
SFYAFPLWKPVATASQSQNLYSGFAMHHGLVPFNDFYGTGGTVFYLINWLGNIGGTTWLLWLFEIIALLISGILVYRLVG
QQTKNQTASLTVSVFTLVIIAGLARGGDSPTLFALPFALWAARFLSSYFQDSSTDRGFIRFGMAAAFALVISPVMSVFFI
LSAIALIIHNVGSRKIGRGFYQMLATILGVLLVGYSVAYYSLEEQTIYTSIEQSILIPFTHFGPSGDLLLTLAKALVLTL
IFGIVAGFVQGIVQLKKGGPARVWYVMMLIGIVGLTTMIVFAQTFDSSNLLAVLPFTIVFAGLGLTDSDQILLKYLQNRL
FAPILAILFVVFTPISYHFMNRTIASEEQSVAQYIKANATGSDRVYVVADGKNINNLTKTISTLDNVPANYPIKFTQSYD
LKVGKLSDKFVVLQASEKAPTSLKKVLDKDYKVTNYAGKYFQVYKKK
>Mature_526_residues
SNEYRSRSSRRERRSSRWANKDSDVVEAAANQANRHLEEEPEGQNVERTSRQKLTHEKTLRIPLAVYGLLTGLSVLLALS
FYAFPLWKPVATASQSQNLYSGFAMHHGLVPFNDFYGTGGTVFYLINWLGNIGGTTWLLWLFEIIALLISGILVYRLVGQ
QTKNQTASLTVSVFTLVIIAGLARGGDSPTLFALPFALWAARFLSSYFQDSSTDRGFIRFGMAAAFALVISPVMSVFFIL
SAIALIIHNVGSRKIGRGFYQMLATILGVLLVGYSVAYYSLEEQTIYTSIEQSILIPFTHFGPSGDLLLTLAKALVLTLI
FGIVAGFVQGIVQLKKGGPARVWYVMMLIGIVGLTTMIVFAQTFDSSNLLAVLPFTIVFAGLGLTDSDQILLKYLQNRLF
APILAILFVVFTPISYHFMNRTIASEEQSVAQYIKANATGSDRVYVVADGKNINNLTKTISTLDNVPANYPIKFTQSYDL
KVGKLSDKFVVLQASEKAPTSLKKVLDKDYKVTNYAGKYFQVYKKK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58374; Mature: 58242

Theoretical pI: Translated: 9.99; Mature: 9.99

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
1.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CEEECCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHCHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SNEYRSRSSRRERRSSRWANKDSDVVEAAANQANRHLEEEPEGQNVERTSRQKLTHEKT
CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH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CEEECCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHCHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA