| Definition | Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_000909 |
| Length | 1,664,970 |
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The map label for this gene is 15669821
Identifier: 15669821
GI number: 15669821
Start: 1600078
End: 1602375
Strand: Reverse
Name: 15669821
Synonym: MJ1626
Alternate gene names: NA
Gene position: 1602375-1600078 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15669823
Following gene: 15669820
Centisome position: 96.24
GC content: 26.68
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases CTTCCGTTACCTTCATAGGCATAATTAAGAGGCACTGCCGAGCGTAGCGAGGTAGTGCATCCGTTTTGATCAACCTTTTA GTAAAAGGTTGGATGGCTAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 765; Mature: 765
Protein sequence:
>765_residues MLITSSLLPPSGTWIFNINSLFCSLSIKNALSNLPLMRFCNSSTTQHTSTLVISLFIISPENIIFFFRIFYYCDNMEREE FLKYLRQGKYDKLAKLINSYSDILSFLDELFTSNKKDDVRRALLVLKRLDNEVIERYLYYILLNLNEKRIIAKEAEEILK KITNKESVEEAILEIAKKPLDEKIVYLFLQNMKEGNIFFRAILEHTKSKNMEESIKILLKNYNSEMILKILANKLYSSEK DERELTINILLNIVDSLTDEQKNILRGHLSVSLLGDEDKKLYRKFKQLFEKLDIPAELSDEQIKSLLKSHGKTTLNIILR ENIKLPANFYNREFLKDFLYTGDEEKQFVGVKLISLKKDSKKKVDLLFRFLNYGYGKAKTAAIRELKKIAQNNNELKKYI ENKTLMYAKKMNLGLKISSLRILKEFAKKEHLEFLINEHKRLKELVYKLEEEKFMGGFRHLLMMEEEIRKCNVAMRLIEE IVAEICLKNDIHYNDLKISEKLGYEFYRTMELIGVKNLNLIDIHEFLEDVKRDGELITYLSGIVINNNKIDDNLAKKILE VTEKAEMEDKDVLNANKIMIYASLNRVDKIGEIINMAEGYYSKLAFINGVKKFIDEKLLDEEKINLLIPKIAEMIYSTKK LRLMALEFFKNYPNELVLPILINEIGNYRGEDKLMIDVISNVIFKYPNNIHSIRELLNTDKRNSALKILLKVSEKRPELL EDFIYLLAGMYSSANEEDKKLIKKILKNITTEEQKLILKPIIGDL
Sequences:
>Translated_765_residues MLITSSLLPPSGTWIFNINSLFCSLSIKNALSNLPLMRFCNSSTTQHTSTLVISLFIISPENIIFFFRIFYYCDNMEREE FLKYLRQGKYDKLAKLINSYSDILSFLDELFTSNKKDDVRRALLVLKRLDNEVIERYLYYILLNLNEKRIIAKEAEEILK KITNKESVEEAILEIAKKPLDEKIVYLFLQNMKEGNIFFRAILEHTKSKNMEESIKILLKNYNSEMILKILANKLYSSEK DERELTINILLNIVDSLTDEQKNILRGHLSVSLLGDEDKKLYRKFKQLFEKLDIPAELSDEQIKSLLKSHGKTTLNIILR ENIKLPANFYNREFLKDFLYTGDEEKQFVGVKLISLKKDSKKKVDLLFRFLNYGYGKAKTAAIRELKKIAQNNNELKKYI ENKTLMYAKKMNLGLKISSLRILKEFAKKEHLEFLINEHKRLKELVYKLEEEKFMGGFRHLLMMEEEIRKCNVAMRLIEE IVAEICLKNDIHYNDLKISEKLGYEFYRTMELIGVKNLNLIDIHEFLEDVKRDGELITYLSGIVINNNKIDDNLAKKILE VTEKAEMEDKDVLNANKIMIYASLNRVDKIGEIINMAEGYYSKLAFINGVKKFIDEKLLDEEKINLLIPKIAEMIYSTKK LRLMALEFFKNYPNELVLPILINEIGNYRGEDKLMIDVISNVIFKYPNNIHSIRELLNTDKRNSALKILLKVSEKRPELL EDFIYLLAGMYSSANEEDKKLIKKILKNITTEEQKLILKPIIGDL >Mature_765_residues MLITSSLLPPSGTWIFNINSLFCSLSIKNALSNLPLMRFCNSSTTQHTSTLVISLFIISPENIIFFFRIFYYCDNMEREE FLKYLRQGKYDKLAKLINSYSDILSFLDELFTSNKKDDVRRALLVLKRLDNEVIERYLYYILLNLNEKRIIAKEAEEILK KITNKESVEEAILEIAKKPLDEKIVYLFLQNMKEGNIFFRAILEHTKSKNMEESIKILLKNYNSEMILKILANKLYSSEK DERELTINILLNIVDSLTDEQKNILRGHLSVSLLGDEDKKLYRKFKQLFEKLDIPAELSDEQIKSLLKSHGKTTLNIILR ENIKLPANFYNREFLKDFLYTGDEEKQFVGVKLISLKKDSKKKVDLLFRFLNYGYGKAKTAAIRELKKIAQNNNELKKYI ENKTLMYAKKMNLGLKISSLRILKEFAKKEHLEFLINEHKRLKELVYKLEEEKFMGGFRHLLMMEEEIRKCNVAMRLIEE IVAEICLKNDIHYNDLKISEKLGYEFYRTMELIGVKNLNLIDIHEFLEDVKRDGELITYLSGIVINNNKIDDNLAKKILE VTEKAEMEDKDVLNANKIMIYASLNRVDKIGEIINMAEGYYSKLAFINGVKKFIDEKLLDEEKINLLIPKIAEMIYSTKK LRLMALEFFKNYPNELVLPILINEIGNYRGEDKLMIDVISNVIFKYPNNIHSIRELLNTDKRNSALKILLKVSEKRPELL EDFIYLLAGMYSSANEEDKKLIKKILKNITTEEQKLILKPIIGDL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): Y1626_METJA (Q59019)
Other databases:
- EMBL: L77117 - PIR: G64502 - RefSeq: NP_248635.1 - ProteinModelPortal: Q59019 - GeneID: 1452534 - GenomeReviews: L77117_GR - KEGG: mja:MJ_1626 - NMPDR: fig|243232.1.peg.1672 - TIGR: MJ1626 - OMA: MALEFFK - ProtClustDB: CLSK214893 - BioCyc: MJAN243232:MJ_1626-MONOMER
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 89609; Mature: 89609
Theoretical pI: Translated: 9.06; Mature: 9.06
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLITSSLLPPSGTWIFNINSLFCSLSIKNALSNLPLMRFCNSSTTQHTSTLVISLFIISP CCEECCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCHHHHHEEEEEEEECC ENIIFFFRIFYYCDNMEREEFLKYLRQGKYDKLAKLINSYSDILSFLDELFTSNKKDDVR CHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH RALLVLKRLDNEVIERYLYYILLNLNEKRIIAKEAEEILKKITNKESVEEAILEIAKKPL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCH DEKIVYLFLQNMKEGNIFFRAILEHTKSKNMEESIKILLKNYNSEMILKILANKLYSSEK HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCC DERELTINILLNIVDSLTDEQKNILRGHLSVSLLGDEDKKLYRKFKQLFEKLDIPAELSD CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH EQIKSLLKSHGKTTLNIILRENIKLPANFYNREFLKDFLYTGDEEKQFVGVKLISLKKDS HHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEECCCC KKKVDLLFRFLNYGYGKAKTAAIRELKKIAQNNNELKKYIENKTLMYAKKMNLGLKISSL HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCHHHH RILKEFAKKEHLEFLINEHKRLKELVYKLEEEKFMGGFRHLLMMEEEIRKCNVAMRLIEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVAEICLKNDIHYNDLKISEKLGYEFYRTMELIGVKNLNLIDIHEFLEDVKRDGELITYL HHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEHH SGIVINNNKIDDNLAKKILEVTEKAEMEDKDVLNANKIMIYASLNRVDKIGEIINMAEGY HCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH YSKLAFINGVKKFIDEKLLDEEKINLLIPKIAEMIYSTKKLRLMALEFFKNYPNELVLPI HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH LINEIGNYRGEDKLMIDVISNVIFKYPNNIHSIRELLNTDKRNSALKILLKVSEKRPELL HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHH EDFIYLLAGMYSSANEEDKKLIKKILKNITTEEQKLILKPIIGDL HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MLITSSLLPPSGTWIFNINSLFCSLSIKNALSNLPLMRFCNSSTTQHTSTLVISLFIISP CCEECCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCHHHHHEEEEEEEECC ENIIFFFRIFYYCDNMEREEFLKYLRQGKYDKLAKLINSYSDILSFLDELFTSNKKDDVR CHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH RALLVLKRLDNEVIERYLYYILLNLNEKRIIAKEAEEILKKITNKESVEEAILEIAKKPL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCH DEKIVYLFLQNMKEGNIFFRAILEHTKSKNMEESIKILLKNYNSEMILKILANKLYSSEK HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCC DERELTINILLNIVDSLTDEQKNILRGHLSVSLLGDEDKKLYRKFKQLFEKLDIPAELSD CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH EQIKSLLKSHGKTTLNIILRENIKLPANFYNREFLKDFLYTGDEEKQFVGVKLISLKKDS HHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEECCCC KKKVDLLFRFLNYGYGKAKTAAIRELKKIAQNNNELKKYIENKTLMYAKKMNLGLKISSL HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCHHHH RILKEFAKKEHLEFLINEHKRLKELVYKLEEEKFMGGFRHLLMMEEEIRKCNVAMRLIEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVAEICLKNDIHYNDLKISEKLGYEFYRTMELIGVKNLNLIDIHEFLEDVKRDGELITYL HHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEHH SGIVINNNKIDDNLAKKILEVTEKAEMEDKDVLNANKIMIYASLNRVDKIGEIINMAEGY HCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH YSKLAFINGVKKFIDEKLLDEEKINLLIPKIAEMIYSTKKLRLMALEFFKNYPNELVLPI HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH LINEIGNYRGEDKLMIDVISNVIFKYPNNIHSIRELLNTDKRNSALKILLKVSEKRPELL HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHH EDFIYLLAGMYSSANEEDKKLIKKILKNITTEEQKLILKPIIGDL HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087