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The map label for this gene is 15669256

Identifier: 15669256

GI number: 15669256

Start: 1008091

End: 1009614

Strand: Reverse

Name: 15669256

Synonym: MJ1068

Alternate gene names: NA

Gene position: 1009614-1008091 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15669257

Following gene: 15669255

Centisome position: 60.64

GC content: 28.35

Gene sequence:

>1524_bases
TTGAGTTATAAAGAAAAGGCAGTTAAAGGCGTAAGTTGGCATCTTCTTTCATATTTCTTAGCTGCTCCAATAGCATATTT
AGTTAGAGTTTTATATGCAAATGAAATTCCTAAGTTAGATGTTGGACTATTTTATGCTGTTTTAGATTTTTTTAGTATGT
TAGTAGTTTTTAGGGCTTTTGGTTTAGATCAGGCACTTATAAGGTATATTCCAAAATATTTAGCAGAGAATAGATTAGAT
ATGTTGAAATCATCAATCGTTTTTGTAGGAATTTTGCAAACAATTTTAGCATTTATTGTTGCATTTTTAGTAGTTATCTT
TGCACCATATATTGCAGAGTTTTATATTAACAATCAAGGGCAATTTACCGGAAGATTGGATTTAGTTATTAATATTTTAA
TCATTATGGCAATGGGATATTATTTTTTAGATAGTATCGTAGCGTTTTTTTCAAATATATTAACAGGCTTTCAACTTCAG
AATTATGCAAGTTCAACAAGAGTCGTTAGAATATTAAGCGTTTTTATCTTTTCATTAATTTTTATTTATCTTTTTAATGT
TCATAACGCTTATGTTCCCTCCGTATCTTACCTTTTGATGGCTGTTGTTATGATTATTATTTATGGATATATTGTAGTTA
AAAAAATATTTCCAAAGTTTGCTAAAGAAAAAGTTATATTTTCAAGGAAATTAATTAGGAATTTGTTTTCTTATGGGATG
TATGTGATGATAGGTTATGCGGGAAGTTTGATATTGGGATACTTAGATGGGATTTGTTTAACCTATTTTACTGGCTTAAA
TGCAGTTGCCGATTATAGAAATGTTGCTATGCCAACTGTTAATATTCTAAGTTATTTTGCCTTTTCTGTTGGAGCAGTTC
TCTTCCCTATGAGTTCTGAGTTATGGGAAAAGGGTTATAAAAAGGCATTAAGTTATGGTGTTGAGAAAGTTTTTTTGTAT
TCTCTGATTATTGTAACCCCATTGGCTATCTTGATGGCATATTTTCCAACTGTTATCATCAATATTTTATTTAATCCCAA
GTATTTATCCGCAGCCCCTGCTATACAGATTTTAAGTTTTGGGGCAATGTTTTTAACATTTAATTCCATAGGGTTCAATA
TTTTAAATGGCATTGGAAGACCAAACATATCAACAAAAATTTTGTATATTGGAGCAAGTTTTAACTTAATATTTAATATT
TTGTTAATTCCTAAGTTTGGGATTATCGGGGCAGCCATAACTACTGTATTTGGATACTTTATAATGTGGATTTTCCAAAT
ATGGTTTTTAAATAAACTTTTAGAACACCAATTTCTAAATAAAAAATGGATTTTAGTTATTTTAGTAGGAATTTTTAGCT
TAATTCCAGTTATGTTCATTAAGGATTTGATTGATAATGTTATATTACAGCTATTTGTTTGTGGAGTTGTTTATTTTGGA
ATATATATATTAGGAATTTTTGGGCTTAAGATAATAAATATATATGAGGTTAAGGATATTATCTCCAAGATTATAAAAAG
GTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAAAATGCAAAAAATTTTATAAAAGAGAATTTTAACTGGAAGAAGTCAGTTAAGGAATATAAAAAGATTTTTGAGAGATT
AGTTAATTAGGTGGTATTAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTAAATGATAAGAGAAAGTTTTTTGCCACCATTTAGGCCATGTATTGGTGAAGAAGAGATAAATGAAGTTATAGATACAT
TAAAGTCAGATTGGATAACT

Product: polysaccharide biosynthesis protein CapF

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 507; Mature: 506

Protein sequence:

>507_residues
MSYKEKAVKGVSWHLLSYFLAAPIAYLVRVLYANEIPKLDVGLFYAVLDFFSMLVVFRAFGLDQALIRYIPKYLAENRLD
MLKSSIVFVGILQTILAFIVAFLVVIFAPYIAEFYINNQGQFTGRLDLVINILIIMAMGYYFLDSIVAFFSNILTGFQLQ
NYASSTRVVRILSVFIFSLIFIYLFNVHNAYVPSVSYLLMAVVMIIIYGYIVVKKIFPKFAKEKVIFSRKLIRNLFSYGM
YVMIGYAGSLILGYLDGICLTYFTGLNAVADYRNVAMPTVNILSYFAFSVGAVLFPMSSELWEKGYKKALSYGVEKVFLY
SLIIVTPLAILMAYFPTVIINILFNPKYLSAAPAIQILSFGAMFLTFNSIGFNILNGIGRPNISTKILYIGASFNLIFNI
LLIPKFGIIGAAITTVFGYFIMWIFQIWFLNKLLEHQFLNKKWILVILVGIFSLIPVMFIKDLIDNVILQLFVCGVVYFG
IYILGIFGLKIINIYEVKDIISKIIKR

Sequences:

>Translated_507_residues
MSYKEKAVKGVSWHLLSYFLAAPIAYLVRVLYANEIPKLDVGLFYAVLDFFSMLVVFRAFGLDQALIRYIPKYLAENRLD
MLKSSIVFVGILQTILAFIVAFLVVIFAPYIAEFYINNQGQFTGRLDLVINILIIMAMGYYFLDSIVAFFSNILTGFQLQ
NYASSTRVVRILSVFIFSLIFIYLFNVHNAYVPSVSYLLMAVVMIIIYGYIVVKKIFPKFAKEKVIFSRKLIRNLFSYGM
YVMIGYAGSLILGYLDGICLTYFTGLNAVADYRNVAMPTVNILSYFAFSVGAVLFPMSSELWEKGYKKALSYGVEKVFLY
SLIIVTPLAILMAYFPTVIINILFNPKYLSAAPAIQILSFGAMFLTFNSIGFNILNGIGRPNISTKILYIGASFNLIFNI
LLIPKFGIIGAAITTVFGYFIMWIFQIWFLNKLLEHQFLNKKWILVILVGIFSLIPVMFIKDLIDNVILQLFVCGVVYFG
IYILGIFGLKIINIYEVKDIISKIIKR
>Mature_506_residues
SYKEKAVKGVSWHLLSYFLAAPIAYLVRVLYANEIPKLDVGLFYAVLDFFSMLVVFRAFGLDQALIRYIPKYLAENRLDM
LKSSIVFVGILQTILAFIVAFLVVIFAPYIAEFYINNQGQFTGRLDLVINILIIMAMGYYFLDSIVAFFSNILTGFQLQN
YASSTRVVRILSVFIFSLIFIYLFNVHNAYVPSVSYLLMAVVMIIIYGYIVVKKIFPKFAKEKVIFSRKLIRNLFSYGMY
VMIGYAGSLILGYLDGICLTYFTGLNAVADYRNVAMPTVNILSYFAFSVGAVLFPMSSELWEKGYKKALSYGVEKVFLYS
LIIVTPLAILMAYFPTVIINILFNPKYLSAAPAIQILSFGAMFLTFNSIGFNILNGIGRPNISTKILYIGASFNLIFNIL
LIPKFGIIGAAITTVFGYFIMWIFQIWFLNKLLEHQFLNKKWILVILVGIFSLIPVMFIKDLIDNVILQLFVCGVVYFGI
YILGIFGLKIINIYEVKDIISKIIKR

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential)

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): Y1068_METJA (Q58467)

Other databases:

- EMBL:   L77117
- PIR:   B64433
- RefSeq:   NP_248061.1
- ProteinModelPortal:   Q58467
- GeneID:   1451964
- GenomeReviews:   L77117_GR
- KEGG:   mja:MJ_1068
- NMPDR:   fig|243232.1.peg.1098
- TIGR:   MJ1068
- HOGENOM:   HBG538937
- OMA:   FIMWIFQ
- ProtClustDB:   CLSK796712
- BioCyc:   MJAN243232:MJ_1068-MONOMER
- InterPro:   IPR002797

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57664; Mature: 57533

Theoretical pI: Translated: 9.86; Mature: 9.86

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

HASH(0xdc1a2b8)-; HASH(0xddd3abc)-; HASH(0xde8ab18)-; HASH(0xdefc558)-; HASH(0xe1191d0)-; HASH(0xd58b5cc)-; HASH(0xe114c84)-; HASH(0xd9e2c9c)-; HASH(0xcb9f05c)-; HASH(0xde17284)-; HASH(0xde69e08)-; HASH(0xdc38fdc)-; HASH(0xd98ff98)-; HASH(0xc6dcbc8)-;

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
>Mature Secondary Structure 
SYKEKAVKGVSWHLLSYFLAAPIAYLVRVLYANEIPKLDVGLFYAVLDFFSMLVVFRAF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087