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The map label for this gene is betT [C]

Identifier: 15603656

GI number: 15603656

Start: 2014284

End: 2016290

Strand: Direct

Name: betT [C]

Synonym: PM1791

Alternate gene names: 15603656

Gene position: 2014284-2016290 (Clockwise)

Preceding gene: 15603648

Following gene: 15603657

Centisome position: 89.23

GC content: 40.11

Gene sequence:

>2007_bases
TTGACATTTTTTAAGCAGTTACAACAACGTAGTACATTAAAAGCACCGATTTTCTTTCCCAGTCTTTTCTTCATCATTTT
TGTCACTTTATATTGTTCTTTTTTTCCACAACATGCTCAAGGGACCTTAAATGTCGTTAAGCAACAAATCTTTAGCCATT
TCAGTTGGTTTTATGTGCTTGCGGTATCCATTTTTATTGTTTTCTTAGTGTTGCTTTGTACCAGTCGATTAGGCGATATT
CGTTTAGGTTCGGATAATGAAGAACCAGAGTATCCATTCCTCTCTTGGATAGCGATGTTATTCGCGGCAGGAATGGGTAT
TGGTTTGATGTATTTTGGTGTGGCTGAGCCGATGTTGCATTATGCCAATCCATTACATCAGGGCATGACTGCAGCGGAAA
AAACCAAAGAAGCCATGTTAATGACTTTTTATCACTGGGGGATTCATGCTTGGGCAATTTATGCGGTGATTGGTCTCGCA
CTGGCGTATTTCGGTTTTCGGTATAAGTTACCGCTCACCATCCGTTCAGGCTTTTATCCGTTATTAAAACAGCGTATTTC
AGGTTTTTGGGGACATGTGATCGATGTCTGTGCCTTATGTAGTACGATTTTCGGTATCACGACGACCTTAGGTTATGGCG
CCATGCAGTTAGATGCGGGATTAAATAGCTTGGGTTGGATTGACTCTCGGAGTTTTTCCACGCTTTCTCTGTTGATCATT
TTGGTGATGTGTTTTGCAACGATTTCTGCCATTACGGGGGTTGCAAAGGGGGTGCGCCGTTTAAGTGAAATTAATTTATT
TTTTGCGCTGATTCTAATGCTGTTTGTGATCGTGCTTGGACCGACATTGTTATTGTTAACCAGCTTCACGGAAAATCTAG
GTTATTATCTGAGTAATTTAGTGTCGTTAAGTTTCCGCACCTTTGCTTATGAGCCTGAAAATCAAGGTTGGTTTAGCGGT
TGGACAGTGTTGTATTGGGCGTGGTGGGTGTCTTGGGCCCCGTTTGTCGGTCTTTTTATTGCCAAAATTTCTAAAGGGCG
CACGATTCGCGAATTTATTTTAGGGGTGTTATTTATTCCTTCACTCTTTAATGCACTGTGGATGACCACTTTCGGCAATT
CTGCGATTTGGCTAGATGGGGAAACTGCAGGAAATTTGACCGCACTTGCGGGCAACACGGAAGCGTTATTATTTGGTTTT
TTTGATTTATTACCTTTTGGCAATATTGCTTCCTTTATTGCCATTGTGATTATCGCTTTATTCTTTATTACCTCGGCGGA
TTCTGGCATCTATGTGATTAACAGCATTGCTTCGCAAGGGGAAGAAAACAGTGTCAAATGGCAAAGTGTGTTTTGGGCAA
TATTATTGGCGGTACTGGCGATTGCCTTATTACGTTCAGACGGCTTGTCTGCCTTACAAACCATGACACTGGTCATCGCC
TTACCTTTCACCATGATTATGTTGTTACTGTGTTTTGGTCTATGGAAAGGGTTGATGGTGGATAACCAATATTTCAGCAA
AACTTTTTCACAGGGTAGCAGTAATTGGACGGGGAAACACTGGAAGTTGCGCTTAGAAAAAATTCTTTCGCAATCGAAAC
GTGCTGACGTGCGTAATTTTATTGATGAAATTGCTCAGCCTGCTTTTTATGAATTAGTGGCGGAGTTTGAAAAACACGGT
TTAACCGCACAAGTTGACATGATTGCAGGGAAAAAACCAAAAATTGAATTTGTGGTGATGAAAGAAAATTTACGTAATTT
CTTATATGGTATTGAATGTCAATTCCGTGAATTATCCACCTTAGTGGTGGAAGATGAAGCGATGCCAAATATTGATTCTA
AACGTTCTTATGAGCCGATTACCTACTTTATTGATGGGCGAGAAGGTTATGATGTGCAATATATGACTAAAGATGAATTA
ATTGCTGATGTATTAAAACAATATGAGCGTTATATGAATTTAGCGATGGATAAAACCAATGCTTTGATGACCTACGATGT
AGCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACTGTATTTTGCGCAGTTTTTTCCTTATTTTTCATGAATAGCATGAAATTTCCGTATGCCAATAGGTTATATCACATTAT
CTCGTCACTAAGGAGGCGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAAGTAATCAATAAGCAAAAACGGGATATTTTGTTATATCCTGTTTTTTTTGTTGGTGAATCAGCGATGTGATGAGAAA
TTTATTTTTTTGTTATATAA

Product: hypothetical protein

Products: Proton [Cytoplasm]; choline [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 668; Mature: 667

Protein sequence:

>668_residues
MTFFKQLQQRSTLKAPIFFPSLFFIIFVTLYCSFFPQHAQGTLNVVKQQIFSHFSWFYVLAVSIFIVFLVLLCTSRLGDI
RLGSDNEEPEYPFLSWIAMLFAAGMGIGLMYFGVAEPMLHYANPLHQGMTAAEKTKEAMLMTFYHWGIHAWAIYAVIGLA
LAYFGFRYKLPLTIRSGFYPLLKQRISGFWGHVIDVCALCSTIFGITTTLGYGAMQLDAGLNSLGWIDSRSFSTLSLLII
LVMCFATISAITGVAKGVRRLSEINLFFALILMLFVIVLGPTLLLLTSFTENLGYYLSNLVSLSFRTFAYEPENQGWFSG
WTVLYWAWWVSWAPFVGLFIAKISKGRTIREFILGVLFIPSLFNALWMTTFGNSAIWLDGETAGNLTALAGNTEALLFGF
FDLLPFGNIASFIAIVIIALFFITSADSGIYVINSIASQGEENSVKWQSVFWAILLAVLAIALLRSDGLSALQTMTLVIA
LPFTMIMLLLCFGLWKGLMVDNQYFSKTFSQGSSNWTGKHWKLRLEKILSQSKRADVRNFIDEIAQPAFYELVAEFEKHG
LTAQVDMIAGKKPKIEFVVMKENLRNFLYGIECQFRELSTLVVEDEAMPNIDSKRSYEPITYFIDGREGYDVQYMTKDEL
IADVLKQYERYMNLAMDKTNALMTYDVA

Sequences:

>Translated_668_residues
MTFFKQLQQRSTLKAPIFFPSLFFIIFVTLYCSFFPQHAQGTLNVVKQQIFSHFSWFYVLAVSIFIVFLVLLCTSRLGDI
RLGSDNEEPEYPFLSWIAMLFAAGMGIGLMYFGVAEPMLHYANPLHQGMTAAEKTKEAMLMTFYHWGIHAWAIYAVIGLA
LAYFGFRYKLPLTIRSGFYPLLKQRISGFWGHVIDVCALCSTIFGITTTLGYGAMQLDAGLNSLGWIDSRSFSTLSLLII
LVMCFATISAITGVAKGVRRLSEINLFFALILMLFVIVLGPTLLLLTSFTENLGYYLSNLVSLSFRTFAYEPENQGWFSG
WTVLYWAWWVSWAPFVGLFIAKISKGRTIREFILGVLFIPSLFNALWMTTFGNSAIWLDGETAGNLTALAGNTEALLFGF
FDLLPFGNIASFIAIVIIALFFITSADSGIYVINSIASQGEENSVKWQSVFWAILLAVLAIALLRSDGLSALQTMTLVIA
LPFTMIMLLLCFGLWKGLMVDNQYFSKTFSQGSSNWTGKHWKLRLEKILSQSKRADVRNFIDEIAQPAFYELVAEFEKHG
LTAQVDMIAGKKPKIEFVVMKENLRNFLYGIECQFRELSTLVVEDEAMPNIDSKRSYEPITYFIDGREGYDVQYMTKDEL
IADVLKQYERYMNLAMDKTNALMTYDVA
>Mature_667_residues
TFFKQLQQRSTLKAPIFFPSLFFIIFVTLYCSFFPQHAQGTLNVVKQQIFSHFSWFYVLAVSIFIVFLVLLCTSRLGDIR
LGSDNEEPEYPFLSWIAMLFAAGMGIGLMYFGVAEPMLHYANPLHQGMTAAEKTKEAMLMTFYHWGIHAWAIYAVIGLAL
AYFGFRYKLPLTIRSGFYPLLKQRISGFWGHVIDVCALCSTIFGITTTLGYGAMQLDAGLNSLGWIDSRSFSTLSLLIIL
VMCFATISAITGVAKGVRRLSEINLFFALILMLFVIVLGPTLLLLTSFTENLGYYLSNLVSLSFRTFAYEPENQGWFSGW
TVLYWAWWVSWAPFVGLFIAKISKGRTIREFILGVLFIPSLFNALWMTTFGNSAIWLDGETAGNLTALAGNTEALLFGFF
DLLPFGNIASFIAIVIIALFFITSADSGIYVINSIASQGEENSVKWQSVFWAILLAVLAIALLRSDGLSALQTMTLVIAL
PFTMIMLLLCFGLWKGLMVDNQYFSKTFSQGSSNWTGKHWKLRLEKILSQSKRADVRNFIDEIAQPAFYELVAEFEKHGL
TAQVDMIAGKKPKIEFVVMKENLRNFLYGIECQFRELSTLVVEDEAMPNIDSKRSYEPITYFIDGREGYDVQYMTKDELI
ADVLKQYERYMNLAMDKTNALMTYDVA

Specific function: High-Affinity Uptake Of Choline Driven By A Proton- Motive Force. [C]

COG id: COG1292

COG function: function code M; Choline-glycine betaine transporter

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the BCCT transporter (TC 2.A.15) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786506, Length=671, Percent_Identity=34.8733233979136, Blast_Score=422, Evalue=1e-119,
Organism=Escherichia coli, GI1788102, Length=456, Percent_Identity=28.9473684210526, Blast_Score=170, Evalue=3e-43,
Organism=Escherichia coli, GI1786224, Length=510, Percent_Identity=28.4313725490196, Blast_Score=147, Evalue=3e-36,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000060
- InterPro:   IPR018093 [H]

Pfam domain/function: PF02028 BCCT [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 75558; Mature: 75427

Theoretical pI: Translated: 6.60; Mature: 6.60

Prosite motif: PS01303 BCCT

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CEEEEECC
>Mature Secondary Structure 
TFFKQLQQRSTLKAPIFFPSLFFIIFVTLYCSFFPQHAQGTLNVVKQQIFSHFSWFYVL
CHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH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CEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton [Periplasm]; choline [Periplasm] [C]

Specific reaction: Proton [Periplasm] + choline [Periplasm] = Proton [Cytoplasm] + choline [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]