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The map label for this gene is siaT [H]

Identifier: 15603573

GI number: 15603573

Start: 1915996

End: 1917900

Strand: Reverse

Name: siaT [H]

Synonym: PM1708

Alternate gene names: 15603573

Gene position: 1917900-1915996 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15603574

Following gene: 15603572

Centisome position: 84.96

GC content: 39.16

Gene sequence:

>1905_bases
TTGGGTTGTCTTGAGGTATCTATGAAAATAATAAATAAATTAGAAGAGTGGATTGGCGGTGTGCTATTCATTGGAATTTT
CTTAATTCTGTTAGCACAAATTATTGCTCGTCAAGTGTTTCAGTCACCGTTTATTTGGAGTGAAGAACTCGCAAGATTGC
TATTTATCTATGTCGGGCTACTTGGTATCAGCATGGGTATCCGTAGTCAACAGCATGTTTATATTGATTTTTTAACTAAC
TTTATGCCCGAGAAAGTGAGAAAGGTGACAAACTCCTTTGTTCAAGTTCTCATCTTTATTTCCATCATTATTTTCATTCA
TTTAGGCTTTAAAGTTTGGCTCGACTCCAGTTTTAAAATGGAAGCGTTAACTGCTTTCGCTTCAGATTTAATTGGGCGCG
AGACGATTGTGCCTGAAAAATGGATGTATGCGGCATTGCCTTTTATTTCTTGTTTAATGTTATTCCGCTTTTTCCAAGCG
CAAGTTGAAAATTATAGAAATAAGTTAAGTTATATTCCTGTCACGGCATTTGTGATTGGTGCGGTCATTATTTTTGCGAT
TTTATTGATTGAGCCAGATTGGTATAAAGTCCTCCGTATTTCAAATTATGTGAAATTTGGTAGTGATGCGGTGTATATCA
CATTAGTGATTTGGCTTGTCATTATGTTTGTGGGAACCCCGGTAGGTTGGTCATTATTTATTGCGACGTTGCTTTATTTT
GCGATGACGCGTTGGAATATTGTTAACTCAGCATCAACCAAGCTCACCGACAGTTTAAATAGTTTCCCATTGTTGAGTGT
ACCGTTCTTTATTTTAACCGGTATTTTAATGAATACGGGCGGAATTACAGAACGTATTTTTGATTTCGCACGTGCCTTGC
TCGGTCATTACCGTGGTGGTATGGGACACGTGAATATCGGGGCAAGTTTAATTTTCTCAGGTATGTCTGGTTCTGCACTT
GCCGATGCAGGTGGTTTAGGCCAGTTAGAAATTAAAGCCATGCGTGATGCTGGGTATGACGATGACATCTGTGGTGGGAT
TACCGCTGCCTCTTGTATTATCGGTCCATTAGTCCCACCAAGTATTGCGATGATTATCTATGGGGTTATTTCTAACCAAT
CTATTGCAAAATTATTTATTGCGGGTTTTATTCCTGGTGTGCTCGTGACCATTGCGTTAATGACCATGAACTATTATGTG
GCGAAAAAACGTGGTTATCCAAGAACACCTAAAGCGACCCTTGAACAACGTTGCCAGGCATTTAAAAAAGCCATTTGGGC
GGTGTTAACCCCAATTTTGATTATCGGTGGTATTTTCTCTGGTCTCTTTACACCAACAGAAGCCGCGGTGATTGCAGCCT
TCTATTCCATTATTATCGGGATGTTTGTTTACCGAGAGTTGAATTTACAAATGTTGTTCAAAAGCTGTATTGAAGCAATG
GCGATTACAGGGGTAACAGCATTAATGGTGATGACGGTCACTTTCTTTGGTGACATGATTGCACGTGAACAAGTGGCTAT
GAAAATTGCAGAAGTCTTTGTTGCAGTAGCCGATTCACCAACGATGGTGTTAGTCATGATCAACCTATTGCTCTTGTTCC
TTGGTATGTTTATTGATGCTTTAGCATTGCAATTCTTGGTGTTACCGATGTTAATTCCAATTGCGGTTCACTTTGGCATT
GACTTAATTTTCTTTGGTGTCATGACCACATTAAATATGATGATTGGTATTTTGACTCCACCAATGGGAATGGCATTATT
TGTTGTGGCACGTGTTGGTAATATGCCGGTGAGTACAGTCGCAAAAGGGGTTTTACCTTTCTTAGTACCAATTTTTGTGA
CACTGGTGTTGATTACAATTTTCCCACAAATTATCACCTTTATACCAAATCTTCTGATGCCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGGTGAAGTCGGTAAAATGGCGATTGAAGAAATTTCTAATCTCGCTAAATAAATATAGTAACCTTATCCCTGCGCCTTA
AGGGATAAGGTTCCTTTTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGGCGTGAAGAAATGGCATTCAAAGCCAATCGGACTCGGTTGGCTTTAATTTAAAAAACTTGCCATTCAGTATTATGCTA
TCTGAATCGGTATTCATTCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: N-acetylneuraminic acid permease; N-acetylneuraminic acid transporter; Neu5Ac permease [H]

Number of amino acids: Translated: 634; Mature: 633

Protein sequence:

>634_residues
MGCLEVSMKIINKLEEWIGGVLFIGIFLILLAQIIARQVFQSPFIWSEELARLLFIYVGLLGISMGIRSQQHVYIDFLTN
FMPEKVRKVTNSFVQVLIFISIIIFIHLGFKVWLDSSFKMEALTAFASDLIGRETIVPEKWMYAALPFISCLMLFRFFQA
QVENYRNKLSYIPVTAFVIGAVIIFAILLIEPDWYKVLRISNYVKFGSDAVYITLVIWLVIMFVGTPVGWSLFIATLLYF
AMTRWNIVNSASTKLTDSLNSFPLLSVPFFILTGILMNTGGITERIFDFARALLGHYRGGMGHVNIGASLIFSGMSGSAL
ADAGGLGQLEIKAMRDAGYDDDICGGITAASCIIGPLVPPSIAMIIYGVISNQSIAKLFIAGFIPGVLVTIALMTMNYYV
AKKRGYPRTPKATLEQRCQAFKKAIWAVLTPILIIGGIFSGLFTPTEAAVIAAFYSIIIGMFVYRELNLQMLFKSCIEAM
AITGVTALMVMTVTFFGDMIAREQVAMKIAEVFVAVADSPTMVLVMINLLLLFLGMFIDALALQFLVLPMLIPIAVHFGI
DLIFFGVMTTLNMMIGILTPPMGMALFVVARVGNMPVSTVAKGVLPFLVPIFVTLVLITIFPQIITFIPNLLMP

Sequences:

>Translated_634_residues
MGCLEVSMKIINKLEEWIGGVLFIGIFLILLAQIIARQVFQSPFIWSEELARLLFIYVGLLGISMGIRSQQHVYIDFLTN
FMPEKVRKVTNSFVQVLIFISIIIFIHLGFKVWLDSSFKMEALTAFASDLIGRETIVPEKWMYAALPFISCLMLFRFFQA
QVENYRNKLSYIPVTAFVIGAVIIFAILLIEPDWYKVLRISNYVKFGSDAVYITLVIWLVIMFVGTPVGWSLFIATLLYF
AMTRWNIVNSASTKLTDSLNSFPLLSVPFFILTGILMNTGGITERIFDFARALLGHYRGGMGHVNIGASLIFSGMSGSAL
ADAGGLGQLEIKAMRDAGYDDDICGGITAASCIIGPLVPPSIAMIIYGVISNQSIAKLFIAGFIPGVLVTIALMTMNYYV
AKKRGYPRTPKATLEQRCQAFKKAIWAVLTPILIIGGIFSGLFTPTEAAVIAAFYSIIIGMFVYRELNLQMLFKSCIEAM
AITGVTALMVMTVTFFGDMIAREQVAMKIAEVFVAVADSPTMVLVMINLLLLFLGMFIDALALQFLVLPMLIPIAVHFGI
DLIFFGVMTTLNMMIGILTPPMGMALFVVARVGNMPVSTVAKGVLPFLVPIFVTLVLITIFPQIITFIPNLLMP
>Mature_633_residues
GCLEVSMKIINKLEEWIGGVLFIGIFLILLAQIIARQVFQSPFIWSEELARLLFIYVGLLGISMGIRSQQHVYIDFLTNF
MPEKVRKVTNSFVQVLIFISIIIFIHLGFKVWLDSSFKMEALTAFASDLIGRETIVPEKWMYAALPFISCLMLFRFFQAQ
VENYRNKLSYIPVTAFVIGAVIIFAILLIEPDWYKVLRISNYVKFGSDAVYITLVIWLVIMFVGTPVGWSLFIATLLYFA
MTRWNIVNSASTKLTDSLNSFPLLSVPFFILTGILMNTGGITERIFDFARALLGHYRGGMGHVNIGASLIFSGMSGSALA
DAGGLGQLEIKAMRDAGYDDDICGGITAASCIIGPLVPPSIAMIIYGVISNQSIAKLFIAGFIPGVLVTIALMTMNYYVA
KKRGYPRTPKATLEQRCQAFKKAIWAVLTPILIIGGIFSGLFTPTEAAVIAAFYSIIIGMFVYRELNLQMLFKSCIEAMA
ITGVTALMVMTVTFFGDMIAREQVAMKIAEVFVAVADSPTMVLVMINLLLLFLGMFIDALALQFLVLPMLIPIAVHFGID
LIFFGVMTTLNMMIGILTPPMGMALFVVARVGNMPVSTVAKGVLPFLVPIFVTLVLITIFPQIITFIPNLLMP

Specific function: Part of the tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) transport system siaPT involved in the uptake of sialic acid [H]

COG id: COG1593

COG function: function code G; TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, large permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: In the C-terminal section; belongs to the TRAP transporter large permease family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI48994950, Length=384, Percent_Identity=36.71875, Blast_Score=229, Evalue=5e-61,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010656
- InterPro:   IPR007387
- InterPro:   IPR004681 [H]

Pfam domain/function: PF06808 DctM; PF04290 DctQ [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 70057; Mature: 69926

Theoretical pI: Translated: 8.70; Mature: 8.70

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
5.4 %Met     (Translated Protein)
6.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
5.2 %Met     (Mature Protein)
6.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
GCLEVSMKIINKLEEWIGGVLFIGIFLILLAQIIARQVFQSPFIWSEELARLLFIYVGL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]