| Definition | Pasteurella multocida subsp. multocida str. Pm70, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002663 |
| Length | 2,257,487 |
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The map label for this gene is kefA [C]
Identifier: 15602223
GI number: 15602223
Start: 417702
End: 421043
Strand: Direct
Name: kefA [C]
Synonym: PM0358
Alternate gene names: 15602223
Gene position: 417702-421043 (Clockwise)
Preceding gene: 15602222
Following gene: 15602224
Centisome position: 18.5
GC content: 38.9
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AAGATGGCAGGAAATACAATTGGGCAACTTTTTCAGGTAACAACATTTGGTGAATCACATGGGATTGCGCTCGGCTGTAT TGTGGATGGTGTGCCACCCG
Product: potassium efflux protein KefA
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1113; Mature: 1113
Protein sequence:
>1113_residues MKKTHLVKKAFFALSLCFMFNAYTFAQLPTPNDIQAQLKVAKSAEQNDTNSKTVVQNLEETLALLAKIDKQKADIKDLEA RIDGAAEQTTKAQKRLETLKSTPAPSATQFEKLSLADLQAKLLSTQQALQQIQADATGLNTELVTLRTAPERAQVTLNAN LTRVQEINKLLANADTIPSGKVKLETELALLELQNSFNKLLLQGNNVLTTLYTLELEDKNLEVAQLQEQIKNLQDAINQK YLKESQQQVEQLTKSQLENKGTTHPEVASQLEQNVRLSQALVQQTTEMNTLSQDNLRIKNVLNNLQQTQRNIEDQISALQ GSLVLSRIINKQKELLPQDEMIAGLSKRITDLRVRIFDLTEMRDNLYDPQSYIAALEKKQQVAFSAQEKASLDSILQERR KLLSDIISLLNNQLNLVINIELNQKQVALISDQLQSKLQQQSFWVKSNAPMDVDWVKQFLPAVQVQVTEIIKQIDFSNWR EDLVPAALIIALLLVFTFLIQLQKAKIKQRLTNINQKINTLTSDSQWHTPEAILWTLVLCLPSTFIFTALLVFMVYLCFA EPLNLASWVVSMGGYWCFFAFMLSLLRPNGIAYRHFSMPKESVDRFYRVFGRSVWISALWINASLFTHLETGITNDVIGQ VMTISVLFISLLIIGPRIQDAVKSYENSSEDNTKSIHMVLKIGRFFLVAAPIILIVLVVMGYYYTALNLMEHLMSSYFVV VTWLVLKNVIHRGLTVSSRRLSYNRLKEKIEQQAQPKVNTEEELNIGLELQQSESLGIAQVKDQVLRVTDLLLTVILLGM LYWVWSDLVTVAYYLQGVTLWQQSVTTAAGTVMESITLLNLLLAVVILIAMYALVRNIGGLLEVLVFSRVSFSQGTPYTI TTLATYFIIAIGAGVAFSTLGMSWSKLQWLFAALSVGLGFGLQEIFANFVSGLIILFERPVRIGDVITIGEYSGTVSRIR IRSTTLIDFDRKEVIVPNKAFVTERLVNWALNDSVTRVVIRVGVGYGSDLELTKRLLLQAATECDRVLKDPEPVVYFLNF GASSLDHELRLYVGKLADRNPTVDCLNRRINSLFEENNIEISFNQLDVFIKNQVTNEEIKLNQQCFPTQKQEG
Sequences:
>Translated_1113_residues MKKTHLVKKAFFALSLCFMFNAYTFAQLPTPNDIQAQLKVAKSAEQNDTNSKTVVQNLEETLALLAKIDKQKADIKDLEA RIDGAAEQTTKAQKRLETLKSTPAPSATQFEKLSLADLQAKLLSTQQALQQIQADATGLNTELVTLRTAPERAQVTLNAN LTRVQEINKLLANADTIPSGKVKLETELALLELQNSFNKLLLQGNNVLTTLYTLELEDKNLEVAQLQEQIKNLQDAINQK YLKESQQQVEQLTKSQLENKGTTHPEVASQLEQNVRLSQALVQQTTEMNTLSQDNLRIKNVLNNLQQTQRNIEDQISALQ GSLVLSRIINKQKELLPQDEMIAGLSKRITDLRVRIFDLTEMRDNLYDPQSYIAALEKKQQVAFSAQEKASLDSILQERR KLLSDIISLLNNQLNLVINIELNQKQVALISDQLQSKLQQQSFWVKSNAPMDVDWVKQFLPAVQVQVTEIIKQIDFSNWR EDLVPAALIIALLLVFTFLIQLQKAKIKQRLTNINQKINTLTSDSQWHTPEAILWTLVLCLPSTFIFTALLVFMVYLCFA EPLNLASWVVSMGGYWCFFAFMLSLLRPNGIAYRHFSMPKESVDRFYRVFGRSVWISALWINASLFTHLETGITNDVIGQ VMTISVLFISLLIIGPRIQDAVKSYENSSEDNTKSIHMVLKIGRFFLVAAPIILIVLVVMGYYYTALNLMEHLMSSYFVV VTWLVLKNVIHRGLTVSSRRLSYNRLKEKIEQQAQPKVNTEEELNIGLELQQSESLGIAQVKDQVLRVTDLLLTVILLGM LYWVWSDLVTVAYYLQGVTLWQQSVTTAAGTVMESITLLNLLLAVVILIAMYALVRNIGGLLEVLVFSRVSFSQGTPYTI TTLATYFIIAIGAGVAFSTLGMSWSKLQWLFAALSVGLGFGLQEIFANFVSGLIILFERPVRIGDVITIGEYSGTVSRIR IRSTTLIDFDRKEVIVPNKAFVTERLVNWALNDSVTRVVIRVGVGYGSDLELTKRLLLQAATECDRVLKDPEPVVYFLNF GASSLDHELRLYVGKLADRNPTVDCLNRRINSLFEENNIEISFNQLDVFIKNQVTNEEIKLNQQCFPTQKQEG >Mature_1113_residues MKKTHLVKKAFFALSLCFMFNAYTFAQLPTPNDIQAQLKVAKSAEQNDTNSKTVVQNLEETLALLAKIDKQKADIKDLEA RIDGAAEQTTKAQKRLETLKSTPAPSATQFEKLSLADLQAKLLSTQQALQQIQADATGLNTELVTLRTAPERAQVTLNAN LTRVQEINKLLANADTIPSGKVKLETELALLELQNSFNKLLLQGNNVLTTLYTLELEDKNLEVAQLQEQIKNLQDAINQK YLKESQQQVEQLTKSQLENKGTTHPEVASQLEQNVRLSQALVQQTTEMNTLSQDNLRIKNVLNNLQQTQRNIEDQISALQ GSLVLSRIINKQKELLPQDEMIAGLSKRITDLRVRIFDLTEMRDNLYDPQSYIAALEKKQQVAFSAQEKASLDSILQERR KLLSDIISLLNNQLNLVINIELNQKQVALISDQLQSKLQQQSFWVKSNAPMDVDWVKQFLPAVQVQVTEIIKQIDFSNWR EDLVPAALIIALLLVFTFLIQLQKAKIKQRLTNINQKINTLTSDSQWHTPEAILWTLVLCLPSTFIFTALLVFMVYLCFA EPLNLASWVVSMGGYWCFFAFMLSLLRPNGIAYRHFSMPKESVDRFYRVFGRSVWISALWINASLFTHLETGITNDVIGQ VMTISVLFISLLIIGPRIQDAVKSYENSSEDNTKSIHMVLKIGRFFLVAAPIILIVLVVMGYYYTALNLMEHLMSSYFVV VTWLVLKNVIHRGLTVSSRRLSYNRLKEKIEQQAQPKVNTEEELNIGLELQQSESLGIAQVKDQVLRVTDLLLTVILLGM LYWVWSDLVTVAYYLQGVTLWQQSVTTAAGTVMESITLLNLLLAVVILIAMYALVRNIGGLLEVLVFSRVSFSQGTPYTI TTLATYFIIAIGAGVAFSTLGMSWSKLQWLFAALSVGLGFGLQEIFANFVSGLIILFERPVRIGDVITIGEYSGTVSRIR IRSTTLIDFDRKEVIVPNKAFVTERLVNWALNDSVTRVVIRVGVGYGSDLELTKRLLLQAATECDRVLKDPEPVVYFLNF GASSLDHELRLYVGKLADRNPTVDCLNRRINSLFEENNIEISFNQLDVFIKNQVTNEEIKLNQQCFPTQKQEG
Specific function: Unknown
COG id: COG3264
COG function: function code M; Small-conductance mechanosensitive channel
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the mscS (TC 1.A.23) family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1786670, Length=1125, Percent_Identity=38.0444444444444, Blast_Score=699, Evalue=0.0, Organism=Escherichia coli, GI2367355, Length=1095, Percent_Identity=26.8493150684932, Blast_Score=348, Evalue=1e-96, Organism=Escherichia coli, GI1789291, Length=253, Percent_Identity=28.0632411067194, Blast_Score=97, Evalue=8e-21,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR010920 - InterPro: IPR011066 - InterPro: IPR006685 - InterPro: IPR006686 - InterPro: IPR011014 [H]
Pfam domain/function: PF00924 MS_channel [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 125702; Mature: 125702
Theoretical pI: Translated: 7.24; Mature: 7.24
Prosite motif: PS00107 PROTEIN_KINASE_ATP ; PS01246 UPF0003
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKTHLVKKAFFALSLCFMFNAYTFAQLPTPNDIQAQLKVAKSAEQNDTNSKTVVQNLEE CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH TLALLAKIDKQKADIKDLEARIDGAAEQTTKAQKRLETLKSTPAPSATQFEKLSLADLQA HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH KLLSTQQALQQIQADATGLNTELVTLRTAPERAQVTLNANLTRVQEINKLLANADTIPSG HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC KVKLETELALLELQNSFNKLLLQGNNVLTTLYTLELEDKNLEVAQLQEQIKNLQDAINQK CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLKESQQQVEQLTKSQLENKGTTHPEVASQLEQNVRLSQALVQQTTEMNTLSQDNLRIKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH VLNNLQQTQRNIEDQISALQGSLVLSRIINKQKELLPQDEMIAGLSKRITDLRVRIFDLT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EMRDNLYDPQSYIAALEKKQQVAFSAQEKASLDSILQERRKLLSDIISLLNNQLNLVINI HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE ELNQKQVALISDQLQSKLQQQSFWVKSNAPMDVDWVKQFLPAVQVQVTEIIKQIDFSNWR EECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH EDLVPAALIIALLLVFTFLIQLQKAKIKQRLTNINQKINTLTSDSQWHTPEAILWTLVLC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH LPSTFIFTALLVFMVYLCFAEPLNLASWVVSMGGYWCFFAFMLSLLRPNGIAYRHFSMPK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCH ESVDRFYRVFGRSVWISALWINASLFTHLETGITNDVIGQVMTISVLFISLLIIGPRIQD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH AVKSYENSSEDNTKSIHMVLKIGRFFLVAAPIILIVLVVMGYYYTALNLMEHLMSSYFVV HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VTWLVLKNVIHRGLTVSSRRLSYNRLKEKIEQQAQPKVNTEEELNIGLELQQSESLGIAQ HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCEEEECCCCCCHHH VKDQVLRVTDLLLTVILLGMLYWVWSDLVTVAYYLQGVTLWQQSVTTAAGTVMESITLLN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLLAVVILIAMYALVRNIGGLLEVLVFSRVSFSQGTPYTITTLATYFIIAIGAGVAFSTL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GMSWSKLQWLFAALSVGLGFGLQEIFANFVSGLIILFERPVRIGDVITIGEYSGTVSRIR CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCHHEEE IRSTTLIDFDRKEVIVPNKAFVTERLVNWALNDSVTRVVIRVGVGYGSDLELTKRLLLQA EEEEEEEECCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHH ATECDRVLKDPEPVVYFLNFGASSLDHELRLYVGKLADRNPTVDCLNRRINSLFEENNIE HHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCE ISFNQLDVFIKNQVTNEEIKLNQQCFPTQKQEG EEEHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKKTHLVKKAFFALSLCFMFNAYTFAQLPTPNDIQAQLKVAKSAEQNDTNSKTVVQNLEE CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH TLALLAKIDKQKADIKDLEARIDGAAEQTTKAQKRLETLKSTPAPSATQFEKLSLADLQA HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH KLLSTQQALQQIQADATGLNTELVTLRTAPERAQVTLNANLTRVQEINKLLANADTIPSG HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC KVKLETELALLELQNSFNKLLLQGNNVLTTLYTLELEDKNLEVAQLQEQIKNLQDAINQK CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YLKESQQQVEQLTKSQLENKGTTHPEVASQLEQNVRLSQALVQQTTEMNTLSQDNLRIKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH VLNNLQQTQRNIEDQISALQGSLVLSRIINKQKELLPQDEMIAGLSKRITDLRVRIFDLT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EMRDNLYDPQSYIAALEKKQQVAFSAQEKASLDSILQERRKLLSDIISLLNNQLNLVINI HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE ELNQKQVALISDQLQSKLQQQSFWVKSNAPMDVDWVKQFLPAVQVQVTEIIKQIDFSNWR EECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH EDLVPAALIIALLLVFTFLIQLQKAKIKQRLTNINQKINTLTSDSQWHTPEAILWTLVLC HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH LPSTFIFTALLVFMVYLCFAEPLNLASWVVSMGGYWCFFAFMLSLLRPNGIAYRHFSMPK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCH ESVDRFYRVFGRSVWISALWINASLFTHLETGITNDVIGQVMTISVLFISLLIIGPRIQD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH AVKSYENSSEDNTKSIHMVLKIGRFFLVAAPIILIVLVVMGYYYTALNLMEHLMSSYFVV HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VTWLVLKNVIHRGLTVSSRRLSYNRLKEKIEQQAQPKVNTEEELNIGLELQQSESLGIAQ HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCEEEECCCCCCHHH VKDQVLRVTDLLLTVILLGMLYWVWSDLVTVAYYLQGVTLWQQSVTTAAGTVMESITLLN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLLAVVILIAMYALVRNIGGLLEVLVFSRVSFSQGTPYTITTLATYFIIAIGAGVAFSTL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GMSWSKLQWLFAALSVGLGFGLQEIFANFVSGLIILFERPVRIGDVITIGEYSGTVSRIR CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCHHEEE IRSTTLIDFDRKEVIVPNKAFVTERLVNWALNDSVTRVVIRVGVGYGSDLELTKRLLLQA EEEEEEEECCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHH ATECDRVLKDPEPVVYFLNFGASSLDHELRLYVGKLADRNPTVDCLNRRINSLFEENNIE HHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCE ISFNQLDVFIKNQVTNEEIKLNQQCFPTQKQEG EEEHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7542800; 10675023 [H]