Definition Borrelia burgdorferi B31 chromosome, complete genome.
Accession NC_001318
Length 910,724

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The map label for this gene is secA [H]

Identifier: 15594499

GI number: 15594499

Start: 153701

End: 156400

Strand: Reverse

Name: secA [H]

Synonym: BB0154

Alternate gene names: 15594499

Gene position: 156400-153701 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15594506

Following gene: 15594498

Centisome position: 17.17

GC content: 33.15

Gene sequence:

>2700_bases
ATGTTAAAAGCAGTACTTGAGACAACTATTGGCTCAAAAAGTAAAAGAGATTTAAAAGATTATCTTCCGACTTTAAGAAA
TATTAATAAGCTTGAGCGTTGGGCATTATTGTTGGCAGATGAAGATTTTTCAAAGGAGACAGAAAAGCTTAAAGATGAAT
TAAAATCGGGTAATTCTTTAGAGAATATTTTAGAGCGAGCTTTTACTCTGTCTAGAGAAGCTGCTAGAAGGCGTCTTAAA
GAAAGGCCTTATGATGTGCAAATCATTGCGGGGCTTGCTCTTCACAAAGGCAAAATAATAGAAATGAAAACGGGAGAAGG
AAAAACTCTCTCCTCAGTTCAAGCGGCGTATTTAAATAGTTTAACAGGAGATGGGGTTATTATTGTTACTGTTAATGACT
ATCTTGCAGAACGTGATTCCAATTGGATGAAGCCGGTTTTTGATCTTTTGGGTGTTAGCGTGGGGGTTGTTCTATCTAAT
ATGGATTATGAGCTAAGAAAGGCTCAATATGCTAAAGATATTACTTATGTTACAAATAATGAACTTGGATTTGATTATCT
AAGAGATAATATGCGTTATGACTTGAATGAAAAATCCTTGAGAAAGTTTAATTATTGTATTATTGATGAAATTGATTCTA
TTTTGATCGATGAGGCAAGAACTCCATTGATTATTTCAGGGCCTACTGAAGGCAACACCAATGCTTATCTTGAAGTTAAT
TCTCTTGTATCTTTTTTAAAAGAATGTTCCAAGGATCCCAAAACAGGTGATTATCCTTTAGAAATAGACGACCTTGATGG
TGATTATACTGTTGATGAAAAAGCCAAAAGAATTTCTTTTACTGCCAAAGGGCTTAATAATCTTGAACAGCTTTTAGTTT
CTAAAGGCATTATTAGTGGGTCTATGTATACCGATTCAAATTTTAATTATGTTCATTATATGACTCAAGCCTTAAAAGCA
CATTTGCTTTTTTTAAAAAATAGAGAGTATATTGTTGGTGATTCTGGGGTTGAGATTGTAGATGAATTTACTGGGAGAGT
TTTAACAGGGCGAAGATATTCAGATGGACTTCACCAAGCTATTGAGGCTAAAGAAGGAGTTAGAGTTGCTAATGAAAATA
AGACTATGGCAACTATTACTTTTCAAAATTTATTTAGAATGTTTGATAAAATTTCTGGCATGACAGGTACAGCTGATACA
GAAGCTAAGGAATTTCATAAAATATATAATCTTGATGTAGTTGTAGTTCCAACAAATAGATTGTTAGCGCGAATAGATGA
GGATGATACTATTTATTATACGGAAGAATTTAAATTTAATGCGATTACAGATGAGGTTTACAAAACTTACAAAAAAGGCC
AACCGGTTTTAGTGGGAACCGTTTCTATTGAAAAATCTGAGATTTTATCAGCTATGTTTAAAAACAGAGGGATTAAGCAT
GAAGTTCTTAATGCAAAAAATCATTCTCGAGAAGCATTTATTATTGCTGAAGCTGGAGCAAAACATGCGGTTACAATAGC
AACAAATATGGCTGGTCGTGGTACGGATATTAAGCTTGGGGGAAATATTGAGCACAGAGTTAGAAAAAAAATCGGAACTA
ATGTAAGCCTTGAAGAATTTCAAGAGGCTGTTAAAAATGAGAGAGAAAATTACCTGAAAGACTATAATGAGGTTAAAAGT
CTTGGTGGGCTTTATGTTATTGGTAGTGAGCGTCACGAATCAAGGCGAATAGACAATCAGCTTCGTGGGCGTAGTGGAAG
ACAAGGTGACCCTGGGCGCTCAAGATTTTATGTGTCCCTTGAGGACGATTTAATGCGCCTTTTTGCTGGGGACAACCTAA
GATCATTAATGGGTAAGCTTGGAATGGCAACAGGAGAGCCTATTACACATTCTCTTTTAACTAAATCTTTGATTAATGCT
CAAAAACGAGTAGAAGACAGAAATTTTGAAATTAGAAAGCATTTGTTAGAGTATGACGATGTTATTACAAAACAAAGAGA
TTTTATTTATGCTCAGAGAAACTCCATTCTTGAAGATACAGCTATTAAGGATCGTATTCTTGTTGCTTTAGAAGAATATC
TTAGTTTTTTGCTTGAAGGGACAAAAAGTAGCACGGTTTCAAATGTTTTTTTAAATGAAGTAAATTCAATTTTTGCTTAT
ATGCTTGAGAGTCTTGGTTCTATTGAAAATATTAGTTCTCTTGATTTAAAGGCTAAGCTAATGCAAATAGCAAAAGCAAA
TTTAGATGAAAAGGAAAATTTGATTGGTAGAGATCTTTTTAATGGATTTTTAAGATATGAATATTTGAAAAATATTGATT
TTAAATTTCAGGAACATCTTGCAAATTTAGACTCTTTAAGAGAGGCTGTTTATTTAAGGTCTTATGCCAATAAAAATCCA
ATCACAGAATACAAAGAAGAGGGATTTTCAATATTTAGCGAGCTTATTAAAGATATTAAAGTTTCTACCATAAGGCGTGT
TCTTCAATTAAAATTGGATAGCAATTCTTCCGATTTTAAGTCAACAAAGAAGTCTAGGAATGTTAAACCAATTCATAAAG
AACTTTCTGGAATTGTTATTAATGAGAATAAAAGCGCTTCTAATGTTCAAGTGGTTAGAAGTTCTCCTAAAATAGGCAGA
AATGAGCCTTGTTATTGTGGAAGTGGGAAGAAATATAAAAATTGTCATGGCAAAAGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGCAAGCTTAATATAAGAGCTTTATAGTGTTTTTTCATATTTTTATATTATTATTTAAAATGACTTTAAGTCAATTATT
TAGGAGAATTAATACCTACC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AACAGGAGGTTTTTATGTTTAAGCTGCCAGAACTTGGTTATGATTATGATGCTGTTGAGCCTTATATTGATGCTAAAACT
ATGGAAATTCATCATAGCAA

Product: preprotein translocase subunit SecA

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 899; Mature: 899

Protein sequence:

>899_residues
MLKAVLETTIGSKSKRDLKDYLPTLRNINKLERWALLLADEDFSKETEKLKDELKSGNSLENILERAFTLSREAARRRLK
ERPYDVQIIAGLALHKGKIIEMKTGEGKTLSSVQAAYLNSLTGDGVIIVTVNDYLAERDSNWMKPVFDLLGVSVGVVLSN
MDYELRKAQYAKDITYVTNNELGFDYLRDNMRYDLNEKSLRKFNYCIIDEIDSILIDEARTPLIISGPTEGNTNAYLEVN
SLVSFLKECSKDPKTGDYPLEIDDLDGDYTVDEKAKRISFTAKGLNNLEQLLVSKGIISGSMYTDSNFNYVHYMTQALKA
HLLFLKNREYIVGDSGVEIVDEFTGRVLTGRRYSDGLHQAIEAKEGVRVANENKTMATITFQNLFRMFDKISGMTGTADT
EAKEFHKIYNLDVVVVPTNRLLARIDEDDTIYYTEEFKFNAITDEVYKTYKKGQPVLVGTVSIEKSEILSAMFKNRGIKH
EVLNAKNHSREAFIIAEAGAKHAVTIATNMAGRGTDIKLGGNIEHRVRKKIGTNVSLEEFQEAVKNERENYLKDYNEVKS
LGGLYVIGSERHESRRIDNQLRGRSGRQGDPGRSRFYVSLEDDLMRLFAGDNLRSLMGKLGMATGEPITHSLLTKSLINA
QKRVEDRNFEIRKHLLEYDDVITKQRDFIYAQRNSILEDTAIKDRILVALEEYLSFLLEGTKSSTVSNVFLNEVNSIFAY
MLESLGSIENISSLDLKAKLMQIAKANLDEKENLIGRDLFNGFLRYEYLKNIDFKFQEHLANLDSLREAVYLRSYANKNP
ITEYKEEGFSIFSELIKDIKVSTIRRVLQLKLDSNSSDFKSTKKSRNVKPIHKELSGIVINENKSASNVQVVRSSPKIGR
NEPCYCGSGKKYKNCHGKS

Sequences:

>Translated_899_residues
MLKAVLETTIGSKSKRDLKDYLPTLRNINKLERWALLLADEDFSKETEKLKDELKSGNSLENILERAFTLSREAARRRLK
ERPYDVQIIAGLALHKGKIIEMKTGEGKTLSSVQAAYLNSLTGDGVIIVTVNDYLAERDSNWMKPVFDLLGVSVGVVLSN
MDYELRKAQYAKDITYVTNNELGFDYLRDNMRYDLNEKSLRKFNYCIIDEIDSILIDEARTPLIISGPTEGNTNAYLEVN
SLVSFLKECSKDPKTGDYPLEIDDLDGDYTVDEKAKRISFTAKGLNNLEQLLVSKGIISGSMYTDSNFNYVHYMTQALKA
HLLFLKNREYIVGDSGVEIVDEFTGRVLTGRRYSDGLHQAIEAKEGVRVANENKTMATITFQNLFRMFDKISGMTGTADT
EAKEFHKIYNLDVVVVPTNRLLARIDEDDTIYYTEEFKFNAITDEVYKTYKKGQPVLVGTVSIEKSEILSAMFKNRGIKH
EVLNAKNHSREAFIIAEAGAKHAVTIATNMAGRGTDIKLGGNIEHRVRKKIGTNVSLEEFQEAVKNERENYLKDYNEVKS
LGGLYVIGSERHESRRIDNQLRGRSGRQGDPGRSRFYVSLEDDLMRLFAGDNLRSLMGKLGMATGEPITHSLLTKSLINA
QKRVEDRNFEIRKHLLEYDDVITKQRDFIYAQRNSILEDTAIKDRILVALEEYLSFLLEGTKSSTVSNVFLNEVNSIFAY
MLESLGSIENISSLDLKAKLMQIAKANLDEKENLIGRDLFNGFLRYEYLKNIDFKFQEHLANLDSLREAVYLRSYANKNP
ITEYKEEGFSIFSELIKDIKVSTIRRVLQLKLDSNSSDFKSTKKSRNVKPIHKELSGIVINENKSASNVQVVRSSPKIGR
NEPCYCGSGKKYKNCHGKS
>Mature_899_residues
MLKAVLETTIGSKSKRDLKDYLPTLRNINKLERWALLLADEDFSKETEKLKDELKSGNSLENILERAFTLSREAARRRLK
ERPYDVQIIAGLALHKGKIIEMKTGEGKTLSSVQAAYLNSLTGDGVIIVTVNDYLAERDSNWMKPVFDLLGVSVGVVLSN
MDYELRKAQYAKDITYVTNNELGFDYLRDNMRYDLNEKSLRKFNYCIIDEIDSILIDEARTPLIISGPTEGNTNAYLEVN
SLVSFLKECSKDPKTGDYPLEIDDLDGDYTVDEKAKRISFTAKGLNNLEQLLVSKGIISGSMYTDSNFNYVHYMTQALKA
HLLFLKNREYIVGDSGVEIVDEFTGRVLTGRRYSDGLHQAIEAKEGVRVANENKTMATITFQNLFRMFDKISGMTGTADT
EAKEFHKIYNLDVVVVPTNRLLARIDEDDTIYYTEEFKFNAITDEVYKTYKKGQPVLVGTVSIEKSEILSAMFKNRGIKH
EVLNAKNHSREAFIIAEAGAKHAVTIATNMAGRGTDIKLGGNIEHRVRKKIGTNVSLEEFQEAVKNERENYLKDYNEVKS
LGGLYVIGSERHESRRIDNQLRGRSGRQGDPGRSRFYVSLEDDLMRLFAGDNLRSLMGKLGMATGEPITHSLLTKSLINA
QKRVEDRNFEIRKHLLEYDDVITKQRDFIYAQRNSILEDTAIKDRILVALEEYLSFLLEGTKSSTVSNVFLNEVNSIFAY
MLESLGSIENISSLDLKAKLMQIAKANLDEKENLIGRDLFNGFLRYEYLKNIDFKFQEHLANLDSLREAVYLRSYANKNP
ITEYKEEGFSIFSELIKDIKVSTIRRVLQLKLDSNSSDFKSTKKSRNVKPIHKELSGIVINENKSASNVQVVRSSPKIGR
NEPCYCGSGKKYKNCHGKS

Specific function: Part of the Sec protein translocase complex. Interacts with the secYEG preprotein conducting channel. Has a central role in coupling the hydrolysis of ATP to the transfer of proteins into and across the cell membrane, serving as an ATP-driven molecular mo

COG id: COG0653

COG function: function code U; Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Peripheral membrane protein; Cytoplasmic side. Cytoplasm (By similarity). Note=Distribution is 50-50 (By similarity) [H]

Metaboloic importance: Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the secA family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786287, Length=917, Percent_Identity=44.1657579062159, Blast_Score=762, Evalue=0.0,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004027
- InterPro:   IPR000185
- InterPro:   IPR020937
- InterPro:   IPR011115
- InterPro:   IPR014018
- InterPro:   IPR011130
- InterPro:   IPR011116 [H]

Pfam domain/function: PF02810 SEC-C; PF07517 SecA_DEAD; PF01043 SecA_PP_bind; PF07516 SecA_SW [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 102088; Mature: 102088

Theoretical pI: Translated: 7.92; Mature: 7.92

Prosite motif: PS01312 SECA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLKAVLETTIGSKSKRDLKDYLPTLRNINKLERWALLLADEDFSKETEKLKDELKSGNSL
CCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCHH
ENILERAFTLSREAARRRLKERPYDVQIIAGLALHKGKIIEMKTGEGKTLSSVQAAYLNS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHC
LTGDGVIIVTVNDYLAERDSNWMKPVFDLLGVSVGVVLSNMDYELRKAQYAKDITYVTNN
CCCCCEEEEEECHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCEEEECC
ELGFDYLRDNMRYDLNEKSLRKFNYCIIDEIDSILIDEARTPLIISGPTEGNTNAYLEVN
CCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEHH
SLVSFLKECSKDPKTGDYPLEIDDLDGDYTVDEKAKRISFTAKGLNNLEQLLVSKGIISG
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
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CEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEEECCCCHHHHHHHCCCEECCCCHHHHHHHH
IEAKEGVRVANENKTMATITFQNLFRMFDKISGMTGTADTEAKEFHKIYNLDVVVVPTNR
HHHHCCCEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEEECCHH
LLARIDEDDTIYYTEEFKFNAITDEVYKTYKKGQPVLVGTVSIEKSEILSAMFKNRGIKH
HHEEECCCCEEEEECCEEECHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCH
EVLNAKNHSREAFIIAEAGAKHAVTIATNMAGRGTDIKLGGNIEHRVRKKIGTNVSLEEF
HHHCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCHHHH
QEAVKNERENYLKDYNEVKSLGGLYVIGSERHESRRIDNQLRGRSGRQGDPGRSRFYVSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEE
EDDLMRLFAGDNLRSLMGKLGMATGEPITHSLLTKSLINAQKRVEDRNFEIRKHLLEYDD
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
VITKQRDFIYAQRNSILEDTAIKDRILVALEEYLSFLLEGTKSSTVSNVFLNEVNSIFAY
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
MLESLGSIENISSLDLKAKLMQIAKANLDEKENLIGRDLFNGFLRYEYLKNIDFKFQEHL
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
ANLDSLREAVYLRSYANKNPITEYKEEGFSIFSELIKDIKVSTIRRVLQLKLDSNSSDFK
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
STKKSRNVKPIHKELSGIVINENKSASNVQVVRSSPKIGRNEPCYCGSGKKYKNCHGKS
HHHHCCCCCHHHHHCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MLKAVLETTIGSKSKRDLKDYLPTLRNINKLERWALLLADEDFSKETEKLKDELKSGNSL
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LTGDGVIIVTVNDYLAERDSNWMKPVFDLLGVSVGVVLSNMDYELRKAQYAKDITYVTNN
CCCCCEEEEEECHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCEEEECC
ELGFDYLRDNMRYDLNEKSLRKFNYCIIDEIDSILIDEARTPLIISGPTEGNTNAYLEVN
CCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEHH
SLVSFLKECSKDPKTGDYPLEIDDLDGDYTVDEKAKRISFTAKGLNNLEQLLVSKGIISG
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SMYTDSNFNYVHYMTQALKAHLLFLKNREYIVGDSGVEIVDEFTGRVLTGRRYSDGLHQA
CEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEEECCCCHHHHHHHCCCEECCCCHHHHHHHH
IEAKEGVRVANENKTMATITFQNLFRMFDKISGMTGTADTEAKEFHKIYNLDVVVVPTNR
HHHHCCCEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEEECCHH
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EDDLMRLFAGDNLRSLMGKLGMATGEPITHSLLTKSLINAQKRVEDRNFEIRKHLLEYDD
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
VITKQRDFIYAQRNSILEDTAIKDRILVALEEYLSFLLEGTKSSTVSNVFLNEVNSIFAY
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
MLESLGSIENISSLDLKAKLMQIAKANLDEKENLIGRDLFNGFLRYEYLKNIDFKFQEHL
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
ANLDSLREAVYLRSYANKNPITEYKEEGFSIFSELIKDIKVSTIRRVLQLKLDSNSSDFK
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
STKKSRNVKPIHKELSGIVINENKSASNVQVVRSSPKIGRNEPCYCGSGKKYKNCHGKS
HHHHCCCCCHHHHHCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA