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The map label for this gene is 153952267

Identifier: 153952267

GI number: 153952267

Start: 1481539

End: 1484382

Strand: Direct

Name: 153952267

Synonym: JJD26997_1682

Alternate gene names: NA

Gene position: 1481539-1484382 (Clockwise)

Preceding gene: 153952322

Following gene: 153952025

Centisome position: 80.3

GC content: 24.79

Gene sequence:

>2844_bases
ATGGCTAAAGCAAAGCAAAACACAAGAACACATTTATTGTTAAATAAATTTATCCATGATAAATCACTAGTGCAAAAACT
TGATGAAAGTTATGATTTTAATAATTTTTCTCAAGCTATAAATTTGCAATTTTATCAGCAAGAAAGTGTTAAAAATGCTT
TAGCCATACTTTCTTTTTATATGAAAGATGAGTTAAATTTGCATGAATACAATCAAGAACGTAGAAAACTTTTAGAATTT
TATCAAGATGAAAGCGAGAATTTAAAACTACAAAAAGAACATATCGCAAGAGCTTCATTTTGGATGGCTACAGGAAGTGG
TAAAACTATAGTTATGATCAAACTTATAGCTTTGATACATGAATTTATTAAAAATAATCAATTACCTAAAAAGCCTATCA
TGCTTTTAGCGCCAAATGATAAGATTTTAAATCAATTTAAAGAAAATATAATCAAATACAATAATCATCACAGTAATTTT
ATCAAAATAAAAGATTTAAAAGATTTTGAAAGCATAGAAAAAGAAGCTAGTTTATTAAATGAAGCGGTGGTGTATTTTGC
AAGAAGTGATTTGCTTGAGAGTGAAGAAAAAGTAGGTAAAGATAAAAAAGCAAAAAGATTAAACTATAAAAATTATCTTA
ATAAAGATGGTTGGTATATATTGTTAGATGAAGCTCATAGAGGCGATAGTAAAACATCACTAAGAAAAAACTATTATCAT
GAACTTGCTAGAGGTTTTATTAAAGAAGATGAATTTCCAAAAGGCTTTGTTTTTAATTTTTCTGCTACTTTTGAAGATGA
AATAGACTTTATAACTTGTGCTTATAATTATAATCTTCAAAAATTTAATCAAGAAGGATATGGTAAAGACATAGCGGTTT
TAAATGAGAATTTAGATTTTAAAAGTGAAAATAACGAAGAAGCAAAAATAAAAACGATTTTAGAAAGTTTTATAATATTC
AATGCTATTGTAAAATCAAAAGAAGAATTGTTTTTAAAAAGATCAGACTTTAAATATCATAATCCTTTAATCATAGCAGT
CTCTGATAAAGTAAATACTCAAGATGCGGGTATAAAAGCGTATTTTAAGGCAGTGTATAATGTATTAAAAAATAAAGTAG
ATATAGGTAATATAGCTTTAGAGCTTTATAAAAAACTTCAAAATCAAAATTTGCATTTTGGTATAAATACGCTAAGCAAT
GATTTTTTGAAATATATAAAAAATGCAAATAACGATGAACTGAGAAAAAATATTTTTTATGCAAACGCAAATGCAAATTT
AGAATGTTATAGCATTAAAGGAAACGATAAAGAATTAGCTTTTAAGAGTAAAAATTCAAACAAACCTTTCATGCTTTTAA
ATATTTCAAATGCAAAAGAATGGGAAAAAGATTTTTTGCTTGAACTTGGAGTAGAAAGTATAAGCGATATATCGCAAAGT
CATTTTGAAAACATCAATAGCTCGCGATCTTCTATTAATATAATGTTAGGAAGTAAGGTTTTTTCGGAAGGTTGGGATAG
CAATCGCGTAAATTTAATTTCTTTTATCAATATAGGCAGTGTTAATGCTAAAAAATATGTTTTACAAACCATAGGAAGAG
GTGTTAGAATAGAACCTTTCTTAAATATAAGAAAGAGATTAAATGCTTTAAAAGAGATGTTTAAAATCGATGAGCGATGT
GTAAATTTAGCATGTGGTTTAGAAACTCTTTTTGTAATGGCAAGTGATAATGAAGCTATAAAAGCTATCATAGAAGGTAT
AGAATGTGAATTTATGGAAAGTAGGCATTTAAAAGGATTTAAAGAAACAAAATTGTCGTTTAATCTACCTGTGCCAAAAT
ACAAAAACGAAGCAAAACTAAAAAATATTTATAAAATTTCAGAAAAAGAAGCAAAATCTTTAAAAGAATTTATAAATTCT
TATGATGAAGATGTTTTGATTTTAGAGCAATGTTTGTATAAAAATTTTAAATATTCTACATTAGAAGAATTTTATAAATT
TAACGAAGGAAAAGAAAGTAAGATACAGTTATCAGGAGACAATGTAAAATTTAATGAAAAAACAACCTTAAAAACAATCA
ATAGTGTGTTAAATTCTAATGCTAAAGTTTTGGATAAATTTGTAAAGTTAGAAGAAGAAATAACGCACCATAGAAATATA
CAAGCAAAGTTAGATTTTGAAACCGTTCAAAAAATTAATAAGACTATAAAAGATGTTTTAAATACAAAAAGCGAAGATGA
ATTAAAAGCAGACTTTGAAAATAAAAAAATAAATTTAGATGAGCTAATGCAAGGTATAAAAGAAAGTCAAAAAAGCAAGG
AAGTGCAAAATTATATAATTAGTGCAAAACTTAGCAAGCATTATTATAACCCCTTAATCATTTACAATAAAAACGATAAA
GAAAATAAGATTAATTTTGCCATTTCCAATAAAAGTGAAAAAGAATTTTTAGAAGATTTAGAAAGTAATTTAAATTTGTC
TTTTTTTGAACAATATGAATGGTATTTTTCTAAATTGGTAGAAAATCAAGATGAAATTTATATCCCTTATTTTGATGAAG
AACAGCAAAAAGAAAGAAAATTTTATCCTGATTTTATATTTTGGTTAAAAAACAAACAAAGCGGAGATTTTTTTATATAT
TTTATAGATCCAAAAGGCTTAAAAATAGAAGATAATCCTAGATTTAAATTAAAAGGCTTTAGGGCAATATTTGAAAATAA
AAATTTAACTTATGAAGATAAAAACATAAAAATAAATTTATTTTTTTATAACAAAAATATCAACAACGCTTCAGAAGAAA
TCAAAGATTTTGTTAGATCAAATATAGAGGATATTTTCAGATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTACCACTTACAAGATGAGTAGTTGCAAGAAATTTCAGTATGTAAAAAATTCTTACATACTACAAATGATAAAAACAATT
AAAGCTTTAAAGGAAAAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAACCTTTTTAGTTTGTGCTTTAGAGCCTTCAGCAAATTTGCATTTAAAAGAAGTTTTAAAAGCTTATAAAAAAGACTTT
AGCAAATTTGAACTTCATGG

Product: putative type III restriction enzyme R protein

Products: NA

Alternate protein names: Type III Restriction R Protein; Dead/Deah Box Helicase Domain Protein; Type III Restriction Res Subunit; Type III Restriction- System Restriction Subunit; DEAD/DEAH Box Helicase Domain-Containing Protein; Type III R-M System Restriction

Number of amino acids: Translated: 947; Mature: 946

Protein sequence:

>947_residues
MAKAKQNTRTHLLLNKFIHDKSLVQKLDESYDFNNFSQAINLQFYQQESVKNALAILSFYMKDELNLHEYNQERRKLLEF
YQDESENLKLQKEHIARASFWMATGSGKTIVMIKLIALIHEFIKNNQLPKKPIMLLAPNDKILNQFKENIIKYNNHHSNF
IKIKDLKDFESIEKEASLLNEAVVYFARSDLLESEEKVGKDKKAKRLNYKNYLNKDGWYILLDEAHRGDSKTSLRKNYYH
ELARGFIKEDEFPKGFVFNFSATFEDEIDFITCAYNYNLQKFNQEGYGKDIAVLNENLDFKSENNEEAKIKTILESFIIF
NAIVKSKEELFLKRSDFKYHNPLIIAVSDKVNTQDAGIKAYFKAVYNVLKNKVDIGNIALELYKKLQNQNLHFGINTLSN
DFLKYIKNANNDELRKNIFYANANANLECYSIKGNDKELAFKSKNSNKPFMLLNISNAKEWEKDFLLELGVESISDISQS
HFENINSSRSSINIMLGSKVFSEGWDSNRVNLISFINIGSVNAKKYVLQTIGRGVRIEPFLNIRKRLNALKEMFKIDERC
VNLACGLETLFVMASDNEAIKAIIEGIECEFMESRHLKGFKETKLSFNLPVPKYKNEAKLKNIYKISEKEAKSLKEFINS
YDEDVLILEQCLYKNFKYSTLEEFYKFNEGKESKIQLSGDNVKFNEKTTLKTINSVLNSNAKVLDKFVKLEEEITHHRNI
QAKLDFETVQKINKTIKDVLNTKSEDELKADFENKKINLDELMQGIKESQKSKEVQNYIISAKLSKHYYNPLIIYNKNDK
ENKINFAISNKSEKEFLEDLESNLNLSFFEQYEWYFSKLVENQDEIYIPYFDEEQQKERKFYPDFIFWLKNKQSGDFFIY
FIDPKGLKIEDNPRFKLKGFRAIFENKNLTYEDKNIKINLFFYNKNINNASEEIKDFVRSNIEDIFR

Sequences:

>Translated_947_residues
MAKAKQNTRTHLLLNKFIHDKSLVQKLDESYDFNNFSQAINLQFYQQESVKNALAILSFYMKDELNLHEYNQERRKLLEF
YQDESENLKLQKEHIARASFWMATGSGKTIVMIKLIALIHEFIKNNQLPKKPIMLLAPNDKILNQFKENIIKYNNHHSNF
IKIKDLKDFESIEKEASLLNEAVVYFARSDLLESEEKVGKDKKAKRLNYKNYLNKDGWYILLDEAHRGDSKTSLRKNYYH
ELARGFIKEDEFPKGFVFNFSATFEDEIDFITCAYNYNLQKFNQEGYGKDIAVLNENLDFKSENNEEAKIKTILESFIIF
NAIVKSKEELFLKRSDFKYHNPLIIAVSDKVNTQDAGIKAYFKAVYNVLKNKVDIGNIALELYKKLQNQNLHFGINTLSN
DFLKYIKNANNDELRKNIFYANANANLECYSIKGNDKELAFKSKNSNKPFMLLNISNAKEWEKDFLLELGVESISDISQS
HFENINSSRSSINIMLGSKVFSEGWDSNRVNLISFINIGSVNAKKYVLQTIGRGVRIEPFLNIRKRLNALKEMFKIDERC
VNLACGLETLFVMASDNEAIKAIIEGIECEFMESRHLKGFKETKLSFNLPVPKYKNEAKLKNIYKISEKEAKSLKEFINS
YDEDVLILEQCLYKNFKYSTLEEFYKFNEGKESKIQLSGDNVKFNEKTTLKTINSVLNSNAKVLDKFVKLEEEITHHRNI
QAKLDFETVQKINKTIKDVLNTKSEDELKADFENKKINLDELMQGIKESQKSKEVQNYIISAKLSKHYYNPLIIYNKNDK
ENKINFAISNKSEKEFLEDLESNLNLSFFEQYEWYFSKLVENQDEIYIPYFDEEQQKERKFYPDFIFWLKNKQSGDFFIY
FIDPKGLKIEDNPRFKLKGFRAIFENKNLTYEDKNIKINLFFYNKNINNASEEIKDFVRSNIEDIFR
>Mature_946_residues
AKAKQNTRTHLLLNKFIHDKSLVQKLDESYDFNNFSQAINLQFYQQESVKNALAILSFYMKDELNLHEYNQERRKLLEFY
QDESENLKLQKEHIARASFWMATGSGKTIVMIKLIALIHEFIKNNQLPKKPIMLLAPNDKILNQFKENIIKYNNHHSNFI
KIKDLKDFESIEKEASLLNEAVVYFARSDLLESEEKVGKDKKAKRLNYKNYLNKDGWYILLDEAHRGDSKTSLRKNYYHE
LARGFIKEDEFPKGFVFNFSATFEDEIDFITCAYNYNLQKFNQEGYGKDIAVLNENLDFKSENNEEAKIKTILESFIIFN
AIVKSKEELFLKRSDFKYHNPLIIAVSDKVNTQDAGIKAYFKAVYNVLKNKVDIGNIALELYKKLQNQNLHFGINTLSND
FLKYIKNANNDELRKNIFYANANANLECYSIKGNDKELAFKSKNSNKPFMLLNISNAKEWEKDFLLELGVESISDISQSH
FENINSSRSSINIMLGSKVFSEGWDSNRVNLISFINIGSVNAKKYVLQTIGRGVRIEPFLNIRKRLNALKEMFKIDERCV
NLACGLETLFVMASDNEAIKAIIEGIECEFMESRHLKGFKETKLSFNLPVPKYKNEAKLKNIYKISEKEAKSLKEFINSY
DEDVLILEQCLYKNFKYSTLEEFYKFNEGKESKIQLSGDNVKFNEKTTLKTINSVLNSNAKVLDKFVKLEEEITHHRNIQ
AKLDFETVQKINKTIKDVLNTKSEDELKADFENKKINLDELMQGIKESQKSKEVQNYIISAKLSKHYYNPLIIYNKNDKE
NKINFAISNKSEKEFLEDLESNLNLSFFEQYEWYFSKLVENQDEIYIPYFDEEQQKERKFYPDFIFWLKNKQSGDFFIYF
IDPKGLKIEDNPRFKLKGFRAIFENKNLTYEDKNIKINLFFYNKNINNASEEIKDFVRSNIEDIFR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 111330; Mature: 111199

Theoretical pI: Translated: 8.38; Mature: 8.38

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAKAKQNTRTHLLLNKFIHDKSLVQKLDESYDFNNFSQAINLQFYQQESVKNALAILSFY
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH
MKDELNLHEYNQERRKLLEFYQDESENLKLQKEHIARASFWMATGSGKTIVMIKLIALIH
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHEEEEECCCCEEHHHHHHHHHH
EFIKNNQLPKKPIMLLAPNDKILNQFKENIIKYNNHHSNFIKIKDLKDFESIEKEASLLN
HHHHCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
EAVVYFARSDLLESEEKVGKDKKAKRLNYKNYLNKDGWYILLDEAHRGDSKTSLRKNYYH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHH
ELARGFIKEDEFPKGFVFNFSATFEDEIDFITCAYNYNLQKFNQEGYGKDIAVLNENLDF
HHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEECCHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCC
KSENNEEAKIKTILESFIIFNAIVKSKEELFLKRSDFKYHNPLIIAVSDKVNTQDAGIKA
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHH
YFKAVYNVLKNKVDIGNIALELYKKLQNQNLHFGINTLSNDFLKYIKNANNDELRKNIFY
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHEEE
ANANANLECYSIKGNDKELAFKSKNSNKPFMLLNISNAKEWEKDFLLELGVESISDISQS
ECCCCCEEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH
HFENINSSRSSINIMLGSKVFSEGWDSNRVNLISFINIGSVNAKKYVLQTIGRGVRIEPF
HHHHCCCCCCEEEEEECCHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCEECHH
LNIRKRLNALKEMFKIDERCVNLACGLETLFVMASDNEAIKAIIEGIECEFMESRHLKGF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCC
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HHCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHH
LEEFYKFNEGKESKIQLSGDNVKFNEKTTLKTINSVLNSNAKVLDKFVKLEEEITHHRNI
HHHHHHCCCCCCCEEEECCCCEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
QAKLDFETVQKINKTIKDVLNTKSEDELKADFENKKINLDELMQGIKESQKSKEVQNYII
EEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SAKLSKHYYNPLIIYNKNDKENKINFAISNKSEKEFLEDLESNLNLSFFEQYEWYFSKLV
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ENQDEIYIPYFDEEQQKERKFYPDFIFWLKNKQSGDFFIYFIDPKGLKIEDNPRFKLKGF
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RAIFENKNLTYEDKNIKINLFFYNKNINNASEEIKDFVRSNIEDIFR
HHHHCCCCCEEECCEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
AKAKQNTRTHLLLNKFIHDKSLVQKLDESYDFNNFSQAINLQFYQQESVKNALAILSFY
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH
MKDELNLHEYNQERRKLLEFYQDESENLKLQKEHIARASFWMATGSGKTIVMIKLIALIH
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHEEEEECCCCEEHHHHHHHHHH
EFIKNNQLPKKPIMLLAPNDKILNQFKENIIKYNNHHSNFIKIKDLKDFESIEKEASLLN
HHHHCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHEEE
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EEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SAKLSKHYYNPLIIYNKNDKENKINFAISNKSEKEFLEDLESNLNLSFFEQYEWYFSKLV
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ENQDEIYIPYFDEEQQKERKFYPDFIFWLKNKQSGDFFIYFIDPKGLKIEDNPRFKLKGF
CCCCCEEEECCCCHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEECCCCCEECCCCCEEEHHH
RAIFENKNLTYEDKNIKINLFFYNKNINNASEEIKDFVRSNIEDIFR
HHHHCCCCCEEECCEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA