Definition Yersinia pseudotuberculosis IP 31758, complete genome.
Accession NC_009708
Length 4,723,306

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The map label for this gene is 153950864

Identifier: 153950864

GI number: 153950864

Start: 1906884

End: 1909748

Strand: Direct

Name: 153950864

Synonym: YpsIP31758_1640

Alternate gene names: NA

Gene position: 1906884-1909748 (Clockwise)

Preceding gene: 153950253

Following gene: 153946836

Centisome position: 40.37

GC content: 51.27

Gene sequence:

>2865_bases
ATGGAGTATTGGCTGTTAATTTTTTTACTTATCTTCTTGTTTGTCATCTATATGCAAATAAGTGCGTTATCCAACTCGGT
AAAATATATACGAGAAGAGATAGGCAGGCTGCGCAATGAGCTTGCTCCACGCTTGCCTGAACCTACCGTGGCCACTGTTG
AGGAAGAGAACACGCCAACGCATTTGGCAGATGAAGTGGCCGTGTCCAAGGTATGGACCCCTGATTACGCAACCTATCAG
AATTATCTACTCACCAAAAAGCAAAGCCAGATTAAAGAGAAGGCTCTTGCCGATTCAGTAAAAAAAGAACCCGCCCGGCC
AATAGAATATAGGATTGCTGACCGTCTGGTGGTGCTTAAGCCACAGGATGAGGCCCCTCAAGAATCGCCGAAAATGGATG
CAGGCCCTGCCAGTGGTCATCCACAGAAACCAGACGTGTGGACAAAATTGGAAAATGTCCTGTTTTCCTTAAAATCACCG
GAGAGTTTCTGGAAACGCCTCGAGCAAGAGTTTGCCGCACGTTGGATGGTGTGGATCGGCGGTGTGATCATGGCACTGGG
TGTGATTTTCCTGCTGAAAGCAGGCAGCGAACAGGGTCTGTTCGGGCCAACCTTGCGGATTGGTACCGCCATTGTGCTGA
GTGTGCTGATGGTTGTTGGGGGGGAGTGGCTCAGGCGTTCACGTTTTCAGTTGCCCTTGGTCAATGCCGGTTATATCCCG
GCGGCGCTGAGTGGGGCCGGTATTCTCGGTCTGTTTGCCTCAATGCTGGCGGCTAAATATCTCTACGACATGTTCCCGAT
GCCCGTTCTCATGCTATTGCTCAGCCTGATTTCTCTGTTGGCGATGGTGCTGGCATTGTGGCAGGGGCCATTTATGGCGG
CCTTGGGGCTGCTTGGCGCCTATACCGTCCCGTTATTTGTTTCGACGGGCAGCGGTAATGTCACCGGGCTGTTGGCCTAC
CTGTTCCTGGTTAGTTTGGCGTCTATCGGCCTGATGAGCCGTGTCTATCGGCACTGGCTATGGCTGGGGGCGATGGTCGG
AAACTATCTATGGCTTTTGGTTTCTTTATTCATAGCAACGTCCGAACACCAGTTAGCGCGTTCACTATTCCTGCTAGCAA
CCACATACGGCTTCCTAGCCTGGCCACATCTGGGGTGGGCGCTAAAAAGCAAAATACGTTTTCGCCATAATGACTGGAAA
AACTGGCCCCCGGCTTTGCTGGATCCGTTATTAACTGGGTTGATTGCCGGGCTTTCGCTATTAGCCTTAACGTTAAGCGC
AAATCATTCGATCCTGGTCTGGAGCACGTTGGTATTCTCCTGTATTAGCCTGTTACTGATTGCCAGACGCTCACCTTCAT
TGGATTTATTTGTTCCACTGGCCGCGATATTAGCCATTTCTCCCTTTATTAATGCAGGAACGCTGTTTGAGCCAGAAACC
GTCTGGACGAGTCTGCTTGCGCTCAGCACATTAGCGCTATTCTGCGGGATATATGGTAGCTACCAGGTCACCCGGCCGGT
TTACCGCAAGCTGTGGTGGGCGTTATTGTCGGTGCTGGTGCCAATGTATCTCGTTGTAAGTACCTATTATGCCTGTCGCG
ATAATTTTGAGCTGGCTCCAGTTAAATACACACTGCTGGCGGTTTGTCTGGCTATGTATATCGCGTGGAATGCATTCAGT
GATGGGTATCGCCGTGGCTCAGCGCTGTTGCGGACGATCTATCAGGTCGCCGCCCAACTGACGTTGACCTTTGCATTATT
TATGGCTTTCAGCCAGGTTACGCTAACCCTGCTGCTCGCGGGTCAGCTTTTAGTTTTGGTACTCTGGCAACGTTGGCGAC
AGGTTTCGTTACTGTCTTGGATTTTGAAACTGCATGCGATCATACTGCTGGTTCGCCTGTCAATGAACCCGTATATCCTT
GGATATTCCTCGCCGTTGCACATTGGTTCGGTCGTTATTCCTTGGACGCTATACGGTTTTGGGATTCCGATTCTCTGCCT
GTGGCTGAGTTCACGCTGGTTACCTGCGCGTCGCGGTGAGCAGACCGCCAATTGGTTAGCGGCCAATGCTATTTATCTGT
TGGCCTTGTGGATCAACGTTGAATTACGTCACCTGCTGCATGGCAGCTATCATCTGTCGCTGGATTTCGCTTCTCTTACC
GATTGTGCGTTGCATGGGGTGACCTTCGGGCTGATGGCGCTGGCCTACGGCTATCGTGAACAGTTTGCAGATTCGCTACA
ACGGATATACCGCCTGGCGGCTAAAACCAGTGCCATTCTGATGCTCACCCTAACGTTGCTCTGCCTGGTTGTCTTTAACC
CCATCTGGTCAGCACAACAGGTTGGCGGCCTACCGCTGCTGAATATGGTGACCGTTGCCTATGCGATCCCGATGGTGTTC
ATGGTGGTAGCACTAAGATACTGGCCAGATCACTGGCTAGATATCCGTCTGAAGCCCTACGTTATCGGTGCGATTGCGCT
ACTGGGAATGGTGTTCATTACCTTGACGGTCCGCCAGCTCTGGCATGGTGACCGGTTGGATAATGATATCGTGTACAGCG
GCGAACAATACTCTTACTCCTTAGCGTGGATGTTAACTGCCATTGGCATGATGTACAGCGCAATACACTGGCCTAACTAT
AAAGTGCGCCGCGCCTCCCTGGGGTTGTTGGCGCTCACGATCGTCAAACTGTTCCTGTGGGATATGTCTGGTCTTGAAGG
GCTATATCGTTCGGTCTCATTCCTCGGTCTGGGGCTGTGTCTGGTAGCGATTGGTTGGTTCTACCAGAAGTTTGTCGTTA
TGAAGGAAGTCATTGAGCAAAACAAGGATCAGCCGACAGCGGACGTGGTACAAAGCGGGCAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGAAAAATACCTGTCAGATACTGTTTCATGCTATCCGATGAATGGATAGGGTTATCTCATAGAGAATTTTTTACTTAATA
AACGCTGAGTTGGATACATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCGCCATTTGTCTTACCGGAGCGTGCATCGACTGATGTGGGAAAATCAATATACAGCAAGGAGTCAGTGTGATTAATTTT
GTGAAGTTAATGTGTAATGT

Product: integral membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: MSF Permease

Number of amino acids: Translated: 954; Mature: 954

Protein sequence:

>954_residues
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEENTPTHLADEVAVSKVWTPDYATYQ
NYLLTKKQSQIKEKALADSVKKEPARPIEYRIADRLVVLKPQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSP
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AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTGLLAY
LFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWK
NWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET
VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAWNAFS
DGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYIL
GYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT
DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGGLPLLNMVTVAYAIPMVF
MVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNY
KVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ

Sequences:

>Translated_954_residues
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEENTPTHLADEVAVSKVWTPDYATYQ
NYLLTKKQSQIKEKALADSVKKEPARPIEYRIADRLVVLKPQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSP
ESFWKRLEQEFAARWMVWIGGVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP
AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTGLLAY
LFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWK
NWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET
VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAWNAFS
DGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYIL
GYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT
DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGGLPLLNMVTVAYAIPMVF
MVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNY
KVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ
>Mature_954_residues
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEENTPTHLADEVAVSKVWTPDYATYQ
NYLLTKKQSQIKEKALADSVKKEPARPIEYRIADRLVVLKPQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSP
ESFWKRLEQEFAARWMVWIGGVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP
AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGAYTVPLFVSTGSGNVTGLLAY
LFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIATSEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWK
NWPPALLDPLLTGLIAGLSLLALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET
VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAPVKYTLLAVCLAMYIAWNAFS
DGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLAGQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYIL
GYSSPLHIGSVVIPWTLYGFGIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT
DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQVGGLPLLNMVTVAYAIPMVF
MVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQLWHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNY
KVRRASLGLLALTIVKLFLWDMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ

Specific function: Unknown

COG id: COG5373

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 107185; Mature: 107185

Theoretical pI: Translated: 9.44; Mature: 9.44

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEENTPT
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCC
HLADEVAVSKVWTPDYATYQNYLLTKKQSQIKEKALADSVKKEPARPIEYRIADRLVVLK
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCEEEEEC
PQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSPESFWKRLEQEFAARWMVWIG
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
AALSGAGILGLFASMLAAKYLYDMFPMPVLMLLLSLISLLAMVLALWQGPFMAALGLLGA
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
YTVPLFVSTGSGNVTGLLAYLFLVSLASIGLMSRVYRHWLWLGAMVGNYLWLLVSLFIAT
HHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWKNWPPALLDPLLTGLIAGLSL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH
VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAP
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
VKYTLLAVCLAMYIAWNAFSDGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHH
GIPILCLWLSSRWLPARRGEQTANWLAANAIYLLALWINVELRHLLHGSYHLSLDFASLT
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHH
DCALHGVTFGLMALAYGYREQFADSLQRIYRLAAKTSAILMLTLTLLCLVVFNPIWSAQQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
VGGLPLLNMVTVAYAIPMVFMVVALRYWPDHWLDIRLKPYVIGAIALLGMVFITLTVRQL
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNYKVRRASLGLLALTIVKLFLW
HCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MEYWLLIFLLIFLFVIYMQISALSNSVKYIREEIGRLRNELAPRLPEPTVATVEEENTPT
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCC
HLADEVAVSKVWTPDYATYQNYLLTKKQSQIKEKALADSVKKEPARPIEYRIADRLVVLK
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCEEEEEC
PQDEAPQESPKMDAGPASGHPQKPDVWTKLENVLFSLKSPESFWKRLEQEFAARWMVWIG
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVIMALGVIFLLKAGSEQGLFGPTLRIGTAIVLSVLMVVGGEWLRRSRFQLPLVNAGYIP
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HHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SEHQLARSLFLLATTYGFLAWPHLGWALKSKIRFRHNDWKNWPPALLDPLLTGLIAGLSL
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LALTLSANHSILVWSTLVFSCISLLLIARRSPSLDLFVPLAAILAISPFINAGTLFEPET
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH
VWTSLLALSTLALFCGIYGSYQVTRPVYRKLWWALLSVLVPMYLVVSTYYACRDNFELAP
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
VKYTLLAVCLAMYIAWNAFSDGYRRGSALLRTIYQVAAQLTLTFALFMAFSQVTLTLLLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GQLLVLVLWQRWRQVSLLSWILKLHAIILLVRLSMNPYILGYSSPLHIGSVVIPWTLYGF
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
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HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WHGDRLDNDIVYSGEQYSYSLAWMLTAIGMMYSAIHWPNYKVRRASLGLLALTIVKLFLW
HCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DMSGLEGLYRSVSFLGLGLCLVAIGWFYQKFVVMKEVIEQNKDQPTADVVQSGQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA