| Definition | Yersinia pseudotuberculosis IP 31758, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009708 |
| Length | 4,723,306 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 153950152
Identifier: 153950152
GI number: 153950152
Start: 970166
End: 975730
Strand: Reverse
Name: 153950152
Synonym: YpsIP31758_0808
Alternate gene names: NA
Gene position: 975730-970166 (Counterclockwise)
Preceding gene: 153950873
Following gene: 153946855
Centisome position: 20.66
GC content: 44.37
Gene sequence:
>5565_bases ATGGACGTAGAGAATTCACTTTTTCAAGGCCGCTTATCCTTAGAAGAAAAGCTTGAGCGGGCACGCACAGAGTTATTGGA TCTTTCTGCACGAAATAAATTGCTAAATATTCCTCGGTCCAAGACAGCAAAAAGCATAGATATTATTGATGAACGCTCTG AACAGATTTATCGCCTTCTATTACAAGAAGGGAAAGCATTTACTTTCTTACCTGGGCGTAGTGGAAAAGTAAATGGGGAA ACTGAGGCGTTTCCCGAGGACGAATATACTGACTCAGATTTACAGCAACCAGAAGACGATGAGTCAGATGAGCTGCGTGC AGGGCACATCGATACGAAATTTCAAACACGTATGACCCCGAAAGGTTTACAAACACGTTTATTAGACCTCTACCACGACT CACGGACATTAGAAGAGGAGCAAGGGGTTAATATTCTGTTTTTAGCACTAGGCTCATTAAAATGGGTGGATCCAAAAAAT AAAGAAAACATCCGTTTTGCTCCATTAGTACTGTTGCCGGTGACACTAGAACGCGGTACTGCTGGAGAGCGATTTAAACT TAGGGTCAGGCAAGAGGAACTTCTGCCAAACCTATCGCTTGAGTCTTATTTGGACAAAGTCCATCAGCTTAAATTACCGA CTTTTGATATGGGAGATGACTTCGATATTGTCGGTTATATGAGTGCCATTGCTAAAGCGGTTGAAACCAAAACTGATTGG GCGGTACAAGCAAACGATATAACACTTGGTTTTTTCTCTTTTGCTAAATTTTTGATGTATCGTGACCTCGATCCTGAGAG TTGGCCAAGTGATAGCAAGATCACTGAACAGCCCATTGTTCGTGCATTGTTGTCTGACGGTTTCGAAACTTATGATACGT TGATTTCTGATGATGCTTCTATCGACCTGCACATTCAGCCAAAAGAAATGCTGCATATTGTCGATAGTGATAGCTCCCAG ACACTGGCTGTTCACGATGTGCGCAAGGGTCGAAATATTGTTATTCAAGGCCCCCCTGGTACAGGGAAATCGCAGACAAT TGCAAACGTAATTGCATCTGCAATTGCAGATGGTAAAACCGTTCTTTTTGTTGCCGAAAAAATGGCGGCGCTGGATGTAG TCAAACGACGTTTAGACCACGCGGGTGTGGGTGATGCTTGTTTAGAATTACACAGTAACAAAGCCAATAAGCGCGCTTTG CTGGATGAATTAAAACGGGTGTGGGAACTGGGTTCCCCCCGAGGTGAATTTCCAGATATCTTACTGGAGAACCTGACTGC TTCACGAGATGTTTTAAATGAACATGCTCGTCGTCTGCACGAGCAATATAATCCATCTGAGCTAACACCTTATCAGGTTA TGGGGCAACTCGTTCGCCTGCGTAGAGCAGGTCAACAACCGGTTGATATATCACTTGTCGGGGCATTGAATTGGTCAAGT AACAGCTATCATAAGCGCCTTGAGCTCTTAACCGAATTAACCCAACGTATCCATGATATTGGCTTACCAGATAAGCACCC TTGGTATGGCGTAGGTCGTGAAGAGATCCTGCCTATCGAAGTAGAACGCCTGATCCCACGATTAAGTCAGCAAAAACAAC ATGTAGAAGCCTTACAATCTGAATTAAAGAGTTTGGCGGAAACATTAGAGATATCACCAGAGCCGCAAACATTCAGTGAA TTAAACCGTCTTAAAACCGTTGCTGAAATCGTAGCGGGTGCACCATCATTATCACAAAATGCACTTACCTCCCCAGTATG GAGTTCAGACATTCAAGCGGTGCGAGAACTTATTTCTTATGGGCTACAATTTCAGCATGATGCTGCAAAGCTTACCGATG CGATAACCCCTAAGGCTATAGATATCCCATTAGATTCTTTAGATGAAGCTCTCTCCAAGCTTCCACAAGATTTTTCATAC TCCGGATTTAAAGCTGCAACGGTATTGAAAGATTTGCTCCCAAGATTGGAAACTGAAGTAAGTCGCCTCCAGAAAGAGTT AGGTACCAAAGGTGTTTACCAAACCTTTAACGATATATCACGATTAATAGCCTTGGCTGACCGGGTAGCTGATGCGCCAG AAGCCAGTTCGGATGCGTTTATTGCATCTGTCTGGGATCATGGGGTTGAGCAAGCATCAGAGCTCGTTGATGCAATTGCT ACCCTAGAATTGATAAGAGCAACATTGGATACAGAGTTGCTTGATATCGCTTGGGATACAGATGTAAAAGCGGCAAGAAT AGTATTAGCGTCTCAAACCGGACCATTGCGTTTTCTCAGTGGAGAATGGCGCAACGCCAGAGCGCTGGGGCGTTCAATTA TAAAAAACCCTAAACTCCCAATGCCAGACCTGGTAAAGCTGCTTGATGGCCTTTTGAAAGGGCAAGCGGCACTCAGTAAA ATCAAAGAGGGCAATAACTTTGGTCAATCTGCTTTTGGGGCTGACTGGAGAGGTGATCGCAGTAAAAGTGAGCCACTGAG AGCCCTTGTAGAATGGATGAGAACATTAAGAGGGTTCGGGGCAGAGCCGCGTGTATTAGTAAGCCAGTTAGCTGATCGTA ATGTCGTCAAAGCCAGAGCGACACAAGTCAATAATTTGATAGTTGAAGTTGAACCAGCATTGAACCAACTCTGGGATGCT TACTCTTTAAGAGTAAGCGATTACTTCAACGATGAATTATCAGTCGAACGAGTCATCTTGCAAAGAATAGAGGAGCAAGT AGATCATCTCATCTGGATCAATGAGCTATCTCATCAGGTGTTGCAGTCCCCTCCTCAGCGTATTGATGAGCATAGTCAAC TCATCATGCGAATTATTGAATTACAAGCACTAGCCCTGAAAATTTCTGACTATGACCAACTAGGTCGACAAGCTTTCGAT AATGTTTGGCAAGGCGTTAATTCCAACTGGGACGAATGTGAGCAAATAGCAACGTGGATCCAACAATATTCACAGTATCG TTTTCTGGCTGCAACGCTTTTCAATGAGCGTTATATGCTCATTGAATCGGTGGAACATCTGTTGAATGAACGTGAGTCGA TTTTAACAAATATTGAAAAAATATCTGATGAACTACAGGCTAAACCAGAAATACTGTTCAAATCGCCTTCTTCTGAGCTT TTGAGTATACAAAACCTATATGAAACACTTCATTCATGGCTTGTTCATTCAGAGCAATTATCCAAATGGGTCGCCTATCA GCACCGCGCAACCAATGCCCGAAACTCAGGATTAGCAGAGTTAGTTGATCGGTTATCCAGTGGTCAGCTTTCCTTAGCAG AAGCGCTACCCACCATGGAACGAGCCTATTATGAGACTATTTTGGCTTATATGGTTGAACAGGCACCTGAACTGGCTCGT TTTGATGGGGAACTTCATTCCCGATTAGCGATGGATTTCTCAACACTCGACCGACAACGTATTAAAGCCGCCAGTATCGA AGTCGTTCGTGCGCATCATCGGCGGATCCCATCCAAAGAAGGGGGGGCAGGGCCCGTTGGAATTTTACGGGGAGAAATGG CCCGCAAACGCGGACACATGCCAATACGGCAATTGATGCAGAAAGCAGGTTCTGCGATACAAGCACTTAAACCCGTTATG ATGATGAGTCCATTATCCGTAGCACAATTCCTTGTTCCGGGCAGGCAAACCTTCGACTTATTGGTCATGGATGAGGCGAG TCAAATCCAACCTGTTGATGCGATTGGTGCTATTGCTCGCTGTAAGCAAGTCGTTGTGGTTGGCGACGAGCGGCAATTAC CACCTACAAAATTCTTTGCAAAAATGACTGAGTCTAATCCTGATGACAGCGATGAAACGACCCAAGTCTCAGATATTGAA AGCATACTGGGTCTTTTCGTGGCACGAGGATTACCTCAGCGCATGTTGCGTTGGCATTACCGTAGCCGTCACCAATCATT GATTGCTGTATCAAATAGTCAGTTTTATGAAAATAAATTATTTATTGTGCCAAGTCCTTACACTCAAGAAGCCGGGATGG GATTACAGTTTTATCATATTCCTGAGGGTATTTTTGAATCTGGTGGAGCGGGAACTAATATCATTGAAGCTAAACATGTT GCGAAGGCTATCTTGCAACATGCAAAAAATAGCCCTGAGTTATCCTTAGGTATAGCCACATTCTCCGTTTCTCAGCGTAA AGCCATTCAGGATGAATTAGAAACTCTCCGCCGCTTAAATCCTGATCTAGAGAATTTTTTCTATTCCCATCCGAGCGAAC CTTTCTTCGTTAAGAACTTAGAAAACGTTCAGGGTGATGAACGTGATGTCATCATGATTTCCGTGGGATATGCCAAAAAT GCTCAAGGGTATATGGCTATGCGTTTCGGCCCATTAGGGGCAGAGGGAGGGGAACGGCGTTTGAATGTCCTTATTAGCCG GGCTAAACGCCGGTGCGAGGTCTATGCCTCAATAACAGATGAAGATATCGACCTTGAGCGGGCAAAAGGTAAAGGGGTTT TTGCCTTTAAACTATTCTTACAGTATGCGCGTACAGGACGGCTTTCAGTGGCTCAAGCAGGGCTGAGGGAAATGGACAGT GTCTTTGAAGAACAAGTTGCTGATGCTTTGCAATCTGCTGGATATCAAGTACATCCACAAGTCGGTATTGCTGGCTTTTA TATAGACCTAGGTATTGCAGATCCCGATATGCCAGGGCGATACCTCATTGGCATTGAATGTGATGGCAAATCCTACCATT CTTCACGTTCAGCCCGGGAACGTGATCGCTTACGCCAGGCTGTGCTTGAAGATCACGGGTGGATTATCCATCGCATATGG AGTACTGATTGGTTCCAAAGGCCGGATGAGCAGCTACAAAAAACACTTAATGCTATTGAATCAGCAAAAATAGAATTAGC GACCAGACTTGAACAAGGCGCAAAGTCGCGGCGGGCTGTTCCGGTAGAAATTATTACTGTTGACCGTGGTCCGATTACAG AAATTGGTCTTGTTGATGTCGATTCATCGACTCTAAGTTCCAAGGAATATATTGAAGCTAGCCCGATGAGGCATTCAGCC TATGAGTTACATGATACTCCAGTAGGTCTTTTGGCAGACTTAGTCGAGCAAATTGTGGCTATAGAATCCCCTGTTCATTT CAGTGAAGTTGTGACTCGGTTAAGGACAACATGGGGCTTACAGCGATCTGGTGCACGTATTGAAGCTGCTGTTGATCAGG CGGTATCAGTCGCCTGCTCTAAAGGAAATATTGTTAGAGAGGATTCTTTCCTTTCTATCCCTGGTTCGTCACCAGTACTG CGCAATCGTCAAGGTGTGCAGTCAGCGGGGATACGCAAACCCGAAATGATTGCGTCCCAAGAAATTGCGGCAGGGATCCG TCAAATTATAAAAAATAATTTGGGGGCTACAGACGATGAATTAGTGATAACCGTTTCACGGATGCTAGGGTTTAAATCGA CAAGTAGTACACTCAGAAAAGTGATCAGCGATATCATCGAAGAACTCGTTGCAAATGGAACGCTATACCGCGATCAAATG ATGATTGTAGAAAGTTCCAGTAACAAAGAAGCTGTACGAAGCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCCATTGGGATTTTCTTGCTGGTACCAGCACACTGGATGATACCCATCGATATATAGGCATACTGTCAAAAAAACTAACC TACTGGAATAAATAGAGATT
Downstream 100 bases:
>100_bases GCAAACATGGGCTTTATTCTTTTCTAAGCCCATATTCGCTAGATTTTCTGTACTGAAATTATGATGAAATGTAGTCGCTC AGACCTGAACTGACGGCTAC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1854; Mature: 1854
Protein sequence:
>1854_residues MDVENSLFQGRLSLEEKLERARTELLDLSARNKLLNIPRSKTAKSIDIIDERSEQIYRLLLQEGKAFTFLPGRSGKVNGE TEAFPEDEYTDSDLQQPEDDESDELRAGHIDTKFQTRMTPKGLQTRLLDLYHDSRTLEEEQGVNILFLALGSLKWVDPKN KENIRFAPLVLLPVTLERGTAGERFKLRVRQEELLPNLSLESYLDKVHQLKLPTFDMGDDFDIVGYMSAIAKAVETKTDW AVQANDITLGFFSFAKFLMYRDLDPESWPSDSKITEQPIVRALLSDGFETYDTLISDDASIDLHIQPKEMLHIVDSDSSQ TLAVHDVRKGRNIVIQGPPGTGKSQTIANVIASAIADGKTVLFVAEKMAALDVVKRRLDHAGVGDACLELHSNKANKRAL LDELKRVWELGSPRGEFPDILLENLTASRDVLNEHARRLHEQYNPSELTPYQVMGQLVRLRRAGQQPVDISLVGALNWSS NSYHKRLELLTELTQRIHDIGLPDKHPWYGVGREEILPIEVERLIPRLSQQKQHVEALQSELKSLAETLEISPEPQTFSE LNRLKTVAEIVAGAPSLSQNALTSPVWSSDIQAVRELISYGLQFQHDAAKLTDAITPKAIDIPLDSLDEALSKLPQDFSY SGFKAATVLKDLLPRLETEVSRLQKELGTKGVYQTFNDISRLIALADRVADAPEASSDAFIASVWDHGVEQASELVDAIA TLELIRATLDTELLDIAWDTDVKAARIVLASQTGPLRFLSGEWRNARALGRSIIKNPKLPMPDLVKLLDGLLKGQAALSK IKEGNNFGQSAFGADWRGDRSKSEPLRALVEWMRTLRGFGAEPRVLVSQLADRNVVKARATQVNNLIVEVEPALNQLWDA YSLRVSDYFNDELSVERVILQRIEEQVDHLIWINELSHQVLQSPPQRIDEHSQLIMRIIELQALALKISDYDQLGRQAFD NVWQGVNSNWDECEQIATWIQQYSQYRFLAATLFNERYMLIESVEHLLNERESILTNIEKISDELQAKPEILFKSPSSEL LSIQNLYETLHSWLVHSEQLSKWVAYQHRATNARNSGLAELVDRLSSGQLSLAEALPTMERAYYETILAYMVEQAPELAR FDGELHSRLAMDFSTLDRQRIKAASIEVVRAHHRRIPSKEGGAGPVGILRGEMARKRGHMPIRQLMQKAGSAIQALKPVM MMSPLSVAQFLVPGRQTFDLLVMDEASQIQPVDAIGAIARCKQVVVVGDERQLPPTKFFAKMTESNPDDSDETTQVSDIE SILGLFVARGLPQRMLRWHYRSRHQSLIAVSNSQFYENKLFIVPSPYTQEAGMGLQFYHIPEGIFESGGAGTNIIEAKHV AKAILQHAKNSPELSLGIATFSVSQRKAIQDELETLRRLNPDLENFFYSHPSEPFFVKNLENVQGDERDVIMISVGYAKN AQGYMAMRFGPLGAEGGERRLNVLISRAKRRCEVYASITDEDIDLERAKGKGVFAFKLFLQYARTGRLSVAQAGLREMDS VFEEQVADALQSAGYQVHPQVGIAGFYIDLGIADPDMPGRYLIGIECDGKSYHSSRSARERDRLRQAVLEDHGWIIHRIW STDWFQRPDEQLQKTLNAIESAKIELATRLEQGAKSRRAVPVEIITVDRGPITEIGLVDVDSSTLSSKEYIEASPMRHSA YELHDTPVGLLADLVEQIVAIESPVHFSEVVTRLRTTWGLQRSGARIEAAVDQAVSVACSKGNIVREDSFLSIPGSSPVL RNRQGVQSAGIRKPEMIASQEIAAGIRQIIKNNLGATDDELVITVSRMLGFKSTSSTLRKVISDIIEELVANGTLYRDQM MIVESSSNKEAVRS
Sequences:
>Translated_1854_residues MDVENSLFQGRLSLEEKLERARTELLDLSARNKLLNIPRSKTAKSIDIIDERSEQIYRLLLQEGKAFTFLPGRSGKVNGE TEAFPEDEYTDSDLQQPEDDESDELRAGHIDTKFQTRMTPKGLQTRLLDLYHDSRTLEEEQGVNILFLALGSLKWVDPKN KENIRFAPLVLLPVTLERGTAGERFKLRVRQEELLPNLSLESYLDKVHQLKLPTFDMGDDFDIVGYMSAIAKAVETKTDW AVQANDITLGFFSFAKFLMYRDLDPESWPSDSKITEQPIVRALLSDGFETYDTLISDDASIDLHIQPKEMLHIVDSDSSQ TLAVHDVRKGRNIVIQGPPGTGKSQTIANVIASAIADGKTVLFVAEKMAALDVVKRRLDHAGVGDACLELHSNKANKRAL LDELKRVWELGSPRGEFPDILLENLTASRDVLNEHARRLHEQYNPSELTPYQVMGQLVRLRRAGQQPVDISLVGALNWSS NSYHKRLELLTELTQRIHDIGLPDKHPWYGVGREEILPIEVERLIPRLSQQKQHVEALQSELKSLAETLEISPEPQTFSE LNRLKTVAEIVAGAPSLSQNALTSPVWSSDIQAVRELISYGLQFQHDAAKLTDAITPKAIDIPLDSLDEALSKLPQDFSY SGFKAATVLKDLLPRLETEVSRLQKELGTKGVYQTFNDISRLIALADRVADAPEASSDAFIASVWDHGVEQASELVDAIA TLELIRATLDTELLDIAWDTDVKAARIVLASQTGPLRFLSGEWRNARALGRSIIKNPKLPMPDLVKLLDGLLKGQAALSK IKEGNNFGQSAFGADWRGDRSKSEPLRALVEWMRTLRGFGAEPRVLVSQLADRNVVKARATQVNNLIVEVEPALNQLWDA YSLRVSDYFNDELSVERVILQRIEEQVDHLIWINELSHQVLQSPPQRIDEHSQLIMRIIELQALALKISDYDQLGRQAFD NVWQGVNSNWDECEQIATWIQQYSQYRFLAATLFNERYMLIESVEHLLNERESILTNIEKISDELQAKPEILFKSPSSEL LSIQNLYETLHSWLVHSEQLSKWVAYQHRATNARNSGLAELVDRLSSGQLSLAEALPTMERAYYETILAYMVEQAPELAR FDGELHSRLAMDFSTLDRQRIKAASIEVVRAHHRRIPSKEGGAGPVGILRGEMARKRGHMPIRQLMQKAGSAIQALKPVM MMSPLSVAQFLVPGRQTFDLLVMDEASQIQPVDAIGAIARCKQVVVVGDERQLPPTKFFAKMTESNPDDSDETTQVSDIE SILGLFVARGLPQRMLRWHYRSRHQSLIAVSNSQFYENKLFIVPSPYTQEAGMGLQFYHIPEGIFESGGAGTNIIEAKHV AKAILQHAKNSPELSLGIATFSVSQRKAIQDELETLRRLNPDLENFFYSHPSEPFFVKNLENVQGDERDVIMISVGYAKN AQGYMAMRFGPLGAEGGERRLNVLISRAKRRCEVYASITDEDIDLERAKGKGVFAFKLFLQYARTGRLSVAQAGLREMDS VFEEQVADALQSAGYQVHPQVGIAGFYIDLGIADPDMPGRYLIGIECDGKSYHSSRSARERDRLRQAVLEDHGWIIHRIW STDWFQRPDEQLQKTLNAIESAKIELATRLEQGAKSRRAVPVEIITVDRGPITEIGLVDVDSSTLSSKEYIEASPMRHSA YELHDTPVGLLADLVEQIVAIESPVHFSEVVTRLRTTWGLQRSGARIEAAVDQAVSVACSKGNIVREDSFLSIPGSSPVL RNRQGVQSAGIRKPEMIASQEIAAGIRQIIKNNLGATDDELVITVSRMLGFKSTSSTLRKVISDIIEELVANGTLYRDQM MIVESSSNKEAVRS >Mature_1854_residues MDVENSLFQGRLSLEEKLERARTELLDLSARNKLLNIPRSKTAKSIDIIDERSEQIYRLLLQEGKAFTFLPGRSGKVNGE TEAFPEDEYTDSDLQQPEDDESDELRAGHIDTKFQTRMTPKGLQTRLLDLYHDSRTLEEEQGVNILFLALGSLKWVDPKN KENIRFAPLVLLPVTLERGTAGERFKLRVRQEELLPNLSLESYLDKVHQLKLPTFDMGDDFDIVGYMSAIAKAVETKTDW AVQANDITLGFFSFAKFLMYRDLDPESWPSDSKITEQPIVRALLSDGFETYDTLISDDASIDLHIQPKEMLHIVDSDSSQ TLAVHDVRKGRNIVIQGPPGTGKSQTIANVIASAIADGKTVLFVAEKMAALDVVKRRLDHAGVGDACLELHSNKANKRAL LDELKRVWELGSPRGEFPDILLENLTASRDVLNEHARRLHEQYNPSELTPYQVMGQLVRLRRAGQQPVDISLVGALNWSS NSYHKRLELLTELTQRIHDIGLPDKHPWYGVGREEILPIEVERLIPRLSQQKQHVEALQSELKSLAETLEISPEPQTFSE LNRLKTVAEIVAGAPSLSQNALTSPVWSSDIQAVRELISYGLQFQHDAAKLTDAITPKAIDIPLDSLDEALSKLPQDFSY SGFKAATVLKDLLPRLETEVSRLQKELGTKGVYQTFNDISRLIALADRVADAPEASSDAFIASVWDHGVEQASELVDAIA TLELIRATLDTELLDIAWDTDVKAARIVLASQTGPLRFLSGEWRNARALGRSIIKNPKLPMPDLVKLLDGLLKGQAALSK IKEGNNFGQSAFGADWRGDRSKSEPLRALVEWMRTLRGFGAEPRVLVSQLADRNVVKARATQVNNLIVEVEPALNQLWDA YSLRVSDYFNDELSVERVILQRIEEQVDHLIWINELSHQVLQSPPQRIDEHSQLIMRIIELQALALKISDYDQLGRQAFD NVWQGVNSNWDECEQIATWIQQYSQYRFLAATLFNERYMLIESVEHLLNERESILTNIEKISDELQAKPEILFKSPSSEL LSIQNLYETLHSWLVHSEQLSKWVAYQHRATNARNSGLAELVDRLSSGQLSLAEALPTMERAYYETILAYMVEQAPELAR FDGELHSRLAMDFSTLDRQRIKAASIEVVRAHHRRIPSKEGGAGPVGILRGEMARKRGHMPIRQLMQKAGSAIQALKPVM MMSPLSVAQFLVPGRQTFDLLVMDEASQIQPVDAIGAIARCKQVVVVGDERQLPPTKFFAKMTESNPDDSDETTQVSDIE SILGLFVARGLPQRMLRWHYRSRHQSLIAVSNSQFYENKLFIVPSPYTQEAGMGLQFYHIPEGIFESGGAGTNIIEAKHV AKAILQHAKNSPELSLGIATFSVSQRKAIQDELETLRRLNPDLENFFYSHPSEPFFVKNLENVQGDERDVIMISVGYAKN AQGYMAMRFGPLGAEGGERRLNVLISRAKRRCEVYASITDEDIDLERAKGKGVFAFKLFLQYARTGRLSVAQAGLREMDS VFEEQVADALQSAGYQVHPQVGIAGFYIDLGIADPDMPGRYLIGIECDGKSYHSSRSARERDRLRQAVLEDHGWIIHRIW STDWFQRPDEQLQKTLNAIESAKIELATRLEQGAKSRRAVPVEIITVDRGPITEIGLVDVDSSTLSSKEYIEASPMRHSA YELHDTPVGLLADLVEQIVAIESPVHFSEVVTRLRTTWGLQRSGARIEAAVDQAVSVACSKGNIVREDSFLSIPGSSPVL RNRQGVQSAGIRKPEMIASQEIAAGIRQIIKNNLGATDDELVITVSRMLGFKSTSSTLRKVISDIIEELVANGTLYRDQM MIVESSSNKEAVRS
Specific function: Unknown
COG id: COG1112
COG function: function code L; Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the DNA2/NAM7 helicase family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 207910; Mature: 207910
Theoretical pI: Translated: 5.32; Mature: 5.32
Prosite motif: PS00018 EF_HAND_1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDVENSLFQGRLSLEEKLERARTELLDLSARNKLLNIPRSKTAKSIDIIDERSEQIYRLL CCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LQEGKAFTFLPGRSGKVNGETEAFPEDEYTDSDLQQPEDDESDELRAGHIDTKFQTRMTP HHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCC KGLQTRLLDLYHDSRTLEEEQGVNILFLALGSLKWVDPKNKENIRFAPLVLLPVTLERGT HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCEEEEEEECCEEECCCCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCC AGERFKLRVRQEELLPNLSLESYLDKVHQLKLPTFDMGDDFDIVGYMSAIAKAVETKTDW CCCCEEEEEEHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC AVQANDITLGFFSFAKFLMYRDLDPESWPSDSKITEQPIVRALLSDGFETYDTLISDDAS EEEECCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCC IDLHIQPKEMLHIVDSDSSQTLAVHDVRKGRNIVIQGPPGTGKSQTIANVIASAIADGKT EEEEECHHHHHEEECCCCCCEEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCE VLFVAEKMAALDVVKRRLDHAGVGDACLELHSNKANKRALLDELKRVWELGSPRGEFPDI EEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH LLENLTASRDVLNEHARRLHEQYNPSELTPYQVMGQLVRLRRAGQQPVDISLVGALNWSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCC NSYHKRLELLTELTQRIHDIGLPDKHPWYGVGREEILPIEVERLIPRLSQQKQHVEALQS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELKSLAETLEISPEPQTFSELNRLKTVAEIVAGAPSLSQNALTSPVWSSDIQAVRELISY HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH GLQFQHDAAKLTDAITPKAIDIPLDSLDEALSKLPQDFSYSGFKAATVLKDLLPRLETEV CCCCCCHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH SRLQKELGTKGVYQTFNDISRLIALADRVADAPEASSDAFIASVWDHGVEQASELVDAIA HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLELIRATLDTELLDIAWDTDVKAARIVLASQTGPLRFLSGEWRNARALGRSIIKNPKLP HHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEEEECCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCC MPDLVKLLDGLLKGQAALSKIKEGNNFGQSAFGADWRGDRSKSEPLRALVEWMRTLRGFG CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC AEPRVLVSQLADRNVVKARATQVNNLIVEVEPALNQLWDAYSLRVSDYFNDELSVERVIL CCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCEEEEECHHHHHHHHHHHEEHHHHCCCHHHHHHHHH QRIEEQVDHLIWINELSHQVLQSPPQRIDEHSQLIMRIIELQALALKISDYDQLGRQAFD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHH NVWQGVNSNWDECEQIATWIQQYSQYRFLAATLFNERYMLIESVEHLLNERESILTNIEK HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISDELQAKPEILFKSPSSELLSIQNLYETLHSWLVHSEQLSKWVAYQHRATNARNSGLAE HHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHH LVDRLSSGQLSLAEALPTMERAYYETILAYMVEQAPELARFDGELHSRLAMDFSTLDRQR HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKAASIEVVRAHHRRIPSKEGGAGPVGILRGEMARKRGHMPIRQLMQKAGSAIQALKPVM HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MMSPLSVAQFLVPGRQTFDLLVMDEASQIQPVDAIGAIARCKQVVVVGDERQLPPTKFFA HHCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCHHHHHH KMTESNPDDSDETTQVSDIESILGLFVARGLPQRMLRWHYRSRHQSLIAVSNSQFYENKL HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCEE FIVPSPYTQEAGMGLQFYHIPEGIFESGGAGTNIIEAKHVAKAILQHAKNSPELSLGIAT EEECCCCCHHCCCCEEEEECCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEE FSVSQRKAIQDELETLRRLNPDLENFFYSHPSEPFFVKNLENVQGDERDVIMISVGYAKN ECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCEECCCHHHCCCCCCCEEEEEECCCCC AQGYMAMRFGPLGAEGGERRLNVLISRAKRRCEVYASITDEDIDLERAKGKGVFAFKLFL CCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHH QYARTGRLSVAQAGLREMDSVFEEQVADALQSAGYQVHPQVGIAGFYIDLGIADPDMPGR HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCC YLIGIECDGKSYHSSRSARERDRLRQAVLEDHGWIIHRIWSTDWFQRPDEQLQKTLNAIE EEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCHHHCCCHHHHHHHHHHHH SAKIELATRLEQGAKSRRAVPVEIITVDRGPITEIGLVDVDSSTLSSKEYIEASPMRHSA HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEECCCHHCCCHHHHHCCCCCCCC YELHDTPVGLLADLVEQIVAIESPVHFSEVVTRLRTTWGLQRSGARIEAAVDQAVSVACS HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHC KGNIVREDSFLSIPGSSPVLRNRQGVQSAGIRKPEMIASQEIAAGIRQIIKNNLGATDDE CCCEEECCCEEECCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH LVITVSRMLGFKSTSSTLRKVISDIIEELVANGTLYRDQMMIVESSSNKEAVRS HHEEHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECEEEEEECCCCHHHHCC >Mature Secondary Structure MDVENSLFQGRLSLEEKLERARTELLDLSARNKLLNIPRSKTAKSIDIIDERSEQIYRLL CCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LQEGKAFTFLPGRSGKVNGETEAFPEDEYTDSDLQQPEDDESDELRAGHIDTKFQTRMTP HHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCC KGLQTRLLDLYHDSRTLEEEQGVNILFLALGSLKWVDPKNKENIRFAPLVLLPVTLERGT HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCEEEEEEECCEEECCCCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCC AGERFKLRVRQEELLPNLSLESYLDKVHQLKLPTFDMGDDFDIVGYMSAIAKAVETKTDW CCCCEEEEEEHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC AVQANDITLGFFSFAKFLMYRDLDPESWPSDSKITEQPIVRALLSDGFETYDTLISDDAS EEEECCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCC IDLHIQPKEMLHIVDSDSSQTLAVHDVRKGRNIVIQGPPGTGKSQTIANVIASAIADGKT EEEEECHHHHHEEECCCCCCEEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCE VLFVAEKMAALDVVKRRLDHAGVGDACLELHSNKANKRALLDELKRVWELGSPRGEFPDI EEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH LLENLTASRDVLNEHARRLHEQYNPSELTPYQVMGQLVRLRRAGQQPVDISLVGALNWSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCC NSYHKRLELLTELTQRIHDIGLPDKHPWYGVGREEILPIEVERLIPRLSQQKQHVEALQS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELKSLAETLEISPEPQTFSELNRLKTVAEIVAGAPSLSQNALTSPVWSSDIQAVRELISY HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH GLQFQHDAAKLTDAITPKAIDIPLDSLDEALSKLPQDFSYSGFKAATVLKDLLPRLETEV CCCCCCHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH SRLQKELGTKGVYQTFNDISRLIALADRVADAPEASSDAFIASVWDHGVEQASELVDAIA HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLELIRATLDTELLDIAWDTDVKAARIVLASQTGPLRFLSGEWRNARALGRSIIKNPKLP HHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEEEECCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCC MPDLVKLLDGLLKGQAALSKIKEGNNFGQSAFGADWRGDRSKSEPLRALVEWMRTLRGFG CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC AEPRVLVSQLADRNVVKARATQVNNLIVEVEPALNQLWDAYSLRVSDYFNDELSVERVIL CCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCEEEEECHHHHHHHHHHHEEHHHHCCCHHHHHHHHH QRIEEQVDHLIWINELSHQVLQSPPQRIDEHSQLIMRIIELQALALKISDYDQLGRQAFD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHH NVWQGVNSNWDECEQIATWIQQYSQYRFLAATLFNERYMLIESVEHLLNERESILTNIEK HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISDELQAKPEILFKSPSSELLSIQNLYETLHSWLVHSEQLSKWVAYQHRATNARNSGLAE HHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHH LVDRLSSGQLSLAEALPTMERAYYETILAYMVEQAPELARFDGELHSRLAMDFSTLDRQR HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKAASIEVVRAHHRRIPSKEGGAGPVGILRGEMARKRGHMPIRQLMQKAGSAIQALKPVM HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MMSPLSVAQFLVPGRQTFDLLVMDEASQIQPVDAIGAIARCKQVVVVGDERQLPPTKFFA HHCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCHHHHHH KMTESNPDDSDETTQVSDIESILGLFVARGLPQRMLRWHYRSRHQSLIAVSNSQFYENKL HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCEE FIVPSPYTQEAGMGLQFYHIPEGIFESGGAGTNIIEAKHVAKAILQHAKNSPELSLGIAT EEECCCCCHHCCCCEEEEECCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEE FSVSQRKAIQDELETLRRLNPDLENFFYSHPSEPFFVKNLENVQGDERDVIMISVGYAKN ECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCEECCCHHHCCCCCCCEEEEEECCCCC AQGYMAMRFGPLGAEGGERRLNVLISRAKRRCEVYASITDEDIDLERAKGKGVFAFKLFL CCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHH QYARTGRLSVAQAGLREMDSVFEEQVADALQSAGYQVHPQVGIAGFYIDLGIADPDMPGR HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCC YLIGIECDGKSYHSSRSARERDRLRQAVLEDHGWIIHRIWSTDWFQRPDEQLQKTLNAIE EEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCHHHCCCHHHHHHHHHHHH SAKIELATRLEQGAKSRRAVPVEIITVDRGPITEIGLVDVDSSTLSSKEYIEASPMRHSA HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEECCCHHCCCHHHHHCCCCCCCC YELHDTPVGLLADLVEQIVAIESPVHFSEVVTRLRTTWGLQRSGARIEAAVDQAVSVACS HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHC KGNIVREDSFLSIPGSSPVLRNRQGVQSAGIRKPEMIASQEIAAGIRQIIKNNLGATDDE CCCEEECCCEEECCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH LVITVSRMLGFKSTSSTLRKVISDIIEELVANGTLYRDQMMIVESSSNKEAVRS HHEEHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECEEEEEECCCCHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7569993; 1945886; 8253680 [H]