Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 153937801

Identifier: 153937801

GI number: 153937801

Start: 3106437

End: 3107888

Strand: Direct

Name: 153937801

Synonym: CLC_2949

Alternate gene names: NA

Gene position: 3106437-3107888 (Clockwise)

Preceding gene: 153935293

Following gene: 153936571

Centisome position: 82.61

GC content: 23.07

Gene sequence:

>1452_bases
ATGAAAAAAAAATTTATATTTAGATTTACTACTTTTATAATAATACTATTGCTTATTATATCTATAATAACTCCTGTATT
TATAATAAAAACTGGTCATCGTGAAAAATTGATTGAAGGCTTATATAAACATGAAGAGAACTCATATGATGTTGTATTAT
TAGGCTCAAGTCATATGAATGGTTCCATAAATCCCAATATCCTATGGAAGGAACATGGCATAACTAGCTTTAATTATGGA
ACTGGAGGCCAACCAATAGATGTAACTTACTATTTATTAAAAGAAATATTAAAAAAACAAGATAATCCAATTGTTGTAAT
TGATTTATATTATCTAGGATTAACAGATGAATTTGGTAAAGATGAGTATATTAGATATGTTCTTGATAATATGAAATTTT
CTATTAATAAAATAAAAGCTATTATTAATACTACACCTAAAAATCAATGGGTAGATTATTTTTTCCCAATTTTAAAATAT
CATTCTAGATGGAAAGAATTAAAAGAAAATGATTTTAAATTTGATACTAAAAGTAGTTATTATGCAAAAGGATTTAGCGC
TGGACGTAATAAATACAATAAGGAAAATCTATCAAACACTACTACAAATGAAAAATCAGATTTGCCACCTAAATCAAAAG
ATTATCTATACAAAATTATTAATTTATCCAAAAAAGAAAACTTTAAGCTAGTATTTACTAATGCACCACATGATTATACA
AGTACAAATGCTTTAGATAACTGGCATAAAGAACCTGCGAAAATGTTTAACGAAGTAGCAGAAATTGCAAAGAAAAATAA
TATTCCTTTTATAAATTATTGTGATATGATTGATGAAATAAATTTTGATTTTAAATCAGATATGAATAATGAAGGCCATG
TAAATATTTGGGGAGCAGATAAACTGTCAACACATTTAGGAAATTTTTTAAAAGAAAATTACGAACTAAAAGATCACCGT
AATGACGATAAATATAAGCAATGGAATCTAGATTATAGTTATTATTCTCAAGTACAGAAATATAATAATCTAGTTTCAGA
AAAAAATGTAAATAAATACATTGCTTTACTTAAAAATGAAAATTATATTGTAAATATAAGCTGTAATAATTATAATTCAG
CAAATATAAACACTTCTATAGATAAAGATCTAAGAGAACATTTAGGTATAAAAATAAACTCAACCAATAGTAATAATTAT
ATTGCTATTATAAATAATAATAAAGTAGTATTAGAAGAACAAAGTAATTCTATACTTTCTAAAGAACTCTGCTTAGAAAA
TAATATTTTGTTAAAAACTACAACCTCGAGTGATAAAAATATACCAAGTGTAATATTTAACGGAAAAGAATATTCAAATA
AATATAATAAATTTAATATTGTTGTTTATGATAAAGTATTAAATAAGGTTATAGATAATGTATACTTATCTGATAATTTA
ATTATTAGATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATTTATCTGCTATTTGCTTTATATTAATATTGGGTATATATGGAGCAGGGTATGATGCCAATCAATTTATTTATTTTC
AGTTTTAAGGAGGATCAGCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTTATATTTAAAACCCTTTAGAAGTAATCCCTGTAACTAAGAATTTTAAAATATTGTAAAAGTTTATAAATCTATAAATT
CAAAAGAGATTAGATACATA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 483; Mature: 483

Protein sequence:

>483_residues
MKKKFIFRFTTFIIILLLIISIITPVFIIKTGHREKLIEGLYKHEENSYDVVLLGSSHMNGSINPNILWKEHGITSFNYG
TGGQPIDVTYYLLKEILKKQDNPIVVIDLYYLGLTDEFGKDEYIRYVLDNMKFSINKIKAIINTTPKNQWVDYFFPILKY
HSRWKELKENDFKFDTKSSYYAKGFSAGRNKYNKENLSNTTTNEKSDLPPKSKDYLYKIINLSKKENFKLVFTNAPHDYT
STNALDNWHKEPAKMFNEVAEIAKKNNIPFINYCDMIDEINFDFKSDMNNEGHVNIWGADKLSTHLGNFLKENYELKDHR
NDDKYKQWNLDYSYYSQVQKYNNLVSEKNVNKYIALLKNENYIVNISCNNYNSANINTSIDKDLREHLGIKINSTNSNNY
IAIINNNKVVLEEQSNSILSKELCLENNILLKTTTSSDKNIPSVIFNGKEYSNKYNKFNIVVYDKVLNKVIDNVYLSDNL
IIR

Sequences:

>Translated_483_residues
MKKKFIFRFTTFIIILLLIISIITPVFIIKTGHREKLIEGLYKHEENSYDVVLLGSSHMNGSINPNILWKEHGITSFNYG
TGGQPIDVTYYLLKEILKKQDNPIVVIDLYYLGLTDEFGKDEYIRYVLDNMKFSINKIKAIINTTPKNQWVDYFFPILKY
HSRWKELKENDFKFDTKSSYYAKGFSAGRNKYNKENLSNTTTNEKSDLPPKSKDYLYKIINLSKKENFKLVFTNAPHDYT
STNALDNWHKEPAKMFNEVAEIAKKNNIPFINYCDMIDEINFDFKSDMNNEGHVNIWGADKLSTHLGNFLKENYELKDHR
NDDKYKQWNLDYSYYSQVQKYNNLVSEKNVNKYIALLKNENYIVNISCNNYNSANINTSIDKDLREHLGIKINSTNSNNY
IAIINNNKVVLEEQSNSILSKELCLENNILLKTTTSSDKNIPSVIFNGKEYSNKYNKFNIVVYDKVLNKVIDNVYLSDNL
IIR
>Mature_483_residues
MKKKFIFRFTTFIIILLLIISIITPVFIIKTGHREKLIEGLYKHEENSYDVVLLGSSHMNGSINPNILWKEHGITSFNYG
TGGQPIDVTYYLLKEILKKQDNPIVVIDLYYLGLTDEFGKDEYIRYVLDNMKFSINKIKAIINTTPKNQWVDYFFPILKY
HSRWKELKENDFKFDTKSSYYAKGFSAGRNKYNKENLSNTTTNEKSDLPPKSKDYLYKIINLSKKENFKLVFTNAPHDYT
STNALDNWHKEPAKMFNEVAEIAKKNNIPFINYCDMIDEINFDFKSDMNNEGHVNIWGADKLSTHLGNFLKENYELKDHR
NDDKYKQWNLDYSYYSQVQKYNNLVSEKNVNKYIALLKNENYIVNISCNNYNSANINTSIDKDLREHLGIKINSTNSNNY
IAIINNNKVVLEEQSNSILSKELCLENNILLKTTTSSDKNIPSVIFNGKEYSNKYNKFNIVVYDKVLNKVIDNVYLSDNL
IIR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56503; Mature: 56503

Theoretical pI: Translated: 8.98; Mature: 8.98

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKKFIFRFTTFIIILLLIISIITPVFIIKTGHREKLIEGLYKHEENSYDVVLLGSSHMN
CCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCC
GSINPNILWKEHGITSFNYGTGGQPIDVTYYLLKEILKKQDNPIVVIDLYYLGLTDEFGK
CCCCCCEEEECCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCC
DEYIRYVLDNMKFSINKIKAIINTTPKNQWVDYFFPILKYHSRWKELKENDFKFDTKSSY
HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCH
YAKGFSAGRNKYNKENLSNTTTNEKSDLPPKSKDYLYKIINLSKKENFKLVFTNAPHDYT
HHCCHHHHCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCC
STNALDNWHKEPAKMFNEVAEIAKKNNIPFINYCDMIDEINFDFKSDMNNEGHVNIWGAD
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHCCCCHHCCCCCCCEEEEEECH
KLSTHLGNFLKENYELKDHRNDDKYKQWNLDYSYYSQVQKYNNLVSEKNVNKYIALLKNE
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECC
NYIVNISCNNYNSANINTSIDKDLREHLGIKINSTNSNNYIAIINNNKVVLEEQSNSILS
CEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCHHH
KELCLENNILLKTTTSSDKNIPSVIFNGKEYSNKYNKFNIVVYDKVLNKVIDNVYLSDNL
HHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCEEEECCHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHCEEECCCE
IIR
EEC
>Mature Secondary Structure
MKKKFIFRFTTFIIILLLIISIITPVFIIKTGHREKLIEGLYKHEENSYDVVLLGSSHMN
CCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCC
GSINPNILWKEHGITSFNYGTGGQPIDVTYYLLKEILKKQDNPIVVIDLYYLGLTDEFGK
CCCCCCEEEECCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCC
DEYIRYVLDNMKFSINKIKAIINTTPKNQWVDYFFPILKYHSRWKELKENDFKFDTKSSY
HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCH
YAKGFSAGRNKYNKENLSNTTTNEKSDLPPKSKDYLYKIINLSKKENFKLVFTNAPHDYT
HHCCHHHHCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCC
STNALDNWHKEPAKMFNEVAEIAKKNNIPFINYCDMIDEINFDFKSDMNNEGHVNIWGAD
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHCCCCHHCCCCCCCEEEEEECH
KLSTHLGNFLKENYELKDHRNDDKYKQWNLDYSYYSQVQKYNNLVSEKNVNKYIALLKNE
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECC
NYIVNISCNNYNSANINTSIDKDLREHLGIKINSTNSNNYIAIINNNKVVLEEQSNSILS
CEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCHHH
KELCLENNILLKTTTSSDKNIPSVIFNGKEYSNKYNKFNIVVYDKVLNKVIDNVYLSDNL
HHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCEEEECCHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHCEEECCCE
IIR
EEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA