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The map label for this gene is dinF [C]

Identifier: 153936130

GI number: 153936130

Start: 2865140

End: 2866510

Strand: Direct

Name: dinF [C]

Synonym: CLC_2716

Alternate gene names: 153936130

Gene position: 2865140-2866510 (Clockwise)

Preceding gene: 153934979

Following gene: 258676989

Centisome position: 76.19

GC content: 29.25

Gene sequence:

>1371_bases
ATGAATAAAAATCGTGAAGAATTAATTAATGGTAATATGTTTACATTGCTTTTAAAACTTTCTATTCCAGGCATTATAGG
AATGCTAGTCATAGGTTTATACAATTTATGTGATGCTATTTTTGTTGGAAAGTTAGTAGGAGAAACTGCCTTAGCTGCTG
TAAGCATATCTTCTCCATTTACTTTTATAAACAATTGTATTGCTGTACTTGTAGGTGTTGGTTCATCTTCAATTTTATCT
AGAGCTATTGGAGCAAAAGATGATAAAGTTGTTAATGAAATTTTAGCTAATTTAATACTATCTGTATTAGTATTATCATT
AACTGTAACTGTATTAGGATGCTTTTTTTCAGAAAACTTGCTTAGATTTTCAGGGGCTAAAGGAGAAATATTACAATCAG
GCATAAACTATTTAAGAATAGTTTATATTGGCTCATTCTTTGTTAATTTTTCACAAAGTGCTAATATGCTCATAAGAGGG
GAAGGTAAGATGAAAGAAGCTATGGGTATTATGGCATTAGGTGCAGTATTAAATATTATTTTAGATCCAATATTTATAAA
AACTTTAAATTTTGGTGTTGAAGGCGCAGCTATTGCTACCGTAATTGCACAAATAATTCAAGCCTTAGTCACATTTATGT
ACTTTAAATGTAATAAATCAATATTATCAGTAACCAAATTAAAATTTGCTTTTGATTTAATGCCAGAGATATTATCTGTA
GGAGGCTCAGCTGCAATGATGCAACTTATGTATCTAGTGCAACAAACTGCTCTATACAAGCTTATCTCAATATATGGAGG
AGATGACCAATTAGTTTTAATGGGTGTAGCTCTTAGAATTTTAATGTTTACATTTATACCTATCTGGGGAATCGGTCAAG
GACTCCAACCTATAGTAGGAATGAATTTTGGAGCTAAAAAATATGATCGTGTTAAAGATGCTGTTAAAATCTTTAGTATA
GCATCTACTATCTTTATTGGAGTATTATGGGGTTTCTATATGCTTAAACCTAGAGTTGTTTTAAGTTGGTTTATTAATGA
TAGAACTATAATTGAAAATGGATACGAATTTTTTAGACTTATGTTCTTAACTTTCCCAGTATCAGGACTTATAGTTATGT
CTATGACATTTTTCCAATCAATAGGTAAAGGCGGAAAATCTGCACTAATAACTGTTTTAAAGCAAGTAATACTCTTCATG
CCTATAGCTATAATTCTTACTAAAATTATAGGAATAAAAGGAACATGGTTAGCCTCTTCAGTTACTGATGCAATAGTATT
TGTACTTTCTTTTGTTCTTTTAGCTATTGAATTCAAAAAATTATATGATATAAATTCTTCAGAAAATCAAAATATAACTT
ATATTAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCCATTGATATTAAAGGAGGCAGATAAAAATATAAGCAATTGATCACAAAATTATTAGTACTCACTATCATAAAATAATT
TTAAAAAAGGAAGGATATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATCAATGAAGAATATATATTTAAATAAAAGGTGACTCATATACTATGCCACCTTTTATTTTTGCTTATTTTTATTTGTA
TTAATAAATAAGACTTTTGC

Product: MATE efflux family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 456; Mature: 456

Protein sequence:

>456_residues
MNKNREELINGNMFTLLLKLSIPGIIGMLVIGLYNLCDAIFVGKLVGETALAAVSISSPFTFINNCIAVLVGVGSSSILS
RAIGAKDDKVVNEILANLILSVLVLSLTVTVLGCFFSENLLRFSGAKGEILQSGINYLRIVYIGSFFVNFSQSANMLIRG
EGKMKEAMGIMALGAVLNIILDPIFIKTLNFGVEGAAIATVIAQIIQALVTFMYFKCNKSILSVTKLKFAFDLMPEILSV
GGSAAMMQLMYLVQQTALYKLISIYGGDDQLVLMGVALRILMFTFIPIWGIGQGLQPIVGMNFGAKKYDRVKDAVKIFSI
ASTIFIGVLWGFYMLKPRVVLSWFINDRTIIENGYEFFRLMFLTFPVSGLIVMSMTFFQSIGKGGKSALITVLKQVILFM
PIAIILTKIIGIKGTWLASSVTDAIVFVLSFVLLAIEFKKLYDINSSENQNITYIK

Sequences:

>Translated_456_residues
MNKNREELINGNMFTLLLKLSIPGIIGMLVIGLYNLCDAIFVGKLVGETALAAVSISSPFTFINNCIAVLVGVGSSSILS
RAIGAKDDKVVNEILANLILSVLVLSLTVTVLGCFFSENLLRFSGAKGEILQSGINYLRIVYIGSFFVNFSQSANMLIRG
EGKMKEAMGIMALGAVLNIILDPIFIKTLNFGVEGAAIATVIAQIIQALVTFMYFKCNKSILSVTKLKFAFDLMPEILSV
GGSAAMMQLMYLVQQTALYKLISIYGGDDQLVLMGVALRILMFTFIPIWGIGQGLQPIVGMNFGAKKYDRVKDAVKIFSI
ASTIFIGVLWGFYMLKPRVVLSWFINDRTIIENGYEFFRLMFLTFPVSGLIVMSMTFFQSIGKGGKSALITVLKQVILFM
PIAIILTKIIGIKGTWLASSVTDAIVFVLSFVLLAIEFKKLYDINSSENQNITYIK
>Mature_456_residues
MNKNREELINGNMFTLLLKLSIPGIIGMLVIGLYNLCDAIFVGKLVGETALAAVSISSPFTFINNCIAVLVGVGSSSILS
RAIGAKDDKVVNEILANLILSVLVLSLTVTVLGCFFSENLLRFSGAKGEILQSGINYLRIVYIGSFFVNFSQSANMLIRG
EGKMKEAMGIMALGAVLNIILDPIFIKTLNFGVEGAAIATVIAQIIQALVTFMYFKCNKSILSVTKLKFAFDLMPEILSV
GGSAAMMQLMYLVQQTALYKLISIYGGDDQLVLMGVALRILMFTFIPIWGIGQGLQPIVGMNFGAKKYDRVKDAVKIFSI
ASTIFIGVLWGFYMLKPRVVLSWFINDRTIIENGYEFFRLMFLTFPVSGLIVMSMTFFQSIGKGGKSALITVLKQVILFM
PIAIILTKIIGIKGTWLASSVTDAIVFVLSFVLLAIEFKKLYDINSSENQNITYIK

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49981; Mature: 49981

Theoretical pI: Translated: 9.78; Mature: 9.78

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
4.4 %Met     (Translated Protein)
5.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
4.4 %Met     (Mature Protein)
5.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNKNREELINGNMFTLLLKLSIPGIIGMLVIGLYNLCDAIFVGKLVGETALAAVSISSPF
CCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCH
TFINNCIAVLVGVGSSSILSRAIGAKDDKVVNEILANLILSVLVLSLTVTVLGCFFSENL
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LRFSGAKGEILQSGINYLRIVYIGSFFVNFSQSANMLIRGEGKMKEAMGIMALGAVLNII
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LDPIFIKTLNFGVEGAAIATVIAQIIQALVTFMYFKCNKSILSVTKLKFAFDLMPEILSV
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GGSAAMMQLMYLVQQTALYKLISIYGGDDQLVLMGVALRILMFTFIPIWGIGQGLQPIVG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHC
MNFGAKKYDRVKDAVKIFSIASTIFIGVLWGFYMLKPRVVLSWFINDRTIIENGYEFFRL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
MFLTFPVSGLIVMSMTFFQSIGKGGKSALITVLKQVILFMPIAIILTKIIGIKGTWLASS
HHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
VTDAIVFVLSFVLLAIEFKKLYDINSSENQNITYIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEC
>Mature Secondary Structure
MNKNREELINGNMFTLLLKLSIPGIIGMLVIGLYNLCDAIFVGKLVGETALAAVSISSPF
CCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCH
TFINNCIAVLVGVGSSSILSRAIGAKDDKVVNEILANLILSVLVLSLTVTVLGCFFSENL
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LRFSGAKGEILQSGINYLRIVYIGSFFVNFSQSANMLIRGEGKMKEAMGIMALGAVLNII
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LDPIFIKTLNFGVEGAAIATVIAQIIQALVTFMYFKCNKSILSVTKLKFAFDLMPEILSV
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GGSAAMMQLMYLVQQTALYKLISIYGGDDQLVLMGVALRILMFTFIPIWGIGQGLQPIVG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHC
MNFGAKKYDRVKDAVKIFSIASTIFIGVLWGFYMLKPRVVLSWFINDRTIIENGYEFFRL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
MFLTFPVSGLIVMSMTFFQSIGKGGKSALITVLKQVILFMPIAIILTKIIGIKGTWLASS
HHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
VTDAIVFVLSFVLLAIEFKKLYDINSSENQNITYIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]