Definition Clostridium botulinum A str. ATCC 19397, complete genome.
Accession NC_009697
Length 3,863,450

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The map label for this gene is 153931580

Identifier: 153931580

GI number: 153931580

Start: 2952606

End: 2955119

Strand: Reverse

Name: 153931580

Synonym: CLB_2803

Alternate gene names: NA

Gene position: 2955119-2952606 (Counterclockwise)

Preceding gene: 153933968

Following gene: 153932696

Centisome position: 76.49

GC content: 22.0

Gene sequence:

>2514_bases
ATGGATAATTTTTATATTAAAAATGTATTAATAAATAACTTTAGAGGATATAATGCTGAAAAAAAATATAGATTTGAAGA
TGATAATGGTAACCCAAGTAATATAGTTTTATTGTCTGGACCTAATGGATATGGGAAAACAACACTAATGGATTCTATTG
AATGGTGTTTAACAGGGACTATCAAAAGAGTATATGATGATTATATGAAAAGGTGTTCTCAAAAAACAGAGAGGGAACTT
GAAAATTCTTCAAAGGGATTAATATATAATGTTAATTCAAAAAAAAATTATGTTTCAGTTAGAATTGAATGTATATATAA
AGGAAATAAAGTTATAATTGAAAGAGAATTTAATGGAACAAATGAAATTGATGCTTTTGAACAAAATTCTATCCCACATA
TAACTTGTAAAGATGATATTAGAATAGATTTAATTAATATAATGGAACATATAAAAGATAATTTTAATTTTAATAATATT
TGTTCATATGATAAAAATATTGAACTATATAAGAAAGGAAGAACAGATATATATAGTTTTTTTGAATCATCTTTTTCTGA
ACTTAGTGAGGCAAAGAAAATAATTAATAATTTGAGTGATTTGAAAGATAAATTGACTAAAGAAAAAGAAGAGATTGAAG
CAGATATAGATAGACTGTCAGAAAATAAGAGGGATAAGGAAAGAATATTAGAAAAGATAAATAAATCCGAAAATATTAAG
AGTAGAGAGTATCCTAAAAACTATATATTTAAATCTGAAATATATGTGAATGATGGTTATTTTAAGATAATAGATAATGA
TATTGATGTAAAGTTAGAAAAACAGATAGAAATATTAACAGATATATTATATAAAAAGATTGCTGATAATTTAAATGATA
TAATTTATAAAAAGAAGACATGTATAAAATTACTGAAGAATAAAGAATTAACCCAAAGGTATTTGGTAGAGAAAAATAAC
ATAGAACATATAAATAAATATGATTTAAAAGAATTAAAATCCAATAAAAAACAATTAGAATTATTTAAAGATATTGTAAT
TAAACAAATTAAAGATAATAATATTGAAATATTTATAAAAGAATTAGAATCAGATAAAAGTAAATATAAAAAATTTATTA
GAGAATATGAATATAAAATTATTGCAGATGAATATGATAAATTTAAGAATAATGAAAAAATTATTGTTTTATTGAGTAAT
CAAAAAGATTTGTATGATAGCAATAGTCCTATTATTAAAGCAATGAGATATATAGTTGACAATCAAAAAGTTTATGAAAT
CTATAAACAAGAAAATAATGTATGCCCTCTTTGTGGAAGTGAAACTTTTCCAGAAAATGAAGTAGGTAAAATTGCTAAGA
AATTTTTAGGTGAAAAAGATAAGGAAAGGCAGTCTTTAATAAAAGAGATAAATGAATATACAGAAAATAATGAAGTTATA
ATAGGCAAAATTAAAGAGCTAGTAATATCATCAATAGAAAGTCAACTTAATGAAATAAATAATATTTTAAAATTAAGAGG
AGAGTTGCAAGACATATTTTTATTAGCGAAAGAGTTGGAAATAGACATACAAAAAATATCAATAGAGTTATTGACTTGTG
AAAAAATAAAGTTAGAAGAAGAGATATCAGGTTTACAAATAGAGAATGTTAAGGAATTAGATATAATACATTTATTATTA
GAATTAAAATCACCCTTTTTATTAAAATACATAAATGAATTGAAATCGTATAATGATGAATATTATGAAAAAAATGTATT
ATTACTAAGTCAAATGGTAGATGAATTACAGAAAAACAGGGCAACCATTAAATATTCTATAAATAATAATGAATATAAAA
CTTCTACATTGAATTTAATAAAAGATAAGTTAGATATTACGAAAGAAATAGTTTTATATAAAACTAATAATTCTATAAGT
TGTGAAATTAAAAATATTAATAAAGATATATCAAACTTTGAGAAAGAGTTAAAAGCCATAAAAGAAAAAATAGAAAAAGC
ACAAACATTTATTACAAAGATTAAGCGTGTAAAAACAAATAGCGAAAAAAATGAGACACGAAGAATAGCGGAACCATTGA
GTGTAATATATAAGAAGATAACTCGTAATACAAATATTAATGAAATAAATTTAAAGAAAGGAAATGCAAGTAAAAAATCA
TCTTTAGATATTATAGATTCAGATGGAAATAATATACCATTCGGAAATATAATGAGTGCAGGACAAGTATCTACACTTGC
AATTTCAATATATTTTGCTAAGGCTATATTAAATAAAAATAGAACTTTTAAGTTATACATGATGGATGATCCAATACAGA
CAATGGACGATTTAAATGTTATTTCCTTAATAGATTTATTAAGATTTCAGTTTATGCAACCAAAAGAAAATAGGTTTATT
GACCAATTATTTATATCAACATGTGATGATGATTTAGAAAAATTGATATTCCATAAAATGAATAGTTTTGGAATATCAAT
AATTAATCAAAATTTCATTGGAGAAAAATATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGGATATAATTAAGAATAGTGATGTGATAAGTGAACTACTTAAAGAGAAACCGGATTTTGAATCGATTGAGGGGATTTG
GAGTAAGGAGAAATAAAAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCTAATATAACTAAAAATATTTTACATTCTATAAGAAATATGGAAACTATATTGACTAAAAATACAGTGAAATTAATAAT
TTATTAATTAGGATTAACAA

Product: RecF/RecN/SMC domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 837; Mature: 837

Protein sequence:

>837_residues
MDNFYIKNVLINNFRGYNAEKKYRFEDDNGNPSNIVLLSGPNGYGKTTLMDSIEWCLTGTIKRVYDDYMKRCSQKTEREL
ENSSKGLIYNVNSKKNYVSVRIECIYKGNKVIIEREFNGTNEIDAFEQNSIPHITCKDDIRIDLINIMEHIKDNFNFNNI
CSYDKNIELYKKGRTDIYSFFESSFSELSEAKKIINNLSDLKDKLTKEKEEIEADIDRLSENKRDKERILEKINKSENIK
SREYPKNYIFKSEIYVNDGYFKIIDNDIDVKLEKQIEILTDILYKKIADNLNDIIYKKKTCIKLLKNKELTQRYLVEKNN
IEHINKYDLKELKSNKKQLELFKDIVIKQIKDNNIEIFIKELESDKSKYKKFIREYEYKIIADEYDKFKNNEKIIVLLSN
QKDLYDSNSPIIKAMRYIVDNQKVYEIYKQENNVCPLCGSETFPENEVGKIAKKFLGEKDKERQSLIKEINEYTENNEVI
IGKIKELVISSIESQLNEINNILKLRGELQDIFLLAKELEIDIQKISIELLTCEKIKLEEEISGLQIENVKELDIIHLLL
ELKSPFLLKYINELKSYNDEYYEKNVLLLSQMVDELQKNRATIKYSINNNEYKTSTLNLIKDKLDITKEIVLYKTNNSIS
CEIKNINKDISNFEKELKAIKEKIEKAQTFITKIKRVKTNSEKNETRRIAEPLSVIYKKITRNTNINEINLKKGNASKKS
SLDIIDSDGNNIPFGNIMSAGQVSTLAISIYFAKAILNKNRTFKLYMMDDPIQTMDDLNVISLIDLLRFQFMQPKENRFI
DQLFISTCDDDLEKLIFHKMNSFGISIINQNFIGEKY

Sequences:

>Translated_837_residues
MDNFYIKNVLINNFRGYNAEKKYRFEDDNGNPSNIVLLSGPNGYGKTTLMDSIEWCLTGTIKRVYDDYMKRCSQKTEREL
ENSSKGLIYNVNSKKNYVSVRIECIYKGNKVIIEREFNGTNEIDAFEQNSIPHITCKDDIRIDLINIMEHIKDNFNFNNI
CSYDKNIELYKKGRTDIYSFFESSFSELSEAKKIINNLSDLKDKLTKEKEEIEADIDRLSENKRDKERILEKINKSENIK
SREYPKNYIFKSEIYVNDGYFKIIDNDIDVKLEKQIEILTDILYKKIADNLNDIIYKKKTCIKLLKNKELTQRYLVEKNN
IEHINKYDLKELKSNKKQLELFKDIVIKQIKDNNIEIFIKELESDKSKYKKFIREYEYKIIADEYDKFKNNEKIIVLLSN
QKDLYDSNSPIIKAMRYIVDNQKVYEIYKQENNVCPLCGSETFPENEVGKIAKKFLGEKDKERQSLIKEINEYTENNEVI
IGKIKELVISSIESQLNEINNILKLRGELQDIFLLAKELEIDIQKISIELLTCEKIKLEEEISGLQIENVKELDIIHLLL
ELKSPFLLKYINELKSYNDEYYEKNVLLLSQMVDELQKNRATIKYSINNNEYKTSTLNLIKDKLDITKEIVLYKTNNSIS
CEIKNINKDISNFEKELKAIKEKIEKAQTFITKIKRVKTNSEKNETRRIAEPLSVIYKKITRNTNINEINLKKGNASKKS
SLDIIDSDGNNIPFGNIMSAGQVSTLAISIYFAKAILNKNRTFKLYMMDDPIQTMDDLNVISLIDLLRFQFMQPKENRFI
DQLFISTCDDDLEKLIFHKMNSFGISIINQNFIGEKY
>Mature_837_residues
MDNFYIKNVLINNFRGYNAEKKYRFEDDNGNPSNIVLLSGPNGYGKTTLMDSIEWCLTGTIKRVYDDYMKRCSQKTEREL
ENSSKGLIYNVNSKKNYVSVRIECIYKGNKVIIEREFNGTNEIDAFEQNSIPHITCKDDIRIDLINIMEHIKDNFNFNNI
CSYDKNIELYKKGRTDIYSFFESSFSELSEAKKIINNLSDLKDKLTKEKEEIEADIDRLSENKRDKERILEKINKSENIK
SREYPKNYIFKSEIYVNDGYFKIIDNDIDVKLEKQIEILTDILYKKIADNLNDIIYKKKTCIKLLKNKELTQRYLVEKNN
IEHINKYDLKELKSNKKQLELFKDIVIKQIKDNNIEIFIKELESDKSKYKKFIREYEYKIIADEYDKFKNNEKIIVLLSN
QKDLYDSNSPIIKAMRYIVDNQKVYEIYKQENNVCPLCGSETFPENEVGKIAKKFLGEKDKERQSLIKEINEYTENNEVI
IGKIKELVISSIESQLNEINNILKLRGELQDIFLLAKELEIDIQKISIELLTCEKIKLEEEISGLQIENVKELDIIHLLL
ELKSPFLLKYINELKSYNDEYYEKNVLLLSQMVDELQKNRATIKYSINNNEYKTSTLNLIKDKLDITKEIVLYKTNNSIS
CEIKNINKDISNFEKELKAIKEKIEKAQTFITKIKRVKTNSEKNETRRIAEPLSVIYKKITRNTNINEINLKKGNASKKS
SLDIIDSDGNNIPFGNIMSAGQVSTLAISIYFAKAILNKNRTFKLYMMDDPIQTMDDLNVISLIDLLRFQFMQPKENRFI
DQLFISTCDDDLEKLIFHKMNSFGISIINQNFIGEKY

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 98402; Mature: 98402

Theoretical pI: Translated: 7.29; Mature: 7.29

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDNFYIKNVLINNFRGYNAEKKYRFEDDNGNPSNIVLLSGPNGYGKTTLMDSIEWCLTGT
CCCEEEHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
IKRVYDDYMKRCSQKTERELENSSKGLIYNVNSKKNYVSVRIECIYKGNKVIIEREFNGT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEEEEEECCEEEEEECCCCC
NEIDAFEQNSIPHITCKDDIRIDLINIMEHIKDNFNFNNICSYDKNIELYKKGRTDIYSF
CCCCCHHCCCCCEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCHHHHHH
FESSFSELSEAKKIINNLSDLKDKLTKEKEEIEADIDRLSENKRDKERILEKINKSENIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCC
SREYPKNYIFKSEIYVNDGYFKIIDNDIDVKLEKQIEILTDILYKKIADNLNDIIYKKKT
CCCCCCCCEEEEEEEEECCEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CIKLLKNKELTQRYLVEKNNIEHINKYDLKELKSNKKQLELFKDIVIKQIKDNNIEIFIK
HHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEH
ELESDKSKYKKFIREYEYKIIADEYDKFKNNEKIIVLLSNQKDLYDSNSPIIKAMRYIVD
HHHCHHHHHHHHHHHHHHEEEECHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHC
NQKVYEIYKQENNVCPLCGSETFPENEVGKIAKKFLGEKDKERQSLIKEINEYTENNEVI
CHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE
IGKIKELVISSIESQLNEINNILKLRGELQDIFLLAKELEIDIQKISIELLTCEKIKLEE
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEHHHHHHH
EISGLQIENVKELDIIHLLLELKSPFLLKYINELKSYNDEYYEKNVLLLSQMVDELQKNR
HHCCCEECCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
ATIKYSINNNEYKTSTLNLIKDKLDITKEIVLYKTNNSISCEIKNINKDISNFEKELKAI
CEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH
KEKIEKAQTFITKIKRVKTNSEKNETRRIAEPLSVIYKKITRNTNINEINLKKGNASKKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCC
SLDIIDSDGNNIPFGNIMSAGQVSTLAISIYFAKAILNKNRTFKLYMMDDPIQTMDDLNV
CCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHHCCHH
ISLIDLLRFQFMQPKENRFIDQLFISTCDDDLEKLIFHKMNSFGISIINQNFIGEKY
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MDNFYIKNVLINNFRGYNAEKKYRFEDDNGNPSNIVLLSGPNGYGKTTLMDSIEWCLTGT
CCCEEEHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
IKRVYDDYMKRCSQKTERELENSSKGLIYNVNSKKNYVSVRIECIYKGNKVIIEREFNGT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEEEEEECCEEEEEECCCCC
NEIDAFEQNSIPHITCKDDIRIDLINIMEHIKDNFNFNNICSYDKNIELYKKGRTDIYSF
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCC
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CIKLLKNKELTQRYLVEKNNIEHINKYDLKELKSNKKQLELFKDIVIKQIKDNNIEIFIK
HHHHHHCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEH
ELESDKSKYKKFIREYEYKIIADEYDKFKNNEKIIVLLSNQKDLYDSNSPIIKAMRYIVD
HHHCHHHHHHHHHHHHHHEEEECHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHC
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CHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE
IGKIKELVISSIESQLNEINNILKLRGELQDIFLLAKELEIDIQKISIELLTCEKIKLEE
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEEHHHHHHH
EISGLQIENVKELDIIHLLLELKSPFLLKYINELKSYNDEYYEKNVLLLSQMVDELQKNR
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CCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHHCCHH
ISLIDLLRFQFMQPKENRFIDQLFISTCDDDLEKLIFHKMNSFGISIINQNFIGEKY
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA