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The map label for this gene is cstA [H]

Identifier: 152977591

GI number: 152977591

Start: 3981510

End: 3983585

Strand: Reverse

Name: cstA [H]

Synonym: Bcer98_3929

Alternate gene names: 152977591

Gene position: 3983585-3981510 (Counterclockwise)

Preceding gene: 152977592

Following gene: 152977590

Centisome position: 97.47

GC content: 38.54

Gene sequence:

>2076_bases
GTGAAGGCATTCAAATCAATTTTGCTTTGGGGGATAATTTCAGTATTAGGAGCTACCGGATTTGGAGTGATTGCTTTATC
ACAGGGGGAAACGATTAATGCCATTTGGTTATTAGTTGCTGCGGTTTCAGTATATGCCGTTGCATATCGATTTTATAGTA
GATTTATCGCGAGAAAAGTATTTGAACTAGATCATAATCGACAAACACCAGCTGAGACATTGAATGATGGAAAAGACTAT
GTACCAACGAATAAATGGGTGCTATTTGGTCACCACTTTGCAGCAATAGCAGGAGCTGGTCCTCTAGTAGGCCCTATTTT
AGCAGCGCAGATGGGGTATTTACCAGGAACGATTTGGATTATTGTTGGGGTTGTTATTGCAGGAGCAGTACAAGATTTTG
TCATTTTATTTGCTTCAATGAGACGAAATGGAAAGTCGTTAGGAGAAATGATTAAGGATGAGATTGGTCCTATTACAGGG
TTAATCGCAATGATCGGGATTTTAGGTATTATGATTATTTTATTAGCTGTATTGGCTTTAGTAGTTGTGAAAGCACTTAT
CGGAAGTCCGTGGGGGATGTTTACGATTGCAGCAACCATCCCAATTGCTATTTTAATGGGAGTATATATGCGCTATATTC
GTCCAGGAAGAGTGGGAGAAGGATCGGTTATTGGAATTATTTTGCTCATTTTAGCCCTTATTGGTGGACAGTATGTAGCT
GAAAATTCTACTCTTGCAAGCATGTTCACGTTTAGTGGTGAAACAATTGCTATCATGCTTATTGTATATGGCTTTATCGC
ATCTGCACTTCCCGTTTGGATGCTGCTTGCACCGCGTGATTATTTAAGTACATTTTTAAAGATTGGTACAATCGTTGGAT
TGGCAATTGGCATTGTCATTGTTGCGCCAGAATTACAGATGCCCGCTGTTTCGAAGTTTATTGATGGAACAGGTCCGGTA
TTTTCAGGGAACTTATTTCCATTTTTGTTTATTACAATTGCTTGTGGTGCTGTATCAGGATTTCATGCTTTAGTTTCTTC
AGGTACTACGCCAAAAATGATTGAAAGAGAAGGGCATGCACAACCGATTGGTTATGGGGCAATGTTAATGGAATCATTCG
TTGCAGCAATGGCAATGATTGCAGCATGTGTGTTAACACCAGGAACTTATTTTGCGATTAATAGTCCAGCAGCTCTTATC
GGTACAGATGTAACGCAGGCTGCACAAGTGATTTCATCATGGGGATTTGCAATTACACCAAATGAGCTAAAAGAACTGGC
AACAAATGTAGGAGAACAAACGATATTATCTCGAACAGGTGGTGCACCAACATTAGCAATCGGAATGGCTTATATCTTTT
CGCAAATATTGGGTGGTACAGCGATGATGGCATTTTGGTATCACTTCGCCATTTTATTTGAAGCACTATTTATTTTAACG
ACAATTGATGCAGGAACACGTGTAGGCCGTTTTATGATTCAAGATATATTAGGACATGTATATAAGCCTTTTGCAAGAAC
AGATTCTACAGTAGCAAATGTGATCGCTACAACATTATGCGTATTAGGATGGGGTTACTTCTTATACCAGGGAGTAGTTG
ATCCTCTTGGTGGCATTAATACATTATGGCCACTCTTCGGTATTGCTAACCAAATGCTAGCTGGAATTGCTTTATTACTT
GGAACAACTATTTTATTCAAAATGGGCAAAAAGGTATACGTTTGGGTAACATTGATCCCCACAATCGGATTGCTAATTGT
AACAATGACAGCTGGCTATCAAAAGCTGTTCCATGAAAACCCTAAAATTGGATTTTTATCGCATGCAAAAGTATTTCAAG
ATGCATTGGATGAAGGGAAAATATTAGCACCAGCAAAAAATATCGCACAAATGAAACAAATCATTTTCAATGATTATATT
GATGCAGCACTTTGTGGAATTTTCATGTTAGTTGTCATAGCAGTTCTAATTTCTGCAATTCGTATATGGGTTCGTGTGTT
GCAAAACAAGGCGATACCATTAAAAGAAGCGCCATATATTCCAAGAGATGAAAGTGAGTCGAGAAATTATGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGATAACATAAGAATCCTTCATGATAAGGAGGATTCAAATTAAATATTCAGAAAATTTAGTACAATCTCCACTAAGAAG
TTATATTGGGGGGATTGTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAATTCGGAAACATATGGGGAGCAAGAAAACAATTCATTAGCTTGCTTGTTGGAGTTCCAAGTTATGAAACATATGTCA
TTCATATGAAAGAAAATCAT

Product: carbon starvation protein CstA

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 691; Mature: 691

Protein sequence:

>691_residues
MKAFKSILLWGIISVLGATGFGVIALSQGETINAIWLLVAAVSVYAVAYRFYSRFIARKVFELDHNRQTPAETLNDGKDY
VPTNKWVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPGTIWIIVGVVIAGAVQDFVILFASMRRNGKSLGEMIKDEIGPITG
LIAMIGILGIMIILLAVLALVVVKALIGSPWGMFTIAATIPIAILMGVYMRYIRPGRVGEGSVIGIILLILALIGGQYVA
ENSTLASMFTFSGETIAIMLIVYGFIASALPVWMLLAPRDYLSTFLKIGTIVGLAIGIVIVAPELQMPAVSKFIDGTGPV
FSGNLFPFLFITIACGAVSGFHALVSSGTTPKMIEREGHAQPIGYGAMLMESFVAAMAMIAACVLTPGTYFAINSPAALI
GTDVTQAAQVISSWGFAITPNELKELATNVGEQTILSRTGGAPTLAIGMAYIFSQILGGTAMMAFWYHFAILFEALFILT
TIDAGTRVGRFMIQDILGHVYKPFARTDSTVANVIATTLCVLGWGYFLYQGVVDPLGGINTLWPLFGIANQMLAGIALLL
GTTILFKMGKKVYVWVTLIPTIGLLIVTMTAGYQKLFHENPKIGFLSHAKVFQDALDEGKILAPAKNIAQMKQIIFNDYI
DAALCGIFMLVVIAVLISAIRIWVRVLQNKAIPLKEAPYIPRDESESRNYA

Sequences:

>Translated_691_residues
MKAFKSILLWGIISVLGATGFGVIALSQGETINAIWLLVAAVSVYAVAYRFYSRFIARKVFELDHNRQTPAETLNDGKDY
VPTNKWVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPGTIWIIVGVVIAGAVQDFVILFASMRRNGKSLGEMIKDEIGPITG
LIAMIGILGIMIILLAVLALVVVKALIGSPWGMFTIAATIPIAILMGVYMRYIRPGRVGEGSVIGIILLILALIGGQYVA
ENSTLASMFTFSGETIAIMLIVYGFIASALPVWMLLAPRDYLSTFLKIGTIVGLAIGIVIVAPELQMPAVSKFIDGTGPV
FSGNLFPFLFITIACGAVSGFHALVSSGTTPKMIEREGHAQPIGYGAMLMESFVAAMAMIAACVLTPGTYFAINSPAALI
GTDVTQAAQVISSWGFAITPNELKELATNVGEQTILSRTGGAPTLAIGMAYIFSQILGGTAMMAFWYHFAILFEALFILT
TIDAGTRVGRFMIQDILGHVYKPFARTDSTVANVIATTLCVLGWGYFLYQGVVDPLGGINTLWPLFGIANQMLAGIALLL
GTTILFKMGKKVYVWVTLIPTIGLLIVTMTAGYQKLFHENPKIGFLSHAKVFQDALDEGKILAPAKNIAQMKQIIFNDYI
DAALCGIFMLVVIAVLISAIRIWVRVLQNKAIPLKEAPYIPRDESESRNYA
>Mature_691_residues
MKAFKSILLWGIISVLGATGFGVIALSQGETINAIWLLVAAVSVYAVAYRFYSRFIARKVFELDHNRQTPAETLNDGKDY
VPTNKWVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPGTIWIIVGVVIAGAVQDFVILFASMRRNGKSLGEMIKDEIGPITG
LIAMIGILGIMIILLAVLALVVVKALIGSPWGMFTIAATIPIAILMGVYMRYIRPGRVGEGSVIGIILLILALIGGQYVA
ENSTLASMFTFSGETIAIMLIVYGFIASALPVWMLLAPRDYLSTFLKIGTIVGLAIGIVIVAPELQMPAVSKFIDGTGPV
FSGNLFPFLFITIACGAVSGFHALVSSGTTPKMIEREGHAQPIGYGAMLMESFVAAMAMIAACVLTPGTYFAINSPAALI
GTDVTQAAQVISSWGFAITPNELKELATNVGEQTILSRTGGAPTLAIGMAYIFSQILGGTAMMAFWYHFAILFEALFILT
TIDAGTRVGRFMIQDILGHVYKPFARTDSTVANVIATTLCVLGWGYFLYQGVVDPLGGINTLWPLFGIANQMLAGIALLL
GTTILFKMGKKVYVWVTLIPTIGLLIVTMTAGYQKLFHENPKIGFLSHAKVFQDALDEGKILAPAKNIAQMKQIIFNDYI
DAALCGIFMLVVIAVLISAIRIWVRVLQNKAIPLKEAPYIPRDESESRNYA

Specific function: Peptide utilization during carbon starvation [H]

COG id: COG1966

COG function: function code T; Carbon starvation protein, predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the CstA family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786814, Length=691, Percent_Identity=61.0709117221418, Blast_Score=862, Evalue=0.0,
Organism=Escherichia coli, GI87082431, Length=706, Percent_Identity=56.2322946175637, Blast_Score=784, Evalue=0.0,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003706 [H]

Pfam domain/function: PF02554 CstA [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74227; Mature: 74227

Theoretical pI: Translated: 8.88; Mature: 8.88

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
3.9 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
3.9 %Met     (Mature Protein)
4.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKAFKSILLWGIISVLGATGFGVIALSQGETINAIWLLVAAVSVYAVAYRFYSRFIARKV
CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FELDHNRQTPAETLNDGKDYVPTNKWVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPGTIWI
HHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
IVGVVIAGAVQDFVILFASMRRNGKSLGEMIKDEIGPITGLIAMIGILGIMIILLAVLAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VVVKALIGSPWGMFTIAATIPIAILMGVYMRYIRPGRVGEGSVIGIILLILALIGGQYVA
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
ENSTLASMFTFSGETIAIMLIVYGFIASALPVWMLLAPRDYLSTFLKIGTIVGLAIGIVI
CCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VAPELQMPAVSKFIDGTGPVFSGNLFPFLFITIACGAVSGFHALVSSGTTPKMIEREGHA
CCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCC
QPIGYGAMLMESFVAAMAMIAACVLTPGTYFAINSPAALIGTDVTQAAQVISSWGFAITP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCH
NELKELATNVGEQTILSRTGGAPTLAIGMAYIFSQILGGTAMMAFWYHFAILFEALFILT
HHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIDAGTRVGRFMIQDILGHVYKPFARTDSTVANVIATTLCVLGWGYFLYQGVVDPLGGIN
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
TLWPLFGIANQMLAGIALLLGTTILFKMGKKVYVWVTLIPTIGLLIVTMTAGYQKLFHEN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PKIGFLSHAKVFQDALDEGKILAPAKNIAQMKQIIFNDYIDAALCGIFMLVVIAVLISAI
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RIWVRVLQNKAIPLKEAPYIPRDESESRNYA
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKAFKSILLWGIISVLGATGFGVIALSQGETINAIWLLVAAVSVYAVAYRFYSRFIARKV
CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FELDHNRQTPAETLNDGKDYVPTNKWVLFGHHFAAIAGAGPLVGPILAAQMGYLPGTIWI
HHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
IVGVVIAGAVQDFVILFASMRRNGKSLGEMIKDEIGPITGLIAMIGILGIMIILLAVLAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VVVKALIGSPWGMFTIAATIPIAILMGVYMRYIRPGRVGEGSVIGIILLILALIGGQYVA
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEE
ENSTLASMFTFSGETIAIMLIVYGFIASALPVWMLLAPRDYLSTFLKIGTIVGLAIGIVI
CCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VAPELQMPAVSKFIDGTGPVFSGNLFPFLFITIACGAVSGFHALVSSGTTPKMIEREGHA
CCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCC
QPIGYGAMLMESFVAAMAMIAACVLTPGTYFAINSPAALIGTDVTQAAQVISSWGFAITP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCH
NELKELATNVGEQTILSRTGGAPTLAIGMAYIFSQILGGTAMMAFWYHFAILFEALFILT
HHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIDAGTRVGRFMIQDILGHVYKPFARTDSTVANVIATTLCVLGWGYFLYQGVVDPLGGIN
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
TLWPLFGIANQMLAGIALLLGTTILFKMGKKVYVWVTLIPTIGLLIVTMTAGYQKLFHEN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PKIGFLSHAKVFQDALDEGKILAPAKNIAQMKQIIFNDYIDAALCGIFMLVVIAVLISAI
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RIWVRVLQNKAIPLKEAPYIPRDESESRNYA
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 1848300; 9278503; 2521622 [H]