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The map label for this gene is hyfB [H]

Identifier: 150401368

GI number: 150401368

Start: 965859

End: 968030

Strand: Reverse

Name: hyfB [H]

Synonym: Maeo_0943

Alternate gene names: 150401368

Gene position: 968030-965859 (Counterclockwise)

Preceding gene: 150401369

Following gene: 150401367

Centisome position: 61.68

GC content: 32.04

Gene sequence:

>2172_bases
ATGTATGATAACCTGAATAACCATACAAAGTTAAAAGATGTGGTTAAGATGGATATTATAAAACCAAAATTAAATTTAAA
GGTTAAATCAATAAGTATATTTGTTATATTGGCCATATTATTGGCATTTATATCTCCTGTAATGGCAGAATCTAGATTTA
ACACCAATATGACTATTGGGTTAAATGCTATACAATTACCATTTGGAGATAATATGTTAATATGTATATCAATTATTGTA
TTGGGTGGATTATTGGGTGTTTTATTTTCAAAATGGTTCAAATTATCAAAAATAATTTCAATATTGATTATTTCAATGGG
CTCATTATTTGGAACATATAATGCAATTATGGTAATATTAAATAACAAATCTTATGAACTTACATATTTGGTTGAAAGCA
TAATTCCAATAAGTTTTAAAATAGATCCAATATCAATGTTCTTTTCAGCTGTCGTGCTATTGGTTTCTATCATGGCTGCA
ATTTATAGCTATGGATATATGGACGACAAAAAAAGAAAATTAGCAACAGGATTTCAGTATTTAAATTTTGCAGTGCTTGT
AGCCTCAATGGTTGGAGTTACAATTTCAAACAACAGTATTATTTTCTTATTATTTTGGGAATTAATGTCCATTTCATCAT
TCCTATTAGTCATGTTTGACGGATTCAAAGAGGAAGTTAGAAAATCAGGATATATCTATTTAATATATACTCATGCAGGT
GGAATGTTTATATTCGCATCATTCGCCCTGGCATATGTGGCTACTGGTTCTATCAGTTTTGACCAATTTTCTAACATGCC
AGATTATTTAAAAATAGCAGTATTTCTCCTTGGATTTGTAGGTTTTGCGTCAAAAGCAGGAGTATTTCCATTTCACTCAT
GGCTACCGTATGCACATCCTGTGGCACCAAGTCATGTTTCAGCAGTAATGTCTGGTGTTATGATTAAAATGGGTATTTAT
GGAATTATAATGCTCATATTGCTTCTTGGAATAAATAATATTTACATTGGATATATGGTGTTAATATTAGGTATCTTATC
TGGAATTCTTGGGGTGGCTTATGCCCTTGCCCAACACGATATTAAAAGATTGCTTGCATATTCTAGTATTGAAAACATAG
GTATTATATTGATAGGTTTGGGCATTGGATTAATTGGAAAATATTATCATAACGAAACCATAGCCTTGTTGGGATTTGCA
GGAGCTCTCCTCCACATTCTAAATCACGCACTATTTAAATCATTATTATTTATGGGCGCAGGTGCGATGATAAAATCCAC
AGGAACACACTCTTTGGAAGGGATGGGGGGTTTAATGAAGAGAATGCCTACAACAAGCTTGGTTTTCCTTATAGGTTCTC
TTGCAATATCGGGAATACCCCCATTTAATGGATTTGTAAGTGAGCTTTTAATATATATGGGCGGTTTCAATGGACTTAAT
GACTCAGTTGGATTATTAATAGCATCTACATTTGGCATCATTGCATTAGTACTTATTGGAGGCCTTGCAACGGCATGTTT
CACCAAGGTATTGGGAATATCTTTTTTAGGAGCTCCTAAAACAAAGGCATCAGCAAATGCCAAAGCGTCTCCACATGTTA
TGAGCGTTCCTCAAATACTACTGGCTTTAATTTGTATAATTATAGGTATTTTTCCGATATTGTTCGTAAATCCAATTATA
AAAATAGCAAATAGTTCAAATCTTGCAGGAATTACAGCATGCTCTCAATTATCGGTATTTCCAAATCTAACAGGTGTTTA
TATAATTTTAATAGCTTTGGTATCTCTATTCGTTGTATTGAGAATGATATATTACAAAAACAAAATTGTTGATGGATACA
CATGGGATTGTGGATACAGTAATCCAACTTCAAAGATGCAATATACGGCATCATCATATGCTAGTCCAATAGTGGAATTC
TTCAAACCATTTGTAATTATAAAAACCCATGAAAAACCTGTCAAGGGAATATTCCCACATGAAGCCAAATATCATTCACA
TAGTAAAGACTTGGCTGAGGCAGTATTTGAATTACTATTAATAAAACCTATTTCAGTTGGATTATCGGTAATTAGATATC
TTAAAGATGGAAACTTTAACTATTATATGGGATATGTGATTATAATCATATCGCTTCTCCTATCATATATTTATTTAATA
ATGTGGTGGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATTTCTGATCGTATCATAATTTTTTATTAGTTTTTTTTTTATTAAACTTATGTTTAACTACATTAAATAATTCTTAAC
TTTCGAAACAGTTATATATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATGGAATCTATAATATATTATTTACTTACGGTTTCACTTGCTCCGCTGTTTCCTGGTGTGATTGATAAAGTAAAGGCAT
TATCTGCGGGTAAAAAAGGA

Product: NADH dehydrogenase (quinone)

Products: H2; oxidized ferredoxin [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 723; Mature: 723

Protein sequence:

>723_residues
MYDNLNNHTKLKDVVKMDIIKPKLNLKVKSISIFVILAILLAFISPVMAESRFNTNMTIGLNAIQLPFGDNMLICISIIV
LGGLLGVLFSKWFKLSKIISILIISMGSLFGTYNAIMVILNNKSYELTYLVESIIPISFKIDPISMFFSAVVLLVSIMAA
IYSYGYMDDKKRKLATGFQYLNFAVLVASMVGVTISNNSIIFLLFWELMSISSFLLVMFDGFKEEVRKSGYIYLIYTHAG
GMFIFASFALAYVATGSISFDQFSNMPDYLKIAVFLLGFVGFASKAGVFPFHSWLPYAHPVAPSHVSAVMSGVMIKMGIY
GIIMLILLLGINNIYIGYMVLILGILSGILGVAYALAQHDIKRLLAYSSIENIGIILIGLGIGLIGKYYHNETIALLGFA
GALLHILNHALFKSLLFMGAGAMIKSTGTHSLEGMGGLMKRMPTTSLVFLIGSLAISGIPPFNGFVSELLIYMGGFNGLN
DSVGLLIASTFGIIALVLIGGLATACFTKVLGISFLGAPKTKASANAKASPHVMSVPQILLALICIIIGIFPILFVNPII
KIANSSNLAGITACSQLSVFPNLTGVYIILIALVSLFVVLRMIYYKNKIVDGYTWDCGYSNPTSKMQYTASSYASPIVEF
FKPFVIIKTHEKPVKGIFPHEAKYHSHSKDLAEAVFELLLIKPISVGLSVIRYLKDGNFNYYMGYVIIIISLLLSYIYLI
MWW

Sequences:

>Translated_723_residues
MYDNLNNHTKLKDVVKMDIIKPKLNLKVKSISIFVILAILLAFISPVMAESRFNTNMTIGLNAIQLPFGDNMLICISIIV
LGGLLGVLFSKWFKLSKIISILIISMGSLFGTYNAIMVILNNKSYELTYLVESIIPISFKIDPISMFFSAVVLLVSIMAA
IYSYGYMDDKKRKLATGFQYLNFAVLVASMVGVTISNNSIIFLLFWELMSISSFLLVMFDGFKEEVRKSGYIYLIYTHAG
GMFIFASFALAYVATGSISFDQFSNMPDYLKIAVFLLGFVGFASKAGVFPFHSWLPYAHPVAPSHVSAVMSGVMIKMGIY
GIIMLILLLGINNIYIGYMVLILGILSGILGVAYALAQHDIKRLLAYSSIENIGIILIGLGIGLIGKYYHNETIALLGFA
GALLHILNHALFKSLLFMGAGAMIKSTGTHSLEGMGGLMKRMPTTSLVFLIGSLAISGIPPFNGFVSELLIYMGGFNGLN
DSVGLLIASTFGIIALVLIGGLATACFTKVLGISFLGAPKTKASANAKASPHVMSVPQILLALICIIIGIFPILFVNPII
KIANSSNLAGITACSQLSVFPNLTGVYIILIALVSLFVVLRMIYYKNKIVDGYTWDCGYSNPTSKMQYTASSYASPIVEF
FKPFVIIKTHEKPVKGIFPHEAKYHSHSKDLAEAVFELLLIKPISVGLSVIRYLKDGNFNYYMGYVIIIISLLLSYIYLI
MWW
>Mature_723_residues
MYDNLNNHTKLKDVVKMDIIKPKLNLKVKSISIFVILAILLAFISPVMAESRFNTNMTIGLNAIQLPFGDNMLICISIIV
LGGLLGVLFSKWFKLSKIISILIISMGSLFGTYNAIMVILNNKSYELTYLVESIIPISFKIDPISMFFSAVVLLVSIMAA
IYSYGYMDDKKRKLATGFQYLNFAVLVASMVGVTISNNSIIFLLFWELMSISSFLLVMFDGFKEEVRKSGYIYLIYTHAG
GMFIFASFALAYVATGSISFDQFSNMPDYLKIAVFLLGFVGFASKAGVFPFHSWLPYAHPVAPSHVSAVMSGVMIKMGIY
GIIMLILLLGINNIYIGYMVLILGILSGILGVAYALAQHDIKRLLAYSSIENIGIILIGLGIGLIGKYYHNETIALLGFA
GALLHILNHALFKSLLFMGAGAMIKSTGTHSLEGMGGLMKRMPTTSLVFLIGSLAISGIPPFNGFVSELLIYMGGFNGLN
DSVGLLIASTFGIIALVLIGGLATACFTKVLGISFLGAPKTKASANAKASPHVMSVPQILLALICIIIGIFPILFVNPII
KIANSSNLAGITACSQLSVFPNLTGVYIILIALVSLFVVLRMIYYKNKIVDGYTWDCGYSNPTSKMQYTASSYASPIVEF
FKPFVIIKTHEKPVKGIFPHEAKYHSHSKDLAEAVFELLLIKPISVGLSVIRYLKDGNFNYYMGYVIIIISLLLSYIYLI
MWW

Specific function: Unknown

COG id: COG0651

COG function: function code CP; Formate hydrogenlyase subunit 3/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the complex I subunit 5 family [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI251831117, Length=504, Percent_Identity=26.3888888888889, Blast_Score=125, Evalue=2e-28,
Organism=Homo sapiens, GI251831116, Length=288, Percent_Identity=26.7361111111111, Blast_Score=84, Evalue=3e-16,
Organism=Escherichia coli, GI1788827, Length=608, Percent_Identity=35.3618421052632, Blast_Score=345, Evalue=5e-96,
Organism=Escherichia coli, GI2367154, Length=533, Percent_Identity=32.6454033771107, Blast_Score=228, Evalue=7e-61,
Organism=Escherichia coli, GI1788831, Length=358, Percent_Identity=34.0782122905028, Blast_Score=166, Evalue=5e-42,
Organism=Escherichia coli, GI1788829, Length=496, Percent_Identity=27.6209677419355, Blast_Score=148, Evalue=1e-36,
Organism=Escherichia coli, GI1788613, Length=392, Percent_Identity=28.8265306122449, Blast_Score=138, Evalue=1e-33,
Organism=Escherichia coli, GI1788614, Length=500, Percent_Identity=26.4, Blast_Score=108, Evalue=1e-24,
Organism=Escherichia coli, GI145693160, Length=449, Percent_Identity=26.9487750556793, Blast_Score=92, Evalue=2e-19,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001750
- InterPro:   IPR003918 [H]

Pfam domain/function: PF00361 Oxidored_q1 [H]

EC number: 1.-.-.- [C]

Molecular weight: Translated: 79234; Mature: 79234

Theoretical pI: Translated: 9.62; Mature: 9.62

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
4.3 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
4.3 %Met     (Mature Protein)
5.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYDNLNNHTKLKDVVKMDIIKPKLNLKVKSISIFVILAILLAFISPVMAESRFNTNMTIG
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
LNAIQLPFGDNMLICISIIVLGGLLGVLFSKWFKLSKIISILIISMGSLFGTYNAIMVIL
CEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEE
NNKSYELTYLVESIIPISFKIDPISMFFSAVVLLVSIMAAIYSYGYMDDKKRKLATGFQY
CCCCEEHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
LNFAVLVASMVGVTISNNSIIFLLFWELMSISSFLLVMFDGFKEEVRKSGYIYLIYTHAG
HHHHHHHHHHHCEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCC
GMFIFASFALAYVATGSISFDQFSNMPDYLKIAVFLLGFVGFASKAGVFPFHSWLPYAHP
CHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCCCCCC
VAPSHVSAVMSGVMIKMGIYGIIMLILLLGINNIYIGYMVLILGILSGILGVAYALAQHD
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKRLLAYSSIENIGIILIGLGIGLIGKYYHNETIALLGFAGALLHILNHALFKSLLFMGA
HHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
GAMIKSTGTHSLEGMGGLMKRMPTTSLVFLIGSLAISGIPPFNGFVSELLIYMGGFNGLN
CCCEECCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC
DSVGLLIASTFGIIALVLIGGLATACFTKVLGISFLGAPKTKASANAKASPHVMSVPQIL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
LALICIIIGIFPILFVNPIIKIANSSNLAGITACSQLSVFPNLTGVYIILIALVSLFVVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RMIYYKNKIVDGYTWDCGYSNPTSKMQYTASSYASPIVEFFKPFVIIKTHEKPVKGIFPH
HHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCHHEECHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCCC
EAKYHSHSKDLAEAVFELLLIKPISVGLSVIRYLKDGNFNYYMGYVIIIISLLLSYIYLI
CCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MWW
HCC
>Mature Secondary Structure
MYDNLNNHTKLKDVVKMDIIKPKLNLKVKSISIFVILAILLAFISPVMAESRFNTNMTIG
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
LNAIQLPFGDNMLICISIIVLGGLLGVLFSKWFKLSKIISILIISMGSLFGTYNAIMVIL
CEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEE
NNKSYELTYLVESIIPISFKIDPISMFFSAVVLLVSIMAAIYSYGYMDDKKRKLATGFQY
CCCCEEHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
LNFAVLVASMVGVTISNNSIIFLLFWELMSISSFLLVMFDGFKEEVRKSGYIYLIYTHAG
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CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKRLLAYSSIENIGIILIGLGIGLIGKYYHNETIALLGFAGALLHILNHALFKSLLFMGA
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GAMIKSTGTHSLEGMGGLMKRMPTTSLVFLIGSLAISGIPPFNGFVSELLIYMGGFNGLN
CCCEECCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC
DSVGLLIASTFGIIALVLIGGLATACFTKVLGISFLGAPKTKASANAKASPHVMSVPQIL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RMIYYKNKIVDGYTWDCGYSNPTSKMQYTASSYASPIVEFFKPFVIIKTHEKPVKGIFPH
HHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCHHEECHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCCC
EAKYHSHSKDLAEAVFELLLIKPISVGLSVIRYLKDGNFNYYMGYVIIIISLLLSYIYLI
CCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MWW
HCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton; reduced ferredoxin [C]

Specific reaction: Proton + reduced ferredoxin = H2 + oxidized ferredoxin [C]

General reaction: Oxidoreductases [C]

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9205837; 9278503; 2016588 [H]