Definition Methanococcus aeolicus Nankai-3, complete genome.
Accession NC_009635
Length 1,569,500

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The map label for this gene is 150401253

Identifier: 150401253

GI number: 150401253

Start: 855171

End: 856373

Strand: Reverse

Name: 150401253

Synonym: Maeo_0824

Alternate gene names: NA

Gene position: 856373-855171 (Counterclockwise)

Preceding gene: 150401254

Following gene: 150401252

Centisome position: 54.56

GC content: 28.18

Gene sequence:

>1203_bases
ATGAATAATTTAACAGATATACCTTTTTTATTTATGGGTGGCATTTGCGGAATATTTACGGGTTTACTTCCCGGAATTCA
CCCAAACACGATTCTACCTATTTCTTTTGTATTTTTGCCAATTATTCCAACAAATAGCTTTACTTCTTTTTTAATCGGTA
TGGTTATAACCCATTATTTTATAAATTATATTCCCTCTGCATTCATCGGAGCTCCCGACGATGAGACCGCTGTATCCGTC
ATACCTCTACATAATTTAACAAAAAATGGGGAAGGATATGAAGGCATAATTTTGTGCGGGATGGGAGGATTTATTGGAAT
AATTTTCTCACTATGTTTTTTATTTCTGATATTATTATTAAATTTTGATTTAAATGGATTGTATGCATTATTTAAACCAT
TTATTCCTTTTGTTTTATTGTTGTTGATAATTATTACGGTTATTTTTTCAAGTAATAAAATATGGAGTATAATTATAATG
GTGCTTTCTGGCATTCTTGGTTTTGTTGTATTATATAATGGCCCACCAATAGAAAATATTTTAACACCCTTATTTACTGG
AATGTTTGCCATTCCATTATTAATCGAAAACTTAAAAACTAGTAAATTAACTCACCAGATTATATCGTTTCCAGAATTTG
ATTTATCTCATTTAAAATCTGCCATTGCTGGAACGGTCGGGGGATTTTTTAGGATTTTTTTACCGGCTATTGGGGGAGCC
CAGATAAATTTCTTTTTAAGTAAAATTATAAAAGAAAATGACATTAAAAATTTTTTAGTATCTCAGGGCTCTATAACCTT
ATCAAATGAAGTTTTTTCAGTTTTGGCATTATTATTGATTGGAACTGGGAGAAGTGGAACGGCAATTGCTATGAAAGATT
TAAATATTAATTTAAATTATGATATTGCAATATATATGTTAATTATAGCAGGTTTTGGATTTTTTGCCCTATGTTTTGTG
GCAAAATATTTTTTAAGATATATGAATAAGGTAGATTATGGAAAAATTTCATTTTATTTATTGATATTTTGTAGTGCAGT
TATATTTGTATTGGGGTATTTTTCCAACTATTTAATATATTATTTAATTGTCTATATGGTGTCGGTGTTTTTAGGGATTT
TATGTGTAAAAACAAAAGTAAATATGTCCTATATGATGTGTGTTTTAGTATTGCCAACAGTTTTATATTATTTAATTAGA
TAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAATTATTTATTATTAATTATCGGTAGTTATTTAGTAGTTATATATTATTTGTATATTGTTATATATTATTGAATAAAAC
TAAATAAACAGGATAAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATTGATGGAATATTTTATTTTATCTTATAATATGTGTTGCATTTGGTGAAAAAATGAAATCTGACCTTAAATTTAAAAT
AATAGATAATGGAGTAGTTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 400; Mature: 400

Protein sequence:

>400_residues
MNNLTDIPFLFMGGICGIFTGLLPGIHPNTILPISFVFLPIIPTNSFTSFLIGMVITHYFINYIPSAFIGAPDDETAVSV
IPLHNLTKNGEGYEGIILCGMGGFIGIIFSLCFLFLILLLNFDLNGLYALFKPFIPFVLLLLIIITVIFSSNKIWSIIIM
VLSGILGFVVLYNGPPIENILTPLFTGMFAIPLLIENLKTSKLTHQIISFPEFDLSHLKSAIAGTVGGFFRIFLPAIGGA
QINFFLSKIIKENDIKNFLVSQGSITLSNEVFSVLALLLIGTGRSGTAIAMKDLNINLNYDIAIYMLIIAGFGFFALCFV
AKYFLRYMNKVDYGKISFYLLIFCSAVIFVLGYFSNYLIYYLIVYMVSVFLGILCVKTKVNMSYMMCVLVLPTVLYYLIR

Sequences:

>Translated_400_residues
MNNLTDIPFLFMGGICGIFTGLLPGIHPNTILPISFVFLPIIPTNSFTSFLIGMVITHYFINYIPSAFIGAPDDETAVSV
IPLHNLTKNGEGYEGIILCGMGGFIGIIFSLCFLFLILLLNFDLNGLYALFKPFIPFVLLLLIIITVIFSSNKIWSIIIM
VLSGILGFVVLYNGPPIENILTPLFTGMFAIPLLIENLKTSKLTHQIISFPEFDLSHLKSAIAGTVGGFFRIFLPAIGGA
QINFFLSKIIKENDIKNFLVSQGSITLSNEVFSVLALLLIGTGRSGTAIAMKDLNINLNYDIAIYMLIIAGFGFFALCFV
AKYFLRYMNKVDYGKISFYLLIFCSAVIFVLGYFSNYLIYYLIVYMVSVFLGILCVKTKVNMSYMMCVLVLPTVLYYLIR
>Mature_400_residues
MNNLTDIPFLFMGGICGIFTGLLPGIHPNTILPISFVFLPIIPTNSFTSFLIGMVITHYFINYIPSAFIGAPDDETAVSV
IPLHNLTKNGEGYEGIILCGMGGFIGIIFSLCFLFLILLLNFDLNGLYALFKPFIPFVLLLLIIITVIFSSNKIWSIIIM
VLSGILGFVVLYNGPPIENILTPLFTGMFAIPLLIENLKTSKLTHQIISFPEFDLSHLKSAIAGTVGGFFRIFLPAIGGA
QINFFLSKIIKENDIKNFLVSQGSITLSNEVFSVLALLLIGTGRSGTAIAMKDLNINLNYDIAIYMLIIAGFGFFALCFV
AKYFLRYMNKVDYGKISFYLLIFCSAVIFVLGYFSNYLIYYLIVYMVSVFLGILCVKTKVNMSYMMCVLVLPTVLYYLIR

Specific function: Unknown

COG id: COG1784

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002823 [H]

Pfam domain/function: PF01970 DUF112 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44472; Mature: 44472

Theoretical pI: Translated: 8.02; Mature: 8.02

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.8 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.8 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
5.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNNLTDIPFLFMGGICGIFTGLLPGIHPNTILPISFVFLPIIPTNSFTSFLIGMVITHYF
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
INYIPSAFIGAPDDETAVSVIPLHNLTKNGEGYEGIILCGMGGFIGIIFSLCFLFLILLL
HHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECHHCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NFDLNGLYALFKPFIPFVLLLLIIITVIFSSNKIWSIIIMVLSGILGFVVLYNGPPIENI
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEHCCCCCHHHH
LTPLFTGMFAIPLLIENLKTSKLTHQIISFPEFDLSHLKSAIAGTVGGFFRIFLPAIGGA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
QINFFLSKIIKENDIKNFLVSQGSITLSNEVFSVLALLLIGTGRSGTAIAMKDLNINLNY
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEECCC
DIAIYMLIIAGFGFFALCFVAKYFLRYMNKVDYGKISFYLLIFCSAVIFVLGYFSNYLIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YLIVYMVSVFLGILCVKTKVNMSYMMCVLVLPTVLYYLIR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MNNLTDIPFLFMGGICGIFTGLLPGIHPNTILPISFVFLPIIPTNSFTSFLIGMVITHYF
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
INYIPSAFIGAPDDETAVSVIPLHNLTKNGEGYEGIILCGMGGFIGIIFSLCFLFLILLL
HHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECHHCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NFDLNGLYALFKPFIPFVLLLLIIITVIFSSNKIWSIIIMVLSGILGFVVLYNGPPIENI
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEHCCCCCHHHH
LTPLFTGMFAIPLLIENLKTSKLTHQIISFPEFDLSHLKSAIAGTVGGFFRIFLPAIGGA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
QINFFLSKIIKENDIKNFLVSQGSITLSNEVFSVLALLLIGTGRSGTAIAMKDLNINLNY
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEECCC
DIAIYMLIIAGFGFFALCFVAKYFLRYMNKVDYGKISFYLLIFCSAVIFVLGYFSNYLIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YLIVYMVSVFLGILCVKTKVNMSYMMCVLVLPTVLYYLIR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]