Definition Methanococcus aeolicus Nankai-3, complete genome.
Accession NC_009635
Length 1,569,500

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The map label for this gene is 150400824

Identifier: 150400824

GI number: 150400824

Start: 405966

End: 408146

Strand: Reverse

Name: 150400824

Synonym: Maeo_0392

Alternate gene names: NA

Gene position: 408146-405966 (Counterclockwise)

Preceding gene: 150400825

Following gene: 150400809

Centisome position: 26.0

GC content: 25.86

Gene sequence:

>2181_bases
ATGAAATTTGAAAATCCATTTAAATTACAAAATTGGAAGATTAAAAAATTTTTAATGGCTATTTTATTTTTTCAAATATC
TTTATTGGGATTATTTGCACTAAATAAATTGGGAGTTAATACTCCAATTATAAGACCGTTAATAGGATTTATTTATTTGT
CATTTATTCCAGGTTATTTATTATTAAGAATTTTGAGATTGCATAAGTTAAACAGTATTGAGAGTTTTTTATATGCTCTT
GGGCTGAGTTTATTTATGGATATGTTTGTTGGATTTTTAATGAATATGCTTTATCCGATTTTAGGTATTACAGATAAACC
AATCTCAGAAATTCCAATAGTTTTAACTATGGCGGGAGTTGTGTTTTTATTATGTATTATTGCATATCTTAGAGATAAAA
ATTATAACAATCCCGATTTTATAGATTTAAAAGATATTCTAAATCCACAGGTTTTATTTTTAAGTTTAATTCCATTTATG
GCAATATTTGGAACCTATTTGGTAAATTATTACCATAACAATATTTTGTTAATGATTATGATTGTTGTTATTGCATTAGT
TGCTTTAATTATCGGATTTACAAATTGGATTGATAAAAAATATTATCCTTATGCTATTTGGATAATAACTATTGCATTAG
TATGGCATATAATGTTGATAACACCTTATGCGCTTAATTATGATGGTGAAATGTATGGTGCTGAAACGACAATAGAAAAT
GGGTTTTGGAACTATAATAATTTTGGAAATTACAATTCAGTGTTGAGCAGTAAGATATTCACACCATTAATATGTTTCAT
TTGTGGCCTTAATTTAATTTGGATTTATAAGGTAATATTTCCACTATGGATTTCTACATTCCCTGTTGCAATTTATATAT
TTGTTAAAATATATTTAGCTGACAAAATTGCATTTTTATCTTCTCTGATAATAAATAGCATGGGGTATATAATGATATTT
GCAATTACTACTAAGCAATTTATGGCAGAATTTTTCATAATACTATTTATTATTACAATATACAATAATATGAATAAATT
TAAAAAAAAAATATTGACTATTTTAATTGGATTTAGCATAGTTTGGTCCCATTATGGTACTTCATCCATATTTATGGCAG
GATTATTATTTACTGCTTTGTTTTTAAAGATTCCCGGATTATATAATAAAAATAATAATAACTTAAAAGAGGTTTTCTCA
TTAGTTGGAATATATGTCACATTATACTTGTCCTGGTATGTATATATATCTGATTCTTCATTATTTTGTACAATAATAAG
TATTGGAAATAATGTTTTAAATTCAATTTGGACAGAATTTTTAAGTCCTGATACATCAAGAGGGGCATACATGATGACTA
AACAAGTATCCGGGTTATTGTTAATTCGAAAATATATGAACTTTGGAGTAGCATTTTTTATAATATTGGGAATGATCAAA
TGCCTATTAAATCTATTTAATAAAAAATCGAAATTTAAATTTGGTTTAATATATATTGGAATTTCATTATATTTTTTAGC
AATTTTAGTGGCGGCGATAGTTTTACCATTTTTTGCAGTTATGGGACCAGATAGACTATTTACACTGTCACTGGTGGCTA
CATCACCATTTTTTTCCATAGGAGGCATATTTTTTATTAAATTGATTTTAAAGGGGTTTAAAAGAGATATTACTACAACT
AATATTTTAAAGATTATGCATATTTATATAATAATCTTAATGTTACTAAATGTTGGATTTATTCAAGAAATTACAAAAAA
TCATCCGCGATCAATAGCATTAAGTCAAAAATCCATAGATAATTTTGGAAATTTAGAAGACAAATCAGCATTTTATAGGC
TATTAACAGATGTTTATGATGTACATGCGGCAAAATGGGCATCTGCGTATGGAAAAAAGAATATTTCTCGTAATAATGAA
TTGCCGTCATCTGTTGGAGCCACATTTGACAATTATGGAGACAGGTCTTTAAAAATAATTGGATTAAATCCACACATAAA
AAATATAGAAAGTAATACTTACATTTGGCTGAAGTATGCAAATATTAAAAATATAGGATTTGATATTAATCGTTATACGA
TGATATGGTATTATTTTAATTTTTCGGATGTAAAACCCCTGTTAAGAGGTAAAAACAAAATCTACGATAATAAAGGTAGC
CAAATTTTCCTTTCAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCTTGCGAAAGTTTTGAGTGTTTAGCAGATAAACATATATGTATGGAAAATATAAAACCTGAAACAATATTTAAGGCATT
TAAAAAATTAAGGGATAATC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTCAAATTTTAGCTTTAAATTCATTATATAAATCAAATACTATTTTTTTAATCTGTTTATCTGCAACAATTAACATTACC
CCATAAACTAAACTCCCAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 726; Mature: 726

Protein sequence:

>726_residues
MKFENPFKLQNWKIKKFLMAILFFQISLLGLFALNKLGVNTPIIRPLIGFIYLSFIPGYLLLRILRLHKLNSIESFLYAL
GLSLFMDMFVGFLMNMLYPILGITDKPISEIPIVLTMAGVVFLLCIIAYLRDKNYNNPDFIDLKDILNPQVLFLSLIPFM
AIFGTYLVNYYHNNILLMIMIVVIALVALIIGFTNWIDKKYYPYAIWIITIALVWHIMLITPYALNYDGEMYGAETTIEN
GFWNYNNFGNYNSVLSSKIFTPLICFICGLNLIWIYKVIFPLWISTFPVAIYIFVKIYLADKIAFLSSLIINSMGYIMIF
AITTKQFMAEFFIILFIITIYNNMNKFKKKILTILIGFSIVWSHYGTSSIFMAGLLFTALFLKIPGLYNKNNNNLKEVFS
LVGIYVTLYLSWYVYISDSSLFCTIISIGNNVLNSIWTEFLSPDTSRGAYMMTKQVSGLLLIRKYMNFGVAFFIILGMIK
CLLNLFNKKSKFKFGLIYIGISLYFLAILVAAIVLPFFAVMGPDRLFTLSLVATSPFFSIGGIFFIKLILKGFKRDITTT
NILKIMHIYIIILMLLNVGFIQEITKNHPRSIALSQKSIDNFGNLEDKSAFYRLLTDVYDVHAAKWASAYGKKNISRNNE
LPSSVGATFDNYGDRSLKIIGLNPHIKNIESNTYIWLKYANIKNIGFDINRYTMIWYYFNFSDVKPLLRGKNKIYDNKGS
QIFLSN

Sequences:

>Translated_726_residues
MKFENPFKLQNWKIKKFLMAILFFQISLLGLFALNKLGVNTPIIRPLIGFIYLSFIPGYLLLRILRLHKLNSIESFLYAL
GLSLFMDMFVGFLMNMLYPILGITDKPISEIPIVLTMAGVVFLLCIIAYLRDKNYNNPDFIDLKDILNPQVLFLSLIPFM
AIFGTYLVNYYHNNILLMIMIVVIALVALIIGFTNWIDKKYYPYAIWIITIALVWHIMLITPYALNYDGEMYGAETTIEN
GFWNYNNFGNYNSVLSSKIFTPLICFICGLNLIWIYKVIFPLWISTFPVAIYIFVKIYLADKIAFLSSLIINSMGYIMIF
AITTKQFMAEFFIILFIITIYNNMNKFKKKILTILIGFSIVWSHYGTSSIFMAGLLFTALFLKIPGLYNKNNNNLKEVFS
LVGIYVTLYLSWYVYISDSSLFCTIISIGNNVLNSIWTEFLSPDTSRGAYMMTKQVSGLLLIRKYMNFGVAFFIILGMIK
CLLNLFNKKSKFKFGLIYIGISLYFLAILVAAIVLPFFAVMGPDRLFTLSLVATSPFFSIGGIFFIKLILKGFKRDITTT
NILKIMHIYIIILMLLNVGFIQEITKNHPRSIALSQKSIDNFGNLEDKSAFYRLLTDVYDVHAAKWASAYGKKNISRNNE
LPSSVGATFDNYGDRSLKIIGLNPHIKNIESNTYIWLKYANIKNIGFDINRYTMIWYYFNFSDVKPLLRGKNKIYDNKGS
QIFLSN
>Mature_726_residues
MKFENPFKLQNWKIKKFLMAILFFQISLLGLFALNKLGVNTPIIRPLIGFIYLSFIPGYLLLRILRLHKLNSIESFLYAL
GLSLFMDMFVGFLMNMLYPILGITDKPISEIPIVLTMAGVVFLLCIIAYLRDKNYNNPDFIDLKDILNPQVLFLSLIPFM
AIFGTYLVNYYHNNILLMIMIVVIALVALIIGFTNWIDKKYYPYAIWIITIALVWHIMLITPYALNYDGEMYGAETTIEN
GFWNYNNFGNYNSVLSSKIFTPLICFICGLNLIWIYKVIFPLWISTFPVAIYIFVKIYLADKIAFLSSLIINSMGYIMIF
AITTKQFMAEFFIILFIITIYNNMNKFKKKILTILIGFSIVWSHYGTSSIFMAGLLFTALFLKIPGLYNKNNNNLKEVFS
LVGIYVTLYLSWYVYISDSSLFCTIISIGNNVLNSIWTEFLSPDTSRGAYMMTKQVSGLLLIRKYMNFGVAFFIILGMIK
CLLNLFNKKSKFKFGLIYIGISLYFLAILVAAIVLPFFAVMGPDRLFTLSLVATSPFFSIGGIFFIKLILKGFKRDITTT
NILKIMHIYIIILMLLNVGFIQEITKNHPRSIALSQKSIDNFGNLEDKSAFYRLLTDVYDVHAAKWASAYGKKNISRNNE
LPSSVGATFDNYGDRSLKIIGLNPHIKNIESNTYIWLKYANIKNIGFDINRYTMIWYYFNFSDVKPLLRGKNKIYDNKGS
QIFLSN

Specific function: Unknown

COG id: COG4906

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 83585; Mature: 83585

Theoretical pI: Translated: 9.90; Mature: 9.90

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.4 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKFENPFKLQNWKIKKFLMAILFFQISLLGLFALNKLGVNTPIIRPLIGFIYLSFIPGYL
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLRILRLHKLNSIESFLYALGLSLFMDMFVGFLMNMLYPILGITDKPISEIPIVLTMAGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
VFLLCIIAYLRDKNYNNPDFIDLKDILNPQVLFLSLIPFMAIFGTYLVNYYHNNILLMIM
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHH
IVVIALVALIIGFTNWIDKKYYPYAIWIITIALVWHIMLITPYALNYDGEMYGAETTIEN
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCCCCC
GFWNYNNFGNYNSVLSSKIFTPLICFICGLNLIWIYKVIFPLWISTFPVAIYIFVKIYLA
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DKIAFLSSLIINSMGYIMIFAITTKQFMAEFFIILFIITIYNNMNKFKKKILTILIGFSI
HHHHHHHHHHHHCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VWSHYGTSSIFMAGLLFTALFLKIPGLYNKNNNNLKEVFSLVGIYVTLYLSWYVYISDSS
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCC
LFCTIISIGNNVLNSIWTEFLSPDTSRGAYMMTKQVSGLLLIRKYMNFGVAFFIILGMIK
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CLLNLFNKKSKFKFGLIYIGISLYFLAILVAAIVLPFFAVMGPDRLFTLSLVATSPFFSI
HHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEEHHHCCCHHHH
GGIFFIKLILKGFKRDITTTNILKIMHIYIIILMLLNVGFIQEITKNHPRSIALSQKSID
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHC
NFGNLEDKSAFYRLLTDVYDVHAAKWASAYGKKNISRNNELPSSVGATFDNYGDRSLKII
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCEEEEE
GLNPHIKNIESNTYIWLKYANIKNIGFDINRYTMIWYYFNFSDVKPLLRGKNKIYDNKGS
ECCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
QIFLSN
EEEECC
>Mature Secondary Structure
MKFENPFKLQNWKIKKFLMAILFFQISLLGLFALNKLGVNTPIIRPLIGFIYLSFIPGYL
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLRILRLHKLNSIESFLYALGLSLFMDMFVGFLMNMLYPILGITDKPISEIPIVLTMAGV
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VFLLCIIAYLRDKNYNNPDFIDLKDILNPQVLFLSLIPFMAIFGTYLVNYYHNNILLMIM
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHH
IVVIALVALIIGFTNWIDKKYYPYAIWIITIALVWHIMLITPYALNYDGEMYGAETTIEN
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GFWNYNNFGNYNSVLSSKIFTPLICFICGLNLIWIYKVIFPLWISTFPVAIYIFVKIYLA
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DKIAFLSSLIINSMGYIMIFAITTKQFMAEFFIILFIITIYNNMNKFKKKILTILIGFSI
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VWSHYGTSSIFMAGLLFTALFLKIPGLYNKNNNNLKEVFSLVGIYVTLYLSWYVYISDSS
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LFCTIISIGNNVLNSIWTEFLSPDTSRGAYMMTKQVSGLLLIRKYMNFGVAFFIILGMIK
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CLLNLFNKKSKFKFGLIYIGISLYFLAILVAAIVLPFFAVMGPDRLFTLSLVATSPFFSI
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NFGNLEDKSAFYRLLTDVYDVHAAKWASAYGKKNISRNNELPSSVGATFDNYGDRSLKII
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GLNPHIKNIESNTYIWLKYANIKNIGFDINRYTMIWYYFNFSDVKPLLRGKNKIYDNKGS
ECCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
QIFLSN
EEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA