Definition Methanococcus vannielii SB chromosome, complete genome.
Accession NC_009634
Length 1,720,048

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The map label for this gene is 150400391

Identifier: 150400391

GI number: 150400391

Start: 1671157

End: 1672806

Strand: Reverse

Name: 150400391

Synonym: Mevan_1654

Alternate gene names: NA

Gene position: 1672806-1671157 (Counterclockwise)

Preceding gene: 150400392

Following gene: 150400389

Centisome position: 97.25

GC content: 24.91

Gene sequence:

>1650_bases
ATGGGCGGGTTTGGCAAAAAACTTAATGATTCATTTTGGGATTTAATTTTAAAAAATTATTCATTCTTAGGTTTTTCTTA
CTTGCTCATAGTGTCAATTTTAACGATAAAATTAATGATGTATGCACTAACTCCAGAAAGTACATTAGGTGATTATTATG
AGTTAATTGCGATAATTACACAAATACAGGCAGGATTTTTGGGAATATTGATTCCTTTTATACTCATACTTCTTCAAACG
ATTCTTTCAAAATACGGGATGGATTCCATACTTCTTTTTTTAAATGATAGCAGGTTTAAAAGTATATTGGCAGTTTACTT
TTTTGCACTTTCAATGGATGTGCTGGCATTGTATTTAATGTCAAATCATGGCGAGATACTTGTTAACTTAGTTTTTATAA
ATTTTTGGGGTTATTTATTTCCATTTGGTACATTGTTAGTTCTCGTACCCATTTTTCTTTTTATATTCACTACTTTCCTT
TTAATTAGTTTTATTTTGGTAGCCATTTCAAGTATAGACATATACTCATTTTCAAAGTATGTTGTTAACAAAATAAACGT
TAGAAAAATAGAAAAAGATGTGTTAAAATATAATAACGATTTTATGTATCAAACTTCATTTTTTCCGATAAATGTACTAT
TCAGTATGTGTGACCACCTCGTTTTAAAAAAAGATTTCAATTTAACTTCTGTTTCACCAAAATTAGAATATAAATATTCT
GAAATTGAAAATTTATTTTATAAATTATACATTGCTAAGAAAATAGATTTTAAAACCTATTTATCATTTTTTAAGTATTA
TTTAAACAAATATTATAATTTAAGTTATGTAGGATTCGATATTGGGGATTCAAAATGGGCTATGCGGTTAATATCTAAAA
AAATATCCAAAATGTTTAAAAAAATTCAAGATAGAAACTTTGTGTTATCAGATAATGAATTGGATGAGTTTATAGATCTA
TTTCACAAATTCACGTTAGAAATAGATTTAGATGGTAGGGATGAAAAACAAAGCCTTAATAAAAACGGACTATTGTTCAT
AGTATTGAGTTATTACGAATATATAATAAATTATTCACTAAAAAATCCAAATCAATTAAAGAGAATAATTAGCCAAATGG
CAAATACATTATACGTTCTTTTTGATAATTTAATGATCCCAAATAACGATCATATTTACTTTATAAATCCATATATGTCT
AGAATAAACTACTTGACGTTAAATTTAAAAGAAACTGTTGAAAAACGTGATTTAAATTTAATAATAAATACTCATAAGCT
TTATTTGTTTAAATTAGTATATCACCATTCTAATGGCAAAAATAAATCATATGCTTGGAAAAACATTTATGAAGCCACAA
AGTTTTATTTATCTTTATTAATATTTGATTTATCCGATAATAGTTCTGTGGTGGCATATTTATTAAAATTATATAATTTA
GACGATAATGCAGTTCATTCAGTACTGAATGATATTTTAAAATCTAAAAAAATAGAATTTACCTATGACAGCGTATTTTT
CAGCAATTCAGAAAGTTCAGAAAAATCTGATCCGGTAAAACATTTTGATTTATCTGAACTTGAAATTTCAAAAATAGCAA
ATCTCGAAGTAATTTTAAAAAAGTTAAAAGAAAATCAATCGAAAGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTTTTTACTTTTTTTCCCACATTTTCAAAAAACCCAATTCGAAAATTTAATATCTTAGTCGCTTTAAATTAAATTTAATT
ATATTTATCGAGGGGAGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATTCCTTAAAGCCACGTAAAATCCATACCCCCACCAAAAACAACTAATTTTTACTCCCCAACCAAACACTTAAATATAT
TAATTACAATCTCTTTTTAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 549; Mature: 548

Protein sequence:

>549_residues
MGGFGKKLNDSFWDLILKNYSFLGFSYLLIVSILTIKLMMYALTPESTLGDYYELIAIITQIQAGFLGILIPFILILLQT
ILSKYGMDSILLFLNDSRFKSILAVYFFALSMDVLALYLMSNHGEILVNLVFINFWGYLFPFGTLLVLVPIFLFIFTTFL
LISFILVAISSIDIYSFSKYVVNKINVRKIEKDVLKYNNDFMYQTSFFPINVLFSMCDHLVLKKDFNLTSVSPKLEYKYS
EIENLFYKLYIAKKIDFKTYLSFFKYYLNKYYNLSYVGFDIGDSKWAMRLISKKISKMFKKIQDRNFVLSDNELDEFIDL
FHKFTLEIDLDGRDEKQSLNKNGLLFIVLSYYEYIINYSLKNPNQLKRIISQMANTLYVLFDNLMIPNNDHIYFINPYMS
RINYLTLNLKETVEKRDLNLIINTHKLYLFKLVYHHSNGKNKSYAWKNIYEATKFYLSLLIFDLSDNSSVVAYLLKLYNL
DDNAVHSVLNDILKSKKIEFTYDSVFFSNSESSEKSDPVKHFDLSELEISKIANLEVILKKLKENQSKE

Sequences:

>Translated_549_residues
MGGFGKKLNDSFWDLILKNYSFLGFSYLLIVSILTIKLMMYALTPESTLGDYYELIAIITQIQAGFLGILIPFILILLQT
ILSKYGMDSILLFLNDSRFKSILAVYFFALSMDVLALYLMSNHGEILVNLVFINFWGYLFPFGTLLVLVPIFLFIFTTFL
LISFILVAISSIDIYSFSKYVVNKINVRKIEKDVLKYNNDFMYQTSFFPINVLFSMCDHLVLKKDFNLTSVSPKLEYKYS
EIENLFYKLYIAKKIDFKTYLSFFKYYLNKYYNLSYVGFDIGDSKWAMRLISKKISKMFKKIQDRNFVLSDNELDEFIDL
FHKFTLEIDLDGRDEKQSLNKNGLLFIVLSYYEYIINYSLKNPNQLKRIISQMANTLYVLFDNLMIPNNDHIYFINPYMS
RINYLTLNLKETVEKRDLNLIINTHKLYLFKLVYHHSNGKNKSYAWKNIYEATKFYLSLLIFDLSDNSSVVAYLLKLYNL
DDNAVHSVLNDILKSKKIEFTYDSVFFSNSESSEKSDPVKHFDLSELEISKIANLEVILKKLKENQSKE
>Mature_548_residues
GGFGKKLNDSFWDLILKNYSFLGFSYLLIVSILTIKLMMYALTPESTLGDYYELIAIITQIQAGFLGILIPFILILLQTI
LSKYGMDSILLFLNDSRFKSILAVYFFALSMDVLALYLMSNHGEILVNLVFINFWGYLFPFGTLLVLVPIFLFIFTTFLL
ISFILVAISSIDIYSFSKYVVNKINVRKIEKDVLKYNNDFMYQTSFFPINVLFSMCDHLVLKKDFNLTSVSPKLEYKYSE
IENLFYKLYIAKKIDFKTYLSFFKYYLNKYYNLSYVGFDIGDSKWAMRLISKKISKMFKKIQDRNFVLSDNELDEFIDLF
HKFTLEIDLDGRDEKQSLNKNGLLFIVLSYYEYIINYSLKNPNQLKRIISQMANTLYVLFDNLMIPNNDHIYFINPYMSR
INYLTLNLKETVEKRDLNLIINTHKLYLFKLVYHHSNGKNKSYAWKNIYEATKFYLSLLIFDLSDNSSVVAYLLKLYNLD
DNAVHSVLNDILKSKKIEFTYDSVFFSNSESSEKSDPVKHFDLSELEISKIANLEVILKKLKENQSKE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 64492; Mature: 64361

Theoretical pI: Translated: 8.86; Mature: 8.86

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGGFGKKLNDSFWDLILKNYSFLGFSYLLIVSILTIKLMMYALTPESTLGDYYELIAIIT
CCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
QIQAGFLGILIPFILILLQTILSKYGMDSILLFLNDSRFKSILAVYFFALSMDVLALYLM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SNHGEILVNLVFINFWGYLFPFGTLLVLVPIFLFIFTTFLLISFILVAISSIDIYSFSKY
CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
VVNKINVRKIEKDVLKYNNDFMYQTSFFPINVLFSMCDHLVLKKDFNLTSVSPKLEYKYS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHH
EIENLFYKLYIAKKIDFKTYLSFFKYYLNKYYNLSYVGFDIGDSKWAMRLISKKISKMFK
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KIQDRNFVLSDNELDEFIDLFHKFTLEIDLDGRDEKQSLNKNGLLFIVLSYYEYIINYSL
HHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCC
KNPNQLKRIISQMANTLYVLFDNLMIPNNDHIYFINPYMSRINYLTLNLKETVEKRDLNL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECHHHHCCCEEEEEHHHHHHHCCCEE
IINTHKLYLFKLVYHHSNGKNKSYAWKNIYEATKFYLSLLIFDLSDNSSVVAYLLKLYNL
EEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHCC
DDNAVHSVLNDILKSKKIEFTYDSVFFSNSESSEKSDPVKHFDLSELEISKIANLEVILK
CHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
KLKENQSKE
HHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
GGFGKKLNDSFWDLILKNYSFLGFSYLLIVSILTIKLMMYALTPESTLGDYYELIAIIT
CCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
QIQAGFLGILIPFILILLQTILSKYGMDSILLFLNDSRFKSILAVYFFALSMDVLALYLM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SNHGEILVNLVFINFWGYLFPFGTLLVLVPIFLFIFTTFLLISFILVAISSIDIYSFSKY
CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
VVNKINVRKIEKDVLKYNNDFMYQTSFFPINVLFSMCDHLVLKKDFNLTSVSPKLEYKYS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHH
EIENLFYKLYIAKKIDFKTYLSFFKYYLNKYYNLSYVGFDIGDSKWAMRLISKKISKMFK
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KIQDRNFVLSDNELDEFIDLFHKFTLEIDLDGRDEKQSLNKNGLLFIVLSYYEYIINYSL
HHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCC
KNPNQLKRIISQMANTLYVLFDNLMIPNNDHIYFINPYMSRINYLTLNLKETVEKRDLNL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECHHHHCCCEEEEEHHHHHHHCCCEE
IINTHKLYLFKLVYHHSNGKNKSYAWKNIYEATKFYLSLLIFDLSDNSSVVAYLLKLYNL
EEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHCC
DDNAVHSVLNDILKSKKIEFTYDSVFFSNSESSEKSDPVKHFDLSELEISKIANLEVILK
CHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
KLKENQSKE
HHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA